MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 chromosome

Total Repeats: 131943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018581	CGGG	2	8	40386	40393	0 %	0 %	75 %	25 %	404212671
1002	NC_018581	GCC	2	6	40402	40407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212671
1003	NC_018581	CCG	2	6	40454	40459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212671
1004	NC_018581	GCC	2	6	40525	40530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212671
1005	NC_018581	TGC	2	6	40566	40571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212671
1006	NC_018581	GTC	2	6	40618	40623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212671
1007	NC_018581	CGG	2	6	40632	40637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212671
1008	NC_018581	TGG	2	6	40647	40652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212671
1009	NC_018581	CGGACC	2	12	40721	40732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212671
1010	NC_018581	GCCGT	2	10	40778	40787	0 %	20 %	40 %	40 %	404212671
1011	NC_018581	AGT	2	6	40800	40805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212671
1012	NC_018581	GAT	2	6	40807	40812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212671
1013	NC_018581	TGT	2	6	40963	40968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212672
1014	NC_018581	CCG	2	6	41074	41079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212672
1015	NC_018581	CAA	2	6	41084	41089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212672
1016	NC_018581	AGG	2	6	41113	41118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212672
1017	NC_018581	CCG	2	6	41146	41151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212672
1018	NC_018581	GGC	2	6	41162	41167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212672
1019	NC_018581	CCG	2	6	41212	41217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212672
1020	NC_018581	TCGA	2	8	41236	41243	25 %	25 %	25 %	25 %	404212672
1021	NC_018581	CGG	2	6	41245	41250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212672
1022	NC_018581	CGGT	2	8	41258	41265	0 %	25 %	50 %	25 %	404212672
1023	NC_018581	CTC	2	6	41277	41282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212672
1024	NC_018581	CG	3	6	41301	41306	0 %	0 %	50 %	50 %	404212672
1025	NC_018581	TGG	2	6	41385	41390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212672
1026	NC_018581	CGA	2	6	41393	41398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212672
1027	NC_018581	GGTC	2	8	41404	41411	0 %	25 %	50 %	25 %	404212672
1028	NC_018581	GAA	2	6	41450	41455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212672
1029	NC_018581	CG	3	6	41547	41552	0 %	0 %	50 %	50 %	404212672
1030	NC_018581	GCTG	2	8	41560	41567	0 %	25 %	50 %	25 %	404212672
1031	NC_018581	CGC	2	6	41568	41573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212672
1032	NC_018581	ACG	2	6	41587	41592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212672
1033	NC_018581	CAA	2	6	41618	41623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212672
1034	NC_018581	GCG	2	6	41637	41642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212672
1035	NC_018581	CGC	2	6	41667	41672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212672
1036	NC_018581	AGG	2	6	41875	41880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212673
1037	NC_018581	GTT	2	6	41906	41911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212673
1038	NC_018581	CG	3	6	41934	41939	0 %	0 %	50 %	50 %	404212673
1039	NC_018581	TCT	2	6	42045	42050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212673
1040	NC_018581	TCG	2	6	42276	42281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212673
1041	NC_018581	GGA	2	6	42344	42349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212673
1042	NC_018581	CGAGT	2	10	42384	42393	20 %	20 %	40 %	20 %	404212673
1043	NC_018581	GTT	2	6	42546	42551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212674
1044	NC_018581	CT	3	6	42605	42610	0 %	50 %	0 %	50 %	404212674
1045	NC_018581	ACT	2	6	42650	42655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212674
1046	NC_018581	CTG	2	6	42657	42662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212674
1047	NC_018581	CGGCCG	2	12	42664	42675	0 %	0 %	50 %	50 %	404212674
1048	NC_018581	TGGC	2	8	42676	42683	0 %	25 %	50 %	25 %	404212674
1049	NC_018581	GCG	2	6	42709	42714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212674
1050	NC_018581	TG	3	6	42719	42724	0 %	50 %	50 %	0 %	404212674
1051	NC_018581	GACG	2	8	42810	42817	25 %	0 %	50 %	25 %	404212674
1052	NC_018581	GTC	2	6	42830	42835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212674
1053	NC_018581	CG	3	6	42902	42907	0 %	0 %	50 %	50 %	404212674
1054	NC_018581	TCG	2	6	42973	42978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212674
1055	NC_018581	GAT	2	6	42998	43003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212674
1056	NC_018581	AGC	2	6	43006	43011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212674
1057	NC_018581	AAG	2	6	43071	43076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212674
1058	NC_018581	AG	3	6	43108	43113	50 %	0 %	50 %	0 %	404212674
1059	NC_018581	GGC	2	6	43123	43128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212674
1060	NC_018581	GGT	2	6	43157	43162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212674
1061	NC_018581	CG	3	6	43278	43283	0 %	0 %	50 %	50 %	404212674
1062	NC_018581	GCT	2	6	43290	43295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212674
1063	NC_018581	GAG	2	6	43317	43322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212674
1064	NC_018581	AAG	2	6	43360	43365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212674
1065	NC_018581	AGA	2	6	43376	43381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212674
1066	NC_018581	TGT	2	6	43400	43405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212674
1067	NC_018581	GTG	2	6	43406	43411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212674
1068	NC_018581	AGTC	2	8	43503	43510	25 %	25 %	25 %	25 %	404212675
1069	NC_018581	GCA	2	6	43526	43531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1070	NC_018581	CGGG	2	8	43551	43558	0 %	0 %	75 %	25 %	404212675
1071	NC_018581	TTC	2	6	43650	43655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212675
1072	NC_018581	CAA	2	6	43705	43710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212675
1073	NC_018581	GATCC	2	10	43934	43943	20 %	20 %	20 %	40 %	404212675
1074	NC_018581	TCG	2	6	43947	43952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1075	NC_018581	AGC	2	6	44006	44011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1076	NC_018581	GGT	2	6	44221	44226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212675
1077	NC_018581	ACC	2	6	44235	44240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212675
1078	NC_018581	AC	3	6	44245	44250	50 %	0 %	0 %	50 %	404212675
1079	NC_018581	GCT	2	6	44313	44318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1080	NC_018581	CTTC	2	8	44349	44356	0 %	50 %	0 %	50 %	404212675
1081	NC_018581	GCT	2	6	44479	44484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1082	NC_018581	GCA	2	6	44504	44509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1083	NC_018581	GCG	2	6	44550	44555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212675
1084	NC_018581	TCA	2	6	44587	44592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212675
1085	NC_018581	TCGAC	2	10	44658	44667	20 %	20 %	20 %	40 %	404212675
1086	NC_018581	AG	3	6	44669	44674	50 %	0 %	50 %	0 %	404212675
1087	NC_018581	ACG	2	6	44724	44729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1088	NC_018581	GTC	2	6	44816	44821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1089	NC_018581	AGG	2	6	44865	44870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212675
1090	NC_018581	CTT	2	6	44882	44887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212675
1091	NC_018581	TTC	2	6	44927	44932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212675
1092	NC_018581	CGT	2	6	44954	44959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1093	NC_018581	ACG	2	6	44988	44993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212675
1094	NC_018581	CGG	2	6	45037	45042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212675
1095	NC_018581	CCT	2	6	45085	45090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212675
1096	NC_018581	TGC	2	6	45403	45408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212676
1097	NC_018581	TGGT	2	8	45438	45445	0 %	50 %	50 %	0 %	404212676
1098	NC_018581	CGACGG	2	12	45484	45495	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	404212676
1099	NC_018581	GCC	2	6	45544	45549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212676
1100	NC_018581	CTGG	2	8	45598	45605	0 %	25 %	50 %	25 %	404212676
1101	NC_018581	CGG	2	6	45662	45667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212676
1102	NC_018581	ATCCA	2	10	45675	45684	40 %	20 %	0 %	40 %	404212676
1103	NC_018581	CG	4	8	45719	45726	0 %	0 %	50 %	50 %	404212676
1104	NC_018581	TGG	2	6	46185	46190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212677
1105	NC_018581	TGC	2	6	46239	46244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212677
1106	NC_018581	CAA	2	6	46335	46340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212677
1107	NC_018581	CG	3	6	46439	46444	0 %	0 %	50 %	50 %	404212678
1108	NC_018581	TC	3	6	46464	46469	0 %	50 %	0 %	50 %	404212678
1109	NC_018581	GCC	2	6	46495	46500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212678
1110	NC_018581	TCC	2	6	46516	46521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212678
1111	NC_018581	GTCC	2	8	46523	46530	0 %	25 %	25 %	50 %	404212678
1112	NC_018581	GGC	2	6	46533	46538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212678
1113	NC_018581	GGT	2	6	46542	46547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212678
1114	NC_018581	ACG	2	6	46631	46636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212678
1115	NC_018581	TGCG	2	8	46670	46677	0 %	25 %	50 %	25 %	404212678
1116	NC_018581	CGA	2	6	46686	46691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212678
1117	NC_018581	GC	4	8	46697	46704	0 %	0 %	50 %	50 %	404212678
1118	NC_018581	GT	3	6	46715	46720	0 %	50 %	50 %	0 %	404212678
1119	NC_018581	GGT	2	6	46743	46748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212678
1120	NC_018581	GGCG	2	8	46773	46780	0 %	0 %	75 %	25 %	404212678
1121	NC_018581	CCA	2	6	46820	46825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212678
1122	NC_018581	TCA	2	6	46919	46924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212678
1123	NC_018581	GGTCAC	2	12	46962	46973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212678
1124	NC_018581	CGA	2	6	47040	47045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212678
1125	NC_018581	TCG	2	6	47114	47119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212678
1126	NC_018581	ACA	2	6	47126	47131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212678
1127	NC_018581	GAT	2	6	47151	47156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212678
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1132	NC_018581	GAT	2	6	47250	47255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212678
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1136	NC_018581	CG	3	6	47404	47409	0 %	0 %	50 %	50 %	404212678
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1139	NC_018581	ATC	2	6	47491	47496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212678
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1146	NC_018581	CCGG	2	8	47770	47777	0 %	0 %	50 %	50 %	404212678
1147	NC_018581	GC	4	8	47799	47806	0 %	0 %	50 %	50 %	404212678
1148	NC_018581	AGCGA	2	10	47828	47837	40 %	0 %	40 %	20 %	404212678
1149	NC_018581	GATCG	2	10	47848	47857	20 %	20 %	40 %	20 %	404212678
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1155	NC_018581	CAG	2	6	48095	48100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212679
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1159	NC_018581	GCCG	2	8	48321	48328	0 %	0 %	50 %	50 %	404212679
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1250	NC_018581	GGC	2	6	53124	53129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212683
1251	NC_018581	ATC	2	6	53131	53136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212683
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1253	NC_018581	CGT	2	6	53238	53243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212683
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1255	NC_018581	GAC	2	6	53277	53282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212683
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1282	NC_018581	TCG	3	9	54477	54485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212684
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1352	NC_018581	CCG	2	6	58921	58926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212688
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1357	NC_018581	CCAG	2	8	59144	59151	25 %	0 %	25 %	50 %	404212688
1358	NC_018581	TGCG	2	8	59181	59188	0 %	25 %	50 %	25 %	404212688
1359	NC_018581	GC	3	6	59222	59227	0 %	0 %	50 %	50 %	404212688
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1362	NC_018581	CG	3	6	59302	59307	0 %	0 %	50 %	50 %	404212688
1363	NC_018581	GC	3	6	59339	59344	0 %	0 %	50 %	50 %	404212688
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1370	NC_018581	CCG	2	6	59671	59676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212689
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1372	NC_018581	TGA	2	6	59706	59711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212689
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1489	NC_018581	CA	3	6	65056	65061	50 %	0 %	0 %	50 %	404212695
1490	NC_018581	CCGGTG	2	12	65062	65073	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404212695
1491	NC_018581	CGAC	2	8	65114	65121	25 %	0 %	25 %	50 %	404212695
1492	NC_018581	CGT	2	6	65204	65209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212695
1493	NC_018581	CGA	2	6	65225	65230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212695
1494	NC_018581	TCCGG	2	10	65284	65293	0 %	20 %	40 %	40 %	404212695
1495	NC_018581	CTC	2	6	65361	65366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212695
1496	NC_018581	GGGACG	2	12	65368	65379	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	404212695
1497	NC_018581	GGGC	2	8	65405	65412	0 %	0 %	75 %	25 %	404212695
1498	NC_018581	TGA	2	6	65460	65465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212695
1499	NC_018581	GC	3	6	65492	65497	0 %	0 %	50 %	50 %	404212695
1500	NC_018581	CGT	2	6	65510	65515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212695

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