MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIPal5I

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010124	CTA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010124	CCA	2	6	79	84	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010124	GTC	2	6	148	153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010124	GAC	2	6	809	814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010124	GTC	2	6	836	841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010124	CGT	2	6	843	848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010124	GAT	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010124	GGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010124	GCC	2	6	1103	1108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010124	CCT	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010124	GTG	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010124	CCA	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010124	CCA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010124	AAG	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010124	AGG	2	6	3936	3941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010124	GAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010124	TGG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010124	TAC	2	6	3975	3980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010124	GCG	2	6	3989	3994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010124	GCC	2	6	4052	4057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010124	AGG	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010124	TCT	2	6	4210	4215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010124	TTC	2	6	4951	4956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010124	TCA	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010124	TGA	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010124	GAA	2	6	8488	8493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010124	GAA	2	6	8497	8502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010124	AAG	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010124	GCC	2	6	9395	9400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010124	GGC	2	6	9407	9412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010124	GAT	2	6	9871	9876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010124	TGG	2	6	9886	9891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010124	TGC	2	6	10005	10010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010124	CGC	2	6	10048	10053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010124	AAG	2	6	19445	19450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010124	AGA	2	6	19483	19488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010124	ATG	2	6	19490	19495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010124	CCG	2	6	20132	20137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010124	GCG	2	6	22088	22093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010124	GAA	2	6	22471	22476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010124	GTG	2	6	22635	22640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010124	GGT	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010124	GCG	2	6	23874	23879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010124	GGT	2	6	23919	23924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010124	GGC	2	6	23983	23988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010124	TGG	2	6	24964	24969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010124	TCA	2	6	25012	25017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010124	GAA	2	6	26741	26746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010124	GAA	2	6	26757	26762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010124	AAG	2	6	26766	26771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010124	GCT	2	6	26938	26943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010124	GAA	2	6	27099	27104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010124	AAG	2	6	27108	27113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010124	AGA	2	6	27125	27130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010124	AAG	2	6	28261	28266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010124	AAG	2	6	28295	28300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010124	GAA	2	6	28310	28315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010124	GGC	2	6	28604	28609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010124	TCC	2	6	28703	28708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010124	GAC	2	6	29717	29722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010124	ATA	3	9	32014	32022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010124	GAT	2	6	32045	32050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010124	TCT	2	6	34938	34943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010124	TGG	2	6	35486	35491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010124	AAT	2	6	35975	35980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010124	TGA	2	6	36027	36032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010124	CCA	2	6	36134	36139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010124	AGC	2	6	36207	36212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010124	CCT	2	6	36887	36892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010124	GTG	2	6	36918	36923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010124	CCT	2	6	37836	37841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010124	CGG	2	6	38532	38537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010124	CTG	2	6	38555	38560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010124	CAA	2	6	38653	38658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010124	CGA	2	6	38671	38676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010124	AGC	2	6	38696	38701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010124	CGC	2	6	38752	38757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_010124	ACC	2	6	38781	38786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010124	GAT	2	6	38797	38802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010124	CCG	2	6	38804	38809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.