MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter metallireducens GS-15 chromosome

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007517	TTTTC	2	10	24441	24450	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007517	TCCGG	2	10	26233	26242	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_007517	TAGGG	2	10	40115	40124	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007517	CCTCT	2	10	62174	62183	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_007517	GTCAA	2	10	80877	80886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007517	GCCAT	2	10	98338	98347	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007517	GGCGC	2	10	140928	140937	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007517	GGTTC	2	10	156616	156625	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007517	GTCAA	2	10	165016	165025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007517	TTCCG	2	10	213262	213271	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_007517	GAAAA	2	10	213856	213865	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007517	CGGCG	2	10	221973	221982	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007517	TCAAT	2	10	232375	232384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007517	AGGCG	2	10	257793	257802	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007517	TCTCC	2	10	260175	260184	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_007517	CTCTC	2	10	262478	262487	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_007517	TGATT	2	10	265077	265086	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007517	GAGGC	2	10	265304	265313	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007517	TTAAT	2	10	268675	268684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007517	TTCGC	2	10	289287	289296	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007517	CTCTG	2	10	296797	296806	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007517	CCGAC	2	10	302240	302249	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_007517	TCAAT	2	10	315523	315532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007517	AGAAA	2	10	325918	325927	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007517	TCCAT	2	10	338156	338165	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007517	TCCCT	2	10	339612	339621	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_007517	TGCCG	2	10	342481	342490	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007517	GCCGC	2	10	374918	374927	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_007517	TTTTA	2	10	384400	384409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007517	GTCTC	2	10	398424	398433	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007517	TTCCC	2	10	445068	445077	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_007517	CGTGG	2	10	485830	485839	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007517	GCCGG	2	10	511152	511161	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_007517	CTGTC	2	10	549861	549870	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_007517	GCCCG	2	10	552050	552059	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_007517	GAGGG	2	10	552207	552216	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007517	TGTCG	2	10	562804	562813	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007517	CGGGG	2	10	572174	572183	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007517	CCTTT	2	10	575378	575387	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007517	CAGCG	2	10	590961	590970	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_007517	AGGGG	2	10	601115	601124	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007517	CGCTC	2	10	609909	609918	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_007517	GCGAT	2	10	655647	655656	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007517	ACCGA	2	10	665417	665426	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007517	TTTGC	2	10	678004	678013	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007517	CAGTT	2	10	715025	715034	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007517	CCAAG	2	10	715079	715088	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_007517	GACCT	2	10	725719	725728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007517	TTTCC	2	10	733536	733545	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_007517	GTGCA	2	10	760551	760560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007517	CAATA	2	10	760565	760574	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007517	AAGGA	2	10	768014	768023	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007517	GCCGG	2	10	786529	786538	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007517	GTTTT	2	10	791335	791344	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007517	CTCTC	2	10	793824	793833	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_007517	TCTTT	2	10	801073	801082	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007517	CATTA	2	10	802351	802360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007517	GTTCC	2	10	803261	803270	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_007517	CAATA	2	10	806500	806509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007517	GAGGG	2	10	825313	825322	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007517	AGGGG	2	10	883654	883663	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007517	GCCGC	2	10	895676	895685	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_007517	GGAAA	2	10	897906	897915	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007517	TGAAA	2	10	899011	899020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007517	TTTTA	2	10	899228	899237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007517	TCTCC	2	10	910992	911001	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_007517	GGTGG	2	10	943510	943519	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007517	GCTTT	2	10	958762	958771	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_007517	GGAGC	2	10	960026	960035	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007517	GAGAG	2	10	992080	992089	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007517	GGGAA	2	10	996942	996951	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007517	AGGGG	2	10	1044613	1044622	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007517	CCATC	2	10	1049388	1049397	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_007517	GGAGG	2	10	1059668	1059677	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007517	TTCAT	2	10	1093653	1093662	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007517	AAAAG	2	10	1097386	1097395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007517	GAAGG	2	10	1101805	1101814	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007517	GTGAG	2	10	1129694	1129703	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007517	CGGGG	2	10	1141853	1141862	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007517	TGTAT	2	10	1149158	1149167	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007517	CAGGC	2	10	1157739	1157748	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007517	GGCTT	2	10	1162732	1162741	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007517	GTGGC	2	10	1168127	1168136	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007517	GGCCA	2	10	1169477	1169486	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007517	CAAGA	2	10	1177098	1177107	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007517	CAACG	2	10	1177236	1177245	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_007517	TTTGA	2	10	1184228	1184237	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007517	GGCGG	2	10	1194518	1194527	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007517	GAATG	2	10	1219236	1219245	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007517	CGGAA	2	10	1219974	1219983	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007517	TTTTG	2	10	1219994	1220003	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007517	AAGTA	2	10	1231816	1231825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007517	AAGGA	2	10	1244455	1244464	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007517	CCGCA	2	10	1271796	1271805	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_007517	GCATC	2	10	1284220	1284229	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007517	CTAAA	2	10	1288647	1288656	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007517	AAGGG	2	10	1291113	1291122	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007517	CTGGT	2	10	1299729	1299738	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007517	TCGTG	2	10	1311119	1311128	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007517	GAAAA	2	10	1312260	1312269	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007517	ACCGT	2	10	1313695	1313704	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_007517	ACCCC	2	10	1315033	1315042	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
103	NC_007517	GTGTC	2	10	1316866	1316875	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007517	GGGGA	2	10	1323563	1323572	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007517	AACAG	2	10	1324506	1324515	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007517	CCGGA	2	10	1334352	1334361	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_007517	GAGGG	2	10	1349854	1349863	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007517	AAAAT	2	10	1366220	1366229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007517	GGAAG	2	10	1371840	1371849	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007517	AGGGG	2	10	1397939	1397948	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007517	CATAA	2	10	1441351	1441360	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007517	GCGCC	2	10	1445510	1445519	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_007517	TGATT	2	10	1445522	1445531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007517	CCCTT	2	10	1445545	1445554	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_007517	GTTGC	2	10	1457571	1457580	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007517	TAACT	2	10	1484988	1484997	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007517	TGAGA	2	10	1512198	1512207	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007517	TTTGC	2	10	1512368	1512377	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007517	TGGAT	2	10	1541580	1541589	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007517	CATGC	2	10	1544426	1544435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_007517	CACCG	2	10	1548129	1548138	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_007517	GTGCT	2	10	1553172	1553181	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007517	ATAAA	2	10	1611131	1611140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007517	ATTCA	2	10	1626827	1626836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007517	ATGGC	2	10	1645929	1645938	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_007517	CCACC	2	10	1656930	1656939	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
127	NC_007517	CATTA	2	10	1723355	1723364	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007517	TATGA	2	10	1746506	1746515	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007517	GGTAC	2	10	1761909	1761918	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007517	AGGGG	2	10	1772825	1772834	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007517	CGTAA	2	10	1777114	1777123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_007517	CTTTG	2	10	1784569	1784578	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007517	CCTTT	2	10	1792302	1792311	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_007517	GAAAA	2	10	1808971	1808980	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007517	AAGGG	2	10	1828960	1828969	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007517	AAATC	2	10	1848849	1848858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007517	ACGAT	2	10	1888995	1889004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007517	AAATA	2	10	1891722	1891731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007517	CAAAC	2	10	1911007	1911016	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_007517	GATAA	2	10	1978545	1978554	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007517	ATGGA	2	10	1978591	1978600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007517	GGCAA	2	10	1978958	1978967	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007517	GGAAA	2	10	1992572	1992581	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007517	CTGTT	2	10	2003037	2003046	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_007517	CTCTC	2	10	3828640	3828649	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
284	NC_007517	TGAGA	2	10	3838958	3838967	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007517	GACAA	2	10	3848731	3848740	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_007517	GCGGA	2	10	3861970	3861979	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
287	NC_007517	AATTC	2	10	3863381	3863390	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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290	NC_007517	GCCGA	2	10	3913194	3913203	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
291	NC_007517	GTCCT	2	10	3925171	3925180	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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299	NC_007517	ATTCT	2	10	3987462	3987471	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.