MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020051	CT	4	8	2257	2264	0 %	50 %	0 %	50 %	436735874
2	NC_020051	GA	3	6	2300	2305	50 %	0 %	50 %	0 %	436735874
3	NC_020051	CT	3	6	7038	7043	0 %	50 %	0 %	50 %	436735875
4	NC_020051	TC	3	6	7260	7265	0 %	50 %	0 %	50 %	436735875
5	NC_020051	CG	3	6	8717	8722	0 %	0 %	50 %	50 %	436735876
6	NC_020051	TC	3	6	9082	9087	0 %	50 %	0 %	50 %	436735876
7	NC_020051	CA	3	6	9515	9520	50 %	0 %	0 %	50 %	436735877
8	NC_020051	AG	3	6	9629	9634	50 %	0 %	50 %	0 %	436735877
9	NC_020051	GA	3	6	11597	11602	50 %	0 %	50 %	0 %	436735879
10	NC_020051	CA	3	6	11953	11958	50 %	0 %	0 %	50 %	436735880
11	NC_020051	CT	3	6	14401	14406	0 %	50 %	0 %	50 %	436735882
12	NC_020051	GT	5	10	15772	15781	0 %	50 %	50 %	0 %	436735884
13	NC_020051	AG	3	6	18495	18500	50 %	0 %	50 %	0 %	436735885
14	NC_020051	TC	3	6	19376	19381	0 %	50 %	0 %	50 %	436735886
15	NC_020051	GA	3	6	22841	22846	50 %	0 %	50 %	0 %	436735890
16	NC_020051	GA	3	6	23017	23022	50 %	0 %	50 %	0 %	436735890
17	NC_020051	AG	3	6	24286	24291	50 %	0 %	50 %	0 %	436735890
18	NC_020051	TC	3	6	24378	24383	0 %	50 %	0 %	50 %	436735890
19	NC_020051	TA	3	6	24675	24680	50 %	50 %	0 %	0 %	436735890
20	NC_020051	TG	3	6	28030	28035	0 %	50 %	50 %	0 %	436735891
21	NC_020051	TG	3	6	28045	28050	0 %	50 %	50 %	0 %	436735891
22	NC_020051	CT	4	8	29281	29288	0 %	50 %	0 %	50 %	436735892
23	NC_020051	CG	3	6	30680	30685	0 %	0 %	50 %	50 %	436735893
24	NC_020051	GT	3	6	30956	30961	0 %	50 %	50 %	0 %	436735893
25	NC_020051	GT	3	6	40705	40710	0 %	50 %	50 %	0 %	436735899
26	NC_020051	AT	3	6	40800	40805	50 %	50 %	0 %	0 %	436735899
27	NC_020051	AT	3	6	41040	41045	50 %	50 %	0 %	0 %	436735899
28	NC_020051	TA	3	6	41170	41175	50 %	50 %	0 %	0 %	436735899
29	NC_020051	GA	3	6	41330	41335	50 %	0 %	50 %	0 %	436735899
30	NC_020051	AT	3	6	42276	42281	50 %	50 %	0 %	0 %	436735900
31	NC_020051	AG	3	6	42841	42846	50 %	0 %	50 %	0 %	436735901
32	NC_020051	AG	3	6	44226	44231	50 %	0 %	50 %	0 %	436735902
33	NC_020051	GA	3	6	45363	45368	50 %	0 %	50 %	0 %	436735903
34	NC_020051	AG	3	6	45811	45816	50 %	0 %	50 %	0 %	436735903
35	NC_020051	TA	3	6	47649	47654	50 %	50 %	0 %	0 %	436735904
36	NC_020051	TG	3	6	49621	49626	0 %	50 %	50 %	0 %	436735905
37	NC_020051	CT	3	6	50877	50882	0 %	50 %	0 %	50 %	436735905
38	NC_020051	TC	3	6	51755	51760	0 %	50 %	0 %	50 %	436735906
39	NC_020051	TA	3	6	51967	51972	50 %	50 %	0 %	0 %	436735907
40	NC_020051	TA	3	6	53569	53574	50 %	50 %	0 %	0 %	436735907
41	NC_020051	CG	4	8	54906	54913	0 %	0 %	50 %	50 %	436735908
42	NC_020051	TA	3	6	57711	57716	50 %	50 %	0 %	0 %	436735910
43	NC_020051	GA	3	6	60098	60103	50 %	0 %	50 %	0 %	436735913
44	NC_020051	AT	3	6	60192	60197	50 %	50 %	0 %	0 %	436735913
45	NC_020051	AC	3	6	60955	60960	50 %	0 %	0 %	50 %	436735913
46	NC_020051	GC	3	6	62982	62987	0 %	0 %	50 %	50 %	436735915
47	NC_020051	CG	5	10	63611	63620	0 %	0 %	50 %	50 %	436735916
48	NC_020051	TC	3	6	66304	66309	0 %	50 %	0 %	50 %	436735918
49	NC_020051	AT	3	6	68318	68323	50 %	50 %	0 %	0 %	436735920
50	NC_020051	GT	3	6	70243	70248	0 %	50 %	50 %	0 %	436735921
51	NC_020051	GT	3	6	70870	70875	0 %	50 %	50 %	0 %	436735921
52	NC_020051	GT	3	6	71003	71008	0 %	50 %	50 %	0 %	436735921
53	NC_020051	GT	3	6	72365	72370	0 %	50 %	50 %	0 %	436735923
54	NC_020051	CT	3	6	76005	76010	0 %	50 %	0 %	50 %	436735926
55	NC_020051	CT	3	6	77641	77646	0 %	50 %	0 %	50 %	436735926
56	NC_020051	CT	3	6	77856	77861	0 %	50 %	0 %	50 %	436735926
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60	NC_020051	AT	4	8	83040	83047	50 %	50 %	0 %	0 %	436735932
61	NC_020051	CT	3	6	84011	84016	0 %	50 %	0 %	50 %	436735933
62	NC_020051	TC	4	8	84886	84893	0 %	50 %	0 %	50 %	436735934
63	NC_020051	GA	3	6	85266	85271	50 %	0 %	50 %	0 %	436735934
64	NC_020051	AG	3	6	85857	85862	50 %	0 %	50 %	0 %	436735935
65	NC_020051	AT	3	6	87416	87421	50 %	50 %	0 %	0 %	436735936
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70	NC_020051	TC	3	6	92572	92577	0 %	50 %	0 %	50 %	436735942
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73	NC_020051	TA	4	8	96600	96607	50 %	50 %	0 %	0 %	436735948
74	NC_020051	CT	3	6	97244	97249	0 %	50 %	0 %	50 %	436735948
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80	NC_020051	TC	3	6	103371	103376	0 %	50 %	0 %	50 %	436735956
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92	NC_020051	TG	3	6	118995	119000	0 %	50 %	50 %	0 %	436735972
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103	NC_020051	GA	3	6	132791	132796	50 %	0 %	50 %	0 %	436735978
104	NC_020051	CT	3	6	134279	134284	0 %	50 %	0 %	50 %	436735978
105	NC_020051	AG	3	6	134627	134632	50 %	0 %	50 %	0 %	436735979
106	NC_020051	CT	3	6	134970	134975	0 %	50 %	0 %	50 %	436735979
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108	NC_020051	TG	3	6	139135	139140	0 %	50 %	50 %	0 %	436735982
109	NC_020051	TC	3	6	139363	139368	0 %	50 %	0 %	50 %	436735982
110	NC_020051	TA	3	6	139510	139515	50 %	50 %	0 %	0 %	436735982
111	NC_020051	GT	3	6	141232	141237	0 %	50 %	50 %	0 %	436735984
112	NC_020051	GA	3	6	141495	141500	50 %	0 %	50 %	0 %	436735985
113	NC_020051	CA	3	6	141971	141976	50 %	0 %	0 %	50 %	436735986
114	NC_020051	CA	3	6	148511	148516	50 %	0 %	0 %	50 %	436735992
115	NC_020051	CA	3	6	148542	148547	50 %	0 %	0 %	50 %	436735992
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118	NC_020051	CT	3	6	152541	152546	0 %	50 %	0 %	50 %	436735996
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120	NC_020051	TG	3	6	154699	154704	0 %	50 %	50 %	0 %	436735997
121	NC_020051	CG	3	6	155505	155510	0 %	0 %	50 %	50 %	436735998
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123	NC_020051	TC	3	6	156873	156878	0 %	50 %	0 %	50 %	436735999
124	NC_020051	GT	3	6	157537	157542	0 %	50 %	50 %	0 %	436736000
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126	NC_020051	AC	3	6	159777	159782	50 %	0 %	0 %	50 %	436736002
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130	NC_020051	TA	3	6	166879	166884	50 %	50 %	0 %	0 %	436736011
131	NC_020051	AT	3	6	167510	167515	50 %	50 %	0 %	0 %	436736011
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136	NC_020051	AC	3	6	175846	175851	50 %	0 %	0 %	50 %	436736023
137	NC_020051	GA	3	6	176092	176097	50 %	0 %	50 %	0 %	436736024
138	NC_020051	AG	4	8	176335	176342	50 %	0 %	50 %	0 %	436736024
139	NC_020051	AG	3	6	177431	177436	50 %	0 %	50 %	0 %	436736024
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.