MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter sulfurreducens PCA chromosome

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002939	CATAAC	2	12	1554	1565	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002939	CCTTGT	2	12	38495	38506	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002939	CTTCTC	3	18	76829	76846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002939	TGAAAA	2	12	133011	133022	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002939	GCTGAA	2	12	240952	240963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_002939	CGACGC	2	12	329886	329897	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002939	AAATAA	2	12	419073	419084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002939	GTTCAA	2	12	474906	474917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_002939	CCGGCT	2	12	534882	534893	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_002939	CCTGAA	2	12	575256	575267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_002939	TCAAAT	2	12	732634	732645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_002939	CGGTGC	2	12	738021	738032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_002939	GTACGG	2	12	750931	750942	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_002939	CATCCG	2	12	765207	765218	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002939	TTCTTG	2	12	772976	772987	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_002939	CACGCG	2	12	815271	815282	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002939	TCCTTT	2	12	820415	820426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002939	CCGGCC	2	12	829084	829095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_002939	ATACCG	2	12	912043	912054	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002939	CCCGGG	2	12	916641	916652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002939	AACGGG	2	12	949434	949445	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_002939	TGACCG	2	12	1136196	1136207	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002939	AAAATT	2	12	1147147	1147158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002939	TCGGTT	2	12	1158283	1158294	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_002939	TACTCA	2	12	1201410	1201421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002939	CTTTGC	2	12	1213748	1213759	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002939	GTCACG	2	12	1219643	1219654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002939	GATGCA	2	12	1229684	1229695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_002939	GAAGGG	2	12	1261607	1261618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002939	GCCACC	2	12	1281526	1281537	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_002939	GGCGAA	2	12	1292410	1292421	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_002939	CCCAGT	2	12	1449555	1449566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002939	GAAAAG	2	12	1477818	1477829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002939	GGGAAG	2	12	1504103	1504114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002939	TTAATA	2	12	1519409	1519420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002939	CGCTCA	2	12	1522310	1522321	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002939	CTACAC	2	12	1527922	1527933	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_002939	GGGAAA	2	12	1653244	1653255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002939	GTTGTG	2	12	1674619	1674630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002939	AAGGGA	2	12	1726842	1726853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002939	GCGCAG	2	12	1734876	1734887	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002939	CCGCGT	2	12	1756003	1756014	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_002939	CCATAC	2	12	1877568	1877579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002939	TAAAAA	2	12	1948922	1948933	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002939	ATTTTA	2	12	1977470	1977481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002939	TCAAGG	2	12	2028821	2028832	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_002939	ATCGGG	2	12	2102566	2102577	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_002939	TTTCAG	2	12	2244891	2244902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_002939	GTCCCG	2	12	2257241	2257252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002939	CATTCC	2	12	2334241	2334252	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002939	TTGACA	2	12	2367751	2367762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_002939	CAACCA	2	12	2368638	2368649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002939	TTTTTA	2	12	2382960	2382971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002939	ACCGGA	2	12	2391344	2391355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002939	AACTTT	2	12	2391773	2391784	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_002939	TATCAA	2	12	2399997	2400008	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_002939	CCCCGG	2	12	2408881	2408892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_002939	AAGCTC	2	12	2420490	2420501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002939	CCGGAA	2	12	2487313	2487324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002939	CACGGC	2	12	2539960	2539971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002939	TAACAG	2	12	2566015	2566026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_002939	TTTCCC	2	12	2572373	2572384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002939	TCGGTA	2	12	2623205	2623216	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_002939	AATAAC	2	12	2628611	2628622	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_002939	TGCCCT	2	12	2634346	2634357	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002939	ATCTAT	2	12	2707157	2707168	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_002939	TAGATG	2	12	2707185	2707196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002939	CGCCGG	2	12	2715133	2715144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002939	GCGATA	2	12	2773380	2773391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_002939	GGAGGG	2	12	2850488	2850499	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002939	ATTTAC	2	12	2850522	2850533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_002939	GGCCTG	2	12	2866815	2866826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_002939	CGGCAA	2	12	2904276	2904287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002939	GGCGGG	2	12	2927030	2927041	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_002939	GTTCCT	2	12	2957245	2957256	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002939	GGGTCA	2	12	3051467	3051478	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_002939	AACAGA	2	12	3077452	3077463	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_002939	CTTTCC	2	12	3160106	3160117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002939	AATACA	2	12	3173206	3173217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_002939	GCCGCA	2	12	3182516	3182527	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002939	CGAAAA	2	12	3311832	3311843	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_002939	GGGCAC	2	12	3327756	3327767	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002939	TCGGCC	2	12	3327813	3327824	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002939	ACGGAC	2	12	3360115	3360126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002939	AAAAGA	2	12	3391501	3391512	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002939	AACTTT	2	12	3391698	3391709	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_002939	GTAGAA	2	12	3450877	3450888	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002939	CCGGCC	2	12	3460780	3460791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_002939	TGCGGC	2	12	3504069	3504080	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002939	CAATAT	2	12	3546502	3546513	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_002939	TGCGCC	2	12	3636085	3636096	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002939	CCCGTT	2	12	3644152	3644163	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002939	ATTGTG	2	12	3703697	3703708	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002939	GCACAT	2	12	3757069	3757080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.