MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Granulibacter bethesdensis CGDNIH1 chromosome

Total Repeats: 4569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008343	GA	4	8	1287337	1287344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_008343	AAAT	2	8	1288978	1288985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_008343	CGA	2	6	1289071	1289076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_008343	T	6	6	1289120	1289125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_008343	GCT	2	6	1289134	1289139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_008343	C	6	6	1289168	1289173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2007	NC_008343	CG	3	6	1289179	1289184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_008343	T	6	6	1289192	1289197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_008343	CGG	2	6	1290913	1290918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_008343	CGGC	2	8	1294526	1294533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2011	NC_008343	ATT	2	6	1294556	1294561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_008343	AC	3	6	1294568	1294573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2013	NC_008343	ACA	2	6	1294645	1294650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_008343	CCT	2	6	1294680	1294685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2015	NC_008343	ATG	2	6	1295533	1295538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_008343	GGTA	2	8	1295551	1295558	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_008343	AGC	2	6	1296554	1296559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_008343	CCGT	2	8	1296614	1296621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2019	NC_008343	ATG	2	6	1296663	1296668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_008343	GGT	3	9	1296670	1296678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_008343	ACG	2	6	1296727	1296732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_008343	GGC	2	6	1296797	1296802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_008343	GT	3	6	1296820	1296825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_008343	GC	3	6	1296846	1296851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2025	NC_008343	GC	3	6	1296873	1296878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2026	NC_008343	ATT	2	6	1296905	1296910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_008343	ATCG	2	8	1296962	1296969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2028	NC_008343	TCGC	2	8	1297642	1297649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2029	NC_008343	TGA	2	6	1297693	1297698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_008343	TTA	2	6	1297717	1297722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_008343	AGTT	2	8	1297727	1297734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_008343	AGG	2	6	1297748	1297753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_008343	GAG	2	6	1298588	1298593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_008343	TGG	2	6	1303114	1303119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_008343	TTCCG	2	10	1303122	1303131	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2036	NC_008343	CGA	3	9	1303165	1303173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_008343	CGAA	2	8	1303267	1303274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2038	NC_008343	ATT	2	6	1303303	1303308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_008343	TCGG	2	8	1303809	1303816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2040	NC_008343	GAA	2	6	1303901	1303906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_008343	AAT	2	6	1304767	1304772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_008343	T	6	6	1304806	1304811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_008343	C	7	7	1304854	1304860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2044	NC_008343	GC	3	6	1305887	1305892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_008343	GCG	2	6	1305907	1305912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_008343	CATG	2	8	1306002	1306009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2047	NC_008343	GTC	2	6	1306055	1306060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2048	NC_008343	TGG	2	6	1306061	1306066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_008343	TCGA	2	8	1306208	1306215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2050	NC_008343	ATC	2	6	1307199	1307204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_008343	T	6	6	1307219	1307224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_008343	T	6	6	1307231	1307236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_008343	ATT	2	6	1307262	1307267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_008343	CCA	2	6	1307292	1307297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2055	NC_008343	CGCGC	2	10	1307305	1307314	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2056	NC_008343	A	7	7	1307364	1307370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_008343	CAA	2	6	1308087	1308092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_008343	TTC	2	6	1308115	1308120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_008343	TCG	2	6	1308221	1308226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2060	NC_008343	CGC	2	6	1308288	1308293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2061	NC_008343	TTC	2	6	1308298	1308303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_008343	CGGC	2	8	1314443	1314450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2063	NC_008343	GA	3	6	1314477	1314482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_008343	A	7	7	1314594	1314600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_008343	CGGCT	2	10	1314652	1314661	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2066	NC_008343	CGG	2	6	1314664	1314669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_008343	A	6	6	1314680	1314685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_008343	AT	4	8	1314689	1314696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_008343	TGA	2	6	1314824	1314829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2071	NC_008343	TCA	2	6	1315006	1315011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2072	NC_008343	ATC	2	6	1315035	1315040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2073	NC_008343	GCT	2	6	1315076	1315081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2074	NC_008343	A	6	6	1315098	1315103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_008343	TG	3	6	1315126	1315131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_008343	CCGCG	2	10	1315149	1315158	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2077	NC_008343	TGC	2	6	1315165	1315170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2079	NC_008343	GA	3	6	1315274	1315279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_008343	GCC	2	6	1316593	1316598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2081	NC_008343	TGGTT	2	10	1316613	1316622	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2085	NC_008343	TCTT	2	8	1317143	1317150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2087	NC_008343	T	6	6	1324388	1324393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_008343	GCC	2	6	1324411	1324416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2089	NC_008343	ATG	2	6	1324428	1324433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_008343	TGA	2	6	1324456	1324461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_008343	CCGAA	2	10	1324473	1324482	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2092	NC_008343	ATA	2	6	1326413	1326418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_008343	A	6	6	1326418	1326423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_008343	GCG	2	6	1329014	1329019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2095	NC_008343	ATA	2	6	1330570	1330575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_008343	CTT	2	6	1330608	1330613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_008343	ATT	2	6	1330619	1330624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_008343	CTT	2	6	1331495	1331500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2099	NC_008343	TCT	2	6	1334027	1334032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_008343	TGT	2	6	1334046	1334051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_008343	AT	4	8	1334101	1334108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_008343	ATT	2	6	1334125	1334130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_008343	CCCTG	2	10	1337732	1337741	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2104	NC_008343	GGA	2	6	1337768	1337773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_008343	CCAC	2	8	1339418	1339425	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2106	NC_008343	TGC	2	6	1341387	1341392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_008343	GAAA	2	8	1341416	1341423	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_008343	CAG	2	6	1344100	1344105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2109	NC_008343	AGG	2	6	1344148	1344153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_008343	TGTTA	2	10	1344161	1344170	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_008343	CGC	2	6	1344187	1344192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2112	NC_008343	GCC	2	6	1344207	1344212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2113	NC_008343	GC	3	6	1345160	1345165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2114	NC_008343	TGA	2	6	1345169	1345174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_008343	AAT	2	6	1347283	1347288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_008343	TCA	2	6	1347340	1347345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_008343	AT	3	6	1350410	1350415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_008343	T	6	6	1350633	1350638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_008343	GCA	2	6	1350639	1350644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_008343	GAA	2	6	1350655	1350660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_008343	A	6	6	1350659	1350664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_008343	GTA	2	6	1351228	1351233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_008343	CT	3	6	1351236	1351241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2124	NC_008343	AGT	2	6	1354646	1354651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_008343	ATG	2	6	1354745	1354750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_008343	GCA	2	6	1354758	1354763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_008343	GTG	2	6	1354775	1354780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_008343	T	6	6	1355326	1355331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_008343	TTC	2	6	1358554	1358559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_008343	TGT	2	6	1358579	1358584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_008343	AGC	2	6	1358593	1358598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_008343	GAA	2	6	1358634	1358639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_008343	C	7	7	1358650	1358656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2134	NC_008343	GAG	2	6	1358659	1358664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_008343	TC	3	6	1360361	1360366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2136	NC_008343	GCCGG	2	10	1362763	1362772	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2137	NC_008343	CAG	2	6	1364312	1364317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2139	NC_008343	GCTT	2	8	1369393	1369400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2140	NC_008343	GCC	2	6	1369922	1369927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2141	NC_008343	GCCCT	2	10	1370174	1370183	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2142	NC_008343	GGC	2	6	1370307	1370312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2146	NC_008343	CTG	2	6	1370473	1370478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2148	NC_008343	CGG	2	6	1370533	1370538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2155	NC_008343	GGC	2	6	1371278	1371283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2164	NC_008343	CGG	2	6	1380322	1380327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2174	NC_008343	A	6	6	1383447	1383452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2175	NC_008343	TTC	2	6	1383462	1383467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2193	NC_008343	CCAGT	2	10	1412787	1412796	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2215	NC_008343	CAGCG	2	10	1427160	1427169	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2218	NC_008343	TC	3	6	1427272	1427277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2219	NC_008343	T	6	6	1427278	1427283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2220	NC_008343	T	6	6	1427320	1427325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2221	NC_008343	TGAATA	2	12	1427333	1427344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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2223	NC_008343	CCT	2	6	1430208	1430213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2230	NC_008343	CTAA	2	8	1445706	1445713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2231	NC_008343	T	6	6	1445758	1445763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2232	NC_008343	TCC	2	6	1445956	1445961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2234	NC_008343	A	6	6	1446854	1446859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2240	NC_008343	A	6	6	1447647	1447652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2241	NC_008343	CAA	2	6	1447686	1447691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2242	NC_008343	GCC	2	6	1450159	1450164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2243	NC_008343	AGC	2	6	1450189	1450194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NC_008343	TCA	3	9	1450218	1450226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2245	NC_008343	CAG	2	6	1450283	1450288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2246	NC_008343	GCTT	2	8	1450290	1450297	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2247	NC_008343	GCA	2	6	1450313	1450318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2248	NC_008343	TAGCC	2	10	1451658	1451667	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2249	NC_008343	TCA	2	6	1451741	1451746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2250	NC_008343	TGC	2	6	1452659	1452664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_008343	CAT	2	6	1452681	1452686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_008343	A	6	6	1454227	1454232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_008343	GCGG	2	8	1454280	1454287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2254	NC_008343	CAC	2	6	1454349	1454354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2255	NC_008343	CCGTAC	2	12	1454362	1454373	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2256	NC_008343	AGC	2	6	1454394	1454399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2257	NC_008343	AAG	2	6	1454409	1454414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2258	NC_008343	CGG	2	6	1454415	1454420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2259	NC_008343	AAC	2	6	1456012	1456017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2260	NC_008343	CTG	2	6	1456063	1456068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2261	NC_008343	CAT	2	6	1456070	1456075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2263	NC_008343	GAA	2	6	1456104	1456109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2387	NC_008343	TTGG	2	8	1530989	1530996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2389	NC_008343	TCT	2	6	1531037	1531042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2396	NC_008343	GC	3	6	1534322	1534327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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