MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_017456	ATA	2	6	120455	120460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801080
2003	NC_017456	GAT	2	6	120513	120518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801080
2004	NC_017456	TTA	2	6	120519	120524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801080
2005	NC_017456	TGA	2	6	120528	120533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801080
2006	NC_017456	GCG	2	6	120642	120647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801080
2007	NC_017456	TTGCG	2	10	120656	120665	0 %	40 %	40 %	20 %	385801080
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2011	NC_017456	TGA	2	6	120743	120748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801080
2012	NC_017456	GTA	2	6	120758	120763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801080
2013	NC_017456	TTA	2	6	120766	120771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801080
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2015	NC_017456	TAA	2	6	120861	120866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801080
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2017	NC_017456	CTG	2	6	120988	120993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801081
2018	NC_017456	TAC	2	6	121135	121140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801081
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2021	NC_017456	TGC	2	6	121280	121285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801081
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2024	NC_017456	GCA	2	6	121346	121351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801081
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2030	NC_017456	TCG	2	6	121535	121540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801081
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2054	NC_017456	AAT	2	6	122738	122743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801082
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2062	NC_017456	GCT	2	6	123166	123171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801082
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2118	NC_017456	GC	3	6	126244	126249	0 %	0 %	50 %	50 %	385801084
2119	NC_017456	AAGC	2	8	126294	126301	50 %	0 %	25 %	25 %	385801084
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2121	NC_017456	TTG	2	6	126579	126584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801085
2122	NC_017456	A	6	6	126641	126646	100 %	0 %	0 %	0 %	385801085
2123	NC_017456	AG	3	6	126697	126702	50 %	0 %	50 %	0 %	385801085
2124	NC_017456	ATT	2	6	126734	126739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801085
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2126	NC_017456	GTA	2	6	127041	127046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801086
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2134	NC_017456	TGC	3	9	127572	127580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801086
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2142	NC_017456	TCT	2	6	127955	127960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801087
2143	NC_017456	T	6	6	127991	127996	0 %	100 %	0 %	0 %	385801087
2144	NC_017456	T	6	6	128045	128050	0 %	100 %	0 %	0 %	385801087
2145	NC_017456	T	6	6	128160	128165	0 %	100 %	0 %	0 %	385801087
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2238	NC_017456	TAT	2	6	134076	134081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801092
2239	NC_017456	GGAAT	2	10	134302	134311	40 %	20 %	40 %	0 %	385801093
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2483	NC_017456	TGGT	2	8	152049	152056	0 %	50 %	50 %	0 %	385801103
2484	NC_017456	CAC	2	6	152124	152129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801103
2485	NC_017456	TGG	2	6	152164	152169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801103
2486	NC_017456	CA	3	6	152178	152183	50 %	0 %	0 %	50 %	385801103
2487	NC_017456	GTTC	2	8	152190	152197	0 %	50 %	25 %	25 %	385801103
2488	NC_017456	TTC	2	6	152237	152242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801103
2489	NC_017456	T	6	6	152308	152313	0 %	100 %	0 %	0 %	385801103
2490	NC_017456	AGC	2	6	152378	152383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801103
2491	NC_017456	GCA	3	9	152414	152422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801103
2492	NC_017456	TGA	2	6	152505	152510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801103
2493	NC_017456	GAG	2	6	152522	152527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801103
2494	NC_017456	AGC	2	6	152554	152559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801103
2495	NC_017456	CAG	2	6	152601	152606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801103
2496	NC_017456	ATC	2	6	152614	152619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801103
2497	NC_017456	GGT	2	6	152725	152730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801103
2498	NC_017456	AATCA	2	10	152845	152854	60 %	20 %	0 %	20 %	385801103
2499	NC_017456	AGC	2	6	152878	152883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801103
2500	NC_017456	ATC	2	6	152914	152919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801103

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