MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017456	AGA	2	6	53969	53974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801031
1002	NC_017456	GCA	2	6	53980	53985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801031
1003	NC_017456	ATG	2	6	53987	53992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801031
1004	NC_017456	TGA	2	6	54012	54017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801031
1005	NC_017456	AGA	2	6	54032	54037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801031
1006	NC_017456	GCT	2	6	54040	54045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801031
1007	NC_017456	GCT	2	6	54232	54237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801031
1008	NC_017456	TGC	3	9	54258	54266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801031
1009	NC_017456	GAA	3	9	54291	54299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801031
1010	NC_017456	AAG	2	6	54310	54315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801031
1011	NC_017456	CTA	2	6	54320	54325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801031
1012	NC_017456	TGGTGT	2	12	54327	54338	0 %	50 %	50 %	0 %	385801031
1013	NC_017456	GCT	2	6	54355	54360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801031
1014	NC_017456	TGCT	2	8	54365	54372	0 %	50 %	25 %	25 %	385801031
1015	NC_017456	TGT	2	6	54384	54389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801031
1016	NC_017456	ATT	2	6	55133	55138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801032
1017	NC_017456	TCCA	2	8	55146	55153	25 %	25 %	0 %	50 %	385801032
1018	NC_017456	AT	3	6	55168	55173	50 %	50 %	0 %	0 %	385801032
1019	NC_017456	CTC	2	6	55174	55179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801032
1020	NC_017456	TGC	2	6	55367	55372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801032
1021	NC_017456	GAG	2	6	55411	55416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801032
1022	NC_017456	AT	3	6	55515	55520	50 %	50 %	0 %	0 %	385801032
1023	NC_017456	ATT	2	6	55523	55528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801032
1024	NC_017456	GT	3	6	55533	55538	0 %	50 %	50 %	0 %	385801032
1025	NC_017456	GTT	2	6	55561	55566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801032
1026	NC_017456	ATC	2	6	55613	55618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801032
1027	NC_017456	ACC	2	6	55724	55729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801032
1028	NC_017456	TA	3	6	55850	55855	50 %	50 %	0 %	0 %	385801032
1029	NC_017456	ATC	2	6	55859	55864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801032
1030	NC_017456	CCATCG	2	12	55950	55961	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385801032
1031	NC_017456	TCAT	2	8	55965	55972	25 %	50 %	0 %	25 %	385801032
1032	NC_017456	ATA	2	6	55994	55999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801032
1033	NC_017456	GT	3	6	56178	56183	0 %	50 %	50 %	0 %	385801032
1034	NC_017456	GCT	2	6	56194	56199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801032
1035	NC_017456	TTC	2	6	56292	56297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801032
1036	NC_017456	TGT	2	6	56899	56904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801033
1037	NC_017456	TAC	2	6	56951	56956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801033
1038	NC_017456	AT	3	6	57240	57245	50 %	50 %	0 %	0 %	385801033
1039	NC_017456	AC	3	6	57259	57264	50 %	0 %	0 %	50 %	385801033
1040	NC_017456	GAA	2	6	57311	57316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801033
1041	NC_017456	CGAT	2	8	57364	57371	25 %	25 %	25 %	25 %	385801033
1042	NC_017456	AT	3	6	57370	57375	50 %	50 %	0 %	0 %	385801033
1043	NC_017456	AGA	3	9	57412	57420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801033
1044	NC_017456	GAA	2	6	57468	57473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801033
1045	NC_017456	AGA	2	6	57481	57486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801033
1046	NC_017456	GCT	2	6	57500	57505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801033
1047	NC_017456	GCAAG	2	10	57524	57533	40 %	0 %	40 %	20 %	385801033
1048	NC_017456	ACT	2	6	57671	57676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801033
1049	NC_017456	ATGA	2	8	57858	57865	50 %	25 %	25 %	0 %	385801034
1050	NC_017456	AGA	2	6	58079	58084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801034
1051	NC_017456	GCT	2	6	58167	58172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801034
1052	NC_017456	TGG	2	6	58262	58267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801034
1053	NC_017456	TGG	2	6	58346	58351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801034
1054	NC_017456	ATT	2	6	58356	58361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801034
1055	NC_017456	GTT	2	6	58416	58421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801034
1056	NC_017456	AAG	2	6	58540	58545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801034
1057	NC_017456	ATG	2	6	58558	58563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801034
1058	NC_017456	TGT	2	6	58694	58699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801034
1059	NC_017456	TGG	2	6	58716	58721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801034
1060	NC_017456	GGA	2	6	58797	58802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801034
1061	NC_017456	CTC	2	6	58807	58812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801034
1062	NC_017456	GCT	2	6	58821	58826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801034
1063	NC_017456	A	6	6	58900	58905	100 %	0 %	0 %	0 %	385801035
1064	NC_017456	AATGGC	2	12	58979	58990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385801035
1065	NC_017456	GGT	2	6	59001	59006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801035
1066	NC_017456	GCT	2	6	59137	59142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801035
1067	NC_017456	TGC	3	9	59144	59152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801035
1068	NC_017456	ATT	2	6	59163	59168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801035
1069	NC_017456	TGA	2	6	59276	59281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801035
1070	NC_017456	GC	3	6	59288	59293	0 %	0 %	50 %	50 %	385801035
1071	NC_017456	TGGC	2	8	59329	59336	0 %	25 %	50 %	25 %	385801035
1072	NC_017456	ATT	2	6	59418	59423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801035
1073	NC_017456	GGT	2	6	59489	59494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801035
1074	NC_017456	ATG	2	6	59899	59904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801036
1075	NC_017456	TGG	2	6	59916	59921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801036
1076	NC_017456	GCA	2	6	59938	59943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1077	NC_017456	CTG	2	6	59954	59959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1078	NC_017456	CAA	2	6	60014	60019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801036
1079	NC_017456	GCA	2	6	60040	60045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1080	NC_017456	AGA	2	6	60128	60133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801036
1081	NC_017456	TGC	2	6	60168	60173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1082	NC_017456	CAG	2	6	60200	60205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1083	NC_017456	GTA	2	6	60211	60216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801036
1084	NC_017456	CTTC	2	8	60218	60225	0 %	50 %	0 %	50 %	385801036
1085	NC_017456	TA	3	6	60253	60258	50 %	50 %	0 %	0 %	385801036
1086	NC_017456	AAAG	2	8	60321	60328	75 %	0 %	25 %	0 %	385801036
1087	NC_017456	AGC	2	6	60344	60349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1088	NC_017456	AAG	2	6	60508	60513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801036
1089	NC_017456	AGAC	2	8	60572	60579	50 %	0 %	25 %	25 %	385801036
1090	NC_017456	TGA	2	6	60699	60704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801036
1091	NC_017456	AGC	2	6	60720	60725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1092	NC_017456	TCA	2	6	60752	60757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801036
1093	NC_017456	CCAA	2	8	60758	60765	50 %	0 %	0 %	50 %	385801036
1094	NC_017456	CAA	2	6	60788	60793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801036
1095	NC_017456	CTT	2	6	60795	60800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801036
1096	NC_017456	GCTT	2	8	60869	60876	0 %	50 %	25 %	25 %	385801036
1097	NC_017456	ACA	2	6	60919	60924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801036
1098	NC_017456	TCT	2	6	61012	61017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801036
1099	NC_017456	CT	3	6	61019	61024	0 %	50 %	0 %	50 %	385801036
1100	NC_017456	ACCG	2	8	61036	61043	25 %	0 %	25 %	50 %	385801036
1101	NC_017456	CGA	2	6	61044	61049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1102	NC_017456	ACT	2	6	61055	61060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801036
1103	NC_017456	TGG	2	6	61123	61128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801036
1104	NC_017456	GAA	2	6	61167	61172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801036
1105	NC_017456	CAG	2	6	61232	61237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1106	NC_017456	CGA	2	6	61278	61283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1107	NC_017456	CTG	2	6	61322	61327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801036
1108	NC_017456	AAG	2	6	61330	61335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801036
1109	NC_017456	AAAGC	2	10	61387	61396	60 %	0 %	20 %	20 %	385801036
1110	NC_017456	TAGG	2	8	61577	61584	25 %	25 %	50 %	0 %	385801037
1111	NC_017456	TTC	2	6	61633	61638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801037
1112	NC_017456	CAG	2	6	61664	61669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801037
1113	NC_017456	GCA	2	6	61672	61677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801037
1114	NC_017456	CAG	2	6	61697	61702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801037
1115	NC_017456	GTG	2	6	61743	61748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801037
1116	NC_017456	AG	3	6	61829	61834	50 %	0 %	50 %	0 %	385801037
1117	NC_017456	TTG	2	6	61879	61884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801037
1118	NC_017456	AAT	2	6	61890	61895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801037
1119	NC_017456	ATT	2	6	61972	61977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801037
1120	NC_017456	AGA	2	6	62181	62186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801037
1121	NC_017456	GTG	2	6	62239	62244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801037
1122	NC_017456	GTG	2	6	62321	62326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801037
1123	NC_017456	CAAC	2	8	62394	62401	50 %	0 %	0 %	50 %	385801037
1124	NC_017456	GTT	2	6	62419	62424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801037
1125	NC_017456	GTT	2	6	62428	62433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801037
1126	NC_017456	ATT	2	6	62458	62463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801037
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1129	NC_017456	CG	3	6	62754	62759	0 %	0 %	50 %	50 %	385801038
1130	NC_017456	GTC	2	6	62797	62802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801038
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1133	NC_017456	ATC	2	6	62969	62974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801038
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1164	NC_017456	TTG	2	6	64937	64942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801039
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1244	NC_017456	T	6	6	70204	70209	0 %	100 %	0 %	0 %	385801044
1245	NC_017456	TA	3	6	70305	70310	50 %	50 %	0 %	0 %	385801044
1246	NC_017456	AGT	2	6	70317	70322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801044
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