MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT3

Total Repeats: 424

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018583	GATG	2	8	278	285	25 %	25 %	50 %	0 %	404217372
2	NC_018583	GCTG	2	8	551	558	0 %	25 %	50 %	25 %	404217372
3	NC_018583	GCTT	2	8	826	833	0 %	50 %	25 %	25 %	404217372
4	NC_018583	AAGG	2	8	888	895	50 %	0 %	50 %	0 %	404217372
5	NC_018583	CGAC	2	8	980	987	25 %	0 %	25 %	50 %	404217372
6	NC_018583	CCTG	2	8	1035	1042	0 %	25 %	25 %	50 %	404217372
7	NC_018583	ACCA	2	8	1114	1121	50 %	0 %	0 %	50 %	404217373
8	NC_018583	GTCA	2	8	1273	1280	25 %	25 %	25 %	25 %	404217373
9	NC_018583	ATCG	2	8	1520	1527	25 %	25 %	25 %	25 %	404217373
10	NC_018583	TCGC	2	8	1555	1562	0 %	25 %	25 %	50 %	404217373
11	NC_018583	CTGA	2	8	2118	2125	25 %	25 %	25 %	25 %	404217374
12	NC_018583	GTCG	2	8	2353	2360	0 %	25 %	50 %	25 %	404217374
13	NC_018583	CGAG	2	8	2438	2445	25 %	0 %	50 %	25 %	404217374
14	NC_018583	CCTC	2	8	2582	2589	0 %	25 %	0 %	75 %	404217374
15	NC_018583	CCGG	2	8	3030	3037	0 %	0 %	50 %	50 %	404217375
16	NC_018583	GGCG	2	8	3115	3122	0 %	0 %	75 %	25 %	404217375
17	NC_018583	TGGG	2	8	3164	3171	0 %	25 %	75 %	0 %	404217375
18	NC_018583	TCGA	2	8	3282	3289	25 %	25 %	25 %	25 %	404217375
19	NC_018583	GATT	2	8	3381	3388	25 %	50 %	25 %	0 %	404217375
20	NC_018583	GCGG	2	8	3792	3799	0 %	0 %	75 %	25 %	404217376
21	NC_018583	CCGG	2	8	4152	4159	0 %	0 %	50 %	50 %	404217376
22	NC_018583	CCCG	2	8	7170	7177	0 %	0 %	25 %	75 %	404217379
23	NC_018583	GACC	2	8	7276	7283	25 %	0 %	25 %	50 %	404217379
24	NC_018583	TCGG	2	8	7349	7356	0 %	25 %	50 %	25 %	404217379
25	NC_018583	GTGG	2	8	9306	9313	0 %	25 %	75 %	0 %	404217380
26	NC_018583	CCAC	2	8	9468	9475	25 %	0 %	0 %	75 %	404217380
27	NC_018583	GGCG	2	8	9911	9918	0 %	0 %	75 %	25 %	404217380
28	NC_018583	CCGA	2	8	9948	9955	25 %	0 %	25 %	50 %	404217380
29	NC_018583	CACT	2	8	10034	10041	25 %	25 %	0 %	50 %	404217381
30	NC_018583	TCGG	2	8	10763	10770	0 %	25 %	50 %	25 %	404217381
31	NC_018583	CTGG	2	8	11463	11470	0 %	25 %	50 %	25 %	404217382
32	NC_018583	CGGG	2	8	11996	12003	0 %	0 %	75 %	25 %	404217382
33	NC_018583	GCGG	2	8	12034	12041	0 %	0 %	75 %	25 %	404217382
34	NC_018583	CGGC	2	8	12242	12249	0 %	0 %	50 %	50 %	404217382
35	NC_018583	GAAC	2	8	12360	12367	50 %	0 %	25 %	25 %	404217382
36	NC_018583	GACA	2	8	12426	12433	50 %	0 %	25 %	25 %	404217383
37	NC_018583	CGCC	2	8	12927	12934	0 %	0 %	25 %	75 %	404217383
38	NC_018583	ACCG	2	8	13107	13114	25 %	0 %	25 %	50 %	404217383
39	NC_018583	CGGA	2	8	13218	13225	25 %	0 %	50 %	25 %	404217383
40	NC_018583	CGCC	2	8	13293	13300	0 %	0 %	25 %	75 %	404217383
41	NC_018583	GACC	2	8	13385	13392	25 %	0 %	25 %	50 %	404217383
42	NC_018583	TGCT	2	8	13490	13497	0 %	50 %	25 %	25 %	404217383
43	NC_018583	CGCC	2	8	13990	13997	0 %	0 %	25 %	75 %	404217384
44	NC_018583	CGGC	2	8	14061	14068	0 %	0 %	50 %	50 %	404217384
45	NC_018583	TGGA	2	8	14267	14274	25 %	25 %	50 %	0 %	404217384
46	NC_018583	GGCG	2	8	14718	14725	0 %	0 %	75 %	25 %	404217384
47	NC_018583	CGCC	2	8	14896	14903	0 %	0 %	25 %	75 %	404217384
48	NC_018583	CACC	2	8	15069	15076	25 %	0 %	0 %	75 %	404217385
49	NC_018583	CCGC	2	8	15222	15229	0 %	0 %	25 %	75 %	404217385
50	NC_018583	GCCC	2	8	15334	15341	0 %	0 %	25 %	75 %	404217385
51	NC_018583	CCGC	2	8	15655	15662	0 %	0 %	25 %	75 %	404217385
52	NC_018583	CCGC	2	8	16092	16099	0 %	0 %	25 %	75 %	404217385
53	NC_018583	CGGA	2	8	16389	16396	25 %	0 %	50 %	25 %	404217385
54	NC_018583	CTCG	2	8	17161	17168	0 %	25 %	25 %	50 %	404217386
55	NC_018583	CCGC	2	8	17279	17286	0 %	0 %	25 %	75 %	404217386
56	NC_018583	CCTC	2	8	17544	17551	0 %	25 %	0 %	75 %	404217387
57	NC_018583	GGGT	2	8	17954	17961	0 %	25 %	75 %	0 %	404217387
58	NC_018583	CCGG	2	8	17990	17997	0 %	0 %	50 %	50 %	404217387
59	NC_018583	CGGG	2	8	18015	18022	0 %	0 %	75 %	25 %	404217387
60	NC_018583	GCCC	2	8	18390	18397	0 %	0 %	25 %	75 %	404217387
61	NC_018583	CCCA	2	8	18752	18759	25 %	0 %	0 %	75 %	404217387
62	NC_018583	GCAA	2	8	19014	19021	50 %	0 %	25 %	25 %	404217387
63	NC_018583	CCCG	2	8	19344	19351	0 %	0 %	25 %	75 %	404217387
64	NC_018583	CACC	2	8	19646	19653	25 %	0 %	0 %	75 %	404217388
65	NC_018583	CCGC	2	8	19775	19782	0 %	0 %	25 %	75 %	404217388
66	NC_018583	GCGG	2	8	20557	20564	0 %	0 %	75 %	25 %	404217389
67	NC_018583	GGCG	2	8	20809	20816	0 %	0 %	75 %	25 %	404217390
68	NC_018583	TTCC	2	8	21015	21022	0 %	50 %	0 %	50 %	404217390
69	NC_018583	CCGC	2	8	21049	21056	0 %	0 %	25 %	75 %	404217390
70	NC_018583	GTGC	2	8	21500	21507	0 %	25 %	50 %	25 %	404217390
71	NC_018583	TCGG	2	8	21636	21643	0 %	25 %	50 %	25 %	404217390
72	NC_018583	GGCT	2	8	21669	21676	0 %	25 %	50 %	25 %	404217390
73	NC_018583	CGCC	2	8	21698	21705	0 %	0 %	25 %	75 %	404217390
74	NC_018583	ACCC	2	8	23010	23017	25 %	0 %	0 %	75 %	404217391
75	NC_018583	CCGC	2	8	24729	24736	0 %	0 %	25 %	75 %	404217393
76	NC_018583	CGGA	2	8	25146	25153	25 %	0 %	50 %	25 %	404217393
77	NC_018583	GCCA	2	8	25894	25901	25 %	0 %	25 %	50 %	404217393
78	NC_018583	CGAG	2	8	25990	25997	25 %	0 %	50 %	25 %	404217393
79	NC_018583	ACCC	2	8	26482	26489	25 %	0 %	0 %	75 %	404217393
80	NC_018583	GGTC	2	8	26706	26713	0 %	25 %	50 %	25 %	404217393
81	NC_018583	GACC	2	8	26721	26728	25 %	0 %	25 %	50 %	404217393
82	NC_018583	GGGC	2	8	26963	26970	0 %	0 %	75 %	25 %	404217393
83	NC_018583	CCCA	2	8	27344	27351	25 %	0 %	0 %	75 %	404217393
84	NC_018583	CGGG	2	8	27877	27884	0 %	0 %	75 %	25 %	404217393
85	NC_018583	CGCC	2	8	29107	29114	0 %	0 %	25 %	75 %	404217393
86	NC_018583	CTAC	2	8	30780	30787	25 %	25 %	0 %	50 %	404217394
87	NC_018583	GGGC	2	8	30875	30882	0 %	0 %	75 %	25 %	404217395
88	NC_018583	CGGG	3	12	31342	31353	0 %	0 %	75 %	25 %	404217395
89	NC_018583	CCGC	2	8	31772	31779	0 %	0 %	25 %	75 %	404217396
90	NC_018583	GGAC	2	8	32418	32425	25 %	0 %	50 %	25 %	404217397
91	NC_018583	GGGT	2	8	32521	32528	0 %	25 %	75 %	0 %	404217397
92	NC_018583	GCAC	2	8	32689	32696	25 %	0 %	25 %	50 %	404217397
93	NC_018583	CCGA	2	8	32756	32763	25 %	0 %	25 %	50 %	404217397
94	NC_018583	CCCG	2	8	32790	32797	0 %	0 %	25 %	75 %	404217397
95	NC_018583	GTCG	2	8	33246	33253	0 %	25 %	50 %	25 %	404217397
96	NC_018583	ACCA	2	8	33680	33687	50 %	0 %	0 %	50 %	404217397
97	NC_018583	GCGG	2	8	33819	33826	0 %	0 %	75 %	25 %	404217398
98	NC_018583	ACGA	2	8	33935	33942	50 %	0 %	25 %	25 %	404217398
99	NC_018583	CGCA	2	8	34253	34260	25 %	0 %	25 %	50 %	404217398
100	NC_018583	ACCC	2	8	35070	35077	25 %	0 %	0 %	75 %	404217399
101	NC_018583	CGCA	2	8	35324	35331	25 %	0 %	25 %	50 %	404217399
102	NC_018583	TCGG	2	8	36233	36240	0 %	25 %	50 %	25 %	404217400
103	NC_018583	TGCC	2	8	36896	36903	0 %	25 %	25 %	50 %	404217400
104	NC_018583	GCCC	2	8	36912	36919	0 %	0 %	25 %	75 %	404217400
105	NC_018583	TGGG	2	8	37566	37573	0 %	25 %	75 %	0 %	404217401
106	NC_018583	GTTG	2	8	38446	38453	0 %	50 %	50 %	0 %	404217402
107	NC_018583	CTGG	2	8	39271	39278	0 %	25 %	50 %	25 %	404217403
108	NC_018583	GCAC	2	8	39844	39851	25 %	0 %	25 %	50 %	404217403
109	NC_018583	AGGT	2	8	40114	40121	25 %	25 %	50 %	0 %	404217403
110	NC_018583	GGCG	2	8	40328	40335	0 %	0 %	75 %	25 %	404217403
111	NC_018583	TGGT	2	8	40528	40535	0 %	50 %	50 %	0 %	404217403
112	NC_018583	GGTC	2	8	40769	40776	0 %	25 %	50 %	25 %	404217403
113	NC_018583	GGCG	2	8	41132	41139	0 %	0 %	75 %	25 %	404217403
114	NC_018583	TGGG	2	8	41227	41234	0 %	25 %	75 %	0 %	404217403
115	NC_018583	CGGT	2	8	41275	41282	0 %	25 %	50 %	25 %	404217403
116	NC_018583	GCGG	2	8	41487	41494	0 %	0 %	75 %	25 %	404217403
117	NC_018583	GCGG	2	8	41577	41584	0 %	0 %	75 %	25 %	404217403
118	NC_018583	CGGT	2	8	41683	41690	0 %	25 %	50 %	25 %	404217403
119	NC_018583	TGGG	2	8	41953	41960	0 %	25 %	75 %	0 %	404217403
120	NC_018583	GGTG	2	8	42077	42084	0 %	25 %	75 %	0 %	404217403
121	NC_018583	AGAT	2	8	42409	42416	50 %	25 %	25 %	0 %	404217403
122	NC_018583	CGTT	2	8	42814	42821	0 %	50 %	25 %	25 %	404217403
123	NC_018583	CCAA	2	8	42887	42894	50 %	0 %	0 %	50 %	404217403
124	NC_018583	GCAC	2	8	44016	44023	25 %	0 %	25 %	50 %	404217403
125	NC_018583	GGTG	2	8	44609	44616	0 %	25 %	75 %	0 %	404217403
126	NC_018583	TCGC	2	8	44916	44923	0 %	25 %	25 %	50 %	404217403
127	NC_018583	CATC	2	8	45362	45369	25 %	25 %	0 %	50 %	404217403
128	NC_018583	CCAC	2	8	46589	46596	25 %	0 %	0 %	75 %	404217405
129	NC_018583	TGCG	2	8	46885	46892	0 %	25 %	50 %	25 %	404217405
130	NC_018583	ACCA	2	8	46977	46984	50 %	0 %	0 %	50 %	404217405
131	NC_018583	ACCT	2	8	47023	47030	25 %	25 %	0 %	50 %	404217405
132	NC_018583	GCGT	2	8	47547	47554	0 %	25 %	50 %	25 %	404217406
133	NC_018583	GTAC	2	8	47561	47568	25 %	25 %	25 %	25 %	404217406
134	NC_018583	GGCC	2	8	47834	47841	0 %	0 %	50 %	50 %	404217406
135	NC_018583	GGCG	2	8	47999	48006	0 %	0 %	75 %	25 %	404217406
136	NC_018583	GCCC	2	8	48077	48084	0 %	0 %	25 %	75 %	404217406
137	NC_018583	GTGC	2	8	48212	48219	0 %	25 %	50 %	25 %	404217407
138	NC_018583	CGGT	2	8	48293	48300	0 %	25 %	50 %	25 %	404217407
139	NC_018583	TGGG	2	8	48308	48315	0 %	25 %	75 %	0 %	404217407
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141	NC_018583	AGCG	2	8	49469	49476	25 %	0 %	50 %	25 %	404217409
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412	NC_018583	AACG	2	8	167358	167365	50 %	0 %	25 %	25 %	404217530
413	NC_018583	TCGA	2	8	167552	167559	25 %	25 %	25 %	25 %	404217530
414	NC_018583	TGGA	2	8	167635	167642	25 %	25 %	50 %	0 %	404217530
415	NC_018583	CACG	2	8	167676	167683	25 %	0 %	25 %	50 %	404217530
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417	NC_018583	GACC	2	8	169504	169511	25 %	0 %	25 %	50 %	404217531
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419	NC_018583	CGGC	2	8	169823	169830	0 %	0 %	50 %	50 %	404217532
420	NC_018583	TGCC	2	8	169985	169992	0 %	25 %	25 %	50 %	404217532
421	NC_018583	ACCG	2	8	171527	171534	25 %	0 %	25 %	50 %	404217533
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423	NC_018583	CATA	2	8	171856	171863	50 %	25 %	0 %	25 %	404217534
424	NC_018583	GCAT	2	8	172061	172068	25 %	25 %	25 %	25 %	404217534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.