MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017456	AATTGG	2	12	207105	207116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801155
3502	NC_017456	TAA	2	6	207159	207164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801155
3503	NC_017456	TAC	2	6	207172	207177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801155
3504	NC_017456	TTG	2	6	207290	207295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801155
3505	NC_017456	ATG	2	6	207319	207324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801155
3506	NC_017456	TTTG	2	8	207338	207345	0 %	75 %	25 %	0 %	385801155
3507	NC_017456	TGCT	2	8	207380	207387	0 %	50 %	25 %	25 %	385801155
3508	NC_017456	TTC	2	6	207399	207404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801155
3509	NC_017456	TAT	2	6	207414	207419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801155
3510	NC_017456	GTG	2	6	207450	207455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801155
3511	NC_017456	CTT	2	6	207457	207462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801155
3512	NC_017456	CTA	2	6	207503	207508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801155
3513	NC_017456	TAT	2	6	207618	207623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801155
3514	NC_017456	GAT	2	6	207624	207629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801155
3515	NC_017456	CAA	2	6	207634	207639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801155
3516	NC_017456	GA	3	6	207686	207691	50 %	0 %	50 %	0 %	385801155
3517	NC_017456	TTC	2	6	207692	207697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801155
3518	NC_017456	CTA	2	6	207704	207709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801155
3519	NC_017456	TCT	2	6	207741	207746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801155
3520	NC_017456	GAA	2	6	207937	207942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801155
3521	NC_017456	AT	3	6	207957	207962	50 %	50 %	0 %	0 %	385801155
3522	NC_017456	ACT	2	6	207972	207977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801155
3523	NC_017456	A	6	6	207987	207992	100 %	0 %	0 %	0 %	385801155
3524	NC_017456	TGC	2	6	207996	208001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801155
3525	NC_017456	TGG	2	6	208146	208151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801155
3526	NC_017456	ATT	2	6	208186	208191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801155
3527	NC_017456	TCT	2	6	208472	208477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801156
3528	NC_017456	CTT	2	6	208535	208540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801156
3529	NC_017456	AAT	2	6	208601	208606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801156
3530	NC_017456	CTTT	2	8	208626	208633	0 %	75 %	0 %	25 %	385801157
3531	NC_017456	GAAC	2	8	208709	208716	50 %	0 %	25 %	25 %	385801157
3532	NC_017456	TCT	2	6	208720	208725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801157
3533	NC_017456	T	6	6	208748	208753	0 %	100 %	0 %	0 %	385801157
3534	NC_017456	ATA	2	6	208835	208840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801157
3535	NC_017456	CCAT	2	8	208883	208890	25 %	25 %	0 %	50 %	385801157
3536	NC_017456	A	6	6	209199	209204	100 %	0 %	0 %	0 %	385801158
3537	NC_017456	TTGT	2	8	209207	209214	0 %	75 %	25 %	0 %	385801158
3538	NC_017456	TGA	2	6	209228	209233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801158
3539	NC_017456	AAG	2	6	209258	209263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801158
3540	NC_017456	ACA	2	6	209279	209284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801158
3541	NC_017456	T	6	6	209308	209313	0 %	100 %	0 %	0 %	385801158
3542	NC_017456	GC	3	6	209332	209337	0 %	0 %	50 %	50 %	385801158
3543	NC_017456	CAA	2	6	209340	209345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801158
3544	NC_017456	ATT	2	6	209373	209378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801158
3545	NC_017456	AAG	2	6	209400	209405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801158
3546	NC_017456	TCT	2	6	209422	209427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801158
3547	NC_017456	CAA	2	6	209429	209434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801158
3548	NC_017456	CCA	2	6	209475	209480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801158
3549	NC_017456	ACT	2	6	209610	209615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801158
3550	NC_017456	TTA	2	6	209653	209658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801158
3551	NC_017456	T	6	6	209715	209720	0 %	100 %	0 %	0 %	385801158
3552	NC_017456	TTTC	2	8	209752	209759	0 %	75 %	0 %	25 %	385801158
3553	NC_017456	TTA	2	6	209992	209997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801158
3554	NC_017456	TA	3	6	210009	210014	50 %	50 %	0 %	0 %	385801158
3555	NC_017456	TCC	2	6	210024	210029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801158
3556	NC_017456	ATT	2	6	210069	210074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801158
3557	NC_017456	CACTT	2	10	210165	210174	20 %	40 %	0 %	40 %	385801158
3558	NC_017456	TCG	2	6	210298	210303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801158
3559	NC_017456	TTG	2	6	210354	210359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801158
3560	NC_017456	CAA	2	6	210362	210367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801158
3561	NC_017456	CGT	2	6	210377	210382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801158
3562	NC_017456	ATT	2	6	210387	210392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801158
3563	NC_017456	GAA	2	6	210420	210425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801158
3564	NC_017456	CAA	2	6	210632	210637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801158
3565	NC_017456	TCAGC	2	10	210945	210954	20 %	20 %	20 %	40 %	385801159
3566	NC_017456	TTTC	2	8	210987	210994	0 %	75 %	0 %	25 %	385801159
3567	NC_017456	TCA	2	6	211001	211006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801159
3568	NC_017456	CTG	2	6	211086	211091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801159
3569	NC_017456	GAGT	2	8	211448	211455	25 %	25 %	50 %	0 %	385801160
3570	NC_017456	GAT	3	9	211467	211475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801160
3571	NC_017456	TGC	2	6	211493	211498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801160
3572	NC_017456	TTG	2	6	211521	211526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801160
3573	NC_017456	GAAA	2	8	211565	211572	75 %	0 %	25 %	0 %	385801160
3574	NC_017456	AGACG	2	10	211620	211629	40 %	0 %	40 %	20 %	385801160
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3578	NC_017456	CCAGAG	2	12	211945	211956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801161
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3584	NC_017456	TTC	2	6	212197	212202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801161
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3589	NC_017456	GCA	2	6	212386	212391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801161
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3592	NC_017456	GC	3	6	212538	212543	0 %	0 %	50 %	50 %	385801161
3593	NC_017456	CGTG	3	12	212595	212606	0 %	25 %	50 %	25 %	385801161
3594	NC_017456	CTGG	2	8	212637	212644	0 %	25 %	50 %	25 %	385801161
3595	NC_017456	AGT	2	6	212676	212681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801161
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3602	NC_017456	GTA	2	6	213130	213135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801162
3603	NC_017456	AGT	2	6	213190	213195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801162
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3605	NC_017456	AAT	2	6	213268	213273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801162
3606	NC_017456	CCAA	2	8	213280	213287	50 %	0 %	0 %	50 %	385801162
3607	NC_017456	GCA	2	6	213335	213340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801162
3608	NC_017456	GTA	2	6	213343	213348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801162
3609	NC_017456	GGA	2	6	213446	213451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801162
3610	NC_017456	TCG	2	6	213494	213499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801162
3611	NC_017456	CAAA	2	8	213549	213556	75 %	0 %	0 %	25 %	385801162
3612	NC_017456	AGCG	2	8	213584	213591	25 %	0 %	50 %	25 %	385801162
3613	NC_017456	AGT	2	6	213615	213620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801162
3614	NC_017456	CGA	2	6	213851	213856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801162
3615	NC_017456	AATC	2	8	213870	213877	50 %	25 %	0 %	25 %	385801162
3616	NC_017456	GC	4	8	213903	213910	0 %	0 %	50 %	50 %	385801162
3617	NC_017456	TGCT	2	8	214029	214036	0 %	50 %	25 %	25 %	385801162
3618	NC_017456	CAAA	2	8	214119	214126	75 %	0 %	0 %	25 %	385801162
3619	NC_017456	CTT	2	6	214195	214200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801162
3620	NC_017456	CGT	2	6	214284	214289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801162
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3622	NC_017456	TCT	2	6	214383	214388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801162
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3739	NC_017456	GC	3	6	221559	221564	0 %	0 %	50 %	50 %	385801168
3740	NC_017456	TGT	2	6	221661	221666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801168
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