MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter metallireducens GS-15 chromosome

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007517	GAAGGC	2	12	2981	2992	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007517	ACGAAG	2	12	34712	34723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007517	GGAGGT	2	12	76548	76559	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007517	TCATTA	2	12	100258	100269	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007517	CACGCG	2	12	101035	101046	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007517	AAATAA	2	12	118186	118197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007517	TACTAT	2	12	139977	139988	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007517	GGAAGG	2	12	163494	163505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007517	AGCCCG	2	12	173493	173504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007517	CGGTGC	2	12	210403	210414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007517	TTCTTT	2	12	249907	249918	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007517	GATTTT	2	12	265168	265179	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007517	GAAAGG	2	12	274091	274102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007517	ATGGGA	2	12	333698	333709	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007517	CTTTTC	2	12	339117	339128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007517	CGAGCC	2	12	352664	352675	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007517	GGGGGA	2	12	460936	460947	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007517	TTTCAA	2	12	463503	463514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007517	ATTCTT	2	12	471021	471032	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007517	GCAGAA	2	12	569535	569546	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007517	TCTTTT	2	12	581653	581664	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007517	AGGCCT	2	12	683695	683706	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007517	CTTTTG	2	12	715010	715021	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007517	CAATGT	2	12	774137	774148	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007517	GGGTCG	2	12	793763	793774	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007517	CGAGGG	2	12	847985	847996	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007517	GGTGAC	2	12	849149	849160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007517	GATAGC	2	12	860817	860828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007517	TTTCGG	2	12	894142	894153	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007517	CTTGAT	2	12	897055	897066	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007517	GGGATG	2	12	936356	936367	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007517	TTGCCG	2	12	938749	938760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007517	ATGAGC	2	12	958257	958268	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007517	GGGAAG	2	12	967749	967760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007517	CAGTTT	2	12	984264	984275	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007517	ATTTCA	2	12	1079752	1079763	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007517	AGGCGA	2	12	1093610	1093621	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007517	ATGGAG	2	12	1118298	1118309	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007517	CAAGGC	2	12	1161092	1161103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007517	TATCGC	2	12	1212042	1212053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007517	TTTGTC	2	12	1220420	1220431	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007517	ATGGCG	2	12	1270929	1270940	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007517	TCGCGT	2	12	1276265	1276276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007517	TCGTTT	2	12	1292605	1292616	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007517	GGGGTG	2	12	1309808	1309819	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007517	CGGTGA	2	12	1337814	1337825	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007517	GGGAAT	2	12	1356062	1356073	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007517	ATTCAA	2	12	1411488	1411499	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007517	ATAACC	2	12	1454230	1454241	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007517	ATCAAG	2	12	1539385	1539396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007517	TTATTG	2	12	1689311	1689322	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007517	TTTTCT	2	12	1760609	1760620	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007517	AAGGGG	2	12	1768068	1768079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007517	GGGGAA	2	12	1803120	1803131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007517	GGGGAG	2	12	1808747	1808758	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007517	CGGCCG	2	12	1810125	1810136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007517	AAAAGG	2	12	1827497	1827508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007517	TCTTGG	2	12	1843231	1843242	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007517	AGATAT	2	12	1888779	1888790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007517	TAAATA	2	12	1890392	1890403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007517	TGGGGT	2	12	1972739	1972750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007517	CAATAT	2	12	2023732	2023743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007517	CTTGAA	2	12	2045563	2045574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007517	GAAGCA	2	12	2130035	2130046	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007517	CCGCAA	2	12	2218708	2218719	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007517	ACCCCT	2	12	2262040	2262051	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007517	AACATC	2	12	2281702	2281713	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007517	AATTTA	2	12	2285859	2285870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007517	TATTAA	2	12	2286942	2286953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007517	ATATTT	2	12	2287480	2287491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007517	TCCCTC	2	12	2362177	2362188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007517	TACATG	2	12	2364429	2364440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007517	AATTTC	2	12	2477594	2477605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007517	ATGTTG	2	12	2560075	2560086	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007517	TGATAC	2	12	2753620	2753631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007517	AACCTG	2	12	2766100	2766111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007517	GGACAC	2	12	2769937	2769948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007517	TCGTAT	2	12	2786624	2786635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007517	TATTTT	2	12	2790272	2790283	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007517	ACCGGC	2	12	2824183	2824194	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007517	TCGAAG	2	12	2826606	2826617	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007517	AGAAGC	2	12	2836539	2836550	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007517	TCGAGA	2	12	2933786	2933797	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007517	ACATCC	2	12	2955008	2955019	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007517	TCCCCG	2	12	2970011	2970022	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007517	AAATAA	2	12	2976802	2976813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007517	CTTTCC	2	12	2978793	2978804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007517	TTCTCT	2	12	2999590	2999601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007517	CCGCAA	2	12	3044120	3044131	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007517	TCTGGG	2	12	3085653	3085664	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007517	CCATCG	2	12	3155398	3155409	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007517	CGCCGG	2	12	3181533	3181544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007517	CCGTAC	2	12	3334363	3334374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007517	ATGAAT	2	12	3334396	3334407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007517	AATTTT	2	12	3372676	3372687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007517	CAAAAA	2	12	3404171	3404182	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007517	GCAGGG	2	12	3434067	3434078	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007517	CCATCG	2	12	3465408	3465419	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007517	CGGCCA	2	12	3468152	3468163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007517	GGATGG	2	12	3482150	3482161	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007517	GCTCAC	2	12	3512272	3512283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007517	ATCGTC	2	12	3524660	3524671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007517	ACCACT	2	12	3531025	3531036	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007517	TATTTT	2	12	3540016	3540027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007517	GACCGG	2	12	3557880	3557891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007517	TCGATA	2	12	3563661	3563672	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007517	TCCGTT	2	12	3604302	3604313	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007517	ACTCCC	2	12	3615152	3615163	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007517	TTTTCA	2	12	3659945	3659956	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_007517	CAATAC	2	12	3697998	3698009	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007517	CATTGC	2	12	3700697	3700708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007517	TCCTTC	2	12	3750973	3750984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007517	TCCCTT	2	12	3751040	3751051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007517	CAAAAA	2	12	3757361	3757372	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007517	ATCAAC	2	12	3772607	3772618	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007517	ATGGCA	2	12	3798722	3798733	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007517	TTTTCT	2	12	3802622	3802633	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007517	AGTAAA	2	12	3843263	3843274	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007517	CCCTTT	2	12	3852041	3852052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007517	CCCTCC	2	12	3866298	3866309	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
121	NC_007517	GTTTGA	2	12	3882436	3882447	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007517	ACCTGG	2	12	3892925	3892936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007517	GTTGAT	2	12	3893420	3893431	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007517	TCGTAT	2	12	3931113	3931124	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.