MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter uraniireducens Rf4 chromosome

Total Repeats: 602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009483	AGTTA	2	10	36685	36694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009483	TAAAA	2	10	36737	36746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009483	CATGT	2	10	66466	66475	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009483	CGCTC	2	10	96668	96677	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_009483	CCCCA	2	10	117568	117577	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_009483	GAACA	2	10	124516	124525	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009483	TTAAG	2	10	127835	127844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009483	AGGGT	2	10	131104	131113	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009483	GAGAA	2	10	131147	131156	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009483	GGTTT	2	10	138404	138413	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009483	CACGT	2	10	138497	138506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009483	ACGTG	2	10	138507	138516	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009483	AAACC	2	10	138591	138600	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009483	AGAAA	2	10	143047	143056	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009483	GGGGA	2	10	143950	143959	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009483	CATGC	2	10	154589	154598	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009483	TTTAT	2	10	179964	179973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009483	AGTAA	2	10	182932	182941	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009483	AAGGA	2	10	192612	192621	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009483	GGTTC	2	10	204649	204658	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009483	ATTTA	2	10	211530	211539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009483	ATTTT	2	10	211825	211834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009483	GGAAC	2	10	236025	236034	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009483	TAACA	2	10	239880	239889	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009483	CATGC	2	10	291666	291675	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009483	GCATG	2	10	299576	299585	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009483	AAGGA	2	10	310507	310516	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009483	TGTTC	2	10	315845	315854	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009483	ATCAT	2	10	316609	316618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009483	GAGAG	2	10	317208	317217	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009483	TTCCG	2	10	320895	320904	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009483	CATAC	2	10	322193	322202	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009483	GACTT	2	10	323071	323080	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009483	CAAAA	2	10	325376	325385	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009483	TTGAC	2	10	332748	332757	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009483	CGGTG	2	10	342276	342285	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009483	TAAAA	2	10	402801	402810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009483	GAACC	2	10	408030	408039	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009483	GAGGG	2	10	413945	413954	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009483	TGATT	2	10	423773	423782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009483	ATATT	2	10	437039	437048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009483	ATTGT	2	10	444449	444458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009483	GTATT	2	10	448572	448581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009483	AAATT	2	10	448607	448616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009483	TTCAT	2	10	450028	450037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009483	CGAAG	2	10	458197	458206	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009483	AAGGA	2	10	458421	458430	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009483	AGCAC	2	10	460041	460050	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009483	AACTC	2	10	460087	460096	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009483	AGCCA	2	10	470405	470414	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009483	CTCCC	2	10	473314	473323	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
52	NC_009483	TGCAA	2	10	476106	476115	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009483	TGGGG	2	10	478922	478931	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009483	TGATG	2	10	501554	501563	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009483	TTTTA	2	10	512238	512247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009483	CACAG	2	10	515511	515520	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009483	CCAGG	2	10	537540	537549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_009483	CACGT	2	10	550059	550068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009483	ACGTG	2	10	550069	550078	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009483	GAAAG	2	10	560133	560142	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009483	GCATG	2	10	560984	560993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009483	GCAGG	2	10	565880	565889	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009483	ATTAA	2	10	565896	565905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009483	AACGT	2	10	598402	598411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009483	AAAAG	2	10	604659	604668	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009483	CTTTT	2	10	604684	604693	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009483	TATGC	2	10	606376	606385	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009483	AATGT	2	10	606392	606401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009483	CATCT	2	10	613738	613747	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009483	CTCCC	2	10	617127	617136	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
71	NC_009483	CATTC	2	10	633516	633525	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_009483	GGTTT	2	10	654561	654570	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009483	CAAAC	2	10	654747	654756	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009483	TGGGG	2	10	657524	657533	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009483	GTAGT	2	10	663494	663503	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009483	GGGAA	2	10	698118	698127	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009483	ACAAA	2	10	717714	717723	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009483	GCAGT	2	10	718479	718488	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009483	ATGCA	2	10	720348	720357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009483	AGGGG	2	10	723190	723199	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009483	ACCAA	2	10	724804	724813	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_009483	GGTTT	2	10	728673	728682	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009483	AAACC	2	10	728828	728837	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009483	ACGAC	2	10	759769	759778	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009483	CATCT	2	10	761275	761284	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009483	AACGG	2	10	767093	767102	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009483	CATGC	2	10	772669	772678	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_009483	ATTTT	2	10	781599	781608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009483	GGTTT	2	10	781685	781694	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009483	CAAAC	2	10	781870	781879	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009483	CAGAA	2	10	784459	784468	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009483	TTACT	2	10	818446	818455	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009483	AATTC	2	10	824216	824225	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009483	GAGTT	2	10	824387	824396	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009483	TAATT	2	10	830259	830268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009483	TCGGC	2	10	854639	854648	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_009483	CTGAG	2	10	859544	859553	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009483	AGGCA	2	10	884987	884996	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009483	TCCGG	2	10	886058	886067	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_009483	AACAA	2	10	910182	910191	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009483	CTATC	2	10	913812	913821	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009483	ACGAA	2	10	934601	934610	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009483	GAAAA	2	10	939335	939344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009483	TATCA	2	10	946571	946580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009483	AGCAA	2	10	955028	955037	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009483	TCTTA	2	10	960595	960604	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009483	CGGCG	2	10	965185	965194	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009483	CGTCC	2	10	967547	967556	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_009483	CCTTC	2	10	967610	967619	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_009483	TGGTG	2	10	982345	982354	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009483	GAACC	2	10	995985	995994	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009483	TTTTA	2	10	1006760	1006769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009483	AGGGG	2	10	1009370	1009379	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009483	CTGCC	2	10	1010812	1010821	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_009483	TAAAC	2	10	1022847	1022856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009483	TCACC	2	10	1030104	1030113	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_009483	AAAGT	2	10	1034345	1034354	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009483	AATTA	2	10	1042350	1042359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009483	AAGAG	2	10	1048857	1048866	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009483	TAAAG	2	10	1063222	1063231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009483	CACGT	2	10	1068838	1068847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009483	GAAGA	2	10	1074315	1074324	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009483	CAAAA	2	10	1082424	1082433	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009483	AAACG	2	10	1087198	1087207	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009483	GATAG	2	10	1087364	1087373	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009483	AAAAT	2	10	1096217	1096226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009483	CTCCC	2	10	1097357	1097366	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_009483	TCTTT	2	10	1103294	1103303	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009483	CGTCC	2	10	1106405	1106414	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_009483	CTCCC	2	10	1108936	1108945	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
131	NC_009483	CTTGA	2	10	1120294	1120303	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009483	CCGGG	2	10	1129326	1129335	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_009483	TCCTG	2	10	1129521	1129530	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_009483	ATCCG	2	10	1144134	1144143	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_009483	TCCGA	2	10	1168585	1168594	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_009483	CATGC	2	10	1190076	1190085	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009483	GGTTT	2	10	1199484	1199493	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009483	CAAAC	2	10	1199670	1199679	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_009483	GGTTT	2	10	1234159	1234168	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009483	CACGT	2	10	1234252	1234261	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009483	ACGTG	2	10	1234262	1234271	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009483	AAACC	2	10	1234346	1234355	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_009483	TGTGG	2	10	1236241	1236250	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009483	TTGAT	2	10	1237728	1237737	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009483	CCAGG	2	10	1238689	1238698	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_009483	TACTT	2	10	1241367	1241376	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009483	CAAAC	2	10	1247727	1247736	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_009483	ATTTA	2	10	1308035	1308044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009483	CTTCT	2	10	1319751	1319760	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_009483	CACGT	2	10	1391756	1391765	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
162	NC_009483	ACGTG	2	10	1391766	1391775	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_009483	CTCCC	2	10	1396699	1396708	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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173	NC_009483	CCTTG	2	10	1460717	1460726	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_009483	CATGC	2	10	1474788	1474797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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179	NC_009483	TCTTT	2	10	1509042	1509051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_009483	GTATC	2	10	2058782	2058791	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_009483	CATCT	2	10	2296929	2296938	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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270	NC_009483	TTAAG	2	10	2300274	2300283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_009483	CAAAC	2	10	2364246	2364255	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_009483	AAAAG	2	10	2428728	2428737	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_009483	ATTTT	2	10	2431231	2431240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_009483	CGGGA	2	10	2436182	2436191	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
282	NC_009483	GAGGG	2	10	2440966	2440975	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_009483	GGTTT	2	10	2441754	2441763	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
285	NC_009483	GGCGG	2	10	2448918	2448927	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
286	NC_009483	GAAAG	2	10	2454382	2454391	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_009483	ACGTG	2	10	3290219	3290228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
399	NC_009483	AAACC	2	10	3290303	3290312	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
400	NC_009483	ATCAA	2	10	3301319	3301328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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402	NC_009483	AAAAC	2	10	3314619	3314628	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
403	NC_009483	ATTAC	2	10	3314718	3314727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
404	NC_009483	AATGA	2	10	3325337	3325346	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_009483	GAACT	2	10	3339060	3339069	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_009483	GGAAC	2	10	3370827	3370836	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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414	NC_009483	CTCCC	2	10	3376496	3376505	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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419	NC_009483	CCCTC	2	10	3428886	3428895	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
420	NC_009483	CCTTA	2	10	3443093	3443102	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
421	NC_009483	GGTTT	2	10	3450480	3450489	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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