MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 chromosome

Total Repeats: 14041

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009328	AAT	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009328	A	7	7	29	35	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009328	AT	3	6	64	69	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009328	T	6	6	69	74	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009328	TGG	2	6	104	109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009328	GCC	2	6	123	128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009328	T	6	6	129	134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009328	AT	3	6	141	146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009328	ATTT	2	8	157	164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009328	T	7	7	162	168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009328	AGGG	2	8	194	201	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009328	TAC	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009328	TTTTTA	2	12	1671	1682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009328	ATTT	2	8	1693	1700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009328	GGA	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009328	TAA	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009328	AGCT	2	8	2884	2891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009328	GCTGT	2	10	2906	2915	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009328	CTTT	2	8	2984	2991	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009328	TAAAA	2	10	3013	3022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009328	AGCG	2	8	3043	3050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009328	AAAG	2	8	4433	4440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009328	AG	3	6	6386	6391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009328	GCC	2	6	6399	6404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009328	GC	3	6	6438	6443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009328	GCG	2	6	6451	6456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009328	CG	3	6	6455	6460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009328	TCTT	2	8	9035	9042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009328	T	10	10	9041	9050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009328	GGAA	2	8	9071	9078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009328	AAAT	2	8	9095	9102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009328	T	6	6	10242	10247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009328	TAT	2	6	10254	10259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009328	A	7	7	10263	10269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009328	ATAA	2	8	10277	10284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009328	ATCT	2	8	10300	10307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009328	CAA	2	6	10314	10319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009328	A	7	7	10326	10332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009328	ATT	2	6	10377	10382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009328	GA	3	6	10383	10388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009328	AAACA	2	10	10411	10420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009328	GCTT	2	8	10447	10454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009328	GAG	2	6	10482	10487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009328	CTTT	2	8	10607	10614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009328	GGC	2	6	10648	10653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009328	GCG	2	6	10710	10715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009328	GGC	2	6	10822	10827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009328	CGA	2	6	10895	10900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009328	GCA	2	6	10969	10974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009328	CGC	2	6	11016	11021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009328	GAA	2	6	11028	11033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009328	TGT	2	6	11056	11061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009328	GGC	2	6	11090	11095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009328	CAG	2	6	11141	11146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009328	ATT	2	6	11182	11187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009328	AGGAG	2	10	11283	11292	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009328	GGA	2	6	11333	11338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009328	GGC	2	6	11353	11358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009328	GAA	2	6	11597	11602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009328	G	6	6	11658	11663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009328	GGT	2	6	11675	11680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009328	GTC	2	6	11689	11694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009328	TCGTG	2	10	11698	11707	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009328	GGA	2	6	11801	11806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009328	ATC	2	6	11825	11830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009328	AC	3	6	11852	11857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009328	AC	3	6	12021	12026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009328	CAC	2	6	12036	12041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009328	AGCC	2	8	12085	12092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009328	CCT	2	6	12164	12169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009328	AAG	2	6	12321	12326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009328	GTA	2	6	12337	12342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009328	TTG	2	6	12366	12371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009328	AAT	2	6	12379	12384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009328	GGT	2	6	12445	12450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009328	AGG	2	6	12521	12526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009328	CCA	2	6	12551	12556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009328	TGA	2	6	12561	12566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009328	TTC	2	6	12639	12644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009328	AG	3	6	12691	12696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009328	GAA	2	6	12722	12727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009328	AAGC	2	8	12833	12840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009328	GGA	2	6	12956	12961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009328	GAA	2	6	12962	12967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009328	GCG	2	6	12990	12995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009328	CGGC	2	8	13098	13105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009328	TCCC	2	8	13141	13148	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_009328	CGG	2	6	13165	13170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009328	GGA	2	6	13197	13202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009328	GGA	2	6	13284	13289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009328	AGT	2	6	13317	13322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009328	CGT	3	9	13448	13456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009328	ACGT	2	8	13528	13535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009328	AGC	2	6	13858	13863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009328	GCC	2	6	13936	13941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009328	TGG	2	6	14013	14018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009328	ACA	2	6	14164	14169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009328	ACC	2	6	14185	14190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009328	G	6	6	14210	14215	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009328	AGG	2	6	14220	14225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009328	GGC	2	6	14238	14243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009328	GAG	2	6	14413	14418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009328	GC	3	6	14430	14435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009328	TGA	2	6	14505	14510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009328	CGG	2	6	14673	14678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009328	GA	3	6	14771	14776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009328	TAC	2	6	14790	14795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009328	ACC	2	6	14944	14949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009328	GGT	2	6	15167	15172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009328	CGT	2	6	15362	15367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009328	CGT	2	6	15388	15393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009328	GAG	2	6	15411	15416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009328	C	6	6	15538	15543	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_009328	ATCG	2	8	15651	15658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009328	GGC	2	6	15679	15684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009328	CTT	2	6	15713	15718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009328	CCA	2	6	15720	15725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009328	GTG	2	6	15775	15780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009328	GCT	2	6	15878	15883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009328	GAAA	2	8	15888	15895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009328	CTG	2	6	15899	15904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009328	CAG	2	6	15912	15917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009328	TTG	2	6	16922	16927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009328	T	7	7	16962	16968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009328	AGT	2	6	16980	16985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009328	GTT	2	6	16993	16998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009328	CTA	2	6	17002	17007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009328	ATA	2	6	17008	17013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009328	T	7	7	18555	18561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009328	AGG	2	6	18594	18599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009328	T	7	7	19988	19994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009328	TAAAA	2	10	20022	20031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009328	ATC	2	6	20040	20045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009328	TAG	2	6	21617	21622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009328	CGTC	2	8	21627	21634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009328	AG	3	6	21640	21645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009328	GGTG	2	8	21648	21655	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009328	AGG	2	6	21668	21673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009328	ATCC	2	8	21683	21690	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009328	GCC	2	6	21738	21743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009328	TGG	2	6	21769	21774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009328	TAA	2	6	21841	21846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009328	TGG	2	6	21848	21853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009328	AGG	2	6	21857	21862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009328	GTTG	2	8	23174	23181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009328	A	7	7	23348	23354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009328	CCG	2	6	23356	23361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_009328	T	7	7	23374	23380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_009328	GGC	2	6	29800	29805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_009328	CCG	2	6	48086	48091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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445	NC_009328	GGA	2	6	88505	88510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_009328	TTC	2	6	89157	89162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_009328	AG	3	6	89209	89214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_009328	GAA	2	6	89480	89485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
461	NC_009328	GCG	2	6	89508	89513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_009328	TCCC	2	8	89659	89666	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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465	NC_009328	GGA	2	6	89715	89720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_009328	AGC	2	6	90377	90382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_009328	GCC	2	6	90455	90460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
471	NC_009328	TGG	2	6	90532	90537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
472	NC_009328	ACA	2	6	90683	90688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_009328	GA	3	6	91292	91297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_009328	TAC	2	6	91311	91316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_009328	ACC	2	6	91465	91470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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