MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017456	AGC	2	6	295228	295233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801234
5002	NC_017456	TAC	2	6	295264	295269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801234
5003	NC_017456	AT	3	6	295374	295379	50 %	50 %	0 %	0 %	385801234
5004	NC_017456	TCA	2	6	295433	295438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801234
5005	NC_017456	GCT	2	6	295441	295446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801234
5006	NC_017456	AAG	2	6	295470	295475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801234
5007	NC_017456	AAT	2	6	295532	295537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801234
5008	NC_017456	CTGCAG	2	12	295719	295730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385801234
5009	NC_017456	T	6	6	295753	295758	0 %	100 %	0 %	0 %	385801234
5010	NC_017456	TCA	2	6	295981	295986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801235
5011	NC_017456	ATTG	2	8	296004	296011	25 %	50 %	25 %	0 %	385801235
5012	NC_017456	TTC	2	6	296043	296048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801235
5013	NC_017456	CTG	2	6	296051	296056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801235
5014	NC_017456	ATA	2	6	296057	296062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801235
5015	NC_017456	CAG	2	6	296119	296124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801235
5016	NC_017456	ATG	2	6	296225	296230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801235
5017	NC_017456	ATGTA	2	10	296237	296246	40 %	40 %	20 %	0 %	385801235
5018	NC_017456	AAGA	2	8	296302	296309	75 %	0 %	25 %	0 %	385801235
5019	NC_017456	ATG	2	6	296363	296368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801235
5020	NC_017456	CAC	2	6	296397	296402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801235
5021	NC_017456	GAA	2	6	296449	296454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801235
5022	NC_017456	AAT	2	6	296461	296466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801235
5023	NC_017456	GAT	2	6	296476	296481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801235
5024	NC_017456	GTTC	2	8	296482	296489	0 %	50 %	25 %	25 %	385801235
5025	NC_017456	GAA	2	6	296496	296501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801235
5026	NC_017456	AAG	2	6	296681	296686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801235
5027	NC_017456	TGA	2	6	296718	296723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801235
5028	NC_017456	GAA	2	6	296835	296840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801235
5029	NC_017456	ATG	2	6	296936	296941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801235
5030	NC_017456	A	6	6	297100	297105	100 %	0 %	0 %	0 %	385801235
5031	NC_017456	A	6	6	297131	297136	100 %	0 %	0 %	0 %	385801235
5032	NC_017456	ATT	2	6	297288	297293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801236
5033	NC_017456	GCT	2	6	297320	297325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801236
5034	NC_017456	TGT	2	6	297406	297411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801236
5035	NC_017456	ATG	2	6	297415	297420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801236
5036	NC_017456	GCG	2	6	297459	297464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801236
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5038	NC_017456	TCT	2	6	297641	297646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801236
5039	NC_017456	TCTT	2	8	297648	297655	0 %	75 %	0 %	25 %	385801236
5040	NC_017456	TTG	2	6	297679	297684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801236
5041	NC_017456	ATT	2	6	297711	297716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801236
5042	NC_017456	GTA	2	6	297736	297741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801236
5043	NC_017456	T	6	6	297751	297756	0 %	100 %	0 %	0 %	385801236
5044	NC_017456	A	6	6	297767	297772	100 %	0 %	0 %	0 %	385801236
5045	NC_017456	GGC	2	6	297794	297799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801236
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5047	NC_017456	TAT	2	6	297890	297895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801236
5048	NC_017456	TGA	2	6	297973	297978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801236
5049	NC_017456	TAT	2	6	298043	298048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801236
5050	NC_017456	TTA	2	6	298056	298061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801236
5051	NC_017456	TCGT	2	8	298076	298083	0 %	50 %	25 %	25 %	385801236
5052	NC_017456	GCA	2	6	298122	298127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801236
5053	NC_017456	A	6	6	298127	298132	100 %	0 %	0 %	0 %	385801236
5054	NC_017456	AAG	2	6	298152	298157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801236
5055	NC_017456	GGT	2	6	298189	298194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801237
5056	NC_017456	ATTT	2	8	298223	298230	25 %	75 %	0 %	0 %	385801237
5057	NC_017456	TGT	2	6	298251	298256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801237
5058	NC_017456	TCT	2	6	298274	298279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801237
5059	NC_017456	TAC	2	6	298402	298407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801237
5060	NC_017456	TTCT	2	8	298419	298426	0 %	75 %	0 %	25 %	385801237
5061	NC_017456	TTG	2	6	298434	298439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801237
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5063	NC_017456	GAT	3	9	298504	298512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801237
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5065	NC_017456	TCT	2	6	298623	298628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801237
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5069	NC_017456	TA	3	6	298719	298724	50 %	50 %	0 %	0 %	385801237
5070	NC_017456	TTG	2	6	298760	298765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801237
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5072	NC_017456	ATT	2	6	298788	298793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801237
5073	NC_017456	GTA	2	6	298821	298826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801237
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5085	NC_017456	AT	3	6	299399	299404	50 %	50 %	0 %	0 %	385801238
5086	NC_017456	A	6	6	299418	299423	100 %	0 %	0 %	0 %	385801238
5087	NC_017456	ATCGTA	2	12	299470	299481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385801238
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5090	NC_017456	TAT	2	6	299555	299560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801238
5091	NC_017456	TAAAG	2	10	299585	299594	60 %	20 %	20 %	0 %	385801238
5092	NC_017456	TAA	2	6	299612	299617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801238
5093	NC_017456	TGA	2	6	299660	299665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801238
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5101	NC_017456	AAAT	2	8	299899	299906	75 %	25 %	0 %	0 %	385801238
5102	NC_017456	GAA	2	6	300060	300065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801238
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5105	NC_017456	GTT	2	6	300140	300145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801238
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5107	NC_017456	CAG	2	6	300220	300225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801238
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5111	NC_017456	CTG	2	6	300376	300381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801238
5112	NC_017456	AATA	2	8	300449	300456	75 %	25 %	0 %	0 %	385801238
5113	NC_017456	TTA	2	6	300459	300464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801238
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5120	NC_017456	TTA	2	6	300802	300807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801238
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5122	NC_017456	ATT	2	6	300879	300884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801238
5123	NC_017456	TGT	2	6	300896	300901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801238
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5480	NC_017456	TGC	2	6	317874	317879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801252
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5482	NC_017456	TGC	2	6	317895	317900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801252
5483	NC_017456	GCT	2	6	317920	317925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801252
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5486	NC_017456	GCT	3	9	317959	317967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801252
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