MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 83774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019703	CTG	2	6	194030	194035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223628
3502	NC_019703	GCT	2	6	194193	194198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223628
3503	NC_019703	A	6	6	194218	194223	100 %	0 %	0 %	0 %	428223628
3504	NC_019703	GAG	2	6	194260	194265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223628
3505	NC_019703	CGC	2	6	194272	194277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223628
3506	NC_019703	AGC	2	6	194300	194305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223628
3507	NC_019703	CGC	2	6	194331	194336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223628
3508	NC_019703	CAA	2	6	194490	194495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223629
3509	NC_019703	CGCC	2	8	194633	194640	0 %	0 %	25 %	75 %	428223629
3510	NC_019703	TGC	2	6	194665	194670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3511	NC_019703	CGAT	2	8	194716	194723	25 %	25 %	25 %	25 %	428223629
3512	NC_019703	CAG	2	6	194775	194780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3513	NC_019703	CAG	2	6	194784	194789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3514	NC_019703	ACT	2	6	194839	194844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223629
3515	NC_019703	TTC	2	6	194874	194879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223629
3516	NC_019703	CGG	2	6	194908	194913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223629
3517	NC_019703	TTC	2	6	195024	195029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223629
3518	NC_019703	AGC	2	6	195049	195054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3519	NC_019703	TTG	2	6	195157	195162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223629
3520	NC_019703	ACG	2	6	195189	195194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3521	NC_019703	GTG	2	6	195225	195230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223629
3522	NC_019703	GCT	3	9	195279	195287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3523	NC_019703	GAAA	2	8	195302	195309	75 %	0 %	25 %	0 %	428223629
3524	NC_019703	CGG	2	6	195371	195376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223629
3525	NC_019703	GAA	2	6	195402	195407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223629
3526	NC_019703	CGG	2	6	195541	195546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223629
3527	NC_019703	GCCA	2	8	195555	195562	25 %	0 %	25 %	50 %	428223629
3528	NC_019703	GAG	2	6	195666	195671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223629
3529	NC_019703	G	6	6	195739	195744	0 %	0 %	100 %	0 %	428223629
3530	NC_019703	GGT	2	6	195755	195760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223629
3531	NC_019703	GCG	2	6	195775	195780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223629
3532	NC_019703	CGGTGC	2	12	195781	195792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428223629
3533	NC_019703	ACTG	2	8	195870	195877	25 %	25 %	25 %	25 %	428223629
3534	NC_019703	TCG	2	6	195951	195956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3535	NC_019703	TGG	2	6	196049	196054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223629
3536	NC_019703	CTG	2	6	196077	196082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3537	NC_019703	GCT	2	6	196151	196156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3538	NC_019703	CAC	2	6	196196	196201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223629
3539	NC_019703	AT	3	6	196208	196213	50 %	50 %	0 %	0 %	428223629
3540	NC_019703	CGG	3	9	196216	196224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223629
3541	NC_019703	GTCGAA	2	12	196301	196312	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428223629
3542	NC_019703	CCG	2	6	196392	196397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223629
3543	NC_019703	GAT	2	6	196416	196421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223629
3544	NC_019703	CTT	2	6	196445	196450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223629
3545	NC_019703	GT	3	6	196456	196461	0 %	50 %	50 %	0 %	428223629
3546	NC_019703	GTGA	2	8	196470	196477	25 %	25 %	50 %	0 %	428223629
3547	NC_019703	GCC	2	6	196485	196490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223629
3548	NC_019703	AGCT	2	8	196501	196508	25 %	25 %	25 %	25 %	428223629
3549	NC_019703	CGC	2	6	196520	196525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223629
3550	NC_019703	GCGCC	2	10	196574	196583	0 %	0 %	40 %	60 %	428223629
3551	NC_019703	GGAG	2	8	196619	196626	25 %	0 %	75 %	0 %	428223629
3552	NC_019703	CGG	2	6	196642	196647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223629
3553	NC_019703	GAT	2	6	196655	196660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223629
3554	NC_019703	TGC	3	9	196735	196743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223629
3555	NC_019703	GAG	2	6	196770	196775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223629
3556	NC_019703	CGG	2	6	196837	196842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223629
3557	NC_019703	GCC	2	6	196929	196934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223629
3558	NC_019703	TGT	2	6	197033	197038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223629
3559	NC_019703	T	6	6	197147	197152	0 %	100 %	0 %	0 %	428223630
3560	NC_019703	GAT	2	6	197349	197354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223630
3561	NC_019703	TCG	2	6	197431	197436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223630
3562	NC_019703	GCA	2	6	197442	197447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223630
3563	NC_019703	TCA	2	6	197479	197484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223630
3564	NC_019703	CA	3	6	197586	197591	50 %	0 %	0 %	50 %	428223630
3565	NC_019703	T	6	6	197781	197786	0 %	100 %	0 %	0 %	428223630
3566	NC_019703	CTCA	2	8	198349	198356	25 %	25 %	0 %	50 %	428223631
3567	NC_019703	GCT	2	6	198474	198479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223631
3568	NC_019703	CCA	2	6	198506	198511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223631
3569	NC_019703	GTT	2	6	198535	198540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223631
3570	NC_019703	AAT	2	6	198577	198582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223631
3571	NC_019703	CAG	2	6	198592	198597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223631
3572	NC_019703	CGA	2	6	198651	198656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223631
3573	NC_019703	ATT	2	6	198710	198715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223632
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3575	NC_019703	AGGT	2	8	198816	198823	25 %	25 %	50 %	0 %	428223632
3576	NC_019703	ATGGG	2	10	198880	198889	20 %	20 %	60 %	0 %	428223632
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3578	NC_019703	CCG	2	6	199149	199154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223632
3579	NC_019703	ATT	2	6	199217	199222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223632
3580	NC_019703	GGTGAC	2	12	199252	199263	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428223632
3581	NC_019703	CT	3	6	199298	199303	0 %	50 %	0 %	50 %	428223632
3582	NC_019703	TGA	2	6	199347	199352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223633
3583	NC_019703	TGC	2	6	199354	199359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223633
3584	NC_019703	GA	3	6	199380	199385	50 %	0 %	50 %	0 %	428223633
3585	NC_019703	GGC	2	6	199391	199396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223633
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3587	NC_019703	GCA	3	9	199510	199518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223633
3588	NC_019703	CAA	2	6	199587	199592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223633
3589	NC_019703	TCT	2	6	199682	199687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223633
3590	NC_019703	GA	3	6	199736	199741	50 %	0 %	50 %	0 %	428223633
3591	NC_019703	TTC	2	6	199919	199924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223633
3592	NC_019703	AGG	2	6	199932	199937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223633
3593	NC_019703	GCT	2	6	199969	199974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223633
3594	NC_019703	GCTA	2	8	199984	199991	25 %	25 %	25 %	25 %	428223633
3595	NC_019703	AGC	2	6	200059	200064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223633
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3598	NC_019703	AGC	2	6	200253	200258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223633
3599	NC_019703	GC	3	6	200362	200367	0 %	0 %	50 %	50 %	428223633
3600	NC_019703	CTG	2	6	200381	200386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223633
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3602	NC_019703	CG	4	8	200546	200553	0 %	0 %	50 %	50 %	428223633
3603	NC_019703	GCA	2	6	200574	200579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223633
3604	NC_019703	ACC	2	6	200616	200621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223633
3605	NC_019703	CTGG	2	8	200752	200759	0 %	25 %	50 %	25 %	428223633
3606	NC_019703	CAA	2	6	200798	200803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223633
3607	NC_019703	GAT	2	6	200811	200816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223633
3608	NC_019703	CAG	2	6	200818	200823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223633
3609	NC_019703	GAAG	2	8	200913	200920	50 %	0 %	50 %	0 %	428223633
3610	NC_019703	ACC	2	6	200977	200982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223633
3611	NC_019703	TGG	2	6	201059	201064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223633
3612	NC_019703	GAT	2	6	201120	201125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223633
3613	NC_019703	CGCT	2	8	201134	201141	0 %	25 %	25 %	50 %	428223633
3614	NC_019703	CTT	2	6	201213	201218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223633
3615	NC_019703	GAT	2	6	201225	201230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223633
3616	NC_019703	AAC	2	6	201238	201243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223633
3617	NC_019703	A	6	6	201268	201273	100 %	0 %	0 %	0 %	428223633
3618	NC_019703	A	6	6	201394	201399	100 %	0 %	0 %	0 %	428223633
3619	NC_019703	GATG	2	8	201428	201435	25 %	25 %	50 %	0 %	428223633
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3621	NC_019703	AGC	2	6	201563	201568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223633
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3970	NC_019703	GCCCC	2	10	218867	218876	0 %	0 %	20 %	80 %	428223657
3971	NC_019703	C	7	7	218873	218879	0 %	0 %	0 %	100 %	428223657
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3976	NC_019703	TGA	2	6	219064	219069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223657
3977	NC_019703	GCTCCA	2	12	219116	219127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428223657
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3980	NC_019703	CGCCGA	2	12	219368	219379	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428223657
3981	NC_019703	GAT	2	6	219380	219385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223657
3982	NC_019703	GGC	2	6	219456	219461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223657
3983	NC_019703	CACC	2	8	219500	219507	25 %	0 %	0 %	75 %	428223657
3984	NC_019703	ATCT	2	8	219519	219526	25 %	50 %	0 %	25 %	428223657
3985	NC_019703	CAC	2	6	219527	219532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223657
3986	NC_019703	GCC	2	6	219541	219546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223657
3987	NC_019703	ATG	2	6	219564	219569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223657
3988	NC_019703	CAG	2	6	219609	219614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223657
3989	NC_019703	TCG	2	6	219625	219630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223657
3990	NC_019703	GTG	4	12	219765	219776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223657
3991	NC_019703	GC	3	6	219843	219848	0 %	0 %	50 %	50 %	428223657
3992	NC_019703	GGC	2	6	219915	219920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223657
3993	NC_019703	CGG	2	6	220003	220008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223657
3994	NC_019703	GCG	2	6	220019	220024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223657
3995	NC_019703	TGG	2	6	220131	220136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223658
3996	NC_019703	CGG	2	6	220174	220179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223658
3997	NC_019703	CAG	2	6	220196	220201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223658
3998	NC_019703	CAG	2	6	220247	220252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223658
3999	NC_019703	CAT	2	6	220256	220261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223658
4000	NC_019703	CAG	2	6	220265	220270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223658

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