MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus kaustophilus HTA426 plasmid pHTA426

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006509	TTGT	2	8	253	260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006509	AGGG	2	8	2862	2869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006509	TGCT	2	8	4242	4249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_006509	AAAG	2	8	4261	4268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006509	GATT	2	8	4411	4418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006509	ATTT	2	8	4889	4896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006509	GTTT	2	8	5148	5155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006509	CTGT	2	8	6373	6380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006509	GACG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006509	GCCA	2	8	7190	7197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006509	TGGA	2	8	7773	7780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006509	TTTA	2	8	11635	11642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006509	AAGG	2	8	15681	15688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006509	GAAA	2	8	15898	15905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006509	ATCA	2	8	17155	17162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_006509	TAAT	2	8	17391	17398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006509	CTCC	2	8	18499	18506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_006509	CTCC	2	8	29462	29469	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_006509	AAGA	2	8	31257	31264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006509	TCCT	2	8	32239	32246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006509	AATT	2	8	33739	33746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006509	CCAT	2	8	33937	33944	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006509	CAAA	2	8	35707	35714	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006509	GGCT	2	8	36397	36404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006509	TCCC	2	8	36758	36765	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_006509	TGAC	2	8	42056	42063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_006509	CATT	2	8	43014	43021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006509	GATC	2	8	43151	43158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_006509	CCTT	2	8	44460	44467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006509	GTTT	2	8	44477	44484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006509	ATGA	2	8	45795	45802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006509	GGGA	2	8	46600	46607	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006509	GAAG	2	8	47176	47183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.