MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 2315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019703	GAGCT	2	10	1237	1246	20 %	20 %	40 %	20 %	428223462
2	NC_019703	CCAAG	2	10	3938	3947	40 %	0 %	20 %	40 %	428223464
3	NC_019703	CCTCA	2	10	6751	6760	20 %	20 %	0 %	60 %	428223467
4	NC_019703	GCTAT	2	10	8049	8058	20 %	40 %	20 %	20 %	428223468
5	NC_019703	CCAGC	2	10	11782	11791	20 %	0 %	20 %	60 %	428223474
6	NC_019703	GGCTT	2	10	14158	14167	0 %	40 %	40 %	20 %	428223477
7	NC_019703	GGGTG	2	10	14261	14270	0 %	20 %	80 %	0 %	428223477
8	NC_019703	GCTCG	2	10	14321	14330	0 %	20 %	40 %	40 %	428223477
9	NC_019703	GAACC	2	10	15122	15131	40 %	0 %	20 %	40 %	428223478
10	NC_019703	GGGCT	2	10	16292	16301	0 %	20 %	60 %	20 %	428223480
11	NC_019703	CCGGC	2	10	16542	16551	0 %	0 %	40 %	60 %	428223480
12	NC_019703	TTTGG	2	10	16787	16796	0 %	60 %	40 %	0 %	428223480
13	NC_019703	GCTGG	2	10	16950	16959	0 %	20 %	60 %	20 %	428223480
14	NC_019703	TGTGC	2	10	17509	17518	0 %	40 %	40 %	20 %	428223480
15	NC_019703	CCCGC	2	10	20313	20322	0 %	0 %	20 %	80 %	428223484
16	NC_019703	CCCGG	2	10	23878	23887	0 %	0 %	40 %	60 %	428223488
17	NC_019703	CGCGC	2	10	24890	24899	0 %	0 %	40 %	60 %	428223491
18	NC_019703	TCAGC	2	10	30101	30110	20 %	20 %	20 %	40 %	428223496
19	NC_019703	GCCCA	2	10	31236	31245	20 %	0 %	20 %	60 %	428223497
20	NC_019703	CACCC	2	10	33736	33745	20 %	0 %	0 %	80 %	428223498
21	NC_019703	TGCCG	2	10	36748	36757	0 %	20 %	40 %	40 %	428223500
22	NC_019703	CCAGG	2	10	36811	36820	20 %	0 %	40 %	40 %	428223500
23	NC_019703	GAGCC	2	10	37404	37413	20 %	0 %	40 %	40 %	428223501
24	NC_019703	CCCAG	2	10	42092	42101	20 %	0 %	20 %	60 %	428223504
25	NC_019703	CGATT	2	10	42876	42885	20 %	40 %	20 %	20 %	428223504
26	NC_019703	TCCGG	2	10	43899	43908	0 %	20 %	40 %	40 %	428223506
27	NC_019703	CCGTC	2	10	47156	47165	0 %	20 %	20 %	60 %	428223509
28	NC_019703	TTCGA	2	10	51735	51744	20 %	40 %	20 %	20 %	428223514
29	NC_019703	TGCCG	2	10	52412	52421	0 %	20 %	40 %	40 %	428223515
30	NC_019703	GCGCT	2	10	58375	58384	0 %	20 %	40 %	40 %	428223520
31	NC_019703	CCAAT	2	10	60817	60826	40 %	20 %	0 %	40 %	428223521
32	NC_019703	CCCTG	2	10	61051	61060	0 %	20 %	20 %	60 %	428223521
33	NC_019703	CCGGA	2	10	62405	62414	20 %	0 %	40 %	40 %	428223522
34	NC_019703	GCAGC	2	10	64201	64210	20 %	0 %	40 %	40 %	428223525
35	NC_019703	TGGTT	2	10	64711	64720	0 %	60 %	40 %	0 %	428223525
36	NC_019703	ATGGT	2	10	68876	68885	20 %	40 %	40 %	0 %	428223529
37	NC_019703	CTGGA	2	10	70475	70484	20 %	20 %	40 %	20 %	428223530
38	NC_019703	CACCG	2	10	72304	72313	20 %	0 %	20 %	60 %	428223532
39	NC_019703	CCACC	2	10	72408	72417	20 %	0 %	0 %	80 %	428223532
40	NC_019703	AGCGC	2	10	72561	72570	20 %	0 %	40 %	40 %	428223532
41	NC_019703	AGCAC	2	10	75884	75893	40 %	0 %	20 %	40 %	428223535
42	NC_019703	AGCGC	2	10	80683	80692	20 %	0 %	40 %	40 %	428223539
43	NC_019703	CCACA	2	10	80834	80843	40 %	0 %	0 %	60 %	428223539
44	NC_019703	CGCCC	2	10	82198	82207	0 %	0 %	20 %	80 %	428223540
45	NC_019703	AGCTG	2	10	82618	82627	20 %	20 %	40 %	20 %	428223541
46	NC_019703	CGGTG	2	10	84168	84177	0 %	20 %	60 %	20 %	428223542
47	NC_019703	CGCCC	2	10	84549	84558	0 %	0 %	20 %	80 %	428223542
48	NC_019703	TTGAT	2	10	85289	85298	20 %	60 %	20 %	0 %	428223543
49	NC_019703	GGGCC	2	10	86043	86052	0 %	0 %	60 %	40 %	428223544
50	NC_019703	AGTTG	2	10	88489	88498	20 %	40 %	40 %	0 %	428223546
51	NC_019703	AGATG	2	10	90331	90340	40 %	20 %	40 %	0 %	428223547
52	NC_019703	GGGGC	2	10	93037	93046	0 %	0 %	80 %	20 %	428223548
53	NC_019703	TAGCG	2	10	94929	94938	20 %	20 %	40 %	20 %	428223549
54	NC_019703	ACGGC	2	10	95444	95453	20 %	0 %	40 %	40 %	428223549
55	NC_019703	CGCAG	2	10	97800	97809	20 %	0 %	40 %	40 %	428223550
56	NC_019703	CAGTC	2	10	98299	98308	20 %	20 %	20 %	40 %	428223550
57	NC_019703	GCTTC	2	10	98458	98467	0 %	40 %	20 %	40 %	428223550
58	NC_019703	CAGCA	2	10	100949	100958	40 %	0 %	20 %	40 %	428223551
59	NC_019703	TGGCG	2	10	102401	102410	0 %	20 %	60 %	20 %	428223552
60	NC_019703	TGGGG	2	10	103507	103516	0 %	20 %	80 %	0 %	428223553
61	NC_019703	GCCCG	2	10	106048	106057	0 %	0 %	40 %	60 %	428223554
62	NC_019703	CCAGC	2	10	108464	108473	20 %	0 %	20 %	60 %	428223557
63	NC_019703	CCCCA	2	10	108699	108708	20 %	0 %	0 %	80 %	428223557
64	NC_019703	GATTC	2	10	110020	110029	20 %	40 %	20 %	20 %	428223559
65	NC_019703	GTGGC	2	10	111558	111567	0 %	20 %	60 %	20 %	428223561
66	NC_019703	TTTGG	2	10	111630	111639	0 %	60 %	40 %	0 %	428223561
67	NC_019703	CCCAG	2	10	114261	114270	20 %	0 %	20 %	60 %	428223565
68	NC_019703	GCCGG	2	10	114982	114991	0 %	0 %	60 %	40 %	428223565
69	NC_019703	GACCC	2	10	117976	117985	20 %	0 %	20 %	60 %	428223568
70	NC_019703	GGCCA	2	10	120335	120344	20 %	0 %	40 %	40 %	428223569
71	NC_019703	GAGGC	2	10	121315	121324	20 %	0 %	60 %	20 %	428223570
72	NC_019703	GTCGA	2	10	121849	121858	20 %	20 %	40 %	20 %	428223571
73	NC_019703	GCCCA	2	10	122332	122341	20 %	0 %	20 %	60 %	428223571
74	NC_019703	GTCCA	2	10	123877	123886	20 %	20 %	20 %	40 %	428223573
75	NC_019703	GCGCT	2	10	125669	125678	0 %	20 %	40 %	40 %	428223574
76	NC_019703	ATCAC	2	10	127991	128000	40 %	20 %	0 %	40 %	428223576
77	NC_019703	CGCCC	2	10	128999	129008	0 %	0 %	20 %	80 %	428223576
78	NC_019703	TCAGC	2	10	129036	129045	20 %	20 %	20 %	40 %	428223576
79	NC_019703	GCCCT	2	10	132161	132170	0 %	20 %	20 %	60 %	428223578
80	NC_019703	TCACC	2	10	134442	134451	20 %	20 %	0 %	60 %	428223580
81	NC_019703	GGGCT	2	10	134864	134873	0 %	20 %	60 %	20 %	428223581
82	NC_019703	CGACG	2	10	136124	136133	20 %	0 %	40 %	40 %	428223582
83	NC_019703	CTGGC	2	10	137018	137027	0 %	20 %	40 %	40 %	428223583
84	NC_019703	GCGAT	2	10	138394	138403	20 %	20 %	40 %	20 %	428223586
85	NC_019703	TTGGC	2	10	140940	140949	0 %	40 %	40 %	20 %	428223588
86	NC_019703	TGGGC	2	10	148965	148974	0 %	20 %	60 %	20 %	428223594
87	NC_019703	GCTCA	2	10	150068	150077	20 %	20 %	20 %	40 %	428223595
88	NC_019703	TCGGG	2	10	154191	154200	0 %	20 %	60 %	20 %	428223598
89	NC_019703	CTGAC	2	10	154385	154394	20 %	20 %	20 %	40 %	428223598
90	NC_019703	TCCAA	2	10	164427	164436	40 %	20 %	0 %	40 %	428223606
91	NC_019703	CGGGG	2	10	165768	165777	0 %	0 %	80 %	20 %	428223607
92	NC_019703	CAGCC	2	10	166644	166653	20 %	0 %	20 %	60 %	428223608
93	NC_019703	CCCCA	2	10	167506	167515	20 %	0 %	0 %	80 %	428223608
94	NC_019703	CAGCT	2	10	168928	168937	20 %	20 %	20 %	40 %	428223608
95	NC_019703	GCCCA	2	10	172368	172377	20 %	0 %	20 %	60 %	428223611
96	NC_019703	CGGCG	2	10	175352	175361	0 %	0 %	60 %	40 %	428223612
97	NC_019703	CTGTG	2	10	175848	175857	0 %	40 %	40 %	20 %	428223613
98	NC_019703	TGCCC	2	10	176165	176174	0 %	20 %	20 %	60 %	428223613
99	NC_019703	CACCG	2	10	179668	179677	20 %	0 %	20 %	60 %	428223617
100	NC_019703	GTCGC	2	10	181128	181137	0 %	20 %	40 %	40 %	428223618
101	NC_019703	GGGCA	2	10	181446	181455	20 %	0 %	60 %	20 %	428223618
102	NC_019703	GCTCA	2	10	183625	183634	20 %	20 %	20 %	40 %	428223619
103	NC_019703	GGCGT	2	10	184010	184019	0 %	20 %	60 %	20 %	428223619
104	NC_019703	ATTTA	2	10	186879	186888	40 %	60 %	0 %	0 %	428223620
105	NC_019703	TCAGC	2	10	188304	188313	20 %	20 %	20 %	40 %	428223621
106	NC_019703	CTCAG	2	10	193807	193816	20 %	20 %	20 %	40 %	428223628
107	NC_019703	GCGCC	2	10	196574	196583	0 %	0 %	40 %	60 %	428223629
108	NC_019703	ATGGG	2	10	198880	198889	20 %	20 %	60 %	0 %	428223632
109	NC_019703	GACCT	2	10	202652	202661	20 %	20 %	20 %	40 %	428223635
110	NC_019703	CGATG	2	10	204674	204683	20 %	20 %	40 %	20 %	428223639
111	NC_019703	GCTGG	2	10	207841	207850	0 %	20 %	60 %	20 %	428223647
112	NC_019703	TCCCA	2	10	208047	208056	20 %	20 %	0 %	60 %	428223647
113	NC_019703	GATCT	2	10	211054	211063	20 %	40 %	20 %	20 %	428223649
114	NC_019703	TGGGC	2	10	213277	213286	0 %	20 %	60 %	20 %	428223651
115	NC_019703	CTGGC	2	10	213464	213473	0 %	20 %	40 %	40 %	428223651
116	NC_019703	CTGGC	2	10	213677	213686	0 %	20 %	40 %	40 %	428223651
117	NC_019703	TCGGG	2	10	213846	213855	0 %	20 %	60 %	20 %	428223651
118	NC_019703	GCTGG	2	10	215812	215821	0 %	20 %	60 %	20 %	428223653
119	NC_019703	GCCCC	2	10	218867	218876	0 %	0 %	20 %	80 %	428223657
120	NC_019703	CTGAC	2	10	220403	220412	20 %	20 %	20 %	40 %	428223658
121	NC_019703	GCTGG	2	10	220782	220791	0 %	20 %	60 %	20 %	428223658
122	NC_019703	CAGTC	2	10	222224	222233	20 %	20 %	20 %	40 %	428223660
123	NC_019703	CCAAG	2	10	222326	222335	40 %	0 %	20 %	40 %	428223660
124	NC_019703	GCCTT	2	10	222844	222853	0 %	40 %	20 %	40 %	428223660
125	NC_019703	CGGCC	2	10	224227	224236	0 %	0 %	40 %	60 %	428223662
126	NC_019703	GCTGA	2	10	225701	225710	20 %	20 %	40 %	20 %	428223663
127	NC_019703	GGCGA	2	10	231836	231845	20 %	0 %	60 %	20 %	428223669
128	NC_019703	GACAG	2	10	232953	232962	40 %	0 %	40 %	20 %	428223671
129	NC_019703	GCTCA	2	10	232989	232998	20 %	20 %	20 %	40 %	428223671
130	NC_019703	GGTTC	2	10	233256	233265	0 %	40 %	40 %	20 %	428223671
131	NC_019703	CTGAC	2	10	234779	234788	20 %	20 %	20 %	40 %	428223672
132	NC_019703	GAGCC	2	10	235222	235231	20 %	0 %	40 %	40 %	428223672
133	NC_019703	TCGCC	2	10	235415	235424	0 %	20 %	20 %	60 %	428223672
134	NC_019703	GACTG	2	10	242956	242965	20 %	20 %	40 %	20 %	428223674
135	NC_019703	CAACG	2	10	244201	244210	40 %	0 %	20 %	40 %	428223675
136	NC_019703	CTGGG	2	10	246844	246853	0 %	20 %	60 %	20 %	428223677
137	NC_019703	TTGGG	2	10	247498	247507	0 %	40 %	60 %	0 %	428223677
138	NC_019703	TGCCA	2	10	247577	247586	20 %	20 %	20 %	40 %	428223677
139	NC_019703	GCGGT	2	10	248208	248217	0 %	20 %	60 %	20 %	428223678
140	NC_019703	CGGCG	2	10	248251	248260	0 %	0 %	60 %	40 %	428223678
141	NC_019703	GCTTT	2	10	251175	251184	0 %	60 %	20 %	20 %	428223680
142	NC_019703	TGGCC	2	10	254091	254100	0 %	20 %	40 %	40 %	428223682
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145	NC_019703	TTCAG	2	10	266730	266739	20 %	40 %	20 %	20 %	428223690
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147	NC_019703	GGCGC	2	10	268893	268902	0 %	0 %	60 %	40 %	428223693
148	NC_019703	GTGCA	2	10	269857	269866	20 %	20 %	40 %	20 %	428223695
149	NC_019703	ACATC	2	10	270458	270467	40 %	20 %	0 %	40 %	428223695
150	NC_019703	CCCGA	2	10	273328	273337	20 %	0 %	20 %	60 %	428223697
151	NC_019703	CGGTT	2	10	273970	273979	0 %	40 %	40 %	20 %	428223698
152	NC_019703	ATACC	2	10	276151	276160	40 %	20 %	0 %	40 %	428223700
153	NC_019703	TACAC	2	10	278024	278033	40 %	20 %	0 %	40 %	428223702
154	NC_019703	CTGGA	2	10	278398	278407	20 %	20 %	40 %	20 %	428223702
155	NC_019703	GTCGG	2	10	278733	278742	0 %	20 %	60 %	20 %	428223703
156	NC_019703	CCCGT	2	10	285125	285134	0 %	20 %	20 %	60 %	428223712
157	NC_019703	TCCTG	2	10	289359	289368	0 %	40 %	20 %	40 %	428223714
158	NC_019703	GCCCA	2	10	290961	290970	20 %	0 %	20 %	60 %	428223716
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160	NC_019703	GGCTG	2	10	295207	295216	0 %	20 %	60 %	20 %	428223719
161	NC_019703	GGGGT	2	10	303165	303174	0 %	20 %	80 %	0 %	428223725
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164	NC_019703	GGCTC	2	10	310749	310758	0 %	20 %	40 %	40 %	428223732
165	NC_019703	GAGCT	2	10	311798	311807	20 %	20 %	40 %	20 %	428223733
166	NC_019703	CTGAG	2	10	314364	314373	20 %	20 %	40 %	20 %	428223733
167	NC_019703	GGCTG	2	10	314604	314613	0 %	20 %	60 %	20 %	428223733
168	NC_019703	GCGCT	2	10	314885	314894	0 %	20 %	40 %	40 %	428223733
169	NC_019703	CGAAA	2	10	315778	315787	60 %	0 %	20 %	20 %	428223734
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246	NC_019703	CCAGC	2	10	480606	480615	20 %	0 %	20 %	60 %	428223856
247	NC_019703	CGACC	2	10	482435	482444	20 %	0 %	20 %	60 %	428223858
248	NC_019703	GCCGC	2	10	482821	482830	0 %	0 %	40 %	60 %	428223858
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252	NC_019703	TGGTG	2	10	493951	493960	0 %	40 %	60 %	0 %	428223869
253	NC_019703	CGGCC	2	10	495404	495413	0 %	0 %	40 %	60 %	428223869
254	NC_019703	CGATG	2	10	496700	496709	20 %	20 %	40 %	20 %	428223871
255	NC_019703	TGAAG	2	10	496994	497003	40 %	20 %	40 %	0 %	428223871
256	NC_019703	CGTGC	2	10	497524	497533	0 %	20 %	40 %	40 %	428223872
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261	NC_019703	CCTTC	2	10	511474	511483	0 %	40 %	0 %	60 %	428223882
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263	NC_019703	GACGC	2	10	514416	514425	20 %	0 %	40 %	40 %	428223886
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500	NC_019703	CGTTC	2	10	950872	950881	0 %	40 %	20 %	40 %	428224238

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