MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter sp. FRC-32 chromosome

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011979	TCCTT	2	10	11761	11770	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011979	AGGCA	2	10	43768	43777	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011979	GTTTT	2	10	62331	62340	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011979	AGGTC	2	10	62635	62644	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011979	CAGGA	2	10	84620	84629	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011979	AGGTG	2	10	91357	91366	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011979	GAAAG	2	10	107614	107623	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011979	TTAAT	2	10	112576	112585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011979	AATGA	2	10	117956	117965	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011979	CCTGA	2	10	118752	118761	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011979	GAAAA	2	10	119726	119735	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011979	TCCTC	2	10	124452	124461	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_011979	CCGGC	2	10	137853	137862	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_011979	ATTTA	2	10	151211	151220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011979	GCCTT	2	10	175365	175374	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011979	TCCAT	2	10	177993	178002	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011979	ACCTT	2	10	187652	187661	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011979	AAAAT	2	10	206473	206482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011979	ATGAA	2	10	224747	224756	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011979	GAAAA	2	10	231778	231787	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011979	TGTGG	2	10	249431	249440	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011979	TCAAA	2	10	251307	251316	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011979	AAAAT	2	10	254386	254395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011979	GAAAA	2	10	314688	314697	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011979	AATTA	2	10	325370	325379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011979	AAACC	2	10	332466	332475	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011979	CTCCA	2	10	337974	337983	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_011979	GTTAA	2	10	359840	359849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011979	ATTAA	2	10	372361	372370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011979	AGGTG	2	10	395145	395154	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011979	TTAGT	2	10	423618	423627	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011979	GGCAC	2	10	441285	441294	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011979	AAAGG	2	10	474406	474415	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011979	TCCTT	2	10	476590	476599	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011979	GAAAG	2	10	515793	515802	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011979	TGAGG	2	10	522383	522392	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011979	TAAGT	2	10	529594	529603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011979	CTCTC	2	10	562055	562064	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_011979	TTTAA	2	10	589281	589290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011979	CCGAA	2	10	601865	601874	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011979	AGGAG	2	10	610700	610709	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011979	GCTTT	2	10	623363	623372	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011979	TGAGA	2	10	623453	623462	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011979	TTTAG	2	10	625365	625374	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011979	TGAAG	2	10	625413	625422	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011979	GAGGG	2	10	642500	642509	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011979	GCTGG	2	10	646009	646018	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011979	TTTCC	2	10	651335	651344	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011979	GGGTC	2	10	652511	652520	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011979	GGGAT	2	10	678856	678865	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011979	AAAAT	2	10	678989	678998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011979	TATTT	2	10	681574	681583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011979	TGGTA	2	10	704895	704904	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011979	TTTCG	2	10	735110	735119	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011979	CCATG	2	10	748964	748973	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011979	TTTTC	2	10	751123	751132	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011979	AAATG	2	10	781600	781609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011979	GCATG	2	10	785947	785956	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011979	GGGCA	2	10	789997	790006	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011979	AAATT	2	10	790078	790087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011979	CAATC	2	10	790151	790160	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011979	GAAAA	2	10	790231	790240	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011979	TTCAG	2	10	790763	790772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011979	GAAAT	2	10	796767	796776	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011979	CAAAA	2	10	808099	808108	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011979	AATGC	2	10	809736	809745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011979	TCTTT	2	10	824390	824399	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011979	AATGA	2	10	861727	861736	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011979	TAAAA	2	10	876837	876846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011979	AAGAA	2	10	918317	918326	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011979	GGGCC	2	10	921247	921256	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_011979	GGAGC	2	10	939425	939434	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011979	GGGGT	2	10	942825	942834	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011979	CTTTC	2	10	946338	946347	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_011979	TTTAA	2	10	952725	952734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011979	AATTC	2	10	999219	999228	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011979	TCCCC	2	10	1010956	1010965	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
78	NC_011979	CATAG	2	10	1010983	1010992	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011979	GTCAC	2	10	1064370	1064379	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011979	TTGTA	2	10	1068804	1068813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011979	CCGTG	2	10	1069601	1069610	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_011979	TCATT	2	10	1075410	1075419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011979	TTTTC	2	10	1085263	1085272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011979	TTTAA	2	10	1109282	1109291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011979	AATGA	2	10	1114167	1114176	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011979	TTCCT	2	10	1141087	1141096	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011979	TCAGC	2	10	1143949	1143958	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_011979	TGCGT	2	10	1168364	1168373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011979	TGAAC	2	10	1181365	1181374	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011979	TGAAG	2	10	1193224	1193233	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011979	TAAAA	2	10	1194775	1194784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011979	ATCAG	2	10	1219338	1219347	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011979	CCTCC	2	10	1251440	1251449	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
94	NC_011979	GAAAG	2	10	1253157	1253166	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011979	AGGGA	2	10	1254447	1254456	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011979	AAGAA	2	10	1268850	1268859	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011979	AAGGA	2	10	1290475	1290484	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011979	ATTCC	2	10	1296973	1296982	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_011979	CTTTT	2	10	1302774	1302783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011979	TAATT	2	10	1306364	1306373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011979	GACAT	2	10	1331509	1331518	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011979	TTTAA	2	10	1336918	1336927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011979	ATTGC	2	10	1350124	1350133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011979	TTTTG	2	10	1356196	1356205	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011979	TGCCT	2	10	1357735	1357744	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011979	AATTT	2	10	1371957	1371966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011979	GCTTT	2	10	1383333	1383342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011979	CTCCG	2	10	1383512	1383521	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_011979	GAGGG	2	10	1387107	1387116	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011979	TAATT	2	10	1415786	1415795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011979	GAAAG	2	10	1462406	1462415	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011979	GGGAT	2	10	1463180	1463189	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011979	GGAAA	2	10	1469794	1469803	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011979	CAAAA	2	10	1478257	1478266	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011979	TAAAG	2	10	1496051	1496060	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011979	TACAT	2	10	1497579	1497588	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011979	AAGGG	2	10	1523603	1523612	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011979	ACGCA	2	10	1533664	1533673	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011979	GAAGA	2	10	1559767	1559776	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011979	TAAAT	2	10	1559858	1559867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011979	CTATT	2	10	1564660	1564669	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011979	GTCAA	2	10	1564684	1564693	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011979	CTGAT	2	10	1576836	1576845	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011979	ATTTT	2	10	1578022	1578031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011979	AAATC	2	10	1583766	1583775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011979	GGATT	2	10	1637325	1637334	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011979	GCTGC	2	10	1650636	1650645	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_011979	AAGGA	2	10	1697403	1697412	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011979	AAGGG	2	10	1722930	1722939	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011979	GACCA	2	10	1723022	1723031	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011979	AAACA	2	10	1793629	1793638	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011979	CTTTT	2	10	1793747	1793756	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011979	GATTT	2	10	1794815	1794824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011979	GGCGG	2	10	1810065	1810074	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011979	TTATA	2	10	1849326	1849335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011979	AAGGA	2	10	1856658	1856667	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011979	TTAAT	2	10	1868651	1868660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011979	AGGTC	2	10	1892285	1892294	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011979	GCTGT	2	10	1892305	1892314	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011979	GGTTC	2	10	1899819	1899828	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011979	TAATT	2	10	1927268	1927277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011979	CAAAA	2	10	1935336	1935345	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011979	AAGCA	2	10	1951029	1951038	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011979	AAAAG	2	10	1961987	1961996	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011979	TTCCA	2	10	1974865	1974874	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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285	NC_011979	AAAGC	2	10	3612807	3612816	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_011979	TGCGT	2	10	3624363	3624372	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_011979	AACAA	2	10	3631628	3631637	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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301	NC_011979	CACTG	2	10	3887136	3887145	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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325	NC_011979	GGACA	2	10	4163538	4163547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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327	NC_011979	TGGAC	2	10	4220373	4220382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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329	NC_011979	TAAAT	2	10	4238498	4238507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_011979	TTCGT	2	10	4244570	4244579	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
331	NC_011979	GAGCT	2	10	4247569	4247578	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
332	NC_011979	CGAGC	2	10	4253610	4253619	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
333	NC_011979	ATTTG	2	10	4257213	4257222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
334	NC_011979	GTTAT	2	10	4281624	4281633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.