MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT3

Total Repeats: 3588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018583	CAC	2	6	77	82	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217372
2	NC_018583	GGA	2	6	89	94	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404217372
3	NC_018583	GCC	2	6	207	212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217372
4	NC_018583	GATG	2	8	278	285	25 %	25 %	50 %	0 %	404217372
5	NC_018583	ACA	2	6	302	307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404217372
6	NC_018583	CGA	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217372
7	NC_018583	CA	3	6	451	456	50 %	0 %	0 %	50 %	404217372
8	NC_018583	GAT	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404217372
9	NC_018583	TCA	3	9	502	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404217372
10	NC_018583	TCT	2	6	536	541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404217372
11	NC_018583	GCTG	2	8	551	558	0 %	25 %	50 %	25 %	404217372
12	NC_018583	CGA	2	6	580	585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217372
13	NC_018583	GAC	2	6	591	596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217372
14	NC_018583	CAA	2	6	649	654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404217372
15	NC_018583	AG	3	6	720	725	50 %	0 %	50 %	0 %	404217372
16	NC_018583	GGA	2	6	753	758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404217372
17	NC_018583	GCTT	2	8	826	833	0 %	50 %	25 %	25 %	404217372
18	NC_018583	AAGG	2	8	888	895	50 %	0 %	50 %	0 %	404217372
19	NC_018583	GGC	2	6	898	903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217372
20	NC_018583	TC	3	6	930	935	0 %	50 %	0 %	50 %	404217372
21	NC_018583	AGA	2	6	938	943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404217372
22	NC_018583	TCC	2	6	949	954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404217372
23	NC_018583	TCC	2	6	967	972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404217372
24	NC_018583	CGAC	2	8	980	987	25 %	0 %	25 %	50 %	404217372
25	NC_018583	TCC	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404217372
26	NC_018583	CCTG	2	8	1035	1042	0 %	25 %	25 %	50 %	404217372
27	NC_018583	GCC	3	9	1099	1107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217373
28	NC_018583	ACCA	2	8	1114	1121	50 %	0 %	0 %	50 %	404217373
29	NC_018583	CGG	2	6	1137	1142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217373
30	NC_018583	CCA	2	6	1148	1153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217373
31	NC_018583	GTCA	2	8	1273	1280	25 %	25 %	25 %	25 %	404217373
32	NC_018583	CCA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217373
33	NC_018583	CA	3	6	1320	1325	50 %	0 %	0 %	50 %	404217373
34	NC_018583	AAC	2	6	1339	1344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404217373
35	NC_018583	TAG	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404217373
36	NC_018583	CAC	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217373
37	NC_018583	CCAGA	2	10	1458	1467	40 %	0 %	20 %	40 %	404217373
38	NC_018583	AGA	3	9	1465	1473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404217373
39	NC_018583	ATCG	2	8	1520	1527	25 %	25 %	25 %	25 %	404217373
40	NC_018583	TCGC	2	8	1555	1562	0 %	25 %	25 %	50 %	404217373
41	NC_018583	GGC	2	6	1573	1578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217373
42	NC_018583	CTGA	2	8	2118	2125	25 %	25 %	25 %	25 %	404217374
43	NC_018583	AGT	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404217374
44	NC_018583	GGT	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217374
45	NC_018583	GAT	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404217374
46	NC_018583	TCA	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404217374
47	NC_018583	GTCG	2	8	2353	2360	0 %	25 %	50 %	25 %	404217374
48	NC_018583	TCG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217374
49	NC_018583	CGAG	2	8	2438	2445	25 %	0 %	50 %	25 %	404217374
50	NC_018583	CCTC	2	8	2582	2589	0 %	25 %	0 %	75 %	404217374
51	NC_018583	GC	4	8	2594	2601	0 %	0 %	50 %	50 %	404217374
52	NC_018583	ACC	2	6	2616	2621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217374
53	NC_018583	CCG	2	6	2711	2716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217374
54	NC_018583	CCGG	2	8	3030	3037	0 %	0 %	50 %	50 %	404217375
55	NC_018583	GGCG	2	8	3115	3122	0 %	0 %	75 %	25 %	404217375
56	NC_018583	GTC	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217375
57	NC_018583	TGGG	2	8	3164	3171	0 %	25 %	75 %	0 %	404217375
58	NC_018583	CTT	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404217375
59	NC_018583	TCGA	2	8	3282	3289	25 %	25 %	25 %	25 %	404217375
60	NC_018583	GTG	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217375
61	NC_018583	CG	3	6	3370	3375	0 %	0 %	50 %	50 %	404217375
62	NC_018583	GATT	2	8	3381	3388	25 %	50 %	25 %	0 %	404217375
63	NC_018583	GCG	2	6	3525	3530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217376
64	NC_018583	GTCGGG	2	12	3573	3584	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404217376
65	NC_018583	G	6	6	3611	3616	0 %	0 %	100 %	0 %	404217376
66	NC_018583	GTC	2	6	3659	3664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217376
67	NC_018583	GCC	2	6	3729	3734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217376
68	NC_018583	CG	3	6	3750	3755	0 %	0 %	50 %	50 %	404217376
69	NC_018583	ACG	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217376
70	NC_018583	GGT	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217376
71	NC_018583	GCGG	2	8	3792	3799	0 %	0 %	75 %	25 %	404217376
72	NC_018583	GCC	2	6	3867	3872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217376
73	NC_018583	TGG	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217376
74	NC_018583	AGC	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217376
75	NC_018583	CTG	2	6	3990	3995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217376
76	NC_018583	GTT	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404217376
77	NC_018583	GGC	2	6	4112	4117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217376
78	NC_018583	CGA	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217376
79	NC_018583	GGC	2	6	4140	4145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217376
80	NC_018583	CCGG	2	8	4152	4159	0 %	0 %	50 %	50 %	404217376
81	NC_018583	CGT	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217376
82	NC_018583	CGATC	2	10	4307	4316	20 %	20 %	20 %	40 %	404217376
83	NC_018583	CGA	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217376
84	NC_018583	GGT	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217376
85	NC_018583	CGG	2	6	4513	4518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217376
86	NC_018583	TCA	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404217376
87	NC_018583	CGC	2	6	4592	4597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217376
88	NC_018583	TGC	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217376
89	NC_018583	TCG	2	6	4633	4638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217376
90	NC_018583	GCC	2	6	4794	4799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217376
91	NC_018583	AGC	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217376
92	NC_018583	CGT	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217376
93	NC_018583	CGA	2	6	4852	4857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217376
94	NC_018583	GGC	2	6	4880	4885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217376
95	NC_018583	CG	4	8	4886	4893	0 %	0 %	50 %	50 %	404217376
96	NC_018583	CGG	2	6	4910	4915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217376
97	NC_018583	TCG	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217376
98	NC_018583	AGCGGC	2	12	4935	4946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	404217376
99	NC_018583	TCG	2	6	4986	4991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217376
100	NC_018583	ACG	2	6	5010	5015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217376
101	NC_018583	GCC	2	6	5021	5026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217376
102	NC_018583	CCT	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404217376
103	NC_018583	GGC	2	6	5142	5147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217376
104	NC_018583	CCG	2	6	5160	5165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217376
105	NC_018583	GTG	2	6	5423	5428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217377
106	NC_018583	GGT	2	6	5487	5492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217377
107	NC_018583	ACG	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217377
108	NC_018583	TGG	2	6	5642	5647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217377
109	NC_018583	GCT	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217377
110	NC_018583	CGA	2	6	5709	5714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217377
111	NC_018583	GT	3	6	5762	5767	0 %	50 %	50 %	0 %	404217377
112	NC_018583	CGC	2	6	5799	5804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217377
113	NC_018583	GAC	2	6	5943	5948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217378
114	NC_018583	CAG	2	6	5974	5979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217378
115	NC_018583	CGA	2	6	5996	6001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217378
116	NC_018583	TGA	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404217378
117	NC_018583	GAG	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404217378
118	NC_018583	CCG	2	6	6164	6169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217378
119	NC_018583	GCT	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217378
120	NC_018583	GGC	2	6	6185	6190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217378
121	NC_018583	TGG	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217378
122	NC_018583	GCG	4	12	6253	6264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217378
123	NC_018583	TGC	2	6	6287	6292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217378
124	NC_018583	CCA	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217378
125	NC_018583	CG	3	6	6449	6454	0 %	0 %	50 %	50 %	404217378
126	NC_018583	GAG	2	6	6555	6560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404217378
127	NC_018583	CGACCC	2	12	6617	6628	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	404217378
128	NC_018583	CAC	3	9	6644	6652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217378
129	NC_018583	TCACC	2	10	6729	6738	20 %	20 %	0 %	60 %	404217379
130	NC_018583	CCCCG	2	10	6765	6774	0 %	0 %	20 %	80 %	404217379
131	NC_018583	GCACC	2	10	6796	6805	20 %	0 %	20 %	60 %	404217379
132	NC_018583	CCA	2	6	6809	6814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217379
133	NC_018583	TCG	2	6	6825	6830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217379
134	NC_018583	CCT	2	6	6877	6882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404217379
135	NC_018583	CGA	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217379
136	NC_018583	CGG	2	6	6964	6969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217379
137	NC_018583	TGG	2	6	6970	6975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217379
138	NC_018583	CGA	2	6	6979	6984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217379
139	NC_018583	GCA	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217379
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142	NC_018583	CCCG	2	8	7170	7177	0 %	0 %	25 %	75 %	404217379
143	NC_018583	GCCCC	2	10	7199	7208	0 %	0 %	20 %	80 %	404217379
144	NC_018583	TCG	2	6	7236	7241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217379
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146	NC_018583	GCGAA	2	10	7320	7329	40 %	0 %	40 %	20 %	404217379
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149	NC_018583	CAT	2	6	7396	7401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404217379
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151	NC_018583	CGC	2	6	7450	7455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217379
152	NC_018583	CGG	2	6	7462	7467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217379
153	NC_018583	TGG	2	6	7521	7526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404217379
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155	NC_018583	GCG	2	6	7559	7564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217379
156	NC_018583	GCC	2	6	7574	7579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217379
157	NC_018583	GCG	2	6	7583	7588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217379
158	NC_018583	TCG	2	6	7623	7628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217379
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161	NC_018583	CCG	2	6	7738	7743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217379
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163	NC_018583	CCG	2	6	7818	7823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217379
164	NC_018583	GCC	2	6	7829	7834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217379
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169	NC_018583	ACC	2	6	9097	9102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217380
170	NC_018583	TGA	2	6	9137	9142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404217380
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252	NC_018583	CGGG	2	8	11996	12003	0 %	0 %	75 %	25 %	404217382
253	NC_018583	CCG	2	6	12008	12013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217382
254	NC_018583	GCG	2	6	12020	12025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217382
255	NC_018583	GCGG	2	8	12034	12041	0 %	0 %	75 %	25 %	404217382
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257	NC_018583	CAC	3	9	12110	12118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217382
258	NC_018583	GC	3	6	12143	12148	0 %	0 %	50 %	50 %	404217382
259	NC_018583	CGG	2	6	12162	12167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217382
260	NC_018583	CGG	3	9	12189	12197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217382
261	NC_018583	GGC	3	9	12199	12207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404217382
262	NC_018583	CGGC	2	8	12242	12249	0 %	0 %	50 %	50 %	404217382
263	NC_018583	CCA	2	6	12308	12313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404217382
264	NC_018583	AGT	2	6	12331	12336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404217382
265	NC_018583	CCG	3	9	12337	12345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217382
266	NC_018583	GAAC	2	8	12360	12367	50 %	0 %	25 %	25 %	404217382
267	NC_018583	GCC	2	6	12384	12389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217382
268	NC_018583	GACA	2	8	12426	12433	50 %	0 %	25 %	25 %	404217383
269	NC_018583	CCG	2	6	12444	12449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217383
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271	NC_018583	CGA	2	6	12512	12517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217383
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275	NC_018583	TTC	2	6	12586	12591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404217383
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283	NC_018583	CGA	2	6	12983	12988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217383
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286	NC_018583	CGGAT	2	10	13135	13144	20 %	20 %	40 %	20 %	404217383
287	NC_018583	GC	3	6	13152	13157	0 %	0 %	50 %	50 %	404217383
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293	NC_018583	CGA	2	6	13317	13322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217383
294	NC_018583	TGA	2	6	13343	13348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404217383
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299	NC_018583	CTG	2	6	13501	13506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217383
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381	NC_018583	CAA	2	6	16957	16962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404217385
382	NC_018583	CCGCGG	2	12	16972	16983	0 %	0 %	50 %	50 %	404217385
383	NC_018583	AACCC	2	10	17090	17099	40 %	0 %	0 %	60 %	404217386
384	NC_018583	CGC	2	6	17101	17106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404217386
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386	NC_018583	CTCG	2	8	17161	17168	0 %	25 %	25 %	50 %	404217386
387	NC_018583	TCGCTG	2	12	17173	17184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404217386
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499	NC_018583	CAA	2	6	21278	21283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404217390
500	NC_018583	ACG	2	6	21295	21300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404217390

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