MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Gramella forsetii KT0803 chromosome

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008571	GCTTCA	2	12	3245	3256	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008571	TTTGAA	2	12	14277	14288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008571	CTTTAT	2	12	54234	54245	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008571	ATTCCG	2	12	99294	99305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008571	TTACTT	2	12	179567	179578	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008571	ACAATT	2	12	208515	208526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008571	TTATTT	2	12	244384	244395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008571	AATTTA	2	12	278082	278093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008571	ATTTTA	2	12	334561	334572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008571	TTAAGT	2	12	336602	336613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008571	TTTTTC	2	12	363433	363444	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008571	ATGTGT	2	12	367160	367171	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008571	TTAATA	2	12	509716	509727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008571	GTGTTT	2	12	535133	535144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008571	TGAAAT	2	12	535171	535182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008571	TAAAAA	2	12	535403	535414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008571	TTAGAA	2	12	553262	553273	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008571	TTTTTC	2	12	574173	574184	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008571	TTCTAT	2	12	574284	574295	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008571	AATTCT	2	12	678052	678063	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008571	TGGTAG	2	12	679087	679098	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008571	CGTTGA	2	12	679167	679178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008571	GAGAAT	2	12	742789	742800	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008571	AAAAGT	2	12	784354	784365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008571	ATGAAT	2	12	807489	807500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008571	TCTCTT	2	12	838585	838596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008571	GTTTTT	2	12	905262	905273	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008571	AAATTT	2	12	928121	928132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008571	AAAAAT	2	12	934384	934395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008571	TGAAAT	2	12	948444	948455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008571	ACGGTT	2	12	952284	952295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008571	ACGGTT	2	12	952914	952925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008571	ACGGTT	2	12	954043	954054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008571	ACGGTT	2	12	955944	955955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008571	AATTTG	2	12	965026	965037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008571	AATTTG	2	12	965389	965400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008571	ACGGTT	2	12	966808	966819	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008571	ATTAGT	2	12	969734	969745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008571	ACGGTT	2	12	974940	974951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008571	AATTTG	2	12	982404	982415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008571	ACGGTT	2	12	992474	992485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008571	ACGGTT	2	12	1008256	1008267	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008571	ACGGTT	2	12	1010307	1010318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008571	TATTTT	2	12	1015075	1015086	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008571	ACGGTT	2	12	1015230	1015241	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008571	AATTTG	2	12	1018939	1018950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008571	TTAGAA	2	12	1032030	1032041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008571	TTTGAA	2	12	1035062	1035073	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008571	ATATTT	2	12	1036412	1036423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008571	CTTTTT	2	12	1053562	1053573	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008571	TTTAAA	2	12	1059535	1059546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008571	TAAATG	2	12	1110327	1110338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008571	GTTATT	2	12	1112403	1112414	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008571	TAAAAT	2	12	1130880	1130891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008571	CTTTTA	2	12	1164592	1164603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008571	TAAAAA	2	12	1188939	1188950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008571	TTCTAT	2	12	1194740	1194751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008571	AATTAA	2	12	1269206	1269217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008571	TATAAT	2	12	1276869	1276880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008571	TTCTAA	2	12	1283369	1283380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008571	TTTTAG	2	12	1299614	1299625	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008571	ATTTAA	2	12	1301348	1301359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008571	ATGCTT	2	12	1309423	1309434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008571	ATAATT	2	12	1321843	1321854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008571	ATTAAA	2	12	1370985	1370996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008571	CATTTC	2	12	1400114	1400125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008571	CTAATT	2	12	1400234	1400245	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008571	CTTTTA	2	12	1430084	1430095	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008571	TATTTA	2	12	1439637	1439648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008571	TGCTTT	2	12	1457960	1457971	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008571	TTGGTT	2	12	1464827	1464838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008571	AAAAAG	2	12	1497872	1497883	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008571	ACTTTC	2	12	1574541	1574552	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008571	AAACCT	2	12	1574814	1574825	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008571	TTTAAG	2	12	1590083	1590094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008571	CAGTTT	2	12	1603186	1603197	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008571	TAAAAA	2	12	1615840	1615851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008571	TAATTC	2	12	1650731	1650742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008571	TTTTTA	2	12	1651752	1651763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008571	TACAAA	2	12	1820198	1820209	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008571	TCAAAA	2	12	1859272	1859283	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008571	AACTTC	2	12	1861721	1861732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008571	GAAAAA	2	12	1888300	1888311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008571	TTTTAA	2	12	1892837	1892848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008571	AATGTA	2	12	1965092	1965103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008571	ATTTTA	2	12	1980567	1980578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008571	CTCTAT	2	12	1988178	1988189	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008571	TCAACG	2	12	1991167	1991178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008571	CTACCA	2	12	1991247	1991258	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008571	TAGAAT	2	12	1992281	1992292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008571	TTCTAT	2	12	2019146	2019157	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008571	TTATTT	2	12	2086389	2086400	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008571	TTGGGG	2	12	2091677	2091688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008571	ATTTAA	2	12	2142151	2142162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008571	TGATTT	2	12	2205033	2205044	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008571	AGATAA	2	12	2221746	2221757	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008571	AAAAGG	2	12	2237348	2237359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008571	AAAAAT	2	12	2309220	2309231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008571	TTATTT	2	12	2318321	2318332	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008571	ATTATA	2	12	2320680	2320691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008571	AGAAAA	2	12	2323787	2323798	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008571	TAAATA	2	12	2345835	2345846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008571	AAAAAG	2	12	2388044	2388055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008571	AAAAAT	2	12	2414970	2414981	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008571	TTGTTT	2	12	2466739	2466750	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008571	GTAATT	2	12	2484901	2484912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008571	AACATT	2	12	2487331	2487342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008571	TGTAAT	2	12	2533142	2533153	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008571	TTTGTT	2	12	2587068	2587079	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008571	CTTTTT	2	12	2590871	2590882	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008571	CTTTTT	2	12	2590955	2590966	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008571	TTTGTT	2	12	2601627	2601638	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008571	TTAAAT	2	12	2626377	2626388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008571	TAAAAA	2	12	2648563	2648574	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008571	TTTCCC	2	12	2662486	2662497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008571	CATTTC	2	12	2679355	2679366	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008571	TTTTTA	2	12	2682456	2682467	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008571	ATAGCT	2	12	2686045	2686056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008571	TTTTCC	2	12	2709613	2709624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008571	AGTTTC	2	12	2743231	2743242	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_008571	AAGTCA	2	12	2775773	2775784	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008571	ACCACT	2	12	2796557	2796568	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008571	GAAAAT	2	12	2796685	2796696	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008571	ATATTT	2	12	2823717	2823728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008571	AACAGC	2	12	2833874	2833885	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008571	GCAGTT	2	12	2912187	2912198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008571	TCAACG	2	12	3043536	3043547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008571	CTACCA	2	12	3043616	3043627	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008571	TAGAAT	2	12	3044650	3044661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008571	AGAATC	2	12	3077037	3077048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008571	GCTATG	2	12	3104517	3104528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_008571	ATTCTA	2	12	3104681	3104692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_008571	ATAATT	2	12	3155809	3155820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008571	AATTAA	2	12	3165120	3165131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008571	AATCTA	2	12	3201717	3201728	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_008571	TAACTA	2	12	3296206	3296217	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_008571	AAATAT	2	12	3347668	3347679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008571	TATTTA	2	12	3351734	3351745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.