MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 83774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019703	GCTG	2	8	165047	165054	0 %	25 %	50 %	25 %	428223606
3002	NC_019703	CTG	2	6	165081	165086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223606
3003	NC_019703	GCC	2	6	165119	165124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223606
3004	NC_019703	GGA	2	6	165125	165130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223606
3005	NC_019703	TGG	2	6	165196	165201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223606
3006	NC_019703	TGGA	2	8	165225	165232	25 %	25 %	50 %	0 %	428223606
3007	NC_019703	TAG	2	6	165331	165336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223607
3008	NC_019703	CGC	2	6	165356	165361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223607
3009	NC_019703	GCT	2	6	165596	165601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223607
3010	NC_019703	GCT	2	6	165626	165631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223607
3011	NC_019703	CGGGG	2	10	165768	165777	0 %	0 %	80 %	20 %	428223607
3012	NC_019703	AGG	2	6	165799	165804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223607
3013	NC_019703	GCT	2	6	165810	165815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223607
3014	NC_019703	GCG	2	6	165838	165843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223607
3015	NC_019703	T	6	6	166363	166368	0 %	100 %	0 %	0 %	428223608
3016	NC_019703	GGC	2	6	166464	166469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223608
3017	NC_019703	G	7	7	166480	166486	0 %	0 %	100 %	0 %	428223608
3018	NC_019703	GCC	2	6	166506	166511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223608
3019	NC_019703	CGG	2	6	166541	166546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223608
3020	NC_019703	GGT	2	6	166560	166565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223608
3021	NC_019703	CAGCC	2	10	166644	166653	20 %	0 %	20 %	60 %	428223608
3022	NC_019703	CTG	2	6	166675	166680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3023	NC_019703	CGA	2	6	166785	166790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3024	NC_019703	AG	3	6	166872	166877	50 %	0 %	50 %	0 %	428223608
3025	NC_019703	GCT	2	6	166970	166975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3026	NC_019703	CGG	2	6	167006	167011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223608
3027	NC_019703	T	6	6	167046	167051	0 %	100 %	0 %	0 %	428223608
3028	NC_019703	GCT	2	6	167058	167063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3029	NC_019703	GGT	2	6	167121	167126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223608
3030	NC_019703	C	6	6	167198	167203	0 %	0 %	0 %	100 %	428223608
3031	NC_019703	CCA	2	6	167256	167261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223608
3032	NC_019703	AGCG	2	8	167301	167308	25 %	0 %	50 %	25 %	428223608
3033	NC_019703	GCTG	2	8	167312	167319	0 %	25 %	50 %	25 %	428223608
3034	NC_019703	GGA	2	6	167370	167375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223608
3035	NC_019703	ACC	2	6	167384	167389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223608
3036	NC_019703	CTG	2	6	167443	167448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3037	NC_019703	GGGGCT	2	12	167451	167462	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428223608
3038	NC_019703	CCCCA	2	10	167506	167515	20 %	0 %	0 %	80 %	428223608
3039	NC_019703	TCA	2	6	167552	167557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223608
3040	NC_019703	GTG	2	6	167596	167601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223608
3041	NC_019703	C	6	6	167605	167610	0 %	0 %	0 %	100 %	428223608
3042	NC_019703	GCC	2	6	167690	167695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223608
3043	NC_019703	CGG	2	6	167739	167744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223608
3044	NC_019703	TCG	2	6	167777	167782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3045	NC_019703	GTGG	2	8	167817	167824	0 %	25 %	75 %	0 %	428223608
3046	NC_019703	CGC	2	6	167847	167852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223608
3047	NC_019703	AGA	2	6	167898	167903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223608
3048	NC_019703	GCC	2	6	167942	167947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223608
3049	NC_019703	CAC	2	6	167994	167999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223608
3050	NC_019703	GCC	2	6	168008	168013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223608
3051	NC_019703	GCTG	2	8	168086	168093	0 %	25 %	50 %	25 %	428223608
3052	NC_019703	GCCT	2	8	168121	168128	0 %	25 %	25 %	50 %	428223608
3053	NC_019703	TGC	2	6	168176	168181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3054	NC_019703	GCG	2	6	168194	168199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223608
3055	NC_019703	CTG	2	6	168217	168222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3056	NC_019703	GT	3	6	168223	168228	0 %	50 %	50 %	0 %	428223608
3057	NC_019703	CCA	2	6	168297	168302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223608
3058	NC_019703	AGC	2	6	168342	168347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3059	NC_019703	TCA	2	6	168362	168367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223608
3060	NC_019703	AGG	2	6	168407	168412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223608
3061	NC_019703	GGT	2	6	168426	168431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223608
3062	NC_019703	GCG	2	6	168612	168617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223608
3063	NC_019703	GCC	2	6	168698	168703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223608
3064	NC_019703	ATC	2	6	168721	168726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223608
3065	NC_019703	CGG	2	6	168773	168778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223608
3066	NC_019703	GCT	2	6	168816	168821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3067	NC_019703	CGG	2	6	168833	168838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223608
3068	NC_019703	GCG	2	6	168849	168854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223608
3069	NC_019703	CAT	2	6	168858	168863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223608
3070	NC_019703	GCT	2	6	168870	168875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3071	NC_019703	CAGCT	2	10	168928	168937	20 %	20 %	20 %	40 %	428223608
3072	NC_019703	GAA	2	6	168970	168975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223608
3073	NC_019703	GGA	2	6	168981	168986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223608
3074	NC_019703	TCT	2	6	168989	168994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223608
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3079	NC_019703	AGC	2	6	169115	169120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223608
3080	NC_019703	TGA	2	6	169169	169174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223608
3081	NC_019703	GGCG	2	8	169188	169195	0 %	0 %	75 %	25 %	428223608
3082	NC_019703	TGG	2	6	169246	169251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223608
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3086	NC_019703	TGAT	2	8	169481	169488	25 %	50 %	25 %	0 %	428223608
3087	NC_019703	TGG	2	6	169533	169538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223609
3088	NC_019703	GCT	2	6	169781	169786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223609
3089	NC_019703	TAC	2	6	169926	169931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223609
3090	NC_019703	CTG	2	6	169932	169937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223609
3091	NC_019703	GAT	2	6	169953	169958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223609
3092	NC_019703	GGCTGA	2	12	170051	170062	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428223609
3093	NC_019703	GGC	2	6	170084	170089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223609
3094	NC_019703	TGG	2	6	170140	170145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223609
3095	NC_019703	CGC	2	6	170152	170157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223609
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3099	NC_019703	GCC	2	6	170271	170276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223609
3100	NC_019703	CAG	2	6	170280	170285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223609
3101	NC_019703	GCG	2	6	170330	170335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223609
3102	NC_019703	GCT	2	6	170343	170348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223610
3103	NC_019703	ATAA	2	8	170410	170417	75 %	25 %	0 %	0 %	428223610
3104	NC_019703	CAG	2	6	170434	170439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223610
3105	NC_019703	CAG	3	9	170533	170541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223610
3106	NC_019703	TCC	2	6	170642	170647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223610
3107	NC_019703	GTC	2	6	170695	170700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223610
3108	NC_019703	GGGC	2	8	170765	170772	0 %	0 %	75 %	25 %	428223610
3109	NC_019703	CA	3	6	170777	170782	50 %	0 %	0 %	50 %	428223610
3110	NC_019703	C	7	7	170805	170811	0 %	0 %	0 %	100 %	428223610
3111	NC_019703	CCA	2	6	170871	170876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223610
3112	NC_019703	GCG	2	6	170930	170935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223610
3113	NC_019703	CA	3	6	170963	170968	50 %	0 %	0 %	50 %	428223610
3114	NC_019703	AAG	3	9	171967	171975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223611
3115	NC_019703	CGC	2	6	171978	171983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223611
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3117	NC_019703	GC	3	6	172092	172097	0 %	0 %	50 %	50 %	428223611
3118	NC_019703	ATT	2	6	172113	172118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223611
3119	NC_019703	CCG	2	6	172152	172157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223611
3120	NC_019703	GCA	2	6	172202	172207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223611
3121	NC_019703	GGCG	2	8	172259	172266	0 %	0 %	75 %	25 %	428223611
3122	NC_019703	GGC	2	6	172274	172279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223611
3123	NC_019703	CGG	2	6	172351	172356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223611
3124	NC_019703	GCCCA	2	10	172368	172377	20 %	0 %	20 %	60 %	428223611
3125	NC_019703	CGG	2	6	172393	172398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223611
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3129	NC_019703	CTG	2	6	172824	172829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223611
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3153	NC_019703	TGC	3	9	173806	173814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223611
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3222	NC_019703	CGC	2	6	176849	176854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223614
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3227	NC_019703	TGG	2	6	177076	177081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223614
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3230	NC_019703	GGC	2	6	177280	177285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223614
3231	NC_019703	GTG	2	6	177435	177440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223614
3232	NC_019703	CTG	2	6	177450	177455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223614
3233	NC_019703	GCA	2	6	177497	177502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223614
3234	NC_019703	GCT	2	6	177689	177694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223614
3235	NC_019703	GGC	2	6	177695	177700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223614
3236	NC_019703	CGG	2	6	177733	177738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223614
3237	NC_019703	ACT	2	6	177739	177744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223614
3238	NC_019703	CGG	2	6	177757	177762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223614
3239	NC_019703	GGC	2	6	177780	177785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223614
3240	NC_019703	TAC	2	6	177962	177967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223615
3241	NC_019703	GATC	2	8	177994	178001	25 %	25 %	25 %	25 %	428223615
3242	NC_019703	CGG	2	6	178008	178013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223615
3243	NC_019703	AAG	2	6	178047	178052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223615
3244	NC_019703	A	6	6	178089	178094	100 %	0 %	0 %	0 %	428223615
3245	NC_019703	GCA	2	6	178171	178176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223616
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3255	NC_019703	GTC	2	6	178577	178582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223616
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3349	NC_019703	CGT	3	9	183552	183560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223619
3350	NC_019703	GCCA	2	8	183578	183585	25 %	0 %	25 %	50 %	428223619
3351	NC_019703	GCTCA	2	10	183625	183634	20 %	20 %	20 %	40 %	428223619
3352	NC_019703	GAT	2	6	183636	183641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223619
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3354	NC_019703	CGC	2	6	183682	183687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223619
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3357	NC_019703	GC	3	6	183765	183770	0 %	0 %	50 %	50 %	428223619
3358	NC_019703	GC	3	6	183827	183832	0 %	0 %	50 %	50 %	428223619
3359	NC_019703	CGG	2	6	183837	183842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223619
3360	NC_019703	CGT	2	6	183864	183869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223619
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3481	NC_019703	GCG	2	6	192460	192465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223627
3482	NC_019703	GCG	2	6	192672	192677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223627
3483	NC_019703	CAC	2	6	192693	192698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223627
3484	NC_019703	CTG	2	6	192782	192787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223627
3485	NC_019703	GCG	2	6	192810	192815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223627
3486	NC_019703	GCA	2	6	192860	192865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223627
3487	NC_019703	AG	3	6	192888	192893	50 %	0 %	50 %	0 %	428223627
3488	NC_019703	CGC	2	6	193560	193565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223628
3489	NC_019703	TAC	2	6	193588	193593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223628
3490	NC_019703	GCC	2	6	193603	193608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223628
3491	NC_019703	CCT	2	6	193613	193618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223628
3492	NC_019703	TGCCCA	2	12	193697	193708	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428223628
3493	NC_019703	TTG	2	6	193715	193720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223628
3494	NC_019703	CGA	2	6	193772	193777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223628
3495	NC_019703	CTC	2	6	193795	193800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223628
3496	NC_019703	CTCAG	2	10	193807	193816	20 %	20 %	20 %	40 %	428223628
3497	NC_019703	GGCG	2	8	193899	193906	0 %	0 %	75 %	25 %	428223628
3498	NC_019703	GCC	2	6	193964	193969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223628
3499	NC_019703	AAT	2	6	193984	193989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223628
3500	NC_019703	ATT	2	6	194011	194016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223628

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