MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017456	TAA	2	6	266895	266900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
4502	NC_017456	TGA	2	6	266910	266915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
4503	NC_017456	TGG	2	6	266943	266948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
4504	NC_017456	GTG	2	6	266960	266965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
4505	NC_017456	GTG	2	6	266978	266983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
4506	NC_017456	TGG	2	6	266997	267002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
4507	NC_017456	TAA	2	6	267003	267008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
4508	NC_017456	ATA	2	6	267038	267043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
4509	NC_017456	ACA	2	6	267050	267055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
4510	NC_017456	ATA	2	6	267059	267064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
4511	NC_017456	AGA	2	6	267069	267074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801200
4512	NC_017456	CTG	2	6	267116	267121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801200
4513	NC_017456	TGT	2	6	267129	267134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801200
4514	NC_017456	CAA	2	6	267147	267152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
4515	NC_017456	CAA	2	6	267178	267183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
4516	NC_017456	AAT	2	6	267184	267189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
4517	NC_017456	GGT	2	6	267277	267282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
4518	NC_017456	ACA	2	6	267303	267308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
4519	NC_017456	CTG	2	6	267389	267394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801200
4520	NC_017456	ATA	2	6	267404	267409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
4521	NC_017456	TTC	2	6	267423	267428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801200
4522	NC_017456	AAT	2	6	267436	267441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
4523	NC_017456	AAT	2	6	267475	267480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
4524	NC_017456	GTA	2	6	267487	267492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
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4526	NC_017456	AAGA	2	8	267700	267707	75 %	0 %	25 %	0 %	385801200
4527	NC_017456	GTA	2	6	267713	267718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
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4529	NC_017456	CAA	2	6	267770	267775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
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4533	NC_017456	TACAAA	2	12	267894	267905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385801200
4534	NC_017456	TTTA	2	8	267954	267961	25 %	75 %	0 %	0 %	385801200
4535	NC_017456	A	6	6	268038	268043	100 %	0 %	0 %	0 %	385801200
4536	NC_017456	TA	3	6	268044	268049	50 %	50 %	0 %	0 %	385801200
4537	NC_017456	ACA	2	6	268256	268261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801201
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4539	NC_017456	TCA	2	6	268416	268421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801201
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4542	NC_017456	TGT	2	6	268503	268508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801201
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4545	NC_017456	ATTT	2	8	268692	268699	25 %	75 %	0 %	0 %	385801202
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4550	NC_017456	AAT	2	6	268810	268815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801202
4551	NC_017456	TG	3	6	268823	268828	0 %	50 %	50 %	0 %	385801202
4552	NC_017456	GAC	2	6	268840	268845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801202
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4554	NC_017456	TGG	2	6	268938	268943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801202
4555	NC_017456	TGG	2	6	268959	268964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801202
4556	NC_017456	GC	3	6	268971	268976	0 %	0 %	50 %	50 %	385801202
4557	NC_017456	GCA	2	6	268987	268992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801202
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4560	NC_017456	TAA	2	6	269216	269221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801202
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4562	NC_017456	ATG	2	6	269390	269395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801203
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4565	NC_017456	CGTT	2	8	269676	269683	0 %	50 %	25 %	25 %	385801203
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4572	NC_017456	AAAGAC	2	12	269968	269979	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385801203
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4587	NC_017456	A	7	7	270781	270787	100 %	0 %	0 %	0 %	385801204
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4602	NC_017456	TGG	2	6	271606	271611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801204
4603	NC_017456	ATG	2	6	271655	271660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801204
4604	NC_017456	CG	3	6	271697	271702	0 %	0 %	50 %	50 %	385801204
4605	NC_017456	AAG	2	6	271834	271839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801204
4606	NC_017456	GCTT	2	8	271854	271861	0 %	50 %	25 %	25 %	385801204
4607	NC_017456	TCT	2	6	271938	271943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801204
4608	NC_017456	AGA	2	6	271956	271961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801204
4609	NC_017456	AAG	2	6	272032	272037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801204
4610	NC_017456	TGAGCA	2	12	272055	272066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385801204
4611	NC_017456	GCT	2	6	272101	272106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801204
4612	NC_017456	GCT	2	6	272115	272120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801204
4613	NC_017456	TGC	2	6	272121	272126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801204
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4619	NC_017456	TGC	2	6	272668	272673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801205
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4847	NC_017456	GC	3	6	285987	285992	0 %	0 %	50 %	50 %	385801222
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4851	NC_017456	TGCACA	2	12	286138	286149	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385801223
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4857	NC_017456	GTT	2	6	286356	286361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801223
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4862	NC_017456	TGG	2	6	286968	286973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801224
4863	NC_017456	GCT	2	6	287043	287048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801224
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4865	NC_017456	TTGGC	2	10	287138	287147	0 %	40 %	40 %	20 %	385801224
4866	NC_017456	TGG	2	6	287271	287276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801224
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4869	NC_017456	TTGG	2	8	287393	287400	0 %	50 %	50 %	0 %	385801224
4870	NC_017456	GCTC	2	8	287490	287497	0 %	25 %	25 %	50 %	385801224
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4969	NC_017456	ATG	2	6	293474	293479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801233
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4973	NC_017456	GCA	2	6	293839	293844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801233
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4977	NC_017456	GTTT	2	8	293941	293948	0 %	75 %	25 %	0 %	385801233
4978	NC_017456	GC	3	6	293957	293962	0 %	0 %	50 %	50 %	385801233
4979	NC_017456	TTGA	2	8	294022	294029	25 %	50 %	25 %	0 %	385801233
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4982	NC_017456	GTTC	2	8	294067	294074	0 %	50 %	25 %	25 %	385801233
4983	NC_017456	GTTG	2	8	294097	294104	0 %	50 %	50 %	0 %	385801233
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4985	NC_017456	TCG	2	6	294258	294263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801233
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4987	NC_017456	TTGA	2	8	294278	294285	25 %	50 %	25 %	0 %	385801233
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4998	NC_017456	ACTTA	2	10	295111	295120	40 %	40 %	0 %	20 %	385801234
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