MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017456	TCT	2	6	84052	84057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801052
1503	NC_017456	AAT	2	6	84498	84503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801053
1504	NC_017456	CTG	2	6	84526	84531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801053
1505	NC_017456	GTT	2	6	84573	84578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801053
1506	NC_017456	GCT	2	6	84612	84617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801053
1507	NC_017456	CTT	2	6	84660	84665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801053
1508	NC_017456	GAT	2	6	84696	84701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801053
1509	NC_017456	TGC	2	6	84712	84717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801053
1510	NC_017456	GTT	2	6	84720	84725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801053
1511	NC_017456	ATG	2	6	84736	84741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801053
1512	NC_017456	GC	3	6	84752	84757	0 %	0 %	50 %	50 %	385801053
1513	NC_017456	ATG	2	6	84796	84801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801053
1514	NC_017456	TGC	2	6	84839	84844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801053
1515	NC_017456	GCT	2	6	84846	84851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801053
1516	NC_017456	TGC	2	6	84869	84874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801053
1517	NC_017456	TGT	2	6	84896	84901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801053
1518	NC_017456	ATG	3	9	85030	85038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801053
1519	NC_017456	GAT	2	6	85083	85088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801053
1520	NC_017456	CGG	2	6	85114	85119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801053
1521	NC_017456	GAA	2	6	85194	85199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801053
1522	NC_017456	TTTGC	2	10	85221	85230	0 %	60 %	20 %	20 %	385801053
1523	NC_017456	TTC	2	6	85238	85243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801053
1524	NC_017456	GC	4	8	85263	85270	0 %	0 %	50 %	50 %	385801054
1525	NC_017456	TGT	3	9	85348	85356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801054
1526	NC_017456	ATT	2	6	85373	85378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801054
1527	NC_017456	CGAG	2	8	85399	85406	25 %	0 %	50 %	25 %	385801054
1528	NC_017456	AGGC	2	8	85445	85452	25 %	0 %	50 %	25 %	385801054
1529	NC_017456	TTG	2	6	85494	85499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801054
1530	NC_017456	GT	3	6	85675	85680	0 %	50 %	50 %	0 %	385801054
1531	NC_017456	T	7	7	85696	85702	0 %	100 %	0 %	0 %	385801054
1532	NC_017456	AGGT	2	8	85712	85719	25 %	25 %	50 %	0 %	385801054
1533	NC_017456	ACA	2	6	86276	86281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801055
1534	NC_017456	CG	4	8	86354	86361	0 %	0 %	50 %	50 %	385801055
1535	NC_017456	AGGC	2	8	86468	86475	25 %	0 %	50 %	25 %	385801055
1536	NC_017456	CAT	2	6	86495	86500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801055
1537	NC_017456	AGC	2	6	86615	86620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801055
1538	NC_017456	GGC	2	6	86665	86670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801055
1539	NC_017456	AGT	2	6	86685	86690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801055
1540	NC_017456	CAA	2	6	86702	86707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801055
1541	NC_017456	ATT	2	6	86779	86784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801055
1542	NC_017456	AGCA	2	8	86810	86817	50 %	0 %	25 %	25 %	385801055
1543	NC_017456	GTC	2	6	86886	86891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801055
1544	NC_017456	TTA	2	6	86939	86944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801055
1545	NC_017456	AAG	2	6	86990	86995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801055
1546	NC_017456	AT	3	6	87014	87019	50 %	50 %	0 %	0 %	385801055
1547	NC_017456	TTTC	2	8	87026	87033	0 %	75 %	0 %	25 %	385801055
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1549	NC_017456	TGC	2	6	87114	87119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801055
1550	NC_017456	AAT	2	6	87142	87147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801055
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1552	NC_017456	AGTAAA	2	12	87544	87555	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385801056
1553	NC_017456	TTA	2	6	87609	87614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801056
1554	NC_017456	ATG	2	6	87617	87622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801056
1555	NC_017456	TGC	2	6	87694	87699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801056
1556	NC_017456	GC	3	6	87698	87703	0 %	0 %	50 %	50 %	385801056
1557	NC_017456	TTG	2	6	87804	87809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801056
1558	NC_017456	AGA	3	9	87862	87870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801056
1559	NC_017456	TATTCT	2	12	87952	87963	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385801056
1560	NC_017456	GCA	2	6	87977	87982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801056
1561	NC_017456	ATT	2	6	88006	88011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801056
1562	NC_017456	ATT	2	6	88016	88021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801056
1563	NC_017456	TATT	2	8	88053	88060	25 %	75 %	0 %	0 %	385801056
1564	NC_017456	GTA	2	6	88097	88102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801056
1565	NC_017456	CAAGG	2	10	88223	88232	40 %	0 %	40 %	20 %	385801056
1566	NC_017456	TTGG	2	8	88325	88332	0 %	50 %	50 %	0 %	385801056
1567	NC_017456	TTC	2	6	88350	88355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801056
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1570	NC_017456	AGA	2	6	88468	88473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801056
1571	NC_017456	TCG	2	6	88474	88479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801056
1572	NC_017456	GAA	3	9	88589	88597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801056
1573	NC_017456	TGG	2	6	88657	88662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801056
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1575	NC_017456	TGC	2	6	88713	88718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801056
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1581	NC_017456	ATT	2	6	89256	89261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801057
1582	NC_017456	TG	3	6	89263	89268	0 %	50 %	50 %	0 %	385801057
1583	NC_017456	GCT	2	6	89334	89339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801057
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1586	NC_017456	TAT	3	9	89480	89488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801057
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1588	NC_017456	ATG	2	6	89577	89582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801057
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1591	NC_017456	TTC	2	6	89652	89657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801057
1592	NC_017456	CAA	2	6	89662	89667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801057
1593	NC_017456	TGA	3	9	89692	89700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801057
1594	NC_017456	TTA	2	6	89701	89706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801057
1595	NC_017456	AAT	2	6	89723	89728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801057
1596	NC_017456	ACT	2	6	89739	89744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801057
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1598	NC_017456	TGC	2	6	89852	89857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801057
1599	NC_017456	AGC	2	6	89906	89911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801057
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1601	NC_017456	TGG	2	6	89951	89956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801057
1602	NC_017456	CTTC	2	8	90055	90062	0 %	50 %	0 %	50 %	385801057
1603	NC_017456	GCA	2	6	90065	90070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801057
1604	NC_017456	GTT	2	6	90072	90077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801057
1605	NC_017456	ATG	2	6	90439	90444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801058
1606	NC_017456	GCA	3	9	90490	90498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801058
1607	NC_017456	AAT	2	6	90577	90582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801058
1608	NC_017456	AAG	2	6	90625	90630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801058
1609	NC_017456	TTC	2	6	90669	90674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801058
1610	NC_017456	AGC	2	6	90677	90682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801058
1611	NC_017456	TGC	2	6	90750	90755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801058
1612	NC_017456	CTT	2	6	90775	90780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801058
1613	NC_017456	AGG	2	6	90864	90869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801058
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1615	NC_017456	AAG	2	6	90991	90996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801058
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1617	NC_017456	CAAC	2	8	91064	91071	50 %	0 %	0 %	50 %	385801058
1618	NC_017456	TTG	2	6	91072	91077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801058
1619	NC_017456	CAATC	2	10	91136	91145	40 %	20 %	0 %	40 %	385801058
1620	NC_017456	AGT	2	6	91176	91181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801058
1621	NC_017456	TGGC	2	8	91232	91239	0 %	25 %	50 %	25 %	385801058
1622	NC_017456	TGC	2	6	91281	91286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801058
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1992	NC_017456	ATT	2	6	119963	119968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801080
1993	NC_017456	CAT	2	6	120079	120084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801080
1994	NC_017456	TTTA	2	8	120148	120155	25 %	75 %	0 %	0 %	385801080
1995	NC_017456	GTT	2	6	120184	120189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801080
1996	NC_017456	A	6	6	120195	120200	100 %	0 %	0 %	0 %	385801080
1997	NC_017456	GAA	2	6	120223	120228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801080
1998	NC_017456	GA	3	6	120231	120236	50 %	0 %	50 %	0 %	385801080
1999	NC_017456	ACT	2	6	120262	120267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801080
2000	NC_017456	GAT	2	6	120399	120404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801080

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