MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02

Total Repeats: 370

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020051	ATGT	2	8	1695	1702	25 %	50 %	25 %	0 %	436735873
2	NC_020051	CTAT	2	8	1930	1937	25 %	50 %	0 %	25 %	436735873
3	NC_020051	TGGA	2	8	4863	4870	25 %	25 %	50 %	0 %	436735875
4	NC_020051	GCTA	2	8	5171	5178	25 %	25 %	25 %	25 %	436735875
5	NC_020051	GATT	2	8	5995	6002	25 %	50 %	25 %	0 %	436735875
6	NC_020051	GTTC	2	8	6084	6091	0 %	50 %	25 %	25 %	436735875
7	NC_020051	TTGT	2	8	6578	6585	0 %	75 %	25 %	0 %	436735875
8	NC_020051	ACAA	2	8	6987	6994	75 %	0 %	0 %	25 %	436735875
9	NC_020051	CGAG	2	8	8853	8860	25 %	0 %	50 %	25 %	436735876
10	NC_020051	GGAC	2	8	9251	9258	25 %	0 %	50 %	25 %	436735876
11	NC_020051	CTTT	2	8	10641	10648	0 %	75 %	0 %	25 %	436735878
12	NC_020051	CAAT	2	8	11723	11730	50 %	25 %	0 %	25 %	436735879
13	NC_020051	AACG	2	8	12097	12104	50 %	0 %	25 %	25 %	436735880
14	NC_020051	CAAC	2	8	13068	13075	50 %	0 %	0 %	50 %	436735882
15	NC_020051	TGCC	2	8	13112	13119	0 %	25 %	25 %	50 %	436735882
16	NC_020051	GGTG	2	8	14070	14077	0 %	25 %	75 %	0 %	436735882
17	NC_020051	ACCC	2	8	14310	14317	25 %	0 %	0 %	75 %	436735882
18	NC_020051	TGCT	2	8	15144	15151	0 %	50 %	25 %	25 %	436735882
19	NC_020051	CGCA	2	8	15988	15995	25 %	0 %	25 %	50 %	436735884
20	NC_020051	GGTT	2	8	15998	16005	0 %	50 %	50 %	0 %	436735884
21	NC_020051	GTCA	2	8	18334	18341	25 %	25 %	25 %	25 %	436735885
22	NC_020051	ATTC	2	8	18420	18427	25 %	50 %	0 %	25 %	436735885
23	NC_020051	CACC	2	8	18621	18628	25 %	0 %	0 %	75 %	436735885
24	NC_020051	CGAT	2	8	18978	18985	25 %	25 %	25 %	25 %	436735885
25	NC_020051	CGAT	2	8	19574	19581	25 %	25 %	25 %	25 %	436735886
26	NC_020051	TCAC	2	8	19730	19737	25 %	25 %	0 %	50 %	436735886
27	NC_020051	ACCC	2	8	20162	20169	25 %	0 %	0 %	75 %	436735886
28	NC_020051	TGGT	2	8	20193	20200	0 %	50 %	50 %	0 %	436735886
29	NC_020051	GTTT	2	8	20403	20410	0 %	75 %	25 %	0 %	436735886
30	NC_020051	CCTG	2	8	20857	20864	0 %	25 %	25 %	50 %	436735887
31	NC_020051	ATCC	2	8	20934	20941	25 %	25 %	0 %	50 %	436735887
32	NC_020051	GACT	2	8	21242	21249	25 %	25 %	25 %	25 %	436735888
33	NC_020051	AATA	2	8	21397	21404	75 %	25 %	0 %	0 %	436735888
34	NC_020051	CCGT	2	8	22057	22064	0 %	25 %	25 %	50 %	436735889
35	NC_020051	AGTG	2	8	22134	22141	25 %	25 %	50 %	0 %	436735889
36	NC_020051	AACT	2	8	22188	22195	50 %	25 %	0 %	25 %	436735889
37	NC_020051	CGAT	2	8	23975	23982	25 %	25 %	25 %	25 %	436735890
38	NC_020051	TTGC	2	8	25060	25067	0 %	50 %	25 %	25 %	436735890
39	NC_020051	TTTG	2	8	27924	27931	0 %	75 %	25 %	0 %	436735891
40	NC_020051	CAAA	2	8	28298	28305	75 %	0 %	0 %	25 %	436735891
41	NC_020051	ATCG	2	8	28705	28712	25 %	25 %	25 %	25 %	436735891
42	NC_020051	AGGC	2	8	29168	29175	25 %	0 %	50 %	25 %	436735891
43	NC_020051	GGTG	2	8	29220	29227	0 %	25 %	75 %	0 %	436735891
44	NC_020051	GGAA	2	8	29504	29511	50 %	0 %	50 %	0 %	436735892
45	NC_020051	AATC	2	8	32857	32864	50 %	25 %	0 %	25 %	436735895
46	NC_020051	GGAT	2	8	37157	37164	25 %	25 %	50 %	0 %	436735897
47	NC_020051	ATTG	2	8	37276	37283	25 %	50 %	25 %	0 %	436735897
48	NC_020051	GAAA	2	8	37336	37343	75 %	0 %	25 %	0 %	436735897
49	NC_020051	AAGA	2	8	37412	37419	75 %	0 %	25 %	0 %	436735897
50	NC_020051	TTGC	2	8	37748	37755	0 %	50 %	25 %	25 %	436735898
51	NC_020051	AAGC	2	8	37941	37948	50 %	0 %	25 %	25 %	436735898
52	NC_020051	TATT	2	8	40307	40314	25 %	75 %	0 %	0 %	436735899
53	NC_020051	TGTT	2	8	40504	40511	0 %	75 %	25 %	0 %	436735899
54	NC_020051	GCTA	2	8	41798	41805	25 %	25 %	25 %	25 %	436735899
55	NC_020051	ACTT	2	8	42560	42567	25 %	50 %	0 %	25 %	436735901
56	NC_020051	TGCC	2	8	42696	42703	0 %	25 %	25 %	50 %	436735901
57	NC_020051	CTCA	2	8	44020	44027	25 %	25 %	0 %	50 %	436735902
58	NC_020051	AAGC	2	8	44074	44081	50 %	0 %	25 %	25 %	436735902
59	NC_020051	AACC	2	8	45571	45578	50 %	0 %	0 %	50 %	436735903
60	NC_020051	AGTA	2	8	46154	46161	50 %	25 %	25 %	0 %	436735903
61	NC_020051	AGCA	2	8	46822	46829	50 %	0 %	25 %	25 %	436735904
62	NC_020051	AGCA	2	8	47806	47813	50 %	0 %	25 %	25 %	436735904
63	NC_020051	AAGT	2	8	48091	48098	50 %	25 %	25 %	0 %	436735904
64	NC_020051	CAAT	2	8	48361	48368	50 %	25 %	0 %	25 %	436735905
65	NC_020051	GTTC	2	8	48390	48397	0 %	50 %	25 %	25 %	436735905
66	NC_020051	ACTT	2	8	50467	50474	25 %	50 %	0 %	25 %	436735905
67	NC_020051	CAAT	2	8	50548	50555	50 %	25 %	0 %	25 %	436735905
68	NC_020051	AGCC	2	8	50714	50721	25 %	0 %	25 %	50 %	436735905
69	NC_020051	ACTT	2	8	50725	50732	25 %	50 %	0 %	25 %	436735905
70	NC_020051	AAGC	2	8	53228	53235	50 %	0 %	25 %	25 %	436735907
71	NC_020051	GGTT	2	8	53271	53278	0 %	50 %	50 %	0 %	436735907
72	NC_020051	AATT	2	8	53430	53437	50 %	50 %	0 %	0 %	436735907
73	NC_020051	AGCA	2	8	54323	54330	50 %	0 %	25 %	25 %	436735908
74	NC_020051	AGCT	2	8	54400	54407	25 %	25 %	25 %	25 %	436735908
75	NC_020051	TCTT	2	8	55102	55109	0 %	75 %	0 %	25 %	436735908
76	NC_020051	GGAG	2	8	57738	57745	25 %	0 %	75 %	0 %	436735910
77	NC_020051	GTAG	2	8	59430	59437	25 %	25 %	50 %	0 %	436735912
78	NC_020051	CCAA	2	8	59554	59561	50 %	0 %	0 %	50 %	436735912
79	NC_020051	TTGA	2	8	59685	59692	25 %	50 %	25 %	0 %	436735912
80	NC_020051	GCAA	2	8	60939	60946	50 %	0 %	25 %	25 %	436735913
81	NC_020051	CAAT	2	8	61032	61039	50 %	25 %	0 %	25 %	436735913
82	NC_020051	ATCA	2	8	62185	62192	50 %	25 %	0 %	25 %	436735915
83	NC_020051	AGCA	2	8	62243	62250	50 %	0 %	25 %	25 %	436735915
84	NC_020051	TCAA	2	8	62781	62788	50 %	25 %	0 %	25 %	436735915
85	NC_020051	TAAA	2	8	63395	63402	75 %	25 %	0 %	0 %	436735916
86	NC_020051	CTCG	3	12	64042	64053	0 %	25 %	25 %	50 %	436735916
87	NC_020051	GATT	2	8	64178	64185	25 %	50 %	25 %	0 %	436735916
88	NC_020051	TAAC	2	8	64220	64227	50 %	25 %	0 %	25 %	436735916
89	NC_020051	AAAT	2	8	64867	64874	75 %	25 %	0 %	0 %	436735916
90	NC_020051	GACT	2	8	64892	64899	25 %	25 %	25 %	25 %	436735916
91	NC_020051	AGCC	2	8	65816	65823	25 %	0 %	25 %	50 %	436735917
92	NC_020051	ATAA	2	8	65945	65952	75 %	25 %	0 %	0 %	436735917
93	NC_020051	AAGC	2	8	66495	66502	50 %	0 %	25 %	25 %	436735918
94	NC_020051	CTTC	2	8	66998	67005	0 %	50 %	0 %	50 %	436735919
95	NC_020051	TTTC	2	8	67882	67889	0 %	75 %	0 %	25 %	436735919
96	NC_020051	TGAT	2	8	68030	68037	25 %	50 %	25 %	0 %	436735919
97	NC_020051	AGAT	2	8	68705	68712	50 %	25 %	25 %	0 %	436735920
98	NC_020051	ATAA	2	8	69210	69217	75 %	25 %	0 %	0 %	436735921
99	NC_020051	GAAT	2	8	70189	70196	50 %	25 %	25 %	0 %	436735921
100	NC_020051	CAGT	2	8	70366	70373	25 %	25 %	25 %	25 %	436735921
101	NC_020051	ACAA	2	8	72037	72044	75 %	0 %	0 %	25 %	436735922
102	NC_020051	GGAT	2	8	72933	72940	25 %	25 %	50 %	0 %	436735923
103	NC_020051	TATT	2	8	74297	74304	25 %	75 %	0 %	0 %	436735925
104	NC_020051	AGCC	2	8	74462	74469	25 %	0 %	25 %	50 %	436735925
105	NC_020051	GAAG	2	8	74650	74657	50 %	0 %	50 %	0 %	436735925
106	NC_020051	ATCG	2	8	75705	75712	25 %	25 %	25 %	25 %	436735926
107	NC_020051	TGGG	2	8	76163	76170	0 %	25 %	75 %	0 %	436735926
108	NC_020051	CATT	2	8	76514	76521	25 %	50 %	0 %	25 %	436735926
109	NC_020051	GCTG	2	8	76599	76606	0 %	25 %	50 %	25 %	436735926
110	NC_020051	GGCA	2	8	76731	76738	25 %	0 %	50 %	25 %	436735926
111	NC_020051	GTTT	2	8	77984	77991	0 %	75 %	25 %	0 %	436735926
112	NC_020051	CAAA	2	8	78060	78067	75 %	0 %	0 %	25 %	436735926
113	NC_020051	ATTG	2	8	79026	79033	25 %	50 %	25 %	0 %	436735927
114	NC_020051	TGAT	2	8	79307	79314	25 %	50 %	25 %	0 %	436735928
115	NC_020051	CATG	2	8	79598	79605	25 %	25 %	25 %	25 %	436735928
116	NC_020051	GAGG	2	8	79861	79868	25 %	0 %	75 %	0 %	436735929
117	NC_020051	GTTC	2	8	79977	79984	0 %	50 %	25 %	25 %	436735929
118	NC_020051	GGAT	2	8	80900	80907	25 %	25 %	50 %	0 %	436735930
119	NC_020051	TAAT	2	8	80968	80975	50 %	50 %	0 %	0 %	436735930
120	NC_020051	TTAG	2	8	82066	82073	25 %	50 %	25 %	0 %	436735931
121	NC_020051	CAAA	2	8	82835	82842	75 %	0 %	0 %	25 %	436735932
122	NC_020051	TCCA	2	8	83185	83192	25 %	25 %	0 %	50 %	436735932
123	NC_020051	TAGT	2	8	83233	83240	25 %	50 %	25 %	0 %	436735932
124	NC_020051	TTCA	2	8	84080	84087	25 %	50 %	0 %	25 %	436735933
125	NC_020051	AAAG	2	8	84222	84229	75 %	0 %	25 %	0 %	436735933
126	NC_020051	TTCC	2	8	85092	85099	0 %	50 %	0 %	50 %	436735934
127	NC_020051	ATGG	2	8	85191	85198	25 %	25 %	50 %	0 %	436735934
128	NC_020051	GCTT	2	8	85251	85258	0 %	50 %	25 %	25 %	436735934
129	NC_020051	GATG	2	8	86075	86082	25 %	25 %	50 %	0 %	436735935
130	NC_020051	CCTG	2	8	87904	87911	0 %	25 %	25 %	50 %	436735936
131	NC_020051	TTGA	2	8	89248	89255	25 %	50 %	25 %	0 %	436735937
132	NC_020051	CAAC	2	8	89729	89736	50 %	0 %	0 %	50 %	436735937
133	NC_020051	TCGA	2	8	89841	89848	25 %	25 %	25 %	25 %	436735937
134	NC_020051	GTCC	2	8	90175	90182	0 %	25 %	25 %	50 %	436735937
135	NC_020051	AGGA	2	8	90221	90228	50 %	0 %	50 %	0 %	436735937
136	NC_020051	CCAT	2	8	90400	90407	25 %	25 %	0 %	50 %	436735938
137	NC_020051	ATAA	2	8	90787	90794	75 %	25 %	0 %	0 %	436735938
138	NC_020051	ATGA	2	8	92401	92408	50 %	25 %	25 %	0 %	436735941
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140	NC_020051	AGGT	2	8	94052	94059	25 %	25 %	50 %	0 %	436735944
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.