MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017456	TGCG	2	8	237626	237633	0 %	25 %	50 %	25 %	385801180
4002	NC_017456	GCG	2	6	237831	237836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801180
4003	NC_017456	TTA	2	6	237934	237939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801181
4004	NC_017456	CTG	2	6	237991	237996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801181
4005	NC_017456	ATT	2	6	238113	238118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801181
4006	NC_017456	GCT	2	6	238215	238220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801181
4007	NC_017456	GAT	2	6	238233	238238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801181
4008	NC_017456	AAG	2	6	238276	238281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801181
4009	NC_017456	ATG	2	6	238300	238305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801181
4010	NC_017456	ATG	2	6	238345	238350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801181
4011	NC_017456	TGC	2	6	238367	238372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801181
4012	NC_017456	A	6	6	238480	238485	100 %	0 %	0 %	0 %	385801181
4013	NC_017456	A	6	6	238522	238527	100 %	0 %	0 %	0 %	385801181
4014	NC_017456	TA	3	6	238561	238566	50 %	50 %	0 %	0 %	385801181
4015	NC_017456	GT	3	6	238575	238580	0 %	50 %	50 %	0 %	385801181
4016	NC_017456	ATG	2	6	238602	238607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801181
4017	NC_017456	TTG	2	6	238633	238638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801181
4018	NC_017456	GAT	2	6	238656	238661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801181
4019	NC_017456	AGA	2	6	238763	238768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801181
4020	NC_017456	AAG	2	6	238773	238778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801181
4021	NC_017456	AGA	3	9	238787	238795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801181
4022	NC_017456	TGC	2	6	238820	238825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801181
4023	NC_017456	TAA	2	6	238847	238852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801181
4024	NC_017456	AAG	2	6	238936	238941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801182
4025	NC_017456	TAA	2	6	238946	238951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801182
4026	NC_017456	CAA	2	6	238954	238959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801182
4027	NC_017456	GTT	2	6	239051	239056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801182
4028	NC_017456	CAG	2	6	239145	239150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801182
4029	NC_017456	ATT	2	6	239151	239156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801182
4030	NC_017456	ATTG	2	8	239178	239185	25 %	50 %	25 %	0 %	385801182
4031	NC_017456	TGG	2	6	239204	239209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801182
4032	NC_017456	AGA	2	6	239312	239317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801182
4033	NC_017456	TGC	2	6	239336	239341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801182
4034	NC_017456	GAG	2	6	239391	239396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801182
4035	NC_017456	AAGC	2	8	239400	239407	50 %	0 %	25 %	25 %	385801182
4036	NC_017456	GAG	2	6	239415	239420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801182
4037	NC_017456	TGA	2	6	239576	239581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801182
4038	NC_017456	GTT	2	6	239601	239606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801182
4039	NC_017456	AAG	3	9	239733	239741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801182
4040	NC_017456	AG	3	6	239749	239754	50 %	0 %	50 %	0 %	385801182
4041	NC_017456	ACT	2	6	239815	239820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801182
4042	NC_017456	GAT	2	6	239876	239881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801182
4043	NC_017456	CTT	2	6	239987	239992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801182
4044	NC_017456	GCT	3	9	240084	240092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801182
4045	NC_017456	TTG	2	6	240150	240155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801182
4046	NC_017456	AGC	2	6	240196	240201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801182
4047	NC_017456	CTG	2	6	240211	240216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801182
4048	NC_017456	TGC	2	6	240230	240235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801182
4049	NC_017456	GCT	2	6	240240	240245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801182
4050	NC_017456	AAG	2	6	240303	240308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801182
4051	NC_017456	TTG	2	6	240412	240417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801182
4052	NC_017456	T	6	6	241753	241758	0 %	100 %	0 %	0 %	385801183
4053	NC_017456	TTG	2	6	241787	241792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801183
4054	NC_017456	ATT	2	6	241799	241804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801183
4055	NC_017456	TCT	2	6	241837	241842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801183
4056	NC_017456	T	6	6	241885	241890	0 %	100 %	0 %	0 %	385801183
4057	NC_017456	TTA	2	6	241907	241912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801183
4058	NC_017456	CAA	2	6	242008	242013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
4059	NC_017456	TAA	2	6	242049	242054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
4060	NC_017456	GCC	2	6	242088	242093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801183
4061	NC_017456	AGT	2	6	242119	242124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
4062	NC_017456	ATA	2	6	242150	242155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
4063	NC_017456	A	6	6	242155	242160	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
4064	NC_017456	AGC	2	6	242188	242193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801183
4065	NC_017456	ATAACA	2	12	242237	242248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385801183
4066	NC_017456	ATAA	2	8	242251	242258	75 %	25 %	0 %	0 %	385801183
4067	NC_017456	ATA	2	6	242336	242341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
4068	NC_017456	TAA	2	6	242352	242357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
4069	NC_017456	CAA	2	6	242367	242372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
4070	NC_017456	CAA	2	6	242382	242387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
4071	NC_017456	GGCG	2	8	242388	242395	0 %	0 %	75 %	25 %	385801183
4072	NC_017456	A	6	6	242509	242514	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
4073	NC_017456	TA	4	8	242550	242557	50 %	50 %	0 %	0 %	385801183
4074	NC_017456	ATAG	2	8	242572	242579	50 %	25 %	25 %	0 %	385801183
4075	NC_017456	T	6	6	242589	242594	0 %	100 %	0 %	0 %	385801183
4076	NC_017456	AGA	2	6	242595	242600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801183
4077	NC_017456	GGC	2	6	242608	242613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801183
4078	NC_017456	TAT	2	6	242671	242676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801183
4079	NC_017456	CTG	2	6	242705	242710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801183
4080	NC_017456	AAT	2	6	242806	242811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
4081	NC_017456	CAA	2	6	242831	242836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
4082	NC_017456	ACT	2	6	242854	242859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801183
4083	NC_017456	CG	3	6	242866	242871	0 %	0 %	50 %	50 %	385801183
4084	NC_017456	AAATA	2	10	242879	242888	80 %	20 %	0 %	0 %	385801183
4085	NC_017456	ATT	2	6	242912	242917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801183
4086	NC_017456	TAA	2	6	242976	242981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
4087	NC_017456	A	6	6	243027	243032	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
4088	NC_017456	TAG	2	6	243213	243218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
4089	NC_017456	TAA	2	6	243282	243287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
4090	NC_017456	GAT	3	9	243313	243321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
4091	NC_017456	ATC	2	6	243440	243445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801183
4092	NC_017456	A	6	6	243525	243530	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
4093	NC_017456	TGA	2	6	243585	243590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
4094	NC_017456	T	6	6	243649	243654	0 %	100 %	0 %	0 %	385801183
4095	NC_017456	TC	3	6	243680	243685	0 %	50 %	0 %	50 %	385801183
4096	NC_017456	ATTG	2	8	243709	243716	25 %	50 %	25 %	0 %	385801183
4097	NC_017456	TCC	2	6	243756	243761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801183
4098	NC_017456	TTC	2	6	243798	243803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801183
4099	NC_017456	AAT	2	6	243814	243819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
4100	NC_017456	AGC	2	6	243823	243828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801183
4101	NC_017456	TAATG	2	10	243870	243879	40 %	40 %	20 %	0 %	385801183
4102	NC_017456	TA	3	6	244044	244049	50 %	50 %	0 %	0 %	385801183
4103	NC_017456	GAT	2	6	244063	244068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
4104	NC_017456	A	6	6	244088	244093	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
4105	NC_017456	TAA	2	6	244104	244109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
4106	NC_017456	GAT	2	6	244129	244134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
4107	NC_017456	ACA	2	6	244153	244158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
4108	NC_017456	GT	3	6	244200	244205	0 %	50 %	50 %	0 %	385801183
4109	NC_017456	AGA	2	6	244233	244238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801183
4110	NC_017456	AAC	2	6	244251	244256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
4111	NC_017456	TTG	2	6	244304	244309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801183
4112	NC_017456	CGAA	2	8	244374	244381	50 %	0 %	25 %	25 %	385801183
4113	NC_017456	GCC	2	6	244408	244413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801183
4114	NC_017456	GCA	2	6	244432	244437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801183
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4116	NC_017456	GGC	2	6	244491	244496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801183
4117	NC_017456	GCG	2	6	244721	244726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801184
4118	NC_017456	TCGC	2	8	244733	244740	0 %	25 %	25 %	50 %	385801184
4119	NC_017456	TGGC	2	8	244743	244750	0 %	25 %	50 %	25 %	385801184
4120	NC_017456	CCA	2	6	244808	244813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801184
4121	NC_017456	TTC	2	6	245035	245040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801184
4122	NC_017456	GCAA	2	8	245044	245051	50 %	0 %	25 %	25 %	385801184
4123	NC_017456	TGC	2	6	245089	245094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801184
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4244	NC_017456	CTT	2	6	251881	251886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801187
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4363	NC_017456	TGC	2	6	258828	258833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801195
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4477	NC_017456	GA	3	6	265573	265578	50 %	0 %	50 %	0 %	385801200
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4484	NC_017456	GC	3	6	265893	265898	0 %	0 %	50 %	50 %	385801200
4485	NC_017456	TTTAC	2	10	265934	265943	20 %	60 %	0 %	20 %	385801200
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4487	NC_017456	GTT	2	6	265969	265974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801200
4488	NC_017456	TTG	2	6	266240	266245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801200
4489	NC_017456	GC	3	6	266252	266257	0 %	0 %	50 %	50 %	385801200
4490	NC_017456	TGG	2	6	266332	266337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
4491	NC_017456	GTG	2	6	266531	266536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
4492	NC_017456	AGA	2	6	266568	266573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801200
4493	NC_017456	A	7	7	266586	266592	100 %	0 %	0 %	0 %	385801200
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4500	NC_017456	ATG	2	6	266873	266878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200

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