MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonibacter pamelaeae 7-10-1-b draft genome

Total Repeats: 46649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021021	CGA	2	6	376486	376491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173825
4002	NC_021021	CCGG	2	8	376547	376554	0 %	0 %	50 %	50 %	479173825
4003	NC_021021	TGC	2	6	376569	376574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173825
4004	NC_021021	CAT	2	6	376732	376737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479173825
4005	NC_021021	CGG	2	6	376798	376803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173825
4006	NC_021021	GCA	2	6	376809	376814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173825
4007	NC_021021	CGA	2	6	376950	376955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173826
4008	NC_021021	CCGAT	2	10	376997	377006	20 %	20 %	20 %	40 %	479173826
4009	NC_021021	GCG	2	6	377108	377113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173826
4010	NC_021021	ACC	2	6	377230	377235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479173826
4011	NC_021021	CGA	2	6	377301	377306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173826
4012	NC_021021	C	6	6	377550	377555	0 %	0 %	0 %	100 %	479173827
4013	NC_021021	GCC	2	6	377558	377563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479173827
4014	NC_021021	CCAA	2	8	377581	377588	50 %	0 %	0 %	50 %	479173827
4015	NC_021021	TGG	2	6	377653	377658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479173827
4016	NC_021021	AAG	2	6	377742	377747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479173827
4017	NC_021021	CGC	2	6	377780	377785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479173827
4018	NC_021021	AGCGA	2	10	377789	377798	40 %	0 %	40 %	20 %	479173827
4019	NC_021021	TCG	2	6	377824	377829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173827
4020	NC_021021	GAG	2	6	378384	378389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479173828
4021	NC_021021	CCT	2	6	378407	378412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479173828
4022	NC_021021	CCCG	2	8	378506	378513	0 %	0 %	25 %	75 %	479173828
4023	NC_021021	GCA	2	6	378587	378592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173828
4024	NC_021021	TTC	2	6	378613	378618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479173828
4025	NC_021021	CTG	2	6	378633	378638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173828
4026	NC_021021	CGT	2	6	378823	378828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173829
4027	NC_021021	CTC	3	9	378899	378907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479173829
4028	NC_021021	GAG	2	6	378908	378913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479173829
4029	NC_021021	CTG	2	6	378942	378947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173829
4030	NC_021021	GTC	2	6	378966	378971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173830
4031	NC_021021	CT	3	6	378993	378998	0 %	50 %	0 %	50 %	479173830
4032	NC_021021	C	6	6	379017	379022	0 %	0 %	0 %	100 %	479173830
4033	NC_021021	CTT	2	6	379026	379031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479173830
4034	NC_021021	GATG	2	8	379061	379068	25 %	25 %	50 %	0 %	479173830
4035	NC_021021	CGTAGT	2	12	379100	379111	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479173830
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4037	NC_021021	GGC	2	6	379146	379151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173830
4038	NC_021021	TTC	2	6	379189	379194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479173830
4039	NC_021021	CGC	2	6	379209	379214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479173830
4040	NC_021021	CTC	2	6	379218	379223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479173830
4041	NC_021021	GGC	2	6	379281	379286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173830
4042	NC_021021	CGT	2	6	379292	379297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173830
4043	NC_021021	GTGC	2	8	379311	379318	0 %	25 %	50 %	25 %	479173830
4044	NC_021021	GCA	2	6	379350	379355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173830
4045	NC_021021	CGG	2	6	379359	379364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173830
4046	NC_021021	TGG	2	6	379492	379497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479173830
4047	NC_021021	CGT	2	6	379512	379517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173830
4048	NC_021021	CCCT	2	8	379598	379605	0 %	25 %	0 %	75 %	479173830
4049	NC_021021	ATG	2	6	379630	379635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479173830
4050	NC_021021	CTTTCC	2	12	379677	379688	0 %	50 %	0 %	50 %	479173830
4051	NC_021021	TCG	2	6	379833	379838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173831
4052	NC_021021	GAT	2	6	379843	379848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479173831
4053	NC_021021	CGC	2	6	379867	379872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479173831
4054	NC_021021	ACC	2	6	379914	379919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479173831
4055	NC_021021	CGA	2	6	379957	379962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173831
4056	NC_021021	TCC	2	6	379965	379970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479173831
4057	NC_021021	TCT	2	6	379971	379976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479173831
4058	NC_021021	ACG	2	6	379977	379982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173831
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4060	NC_021021	GCCA	2	8	380012	380019	25 %	0 %	25 %	50 %	479173831
4061	NC_021021	GC	3	6	380150	380155	0 %	0 %	50 %	50 %	479173831
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4063	NC_021021	CG	3	6	380240	380245	0 %	0 %	50 %	50 %	479173831
4064	NC_021021	CGT	2	6	380284	380289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173831
4065	NC_021021	GCGG	2	8	380510	380517	0 %	0 %	75 %	25 %	479173831
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4067	NC_021021	CGA	3	9	380566	380574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173831
4068	NC_021021	CG	3	6	380590	380595	0 %	0 %	50 %	50 %	479173831
4069	NC_021021	GCA	2	6	380601	380606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173831
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4071	NC_021021	CTG	2	6	380741	380746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173831
4072	NC_021021	CGA	2	6	380758	380763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173831
4073	NC_021021	TCGA	2	8	380780	380787	25 %	25 %	25 %	25 %	479173831
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4080	NC_021021	GAA	2	6	381375	381380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479173832
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4082	NC_021021	GC	3	6	381411	381416	0 %	0 %	50 %	50 %	479173832
4083	NC_021021	ACCG	2	8	381426	381433	25 %	0 %	25 %	50 %	479173832
4084	NC_021021	CG	3	6	381432	381437	0 %	0 %	50 %	50 %	479173832
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4088	NC_021021	TGA	2	6	381475	381480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479173832
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4091	NC_021021	GA	3	6	381644	381649	50 %	0 %	50 %	0 %	479173832
4092	NC_021021	CG	3	6	381671	381676	0 %	0 %	50 %	50 %	479173832
4093	NC_021021	GAG	2	6	381897	381902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479173833
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4104	NC_021021	CG	3	6	382383	382388	0 %	0 %	50 %	50 %	479173834
4105	NC_021021	TGG	2	6	382412	382417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479173834
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4108	NC_021021	AGC	2	6	382489	382494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173834
4109	NC_021021	CGA	2	6	382583	382588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173834
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4112	NC_021021	GAG	2	6	382675	382680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479173834
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4119	NC_021021	CCTG	2	8	383057	383064	0 %	25 %	25 %	50 %	479173834
4120	NC_021021	CAG	2	6	383069	383074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173834
4121	NC_021021	GCG	2	6	383116	383121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173834
4122	NC_021021	GTC	2	6	383130	383135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173834
4123	NC_021021	CAG	2	6	383286	383291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173834
4124	NC_021021	CTT	2	6	383806	383811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479173835
4125	NC_021021	ACC	2	6	383816	383821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479173835
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4128	NC_021021	TCG	2	6	383886	383891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173835
4129	NC_021021	CGA	2	6	383902	383907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173835
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4134	NC_021021	GCC	3	9	384275	384283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479173835
4135	NC_021021	CTG	2	6	384368	384373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173835
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4139	NC_021021	GAG	2	6	384647	384652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479173835
4140	NC_021021	CGT	2	6	384664	384669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173835
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4142	NC_021021	CTA	2	6	384757	384762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479173835
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4200	NC_021021	CTCGG	2	10	388059	388068	0 %	20 %	40 %	40 %	479173837
4201	NC_021021	CGG	2	6	388073	388078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173837
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4226	NC_021021	AAG	2	6	391593	391598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479173839
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4230	NC_021021	CGC	2	6	391828	391833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479173839
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4232	NC_021021	CGC	2	6	391956	391961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479173839
4233	NC_021021	AGA	2	6	391995	392000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479173840
4234	NC_021021	CGG	2	6	392004	392009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173840
4235	NC_021021	GTA	2	6	392044	392049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479173840
4236	NC_021021	AGG	2	6	392090	392095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479173840
4237	NC_021021	AGC	2	6	392120	392125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173840
4238	NC_021021	GGCG	2	8	392137	392144	0 %	0 %	75 %	25 %	479173840
4239	NC_021021	CGT	2	6	392155	392160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479173840
4240	NC_021021	TGA	2	6	392193	392198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479173840
4241	NC_021021	GCA	2	6	392226	392231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173840
4242	NC_021021	CAG	2	6	392254	392259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173840
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4247	NC_021021	CAT	2	6	392440	392445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479173840
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4349	NC_021021	CG	4	8	405289	405296	0 %	0 %	50 %	50 %	479173845
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4358	NC_021021	GGC	2	6	405587	405592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173845
4359	NC_021021	GGCGT	2	10	405606	405615	0 %	20 %	60 %	20 %	479173845
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4482	NC_021021	CTGC	2	8	422382	422389	0 %	25 %	25 %	50 %	479173850
4483	NC_021021	GCC	2	6	422574	422579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479173851
4484	NC_021021	GGCG	2	8	422624	422631	0 %	0 %	75 %	25 %	479173851
4485	NC_021021	CGCA	2	8	422676	422683	25 %	0 %	25 %	50 %	479173851
4486	NC_021021	GTT	2	6	422804	422809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479173851
4487	NC_021021	CGG	2	6	422831	422836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479173851
4488	NC_021021	TCT	2	6	422842	422847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479173851
4489	NC_021021	CTT	2	6	424838	424843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479173852
4490	NC_021021	GAT	2	6	424904	424909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479173852
4491	NC_021021	CGC	2	6	424969	424974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479173852
4492	NC_021021	GCCG	2	8	425003	425010	0 %	0 %	50 %	50 %	479173852
4493	NC_021021	GAC	2	6	425036	425041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479173852
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4495	NC_021021	TGA	2	6	425149	425154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479173852
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