MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT2

Total Repeats: 3503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018580	GGCT	2	8	28633	28640	0 %	25 %	50 %	25 %	404212415
502	NC_018580	GCC	2	6	28715	28720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212415
503	NC_018580	CGC	2	6	28768	28773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212415
504	NC_018580	GGC	2	6	28807	28812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212415
505	NC_018580	GAG	2	6	28838	28843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212415
506	NC_018580	CTC	2	6	28862	28867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212415
507	NC_018580	CGGG	2	8	28954	28961	0 %	0 %	75 %	25 %	404212415
508	NC_018580	CCAC	2	8	28962	28969	25 %	0 %	0 %	75 %	404212415
509	NC_018580	GCTG	2	8	29029	29036	0 %	25 %	50 %	25 %	404212415
510	NC_018580	CGACGT	2	12	29080	29091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404212415
511	NC_018580	CGGAAA	2	12	29431	29442	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404212416
512	NC_018580	AAG	2	6	29453	29458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212416
513	NC_018580	GAA	2	6	29497	29502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212416
514	NC_018580	GC	3	6	29522	29527	0 %	0 %	50 %	50 %	404212416
515	NC_018580	TCGA	2	8	29576	29583	25 %	25 %	25 %	25 %	404212416
516	NC_018580	CAG	2	6	29591	29596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212416
517	NC_018580	TCG	2	6	29631	29636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212416
518	NC_018580	CCG	2	6	29661	29666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212416
519	NC_018580	GCA	2	6	30006	30011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212417
520	NC_018580	TGG	2	6	30022	30027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212417
521	NC_018580	AGAA	2	8	30097	30104	75 %	0 %	25 %	0 %	404212417
522	NC_018580	CGA	2	6	30110	30115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212417
523	NC_018580	GGT	2	6	30158	30163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212417
524	NC_018580	TGG	2	6	30181	30186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212417
525	NC_018580	CTG	2	6	30213	30218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212417
526	NC_018580	CGG	2	6	30229	30234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212417
527	NC_018580	CGG	2	6	30271	30276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212417
528	NC_018580	CCG	2	6	30283	30288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212417
529	NC_018580	TCC	2	6	30384	30389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212418
530	NC_018580	TCG	2	6	30414	30419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212418
531	NC_018580	AGA	2	6	30421	30426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212418
532	NC_018580	CGC	2	6	30493	30498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212418
533	NC_018580	GTCA	2	8	30527	30534	25 %	25 %	25 %	25 %	404212418
534	NC_018580	CGA	3	9	31410	31418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212419
535	NC_018580	CGG	2	6	31491	31496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212419
536	NC_018580	GCA	2	6	31567	31572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212419
537	NC_018580	GCC	2	6	31577	31582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212419
538	NC_018580	GGCC	2	8	31647	31654	0 %	0 %	50 %	50 %	404212419
539	NC_018580	GCA	2	6	31681	31686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212419
540	NC_018580	GGCT	2	8	31733	31740	0 %	25 %	50 %	25 %	404212419
541	NC_018580	TGG	2	6	31779	31784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212419
542	NC_018580	GGC	2	6	31813	31818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212419
543	NC_018580	TACT	2	8	32240	32247	25 %	50 %	0 %	25 %	404212420
544	NC_018580	CGG	2	6	32258	32263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212420
545	NC_018580	CGC	2	6	32274	32279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212420
546	NC_018580	CGG	2	6	32286	32291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212420
547	NC_018580	CTG	2	6	32347	32352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212420
548	NC_018580	CGC	2	6	32467	32472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212420
549	NC_018580	GAA	2	6	32484	32489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212420
550	NC_018580	GACC	2	8	32496	32503	25 %	0 %	25 %	50 %	404212420
551	NC_018580	AAG	2	6	32533	32538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212420
552	NC_018580	CTGGG	2	10	32605	32614	0 %	20 %	60 %	20 %	404212420
553	NC_018580	AAG	2	6	32644	32649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212420
554	NC_018580	CGT	2	6	32684	32689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212420
555	NC_018580	ATCG	2	8	32724	32731	25 %	25 %	25 %	25 %	404212420
556	NC_018580	AGCA	2	8	32823	32830	50 %	0 %	25 %	25 %	404212420
557	NC_018580	TCG	2	6	32873	32878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212420
558	NC_018580	GAA	2	6	32910	32915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212420
559	NC_018580	CGGG	2	8	33005	33012	0 %	0 %	75 %	25 %	404212420
560	NC_018580	GTT	2	6	33028	33033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212420
561	NC_018580	AAG	2	6	33052	33057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212420
562	NC_018580	GAA	2	6	33126	33131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212420
563	NC_018580	AGA	2	6	33149	33154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212420
564	NC_018580	GTC	2	6	33169	33174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212420
565	NC_018580	TCGA	2	8	33205	33212	25 %	25 %	25 %	25 %	404212420
566	NC_018580	GCT	2	6	33225	33230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212420
567	NC_018580	TCG	2	6	33236	33241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212420
568	NC_018580	GTC	2	6	33256	33261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212420
569	NC_018580	GGC	2	6	33319	33324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212420
570	NC_018580	CCGG	2	8	33339	33346	0 %	0 %	50 %	50 %	404212420
571	NC_018580	AG	3	6	33403	33408	50 %	0 %	50 %	0 %	404212420
572	NC_018580	CTC	2	6	33418	33423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212420
573	NC_018580	GAA	2	6	33426	33431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212420
574	NC_018580	TCG	2	6	33503	33508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212420
575	NC_018580	GT	3	6	33545	33550	0 %	50 %	50 %	0 %	404212420
576	NC_018580	GAC	2	6	33562	33567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212420
577	NC_018580	CGA	2	6	33582	33587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212420
578	NC_018580	CGTT	2	8	33629	33636	0 %	50 %	25 %	25 %	404212420
579	NC_018580	CCACC	2	10	33658	33667	20 %	0 %	0 %	80 %	404212420
580	NC_018580	CGA	2	6	33668	33673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212420
581	NC_018580	GCTG	2	8	33677	33684	0 %	25 %	50 %	25 %	404212420
582	NC_018580	AGC	2	6	33689	33694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212420
583	NC_018580	CAA	2	6	33753	33758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212420
584	NC_018580	GAA	2	6	33786	33791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212420
585	NC_018580	ACC	2	6	33827	33832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212420
586	NC_018580	AC	3	6	33847	33852	50 %	0 %	0 %	50 %	404212420
587	NC_018580	CGA	2	6	33960	33965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212420
588	NC_018580	GCC	2	6	34068	34073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212420
589	NC_018580	CACTT	2	10	34076	34085	20 %	40 %	0 %	40 %	404212420
590	NC_018580	CG	4	8	34109	34116	0 %	0 %	50 %	50 %	404212420
591	NC_018580	AG	3	6	34118	34123	50 %	0 %	50 %	0 %	404212420
592	NC_018580	TGG	2	6	34166	34171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212420
593	NC_018580	GGACG	2	10	34263	34272	20 %	0 %	60 %	20 %	404212420
594	NC_018580	GC	3	6	34372	34377	0 %	0 %	50 %	50 %	404212420
595	NC_018580	CGA	2	6	34419	34424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212420
596	NC_018580	GA	3	6	34448	34453	50 %	0 %	50 %	0 %	404212420
597	NC_018580	GAT	2	6	34564	34569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212420
598	NC_018580	CGA	2	6	34846	34851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212421
599	NC_018580	GGC	2	6	34858	34863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212421
600	NC_018580	TCG	2	6	34926	34931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212421
601	NC_018580	GAC	2	6	34964	34969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212421
602	NC_018580	AGG	2	6	35007	35012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212421
603	NC_018580	CGTT	2	8	35075	35082	0 %	50 %	25 %	25 %	404212421
604	NC_018580	CA	4	8	35086	35093	50 %	0 %	0 %	50 %	404212421
605	NC_018580	AGGTG	2	10	35104	35113	20 %	20 %	60 %	0 %	404212421
606	NC_018580	GGC	2	6	35165	35170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212421
607	NC_018580	CCGG	2	8	35184	35191	0 %	0 %	50 %	50 %	404212421
608	NC_018580	GGC	2	6	35219	35224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212421
609	NC_018580	GTG	2	6	35228	35233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212421
610	NC_018580	GCC	2	6	35333	35338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212422
611	NC_018580	TGTTCG	2	12	35417	35428	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	404212422
612	NC_018580	TGC	2	6	35444	35449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212422
613	NC_018580	CCG	2	6	35513	35518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212422
614	NC_018580	TGA	2	6	35609	35614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212422
615	NC_018580	GTC	2	6	35725	35730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212422
616	NC_018580	CTG	2	6	35746	35751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212422
617	NC_018580	AGA	2	6	35801	35806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212422
618	NC_018580	ACC	2	6	35836	35841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212422
619	NC_018580	CGG	2	6	35873	35878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212422
620	NC_018580	GTT	2	6	35919	35924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212422
621	NC_018580	CAA	2	6	35958	35963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212422
622	NC_018580	CAGTT	2	10	35974	35983	20 %	40 %	20 %	20 %	404212422
623	NC_018580	GCT	2	6	36034	36039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212422
624	NC_018580	GC	3	6	36051	36056	0 %	0 %	50 %	50 %	404212422
625	NC_018580	GA	3	6	36062	36067	50 %	0 %	50 %	0 %	404212422
626	NC_018580	CCG	2	6	36084	36089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212422
627	NC_018580	TGC	2	6	36125	36130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212422
628	NC_018580	CCA	2	6	36319	36324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212423
629	NC_018580	AG	3	6	36361	36366	50 %	0 %	50 %	0 %	404212423
630	NC_018580	CGGC	2	8	36392	36399	0 %	0 %	50 %	50 %	404212423
631	NC_018580	ATC	2	6	36417	36422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212423
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633	NC_018580	ACG	2	6	36492	36497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212423
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636	NC_018580	CAC	2	6	36906	36911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212424
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639	NC_018580	TCG	2	6	36981	36986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212424
640	NC_018580	TGC	2	6	36988	36993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212424
641	NC_018580	ATCGG	2	10	36995	37004	20 %	20 %	40 %	20 %	404212424
642	NC_018580	CCA	2	6	37047	37052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212424
643	NC_018580	GCT	2	6	37081	37086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212424
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645	NC_018580	CG	3	6	37117	37122	0 %	0 %	50 %	50 %	404212424
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649	NC_018580	TCC	2	6	37299	37304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212424
650	NC_018580	GCACC	2	10	37419	37428	20 %	0 %	20 %	60 %	404212424
651	NC_018580	TGC	2	6	37434	37439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212424
652	NC_018580	GCT	2	6	37480	37485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212424
653	NC_018580	TCG	2	6	37509	37514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212424
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656	NC_018580	CCG	2	6	37713	37718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212424
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659	NC_018580	CGC	2	6	37879	37884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212424
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661	NC_018580	CCGA	2	8	37946	37953	25 %	0 %	25 %	50 %	404212424
662	NC_018580	GAG	2	6	37964	37969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212424
663	NC_018580	GGC	2	6	38053	38058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212424
664	NC_018580	GCA	2	6	38090	38095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212424
665	NC_018580	GATC	2	8	38149	38156	25 %	25 %	25 %	25 %	404212424
666	NC_018580	GCCG	2	8	38182	38189	0 %	0 %	50 %	50 %	404212424
667	NC_018580	CTT	2	6	38212	38217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212424
668	NC_018580	ATG	2	6	38249	38254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212424
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749	NC_018580	G	6	6	42462	42467	0 %	0 %	100 %	0 %	404212428
750	NC_018580	TGA	3	9	42480	42488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212428
751	NC_018580	AGT	2	6	42523	42528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212428
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753	NC_018580	CGC	2	6	42556	42561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212428
754	NC_018580	AGC	2	6	42583	42588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212428
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786	NC_018580	ACC	2	6	43921	43926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212428
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999	NC_018580	CA	3	6	53702	53707	50 %	0 %	0 %	50 %	404212435
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