MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016907	GTGC	2	8	1863	1870	0 %	25 %	50 %	25 %	378720504
2	NC_016907	GATC	2	8	2251	2258	25 %	25 %	25 %	25 %	378720504
3	NC_016907	ACCA	2	8	4953	4960	50 %	0 %	0 %	50 %	378720508
4	NC_016907	CCAT	2	8	7153	7160	25 %	25 %	0 %	50 %	378720510
5	NC_016907	ACCG	2	8	7687	7694	25 %	0 %	25 %	50 %	378720510
6	NC_016907	GCAC	2	8	8010	8017	25 %	0 %	25 %	50 %	378720511
7	NC_016907	TCGC	2	8	8987	8994	0 %	25 %	25 %	50 %	378720511
8	NC_016907	ATCA	2	8	9655	9662	50 %	25 %	0 %	25 %	378720512
9	NC_016907	CGGC	2	8	12946	12953	0 %	0 %	50 %	50 %	378720514
10	NC_016907	ACGC	2	8	13141	13148	25 %	0 %	25 %	50 %	378720514
11	NC_016907	GCCC	2	8	13472	13479	0 %	0 %	25 %	75 %	378720514
12	NC_016907	GCCT	2	8	13525	13532	0 %	25 %	25 %	50 %	378720514
13	NC_016907	CGTT	2	8	13900	13907	0 %	50 %	25 %	25 %	378720514
14	NC_016907	TCGA	2	8	14709	14716	25 %	25 %	25 %	25 %	378720515
15	NC_016907	GATC	2	8	14785	14792	25 %	25 %	25 %	25 %	378720515
16	NC_016907	ACTC	2	8	15133	15140	25 %	25 %	0 %	50 %	378720515
17	NC_016907	TGGG	2	8	15211	15218	0 %	25 %	75 %	0 %	378720515
18	NC_016907	GGCA	2	8	15273	15280	25 %	0 %	50 %	25 %	378720515
19	NC_016907	CACC	2	8	15402	15409	25 %	0 %	0 %	75 %	378720515
20	NC_016907	GCAA	2	8	15415	15422	50 %	0 %	25 %	25 %	378720515
21	NC_016907	GCTG	2	8	15468	15475	0 %	25 %	50 %	25 %	378720515
22	NC_016907	GCCT	2	8	15494	15501	0 %	25 %	25 %	50 %	378720515
23	NC_016907	TGCA	2	8	15986	15993	25 %	25 %	25 %	25 %	378720516
24	NC_016907	CGCC	2	8	17174	17181	0 %	0 %	25 %	75 %	378720517
25	NC_016907	ACGG	2	8	18065	18072	25 %	0 %	50 %	25 %	378720518
26	NC_016907	TCGG	2	8	19443	19450	0 %	25 %	50 %	25 %	378720520
27	NC_016907	AGCG	2	8	21467	21474	25 %	0 %	50 %	25 %	378720523
28	NC_016907	GCGG	2	8	22031	22038	0 %	0 %	75 %	25 %	378720523
29	NC_016907	TGGG	2	8	22368	22375	0 %	25 %	75 %	0 %	378720523
30	NC_016907	AGCC	2	8	22436	22443	25 %	0 %	25 %	50 %	378720523
31	NC_016907	GGGT	2	8	22838	22845	0 %	25 %	75 %	0 %	378720524
32	NC_016907	CAGG	2	8	22906	22913	25 %	0 %	50 %	25 %	378720524
33	NC_016907	CGGT	2	8	23147	23154	0 %	25 %	50 %	25 %	378720524
34	NC_016907	GTGG	2	8	23235	23242	0 %	25 %	75 %	0 %	378720524
35	NC_016907	GAGT	2	8	23591	23598	25 %	25 %	50 %	0 %	378720525
36	NC_016907	CGAA	2	8	23626	23633	50 %	0 %	25 %	25 %	378720525
37	NC_016907	GGCG	2	8	25509	25516	0 %	0 %	75 %	25 %	378720527
38	NC_016907	TCCT	2	8	25844	25851	0 %	50 %	0 %	50 %	378720527
39	NC_016907	CCAC	2	8	25911	25918	25 %	0 %	0 %	75 %	378720527
40	NC_016907	GTCG	2	8	25977	25984	0 %	25 %	50 %	25 %	378720527
41	NC_016907	CCGA	2	8	26018	26025	25 %	0 %	25 %	50 %	378720527
42	NC_016907	GCCG	2	8	26397	26404	0 %	0 %	50 %	50 %	378720528
43	NC_016907	CCAA	2	8	26564	26571	50 %	0 %	0 %	50 %	378720528
44	NC_016907	GCGA	2	8	27354	27361	25 %	0 %	50 %	25 %	378720529
45	NC_016907	GGCT	2	8	27455	27462	0 %	25 %	50 %	25 %	378720529
46	NC_016907	TGGA	2	8	27584	27591	25 %	25 %	50 %	0 %	378720529
47	NC_016907	CGTT	2	8	28123	28130	0 %	50 %	25 %	25 %	378720529
48	NC_016907	CGGC	2	8	28767	28774	0 %	0 %	50 %	50 %	378720530
49	NC_016907	GGCC	2	8	28868	28875	0 %	0 %	50 %	50 %	378720530
50	NC_016907	CCCG	2	8	28878	28885	0 %	0 %	25 %	75 %	378720530
51	NC_016907	TGGC	2	8	29751	29758	0 %	25 %	50 %	25 %	378720531
52	NC_016907	CGCC	2	8	30466	30473	0 %	0 %	25 %	75 %	378720532
53	NC_016907	CCGT	2	8	30961	30968	0 %	25 %	25 %	50 %	378720533
54	NC_016907	GGCG	2	8	31143	31150	0 %	0 %	75 %	25 %	378720533
55	NC_016907	GGCC	2	8	31254	31261	0 %	0 %	50 %	50 %	378720533
56	NC_016907	GTCG	2	8	31350	31357	0 %	25 %	50 %	25 %	378720534
57	NC_016907	CCAC	2	8	31474	31481	25 %	0 %	0 %	75 %	378720534
58	NC_016907	AATG	2	8	31641	31648	50 %	25 %	25 %	0 %	378720534
59	NC_016907	CCCG	2	8	31852	31859	0 %	0 %	25 %	75 %	378720535
60	NC_016907	CGGC	2	8	33288	33295	0 %	0 %	50 %	50 %	378720537
61	NC_016907	GCAG	2	8	33304	33311	25 %	0 %	50 %	25 %	378720537
62	NC_016907	CGGC	2	8	33974	33981	0 %	0 %	50 %	50 %	378720538
63	NC_016907	GGCG	2	8	34067	34074	0 %	0 %	75 %	25 %	378720538
64	NC_016907	CGAC	2	8	37426	37433	25 %	0 %	25 %	50 %	378720541
65	NC_016907	CCGA	2	8	38124	38131	25 %	0 %	25 %	50 %	378720543
66	NC_016907	CCGG	2	8	38198	38205	0 %	0 %	50 %	50 %	378720543
67	NC_016907	CCGC	2	8	38398	38405	0 %	0 %	25 %	75 %	378720543
68	NC_016907	CGAG	2	8	38420	38427	25 %	0 %	50 %	25 %	378720543
69	NC_016907	ACCG	2	8	38487	38494	25 %	0 %	25 %	50 %	378720543
70	NC_016907	CGGT	2	8	38823	38830	0 %	25 %	50 %	25 %	378720544
71	NC_016907	CGGG	2	8	38840	38847	0 %	0 %	75 %	25 %	378720544
72	NC_016907	GACC	2	8	39127	39134	25 %	0 %	25 %	50 %	378720544
73	NC_016907	AGGA	2	8	41365	41372	50 %	0 %	50 %	0 %	378720546
74	NC_016907	TGAT	2	8	41461	41468	25 %	50 %	25 %	0 %	378720546
75	NC_016907	GAAA	2	8	42294	42301	75 %	0 %	25 %	0 %	378720548
76	NC_016907	GTCG	2	8	42953	42960	0 %	25 %	50 %	25 %	378720548
77	NC_016907	ACCG	2	8	43778	43785	25 %	0 %	25 %	50 %	378720549
78	NC_016907	GAGC	2	8	44528	44535	25 %	0 %	50 %	25 %	378720550
79	NC_016907	GCGT	2	8	44589	44596	0 %	25 %	50 %	25 %	378720550
80	NC_016907	GCCG	2	8	45021	45028	0 %	0 %	50 %	50 %	378720550
81	NC_016907	CGAG	2	8	45573	45580	25 %	0 %	50 %	25 %	378720551
82	NC_016907	TGTC	2	8	46681	46688	0 %	50 %	25 %	25 %	378720552
83	NC_016907	CGAG	2	8	46825	46832	25 %	0 %	50 %	25 %	378720552
84	NC_016907	GCAG	2	8	47429	47436	25 %	0 %	50 %	25 %	378720552
85	NC_016907	CGAC	2	8	47582	47589	25 %	0 %	25 %	50 %	378720552
86	NC_016907	TCGG	2	8	49147	49154	0 %	25 %	50 %	25 %	378720553
87	NC_016907	CGTC	2	8	50495	50502	0 %	25 %	25 %	50 %	378720554
88	NC_016907	CCGG	2	8	50574	50581	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
89	NC_016907	ATCG	2	8	51011	51018	25 %	25 %	25 %	25 %	378720554
90	NC_016907	TCGG	2	8	51198	51205	0 %	25 %	50 %	25 %	378720554
91	NC_016907	AACG	2	8	51399	51406	50 %	0 %	25 %	25 %	378720554
92	NC_016907	CGTT	2	8	51619	51626	0 %	50 %	25 %	25 %	378720554
93	NC_016907	TGCC	2	8	52202	52209	0 %	25 %	25 %	50 %	378720555
94	NC_016907	CGGC	2	8	52457	52464	0 %	0 %	50 %	50 %	378720555
95	NC_016907	GGCC	2	8	52523	52530	0 %	0 %	50 %	50 %	378720556
96	NC_016907	CGAC	2	8	52609	52616	25 %	0 %	25 %	50 %	378720556
97	NC_016907	CGGG	2	8	52867	52874	0 %	0 %	75 %	25 %	378720556
98	NC_016907	CTAT	2	8	53740	53747	25 %	50 %	0 %	25 %	378720557
99	NC_016907	GTCA	2	8	54075	54082	25 %	25 %	25 %	25 %	378720557
100	NC_016907	TGGA	2	8	54506	54513	25 %	25 %	50 %	0 %	378720557
101	NC_016907	ACCT	2	8	54687	54694	25 %	25 %	0 %	50 %	378720557
102	NC_016907	ACGC	2	8	54851	54858	25 %	0 %	25 %	50 %	378720557
103	NC_016907	GCCG	2	8	55356	55363	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
104	NC_016907	CGTG	2	8	55416	55423	0 %	25 %	50 %	25 %	378720558
105	NC_016907	GCCG	2	8	55993	56000	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
106	NC_016907	GAAC	2	8	56254	56261	50 %	0 %	25 %	25 %	378720558
107	NC_016907	GGGT	2	8	56285	56292	0 %	25 %	75 %	0 %	378720558
108	NC_016907	CGGT	2	8	57047	57054	0 %	25 %	50 %	25 %	378720559
109	NC_016907	ACCG	2	8	57545	57552	25 %	0 %	25 %	50 %	378720559
110	NC_016907	CCGG	2	8	58885	58892	0 %	0 %	50 %	50 %	378720562
111	NC_016907	CGGG	2	8	59070	59077	0 %	0 %	75 %	25 %	378720562
112	NC_016907	GGGC	2	8	60264	60271	0 %	0 %	75 %	25 %	378720564
113	NC_016907	CGAC	2	8	60804	60811	25 %	0 %	25 %	50 %	378720565
114	NC_016907	TCGA	2	8	61394	61401	25 %	25 %	25 %	25 %	378720565
115	NC_016907	GGCA	2	8	61465	61472	25 %	0 %	50 %	25 %	378720565
116	NC_016907	GCCA	2	8	61774	61781	25 %	0 %	25 %	50 %	378720566
117	NC_016907	GCCG	2	8	63937	63944	0 %	0 %	50 %	50 %	378720567
118	NC_016907	GGCC	2	8	64305	64312	0 %	0 %	50 %	50 %	378720567
119	NC_016907	GCGA	2	8	64369	64376	25 %	0 %	50 %	25 %	378720567
120	NC_016907	CGAC	2	8	64415	64422	25 %	0 %	25 %	50 %	378720567
121	NC_016907	CGAC	2	8	64433	64440	25 %	0 %	25 %	50 %	378720567
122	NC_016907	CGGG	2	8	64611	64618	0 %	0 %	75 %	25 %	378720567
123	NC_016907	CTGG	2	8	64976	64983	0 %	25 %	50 %	25 %	378720568
124	NC_016907	TCGT	2	8	65412	65419	0 %	50 %	25 %	25 %	378720568
125	NC_016907	GCCG	2	8	65544	65551	0 %	0 %	50 %	50 %	378720569
126	NC_016907	GGTC	2	8	66757	66764	0 %	25 %	50 %	25 %	378720572
127	NC_016907	GCTC	2	8	67023	67030	0 %	25 %	25 %	50 %	378720572
128	NC_016907	CGGG	2	8	69843	69850	0 %	0 %	75 %	25 %	378720575
129	NC_016907	CCCG	2	8	70136	70143	0 %	0 %	25 %	75 %	378720575
130	NC_016907	ACCG	2	8	71112	71119	25 %	0 %	25 %	50 %	378720575
131	NC_016907	CCAC	2	8	71299	71306	25 %	0 %	0 %	75 %	378720575
132	NC_016907	GGGT	2	8	71494	71501	0 %	25 %	75 %	0 %	378720575
133	NC_016907	CCGA	2	8	71931	71938	25 %	0 %	25 %	50 %	378720575
134	NC_016907	GTCG	2	8	73723	73730	0 %	25 %	50 %	25 %	378720577
135	NC_016907	GTGG	2	8	74591	74598	0 %	25 %	75 %	0 %	378720577
136	NC_016907	CGTT	2	8	76226	76233	0 %	50 %	25 %	25 %	378720578
137	NC_016907	GCGG	2	8	76240	76247	0 %	0 %	75 %	25 %	378720578
138	NC_016907	GGGA	2	8	76620	76627	25 %	0 %	75 %	0 %	378720578
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.