MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 chromosome

Total Repeats: 528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011365	GACCC	2	10	2742	2751	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_011365	CAATC	2	10	3951	3960	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011365	GCGAT	2	10	8008	8017	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011365	TTGTT	2	10	17089	17098	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011365	GATGC	2	10	21197	21206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011365	GCCGC	2	10	21280	21289	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011365	GAACG	2	10	24096	24105	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011365	CCCCG	2	10	36558	36567	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_011365	CATCC	2	10	45028	45037	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_011365	CCGCT	2	10	49978	49987	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_011365	CATTG	2	10	63667	63676	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011365	AGAGA	2	10	67996	68005	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011365	CTGGA	2	10	84422	84431	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011365	GGGCC	2	10	85649	85658	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011365	GAACG	2	10	85669	85678	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011365	CCGCT	2	10	86791	86800	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_011365	GCGAC	2	10	87110	87119	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011365	GCCGG	2	10	88390	88399	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011365	TCCAG	2	10	88452	88461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011365	ACCGG	2	10	88979	88988	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011365	GTCCG	2	10	95767	95776	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011365	CCGCT	2	10	104463	104472	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_011365	GGGCG	2	10	115553	115562	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011365	TTGCC	2	10	115577	115586	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011365	AACAG	2	10	115602	115611	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011365	GACCG	2	10	140996	141005	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011365	CCGAA	2	10	144650	144659	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011365	CCGCT	2	10	180499	180508	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_011365	TTTAT	2	10	182938	182947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011365	CAGAG	2	10	183060	183069	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011365	GGTGT	2	10	183817	183826	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011365	ACACC	2	10	185137	185146	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_011365	TCCCG	2	10	198523	198532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_011365	CGGAC	2	10	203238	203247	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011365	GCAGG	2	10	204117	204126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011365	CACGA	2	10	218704	218713	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011365	AGCCC	2	10	274468	274477	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_011365	CCCTA	2	10	287573	287582	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_011365	TCCCG	2	10	287618	287627	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_011365	ACCGG	2	10	301819	301828	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011365	CGGTG	2	10	308221	308230	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011365	GCCCG	2	10	309351	309360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_011365	GAAAG	2	10	317963	317972	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011365	GCGGG	2	10	323406	323415	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011365	TGCGC	2	10	326209	326218	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_011365	TCCTT	2	10	334634	334643	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_011365	AGGCA	2	10	348433	348442	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011365	GTCTG	2	10	348515	348524	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011365	CTTCA	2	10	353971	353980	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011365	CCCGC	2	10	356558	356567	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
51	NC_011365	GTTGC	2	10	360136	360145	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011365	TCCTG	2	10	366963	366972	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_011365	GCCTA	2	10	388431	388440	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011365	GGATC	2	10	389307	389316	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011365	AGCCA	2	10	397477	397486	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011365	CGGGC	2	10	409748	409757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_011365	ATGGG	2	10	413806	413815	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011365	TTCGG	2	10	417727	417736	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011365	GGGCA	2	10	419206	419215	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011365	GACGT	2	10	423636	423645	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011365	AAAGG	2	10	423685	423694	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011365	AACCC	2	10	440003	440012	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_011365	ATTCC	2	10	443414	443423	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011365	CGGAC	2	10	451428	451437	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011365	CGGCC	2	10	454492	454501	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_011365	CCGCC	2	10	457565	457574	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
67	NC_011365	TCCTT	2	10	468244	468253	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011365	CCAAC	2	10	475776	475785	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_011365	ACATG	2	10	475934	475943	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011365	GATCG	2	10	483455	483464	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011365	GATCG	2	10	483470	483479	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011365	GGGAC	2	10	495705	495714	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011365	GCCGG	2	10	495748	495757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_011365	GCTGG	2	10	505216	505225	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011365	GGGAG	2	10	513355	513364	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011365	ACGGG	2	10	521611	521620	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011365	CCGTT	2	10	556310	556319	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011365	TGCCA	2	10	557786	557795	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011365	CGGAC	2	10	564635	564644	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011365	ACCGC	2	10	581701	581710	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_011365	TTGAC	2	10	600038	600047	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011365	CCGCA	2	10	600070	600079	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_011365	GTAAA	2	10	611184	611193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011365	AAAAG	2	10	613076	613085	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011365	TTTGT	2	10	613197	613206	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011365	AAAAT	2	10	613532	613541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011365	CGCTC	2	10	613606	613615	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_011365	AAGAA	2	10	613779	613788	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011365	TCTTT	2	10	614402	614411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011365	ATTTT	2	10	614446	614455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011365	TCCAT	2	10	617229	617238	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_011365	TTATC	2	10	617299	617308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011365	TTTCA	2	10	617357	617366	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011365	AACTG	2	10	620036	620045	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011365	TTCTT	2	10	621140	621149	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011365	TATGA	2	10	625790	625799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011365	GCTTT	2	10	629512	629521	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011365	ACAAT	2	10	631297	631306	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011365	GGTTC	2	10	632814	632823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011365	AACAT	2	10	639647	639656	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011365	ATGTT	2	10	639678	639687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011365	CGGAG	2	10	666895	666904	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011365	CCCCG	2	10	671265	671274	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
104	NC_011365	GCCCG	2	10	671847	671856	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_011365	AGCGG	2	10	674972	674981	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011365	GGCCT	2	10	683439	683448	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011365	GTCCT	2	10	694434	694443	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011365	ACACC	2	10	720661	720670	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_011365	CTTGC	2	10	720772	720781	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011365	ACTTC	2	10	736699	736708	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_011365	GCATC	2	10	742144	742153	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_011365	GGTCC	2	10	757017	757026	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011365	GACGG	2	10	759448	759457	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011365	CGGCG	3	15	760461	760475	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_011365	GGCCG	2	10	793829	793838	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011365	CAGAC	2	10	793876	793885	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_011365	TGCCC	2	10	815984	815993	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_011365	CGCGC	2	10	827072	827081	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119	NC_011365	CCCGG	2	10	840823	840832	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_011365	GTAAT	2	10	855711	855720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011365	CGTTG	2	10	855888	855897	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011365	GCCCT	2	10	871766	871775	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_011365	ATATC	2	10	875007	875016	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011365	CGGAC	2	10	876370	876379	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011365	GGCAT	2	10	878630	878639	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011365	CGACG	2	10	896640	896649	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011365	GCCCC	2	10	909120	909129	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
128	NC_011365	GGCGT	2	10	929379	929388	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011365	TCGGG	2	10	929605	929614	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011365	GCCCC	2	10	933033	933042	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
131	NC_011365	GGACG	2	10	952985	952994	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011365	TTTCC	2	10	954676	954685	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_011365	GCGCG	2	10	959315	959324	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_011365	TCCCG	2	10	971134	971143	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_011365	AATAT	2	10	998426	998435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011365	GCAGG	2	10	1004117	1004126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011365	GACGT	2	10	1004439	1004448	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011365	GCGCG	2	10	1005622	1005631	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011365	CCGGA	2	10	1007028	1007037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_011365	CGGAC	2	10	1007133	1007142	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_011365	CGCGG	2	10	1007242	1007251	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011365	GCCGC	2	10	1007461	1007470	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_011365	CGGCG	2	10	1009543	1009552	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_011365	GGTGT	2	10	1016614	1016623	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011365	CGTTG	2	10	1020121	1020130	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011365	TTTCC	2	10	1045661	1045670	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_011365	CGGCG	2	10	1056355	1056364	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
148	NC_011365	TTGAT	2	10	1059370	1059379	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011365	CGGTC	2	10	1063504	1063513	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_011365	GCCCT	2	10	1090033	1090042	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
151	NC_011365	GGCGA	2	10	1107270	1107279	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_011365	CGCAG	2	10	1171316	1171325	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_011365	CCGGC	2	10	1264459	1264468	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
182	NC_011365	GTCCT	2	10	1268822	1268831	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
183	NC_011365	ATGCT	2	10	1269335	1269344	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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216	NC_011365	CCTCG	2	10	1515101	1515110	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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253	NC_011365	GGCGT	2	10	1765524	1765533	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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256	NC_011365	GGGAT	2	10	1793418	1793427	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_011365	CAACC	2	10	1798826	1798835	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
261	NC_011365	GCCCC	2	10	1798884	1798893	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
262	NC_011365	GGTTG	2	10	1815561	1815570	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_011365	GAACG	2	10	1926141	1926150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_011365	AGGCC	2	10	1937986	1937995	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
275	NC_011365	CCTCA	2	10	1938516	1938525	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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281	NC_011365	CTATT	2	10	1948783	1948792	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_011365	CCGGC	2	10	1951762	1951771	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
283	NC_011365	CCGCT	2	10	1967991	1968000	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
284	NC_011365	TTGCC	2	10	1983423	1983432	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_011365	CCCCG	2	10	2082034	2082043	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
287	NC_011365	CTGCC	2	10	2082499	2082508	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
288	NC_011365	CGCGC	2	10	2088064	2088073	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
289	NC_011365	CGGCC	2	10	2093740	2093749	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
290	NC_011365	CCTGT	2	10	2097815	2097824	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
291	NC_011365	ATTCA	2	10	2100817	2100826	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_011365	CATAA	2	10	2109525	2109534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_011365	GTCTC	2	10	2110350	2110359	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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295	NC_011365	TCATG	2	10	2132231	2132240	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
296	NC_011365	GACCG	2	10	2132450	2132459	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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298	NC_011365	CTGTC	2	10	2154224	2154233	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
299	NC_011365	ACCGA	2	10	2154305	2154314	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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301	NC_011365	GTCAA	2	10	2157560	2157569	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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339	NC_011365	CCCCG	2	10	2397707	2397716	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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421	NC_011365	CCGCT	2	10	2905896	2905905	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
422	NC_011365	ATGGG	2	10	2938755	2938764	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
423	NC_011365	TGGCG	2	10	2940264	2940273	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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425	NC_011365	GCCGG	2	10	2958363	2958372	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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462	NC_011365	TCCTT	2	10	3387386	3387395	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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499	NC_011365	GTACG	2	10	3696870	3696879	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
500	NC_011365	GACAG	2	10	3703890	3703899	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

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