MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017456	AAACG	2	10	182194	182203	60 %	0 %	20 %	20 %	385801135
3002	NC_017456	CGT	2	6	182232	182237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801135
3003	NC_017456	ATT	2	6	182272	182277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801135
3004	NC_017456	AAT	2	6	182294	182299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801135
3005	NC_017456	TTA	2	6	182348	182353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801135
3006	NC_017456	ACA	2	6	182388	182393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801135
3007	NC_017456	GGC	2	6	182465	182470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801135
3008	NC_017456	TGC	2	6	182499	182504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801135
3009	NC_017456	CTT	2	6	182576	182581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801135
3010	NC_017456	A	6	6	182591	182596	100 %	0 %	0 %	0 %	385801135
3011	NC_017456	AAGAA	2	10	182637	182646	80 %	0 %	20 %	0 %	385801135
3012	NC_017456	ATG	2	6	182688	182693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801135
3013	NC_017456	GCG	2	6	182721	182726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801135
3014	NC_017456	TAA	2	6	182755	182760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801135
3015	NC_017456	GTT	2	6	182774	182779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801135
3016	NC_017456	TCC	2	6	182785	182790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801135
3017	NC_017456	TGA	2	6	182826	182831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801135
3018	NC_017456	TGC	3	9	182932	182940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801135
3019	NC_017456	TTGT	2	8	182943	182950	0 %	75 %	25 %	0 %	385801135
3020	NC_017456	TTGT	2	8	183122	183129	0 %	75 %	25 %	0 %	385801135
3021	NC_017456	GAA	2	6	183257	183262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801135
3022	NC_017456	AATA	2	8	183272	183279	75 %	25 %	0 %	0 %	385801135
3023	NC_017456	ATA	2	6	183444	183449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801135
3024	NC_017456	AGC	2	6	183548	183553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801136
3025	NC_017456	AT	3	6	183561	183566	50 %	50 %	0 %	0 %	385801136
3026	NC_017456	ATG	2	6	183584	183589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801136
3027	NC_017456	CTG	2	6	183614	183619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801136
3028	NC_017456	ATA	2	6	183656	183661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801136
3029	NC_017456	TTTA	2	8	183662	183669	25 %	75 %	0 %	0 %	385801136
3030	NC_017456	ATT	2	6	183691	183696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801136
3031	NC_017456	TGA	2	6	183699	183704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801136
3032	NC_017456	ATC	2	6	183750	183755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801136
3033	NC_017456	CTT	2	6	183820	183825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801136
3034	NC_017456	TCT	2	6	183832	183837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801136
3035	NC_017456	CCG	2	6	183892	183897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801136
3036	NC_017456	CAG	2	6	183950	183955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801136
3037	NC_017456	CAG	2	6	183962	183967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801136
3038	NC_017456	GAC	2	6	184024	184029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801136
3039	NC_017456	GCTT	2	8	184043	184050	0 %	50 %	25 %	25 %	385801136
3040	NC_017456	AAG	2	6	184084	184089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801136
3041	NC_017456	AAT	2	6	184189	184194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801136
3042	NC_017456	TATG	2	8	184221	184228	25 %	50 %	25 %	0 %	385801136
3043	NC_017456	GTAT	2	8	184356	184363	25 %	50 %	25 %	0 %	385801136
3044	NC_017456	GAA	2	6	184386	184391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801136
3045	NC_017456	AGTAA	2	10	184441	184450	60 %	20 %	20 %	0 %	385801136
3046	NC_017456	GCC	2	6	184461	184466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801136
3047	NC_017456	GCAA	2	8	184565	184572	50 %	0 %	25 %	25 %	385801136
3048	NC_017456	TAT	2	6	184579	184584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801136
3049	NC_017456	GCGT	2	8	184608	184615	0 %	25 %	50 %	25 %	385801136
3050	NC_017456	A	6	6	184724	184729	100 %	0 %	0 %	0 %	385801137
3051	NC_017456	CAG	2	6	184752	184757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801137
3052	NC_017456	CTA	2	6	184768	184773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801137
3053	NC_017456	TTC	2	6	184794	184799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801137
3054	NC_017456	TAG	2	6	184871	184876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801137
3055	NC_017456	AAT	2	6	184888	184893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801137
3056	NC_017456	TA	3	6	184907	184912	50 %	50 %	0 %	0 %	385801137
3057	NC_017456	ACT	2	6	184919	184924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801137
3058	NC_017456	CTT	2	6	184964	184969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801137
3059	NC_017456	AAT	2	6	184975	184980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801137
3060	NC_017456	GCA	2	6	184994	184999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801137
3061	NC_017456	GAA	2	6	185035	185040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801137
3062	NC_017456	ATT	2	6	185050	185055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801137
3063	NC_017456	GGA	2	6	185122	185127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801137
3064	NC_017456	ATAC	2	8	185132	185139	50 %	25 %	0 %	25 %	385801137
3065	NC_017456	AT	3	6	185154	185159	50 %	50 %	0 %	0 %	385801137
3066	NC_017456	A	6	6	185161	185166	100 %	0 %	0 %	0 %	385801137
3067	NC_017456	ATAA	2	8	185179	185186	75 %	25 %	0 %	0 %	385801137
3068	NC_017456	AAG	2	6	185254	185259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801137
3069	NC_017456	GCT	2	6	185278	185283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801137
3070	NC_017456	TCT	2	6	185395	185400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801137
3071	NC_017456	TCA	2	6	185442	185447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801137
3072	NC_017456	TTC	2	6	185508	185513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801137
3073	NC_017456	TTA	2	6	185515	185520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801137
3074	NC_017456	TGC	2	6	185544	185549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801137
3075	NC_017456	GAA	2	6	185638	185643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801137
3076	NC_017456	ACG	2	6	185805	185810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801138
3077	NC_017456	GAA	2	6	185837	185842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801138
3078	NC_017456	TCA	2	6	185847	185852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801138
3079	NC_017456	A	6	6	186062	186067	100 %	0 %	0 %	0 %	385801138
3080	NC_017456	TAT	2	6	186094	186099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801138
3081	NC_017456	ATG	2	6	186180	186185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801138
3082	NC_017456	AACTC	2	10	186404	186413	40 %	20 %	0 %	40 %	385801138
3083	NC_017456	AAT	2	6	186416	186421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801138
3084	NC_017456	ACA	3	9	186458	186466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801138
3085	NC_017456	CTT	2	6	186547	186552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801138
3086	NC_017456	GCA	2	6	186644	186649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801138
3087	NC_017456	CAT	2	6	186702	186707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801138
3088	NC_017456	GGT	2	6	186722	186727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801138
3089	NC_017456	TAC	2	6	186739	186744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801138
3090	NC_017456	TTG	2	6	186822	186827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801138
3091	NC_017456	TGTT	2	8	186837	186844	0 %	75 %	25 %	0 %	385801138
3092	NC_017456	GA	3	6	186877	186882	50 %	0 %	50 %	0 %	385801138
3093	NC_017456	AGA	2	6	186949	186954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801138
3094	NC_017456	GAA	2	6	186962	186967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801138
3095	NC_017456	TTA	2	6	186975	186980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801138
3096	NC_017456	TAG	2	6	187000	187005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801138
3097	NC_017456	CAA	2	6	187015	187020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801138
3098	NC_017456	GCT	2	6	187172	187177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801138
3099	NC_017456	CGA	2	6	187336	187341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801138
3100	NC_017456	TGT	2	6	187399	187404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801138
3101	NC_017456	AT	3	6	187408	187413	50 %	50 %	0 %	0 %	385801138
3102	NC_017456	A	6	6	187431	187436	100 %	0 %	0 %	0 %	385801138
3103	NC_017456	TACAAG	2	12	187457	187468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385801138
3104	NC_017456	ATT	2	6	187472	187477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801138
3105	NC_017456	TGC	2	6	187492	187497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801138
3106	NC_017456	ATA	2	6	187506	187511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801138
3107	NC_017456	A	6	6	187523	187528	100 %	0 %	0 %	0 %	385801138
3108	NC_017456	TCT	2	6	187529	187534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801138
3109	NC_017456	AGC	3	9	187620	187628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801138
3110	NC_017456	TTC	2	6	187702	187707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801138
3111	NC_017456	GAA	2	6	187739	187744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801138
3112	NC_017456	ATG	2	6	187836	187841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801138
3113	NC_017456	CAA	2	6	187950	187955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801138
3114	NC_017456	GCAT	2	8	187989	187996	25 %	25 %	25 %	25 %	385801138
3115	NC_017456	TG	3	6	188062	188067	0 %	50 %	50 %	0 %	385801138
3116	NC_017456	TTG	2	6	188262	188267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801138
3117	NC_017456	GAGAA	2	10	188268	188277	60 %	0 %	40 %	0 %	385801138
3118	NC_017456	CTG	2	6	188327	188332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801138
3119	NC_017456	TGT	2	6	188470	188475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801138
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