MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 3683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016907	GTGC	2	8	138658	138665	0 %	25 %	50 %	25 %	378720630
3002	NC_016907	TCGGT	2	10	138731	138740	0 %	40 %	40 %	20 %	378720630
3003	NC_016907	CGC	2	6	138756	138761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720630
3004	NC_016907	CAT	2	6	138777	138782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720630
3005	NC_016907	CGC	2	6	138783	138788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720630
3006	NC_016907	GGC	2	6	139077	139082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720631
3007	NC_016907	CCG	4	12	139088	139099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720631
3008	NC_016907	GTG	2	6	139114	139119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720631
3009	NC_016907	CGG	2	6	139143	139148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720631
3010	NC_016907	CGA	2	6	139169	139174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720631
3011	NC_016907	GAT	2	6	139186	139191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720631
3012	NC_016907	TCG	2	6	139217	139222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720631
3013	NC_016907	CGC	2	6	139224	139229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720631
3014	NC_016907	ACC	2	6	139240	139245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720631
3015	NC_016907	GCCC	2	8	139323	139330	0 %	0 %	25 %	75 %	378720631
3016	NC_016907	TCT	2	6	139346	139351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720631
3017	NC_016907	CGG	2	6	139365	139370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720631
3018	NC_016907	GTG	2	6	139409	139414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720631
3019	NC_016907	TGG	2	6	139496	139501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720631
3020	NC_016907	GCC	2	6	139680	139685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720632
3021	NC_016907	GGT	2	6	139686	139691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720632
3022	NC_016907	AAC	2	6	139714	139719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720632
3023	NC_016907	TCG	2	6	139729	139734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3024	NC_016907	GCG	3	9	139745	139753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720632
3025	NC_016907	GC	3	6	139770	139775	0 %	0 %	50 %	50 %	378720632
3026	NC_016907	CG	3	6	139802	139807	0 %	0 %	50 %	50 %	378720632
3027	NC_016907	AACCG	2	10	139811	139820	40 %	0 %	20 %	40 %	378720632
3028	NC_016907	CGG	2	6	139895	139900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720632
3029	NC_016907	GC	4	8	139927	139934	0 %	0 %	50 %	50 %	378720632
3030	NC_016907	GTC	2	6	139982	139987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3031	NC_016907	GAA	2	6	140037	140042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720632
3032	NC_016907	CGG	2	6	140063	140068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720632
3033	NC_016907	GCCGA	2	10	140085	140094	20 %	0 %	40 %	40 %	378720632
3034	NC_016907	GCG	2	6	140113	140118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720632
3035	NC_016907	TCG	2	6	140125	140130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3036	NC_016907	CCG	2	6	140150	140155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720632
3037	NC_016907	GCA	2	6	140159	140164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3038	NC_016907	CGA	2	6	140175	140180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3039	NC_016907	GGT	2	6	140192	140197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720632
3040	NC_016907	GTC	2	6	140211	140216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3041	NC_016907	CGG	2	6	140366	140371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720632
3042	NC_016907	GTCGGC	2	12	140373	140384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378720632
3043	NC_016907	CGA	2	6	140399	140404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3044	NC_016907	CCA	2	6	140538	140543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720632
3045	NC_016907	GTC	2	6	140589	140594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3046	NC_016907	TCG	2	6	140608	140613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3047	NC_016907	ATC	2	6	140617	140622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720632
3048	NC_016907	GA	3	6	140638	140643	50 %	0 %	50 %	0 %	378720632
3049	NC_016907	ACC	2	6	140707	140712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720632
3050	NC_016907	TTG	2	6	140728	140733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720632
3051	NC_016907	GC	3	6	140765	140770	0 %	0 %	50 %	50 %	378720632
3052	NC_016907	TCG	2	6	140788	140793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3053	NC_016907	GAG	2	6	140811	140816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720632
3054	NC_016907	GTC	2	6	140898	140903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3055	NC_016907	GACCTC	2	12	141147	141158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378720632
3056	NC_016907	CGT	2	6	141192	141197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720632
3057	NC_016907	GAG	2	6	141225	141230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720632
3058	NC_016907	GTC	2	6	141516	141521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720633
3059	NC_016907	CAT	2	6	141549	141554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720633
3060	NC_016907	GCG	2	6	141614	141619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720633
3061	NC_016907	CGG	2	6	141708	141713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720633
3062	NC_016907	TCG	2	6	141728	141733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720633
3063	NC_016907	TCG	2	6	141740	141745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720633
3064	NC_016907	GAA	2	6	141756	141761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720633
3065	NC_016907	TCGA	2	8	141763	141770	25 %	25 %	25 %	25 %	378720633
3066	NC_016907	GAG	2	6	141926	141931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720634
3067	NC_016907	ACG	2	6	141948	141953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720634
3068	NC_016907	GTC	2	6	141956	141961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720634
3069	NC_016907	ACGCCG	2	12	142050	142061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378720634
3070	NC_016907	ATC	2	6	142064	142069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720634
3071	NC_016907	ATC	2	6	142097	142102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720634
3072	NC_016907	CGA	2	6	142120	142125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720634
3073	NC_016907	GTG	2	6	142229	142234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720634
3074	NC_016907	CGG	2	6	142288	142293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720634
3075	NC_016907	CGGA	2	8	142332	142339	25 %	0 %	50 %	25 %	378720634
3076	NC_016907	CGGC	2	8	142410	142417	0 %	0 %	50 %	50 %	378720634
3077	NC_016907	CGG	2	6	142429	142434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720634
3078	NC_016907	GTG	2	6	142562	142567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720634
3079	NC_016907	TTC	2	6	142568	142573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720634
3080	NC_016907	CGC	2	6	142588	142593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720634
3081	NC_016907	GC	3	6	142592	142597	0 %	0 %	50 %	50 %	378720634
3082	NC_016907	TCG	2	6	142623	142628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720634
3083	NC_016907	CGG	2	6	142681	142686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720634
3084	NC_016907	GTG	2	6	142691	142696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720634
3085	NC_016907	GGT	2	6	142712	142717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720634
3086	NC_016907	GTG	2	6	142721	142726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720634
3087	NC_016907	CTC	2	6	142751	142756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720634
3088	NC_016907	TCG	2	6	142827	142832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720634
3089	NC_016907	GAAC	2	8	142888	142895	50 %	0 %	25 %	25 %	378720634
3090	NC_016907	GTC	2	6	142940	142945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720634
3091	NC_016907	GCC	2	6	143027	143032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720634
3092	NC_016907	GTGGC	2	10	143040	143049	0 %	20 %	60 %	20 %	378720634
3093	NC_016907	GCA	2	6	143068	143073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720634
3094	NC_016907	CCA	2	6	143143	143148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720634
3095	NC_016907	GT	3	6	143152	143157	0 %	50 %	50 %	0 %	378720634
3096	NC_016907	CGA	2	6	143167	143172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720634
3097	NC_016907	CGATG	2	10	143233	143242	20 %	20 %	40 %	20 %	378720634
3098	NC_016907	CGG	2	6	143333	143338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720635
3099	NC_016907	GTC	2	6	143357	143362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720635
3100	NC_016907	AGC	2	6	143367	143372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720635
3101	NC_016907	CGG	3	9	143422	143430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720635
3102	NC_016907	TGC	2	6	143455	143460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720635
3103	NC_016907	GTGCAT	2	12	143465	143476	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378720635
3104	NC_016907	CG	3	6	143574	143579	0 %	0 %	50 %	50 %	378720635
3105	NC_016907	TCG	2	6	143643	143648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720635
3106	NC_016907	GGC	2	6	143723	143728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720635
3107	NC_016907	CCGCG	2	10	143762	143771	0 %	0 %	40 %	60 %	378720635
3108	NC_016907	GCC	2	6	143787	143792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720635
3109	NC_016907	TCG	2	6	143799	143804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720635
3110	NC_016907	GAC	2	6	143813	143818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720635
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3112	NC_016907	CGG	2	6	143845	143850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720635
3113	NC_016907	GCC	2	6	143854	143859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720635
3114	NC_016907	TCGG	2	8	143916	143923	0 %	25 %	50 %	25 %	378720635
3115	NC_016907	ACG	2	6	143937	143942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720635
3116	NC_016907	CG	3	6	143941	143946	0 %	0 %	50 %	50 %	378720635
3117	NC_016907	GGGTC	2	10	143953	143962	0 %	20 %	60 %	20 %	378720635
3118	NC_016907	GGC	2	6	143996	144001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720635
3119	NC_016907	GCG	2	6	144021	144026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720635
3120	NC_016907	GC	3	6	144046	144051	0 %	0 %	50 %	50 %	378720635
3121	NC_016907	GAT	2	6	144062	144067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720635
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3233	NC_016907	GGC	2	6	149405	149410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720641
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3241	NC_016907	GCT	2	6	149812	149817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720642
3242	NC_016907	CGT	2	6	149862	149867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720642
3243	NC_016907	CGC	2	6	149878	149883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720642
3244	NC_016907	CGG	2	6	149895	149900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720642
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3247	NC_016907	TCG	2	6	149967	149972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720642
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3349	NC_016907	CACC	2	8	154957	154964	25 %	0 %	0 %	75 %	378720648
3350	NC_016907	ACCG	2	8	154968	154975	25 %	0 %	25 %	50 %	378720648
3351	NC_016907	CGC	2	6	154979	154984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720648
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3353	NC_016907	ACC	2	6	154998	155003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720648
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3355	NC_016907	CGT	2	6	155063	155068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720648
3356	NC_016907	CGA	2	6	155069	155074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720648
3357	NC_016907	CGA	2	6	155096	155101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720648
3358	NC_016907	TGG	2	6	155122	155127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720648
3359	NC_016907	CACCG	2	10	155150	155159	20 %	0 %	20 %	60 %	378720648
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3361	NC_016907	CGA	2	6	155243	155248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720648
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3482	NC_016907	CGA	2	6	162005	162010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720655
3483	NC_016907	CTT	2	6	162070	162075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720655
3484	NC_016907	CTGTG	2	10	162076	162085	0 %	40 %	40 %	20 %	378720655
3485	NC_016907	CCG	2	6	162129	162134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720655
3486	NC_016907	GTA	2	6	162210	162215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720655
3487	NC_016907	CGA	2	6	162275	162280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720655
3488	NC_016907	TCT	2	6	162290	162295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720655
3489	NC_016907	CGCTG	2	10	162402	162411	0 %	20 %	40 %	40 %	378720655
3490	NC_016907	GTC	2	6	162448	162453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720655
3491	NC_016907	AGA	2	6	162539	162544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720655
3492	NC_016907	GCC	2	6	162621	162626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720655
3493	NC_016907	TCG	3	9	162643	162651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720655
3494	NC_016907	TCG	2	6	162656	162661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720655
3495	NC_016907	CGTC	2	8	162745	162752	0 %	25 %	25 %	50 %	378720655
3496	NC_016907	CGC	2	6	162781	162786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720655
3497	NC_016907	CGC	2	6	162952	162957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720656
3498	NC_016907	GTC	2	6	163050	163055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720656
3499	NC_016907	CCGA	2	8	163089	163096	25 %	0 %	25 %	50 %	378720656
3500	NC_016907	CA	3	6	163099	163104	50 %	0 %	0 %	50 %	378720656

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