MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 chromosome

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011365	GGGACA	2	12	80430	80441	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011365	ACGGTG	2	12	85202	85213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011365	TCGGCC	2	12	85637	85648	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011365	GGCACC	2	12	86483	86494	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011365	CGCAGG	2	12	86568	86579	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011365	CCGGGG	2	12	87510	87521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011365	AGGGGC	2	12	118161	118172	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011365	GGATCG	2	12	134213	134224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011365	CCGCTC	2	12	144624	144635	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011365	GCGACC	2	12	163980	163991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011365	AACAAG	2	12	175330	175341	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011365	CGATTG	2	12	182653	182664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011365	CGGCTG	2	12	183238	183249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011365	CGGCCA	2	12	195774	195785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011365	GGTCTC	2	12	271313	271324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011365	GAGCGC	2	12	359141	359152	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011365	CCGGAA	2	12	442116	442127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011365	CAGCGC	2	12	511052	511063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011365	TTTGAA	2	12	544381	544392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011365	CATCCG	2	12	568004	568015	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011365	TCTATT	2	12	611074	611085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011365	TAAAAT	2	12	617839	617850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011365	CTGAAC	2	12	619659	619670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011365	TGACCC	2	12	619869	619880	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011365	CCCTGC	2	12	713838	713849	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011365	TATTTT	2	12	837065	837076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011365	CCGGAA	2	12	906864	906875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011365	CCGGCC	2	12	971162	971173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011365	GACCAT	2	12	982350	982361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011365	CACCGT	2	12	1006375	1006386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011365	ACGGCG	2	12	1006920	1006931	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011365	CTGTTC	2	12	1007351	1007362	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011365	GCAGCC	2	12	1012305	1012316	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011365	GCTCGG	2	12	1016334	1016345	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011365	GCATGG	2	12	1019511	1019522	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011365	CGCTTC	2	12	1019681	1019692	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011365	CTCCAT	2	12	1020185	1020196	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011365	CTTGAA	2	12	1061493	1061504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011365	TCGAAG	2	12	1194692	1194703	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011365	TTCACT	2	12	1202221	1202232	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011365	AAGGAC	2	12	1202316	1202327	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011365	CGATTC	2	12	1216939	1216950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011365	CCCTGC	2	12	1220957	1220968	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011365	CCCGCC	2	12	1261440	1261451	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
45	NC_011365	ACCCGC	2	12	1284076	1284087	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011365	CAGCGA	2	12	1288163	1288174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011365	GACACG	2	12	1316006	1316017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011365	GCGATC	2	12	1353288	1353299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011365	CGCCCC	2	12	1422631	1422642	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
50	NC_011365	CGTCCT	2	12	1422645	1422656	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011365	ACCTGT	2	12	1438027	1438038	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011365	GACCTG	2	12	1496494	1496505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011365	TGCGGT	2	12	1510645	1510656	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011365	TCCAGG	2	12	1514614	1514625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011365	TGCCGC	2	12	1514926	1514937	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011365	TTCCGA	2	12	1526921	1526932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011365	GCCGGT	2	12	1581022	1581033	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011365	AAAAAT	2	12	1610616	1610627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011365	CCAATC	2	12	1611837	1611848	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011365	CGGGCC	2	12	1625468	1625479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011365	CAGAAA	2	12	1630257	1630268	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011365	CCCCGG	2	12	1655315	1655326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011365	ATTTTC	2	12	1655403	1655414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011365	ATGAAT	2	12	1708755	1708766	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011365	GGGCAC	2	12	1710619	1710630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011365	TGGGGC	2	12	1710735	1710746	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011365	GCCAAC	2	12	1752849	1752860	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011365	GGGCCA	2	12	1769038	1769049	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011365	ACCAGA	2	12	1809162	1809173	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011365	GGCCGA	2	12	1819039	1819050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011365	GGTGCC	2	12	1844973	1844984	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011365	AACGGC	2	12	1849362	1849373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011365	GGCGCG	2	12	1882354	1882365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011365	CATCCC	2	12	1882460	1882471	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011365	CGCCAT	2	12	1892282	1892293	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011365	TCGGGA	2	12	1902218	1902229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011365	GCACTA	2	12	1919575	1919586	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011365	ACGATC	2	12	1927533	1927544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011365	TCCATG	2	12	1930893	1930904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011365	GGTCAG	2	12	2038605	2038616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011365	CCACCC	2	12	2088114	2088125	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
82	NC_011365	CCGCCC	2	12	2130640	2130651	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
83	NC_011365	CGCGTC	2	12	2144640	2144651	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011365	AAGGAT	2	12	2148345	2148356	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011365	CTTGTT	2	12	2247293	2247304	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011365	TTTTCC	2	12	2267287	2267298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011365	GCCGGC	2	12	2316572	2316583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011365	CGGGGC	2	12	2347943	2347954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011365	CGGTCC	2	12	2348073	2348084	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011365	AGGATA	2	12	2368369	2368380	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011365	AATAAA	2	12	2403450	2403461	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011365	AATGAA	2	12	2418981	2418992	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011365	CTTGTT	2	12	2419398	2419409	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011365	GCGCCC	2	12	2434779	2434790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011365	GGGGAA	2	12	2474865	2474876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011365	TCCGTT	2	12	2491817	2491828	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011365	GGAAGC	2	12	2546495	2546506	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011365	ACGTTG	2	12	2575861	2575872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011365	CAGTTG	2	12	2575983	2575994	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011365	ACCAGA	2	12	2620812	2620823	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011365	CTGGCG	2	12	2686300	2686311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011365	CCTCCA	2	12	2700227	2700238	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011365	CCGCGT	2	12	2780066	2780077	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011365	ATGGCG	2	12	2825696	2825707	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_011365	ATATTG	2	12	2830669	2830680	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011365	GCACCT	2	12	2855995	2856006	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011365	TCTGGT	3	18	2856397	2856414	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011365	TCTGGC	2	12	2856415	2856426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011365	GTCCCG	2	12	2884189	2884200	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011365	ACTGGA	2	12	2884796	2884807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011365	ACGTTC	2	12	2896137	2896148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011365	TGCCGC	2	12	2896481	2896492	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011365	TCGCTC	2	12	2917163	2917174	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011365	GCTCCT	2	12	2921143	2921154	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011365	CTGCCC	2	12	2971620	2971631	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011365	CTGGGT	2	12	2977661	2977672	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011365	GCGGGC	2	12	2978280	2978291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011365	GGCTGG	2	12	2978318	2978329	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011365	ACGCTG	2	12	2978662	2978673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011365	GCGAGG	2	12	2999020	2999031	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011365	CCTTCG	2	12	3035737	3035748	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011365	CGGCCA	2	12	3052936	3052947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011365	GAGAGG	2	12	3052955	3052966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011365	GTTCCA	2	12	3072785	3072796	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011365	TTTCCG	2	12	3327631	3327642	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011365	CGCGTG	2	12	3439492	3439503	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011365	GGGGCA	2	12	3439561	3439572	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011365	GTCTTC	2	12	3452100	3452111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011365	TTCGGG	2	12	3488671	3488682	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_011365	GCGAGG	2	12	3492956	3492967	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_011365	TCTGGT	2	12	3505999	3506010	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_011365	CGCTTG	2	12	3513910	3513921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011365	AAGCTG	2	12	3535972	3535983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_011365	GGCGCG	2	12	3546447	3546458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011365	ACCAGC	2	12	3556018	3556029	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011365	GGGCCC	2	12	3597418	3597429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011365	TCCGGC	2	12	3608801	3608812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011365	GGGGCG	2	12	3635721	3635732	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_011365	CCATGG	2	12	3734497	3734508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011365	GGGCAG	2	12	3748694	3748705	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_011365	ATGGCC	2	12	3780105	3780116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011365	CGCCGG	2	12	3786556	3786567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011365	TCCAGT	2	12	3791405	3791416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011365	CTGGCC	3	18	3819100	3819117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011365	TCGGGT	2	12	3819370	3819381	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_011365	TTCCTG	2	12	3841964	3841975	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011365	CAGCGT	2	12	3846718	3846729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011365	TCGACA	2	12	3847211	3847222	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011365	TTCCCT	2	12	3876695	3876706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.