MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. WCH70 plasmid pWCH7002

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012790	TAT	2	6	2221	2226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012790	TAA	2	6	2227	2232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012790	ATA	2	6	2233	2238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012790	TAT	2	6	2321	2326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012790	TAA	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012790	ATA	2	6	2333	2338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012790	TAT	2	6	2421	2426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012790	TAA	2	6	2427	2432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012790	ATA	2	6	2433	2438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012790	TAT	2	6	2521	2526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012790	TAA	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012790	ATA	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012790	TAT	2	6	2621	2626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012790	TAA	2	6	2627	2632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012790	ATA	2	6	2633	2638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012790	TAT	2	6	2721	2726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012790	TAA	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012790	ATA	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012790	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012790	GTT	2	6	4094	4099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012790	TTG	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012790	TTC	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012790	AAG	3	9	5074	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012790	TTC	3	9	5088	5096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012790	AGA	2	6	5322	5327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012790	TCA	2	6	5364	5369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012790	TAT	2	6	5628	5633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012790	TAA	2	6	5634	5639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012790	ATA	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012790	TGG	2	6	5712	5717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012790	GGA	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012790	GAA	2	6	5787	5792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012790	AGG	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012790	CAC	2	6	6397	6402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012790	ATA	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012790	AGG	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012790	TGG	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012790	ACC	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012790	GGA	2	6	6845	6850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012790	GCG	2	6	7040	7045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012790	TCG	2	6	7306	7311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012790	TTG	2	6	8374	8379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012790	TTC	2	6	8401	8406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012790	AAG	3	9	8469	8477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012790	TTC	3	9	8483	8491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012790	ATA	2	6	9614	9619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012790	GGT	2	6	9658	9663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.