MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Granulibacter bethesdensis CGDNIH1 chromosome

Total Repeats: 4569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008343	GC	3	6	2638949	2638954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_008343	ATT	2	6	2639205	2639210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_008343	ATTC	2	8	2646150	2646157	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_008343	CTG	2	6	2648461	2648466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_008343	CGG	2	6	2648470	2648475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_008343	CCA	2	6	2655822	2655827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_008343	CAT	2	6	2655845	2655850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_008343	ACCG	2	8	2655881	2655888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_008343	CCAC	2	8	2655900	2655907	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4510	NC_008343	TCC	2	6	2655918	2655923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_008343	TCT	2	6	2656359	2656364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_008343	ACT	2	6	2656376	2656381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_008343	TAA	2	6	2656434	2656439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_008343	A	6	6	2656442	2656447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_008343	T	6	6	2656457	2656462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_008343	CTTT	2	8	2656497	2656504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_008343	AAT	2	6	2656923	2656928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_008343	CCTG	2	8	2656978	2656985	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_008343	T	6	6	2656998	2657003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_008343	A	8	8	2660032	2660039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_008343	A	6	6	2660049	2660054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_008343	T	6	6	2660077	2660082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_008343	AGAA	2	8	2665992	2665999	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_008343	GGC	2	6	2666004	2666009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_008343	TGC	2	6	2668968	2668973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_008343	TGG	2	6	2669053	2669058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_008343	ATC	2	6	2669817	2669822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_008343	T	6	6	2671038	2671043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_008343	TGG	2	6	2671079	2671084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_008343	G	6	6	2671083	2671088	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_008343	A	6	6	2674849	2674854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_008343	AC	3	6	2674875	2674880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_008343	GCG	2	6	2677556	2677561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_008343	ACC	2	6	2677585	2677590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_008343	TTC	2	6	2677606	2677611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_008343	C	6	6	2677611	2677616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4537	NC_008343	GGCA	2	8	2677680	2677687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4538	NC_008343	CAGC	2	8	2677791	2677798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_008343	AAG	2	6	2677823	2677828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_008343	GGAAT	2	10	2677893	2677902	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_008343	TGAAT	2	10	2677916	2677925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_008343	CCA	2	6	2680245	2680250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_008343	GAA	2	6	2682986	2682991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_008343	A	7	7	2683026	2683032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008343	AGC	2	6	2684798	2684803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_008343	TATC	2	8	2684844	2684851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_008343	AAAG	2	8	2684882	2684889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_008343	TGCC	2	8	2684900	2684907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_008343	CGG	2	6	2687435	2687440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_008343	CAC	3	9	2687461	2687469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_008343	TCA	2	6	2687517	2687522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_008343	TCA	2	6	2687532	2687537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_008343	GCAA	2	8	2687543	2687550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_008343	AGA	2	6	2687591	2687596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_008343	A	6	6	2687600	2687605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_008343	TTCT	2	8	2688616	2688623	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_008343	AGC	2	6	2689507	2689512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_008343	AAT	2	6	2689535	2689540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_008343	TGC	2	6	2691812	2691817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_008343	CGGCA	2	10	2691823	2691832	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4561	NC_008343	AAT	2	6	2693286	2693291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_008343	TAA	2	6	2693312	2693317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_008343	GAA	2	6	2693427	2693432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_008343	GATA	2	8	2693433	2693440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_008343	AGGAA	2	10	2697714	2697723	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_008343	GGAAA	2	10	2701441	2701450	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_008343	CAC	2	6	2701451	2701456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_008343	AGGC	2	8	2701478	2701485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_008343	GCC	2	6	2707891	2707896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.