MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 3683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016907	TCC	2	6	34222	34227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720538
502	NC_016907	CGGCC	2	10	34241	34250	0 %	0 %	40 %	60 %	378720538
503	NC_016907	GAG	2	6	34296	34301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720538
504	NC_016907	GTG	2	6	34354	34359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720538
505	NC_016907	CG	3	6	35673	35678	0 %	0 %	50 %	50 %	378720539
506	NC_016907	CGA	2	6	35762	35767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720539
507	NC_016907	GCG	2	6	35788	35793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720539
508	NC_016907	CCT	2	6	35798	35803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720539
509	NC_016907	TGA	2	6	35837	35842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720539
510	NC_016907	TCG	2	6	36200	36205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720540
511	NC_016907	TCG	2	6	36224	36229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720540
512	NC_016907	CTGCG	2	10	36234	36243	0 %	20 %	40 %	40 %	378720540
513	NC_016907	TCG	2	6	36356	36361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720540
514	NC_016907	TG	3	6	36369	36374	0 %	50 %	50 %	0 %	378720540
515	NC_016907	GTC	2	6	36394	36399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720540
516	NC_016907	TGG	2	6	36400	36405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720540
517	NC_016907	CTC	2	6	36422	36427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720540
518	NC_016907	TCC	2	6	36914	36919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720541
519	NC_016907	CGC	2	6	36951	36956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720541
520	NC_016907	ACC	2	6	36995	37000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720541
521	NC_016907	GCC	2	6	37033	37038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720541
522	NC_016907	CGG	3	9	37155	37163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720541
523	NC_016907	CG	3	6	37209	37214	0 %	0 %	50 %	50 %	378720541
524	NC_016907	CTC	2	6	37404	37409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720541
525	NC_016907	CGAC	2	8	37426	37433	25 %	0 %	25 %	50 %	378720541
526	NC_016907	TCG	2	6	37492	37497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720542
527	NC_016907	AAG	2	6	37512	37517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720542
528	NC_016907	GGA	2	6	37544	37549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720542
529	NC_016907	ACC	3	9	37557	37565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720542
530	NC_016907	ACC	2	6	37572	37577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720542
531	NC_016907	CCGACG	2	12	37900	37911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378720542
532	NC_016907	CGGAG	2	10	37977	37986	20 %	0 %	60 %	20 %	378720542
533	NC_016907	TGA	2	6	38048	38053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720543
534	NC_016907	CCGA	2	8	38124	38131	25 %	0 %	25 %	50 %	378720543
535	NC_016907	ACC	2	6	38172	38177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720543
536	NC_016907	CCGG	2	8	38198	38205	0 %	0 %	50 %	50 %	378720543
537	NC_016907	CAC	2	6	38216	38221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720543
538	NC_016907	AAG	2	6	38241	38246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720543
539	NC_016907	CCGC	2	8	38398	38405	0 %	0 %	25 %	75 %	378720543
540	NC_016907	CGAG	2	8	38420	38427	25 %	0 %	50 %	25 %	378720543
541	NC_016907	TGG	2	6	38433	38438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720543
542	NC_016907	TGGCCG	2	12	38443	38454	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378720543
543	NC_016907	CCG	2	6	38460	38465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720543
544	NC_016907	ACCG	2	8	38487	38494	25 %	0 %	25 %	50 %	378720543
545	NC_016907	TCC	3	9	38570	38578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720544
546	NC_016907	ACC	2	6	38633	38638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720544
547	NC_016907	GAG	2	6	38756	38761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720544
548	NC_016907	CTG	2	6	38791	38796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720544
549	NC_016907	CGGT	2	8	38823	38830	0 %	25 %	50 %	25 %	378720544
550	NC_016907	CGGG	2	8	38840	38847	0 %	0 %	75 %	25 %	378720544
551	NC_016907	ATCGA	2	10	38867	38876	40 %	20 %	20 %	20 %	378720544
552	NC_016907	CTC	2	6	38935	38940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720544
553	NC_016907	CGT	2	6	38977	38982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720544
554	NC_016907	GTG	2	6	39015	39020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720544
555	NC_016907	CGA	2	6	39028	39033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720544
556	NC_016907	CCT	2	6	39079	39084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720544
557	NC_016907	GTG	2	6	39110	39115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720544
558	NC_016907	CAA	2	6	39121	39126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720544
559	NC_016907	GACC	2	8	39127	39134	25 %	0 %	25 %	50 %	378720544
560	NC_016907	CG	3	6	39189	39194	0 %	0 %	50 %	50 %	378720544
561	NC_016907	CAC	2	6	39208	39213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720544
562	NC_016907	GCC	2	6	39269	39274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720544
563	NC_016907	GCG	2	6	39275	39280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720544
564	NC_016907	GAC	2	6	39293	39298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720544
565	NC_016907	CTC	2	6	39302	39307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720544
566	NC_016907	GGC	2	6	39308	39313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720544
567	NC_016907	GAG	2	6	39329	39334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720544
568	NC_016907	GAG	2	6	39414	39419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720544
569	NC_016907	GCA	2	6	39426	39431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720544
570	NC_016907	CTG	2	6	39439	39444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720544
571	NC_016907	CCGAC	2	10	39454	39463	20 %	0 %	20 %	60 %	378720544
572	NC_016907	CGC	2	6	39525	39530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720544
573	NC_016907	GCCGG	2	10	39548	39557	0 %	0 %	60 %	40 %	378720544
574	NC_016907	CCT	2	6	39610	39615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720544
575	NC_016907	ACT	2	6	39625	39630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720544
576	NC_016907	CGA	3	9	39634	39642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720544
577	NC_016907	ACC	2	6	39714	39719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720544
578	NC_016907	GGT	2	6	39879	39884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720545
579	NC_016907	TGA	2	6	39893	39898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720545
580	NC_016907	TCG	2	6	39919	39924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720545
581	NC_016907	TGC	2	6	39934	39939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720545
582	NC_016907	GGT	2	6	39951	39956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720545
583	NC_016907	GCC	2	6	39966	39971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720545
584	NC_016907	GTCGT	2	10	39982	39991	0 %	40 %	40 %	20 %	378720545
585	NC_016907	GCGATC	2	12	39994	40005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378720545
586	NC_016907	CCT	2	6	40007	40012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720545
587	NC_016907	GCG	2	6	40036	40041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720545
588	NC_016907	CGG	2	6	40058	40063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720545
589	NC_016907	TGA	2	6	40094	40099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720545
590	NC_016907	CCG	2	6	40141	40146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720545
591	NC_016907	GCC	2	6	40165	40170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720545
592	NC_016907	CGT	2	6	40175	40180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720545
593	NC_016907	CGA	2	6	40181	40186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720545
594	NC_016907	TCG	2	6	40243	40248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720545
595	NC_016907	CGA	3	9	40259	40267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720545
596	NC_016907	CGA	2	6	40283	40288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720545
597	NC_016907	TCG	2	6	40303	40308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720545
598	NC_016907	GCG	2	6	40339	40344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720545
599	NC_016907	GTT	2	6	40359	40364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720545
600	NC_016907	CGG	2	6	40391	40396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720545
601	NC_016907	GCC	2	6	40440	40445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720545
602	NC_016907	GT	3	6	40459	40464	0 %	50 %	50 %	0 %	378720545
603	NC_016907	TCG	2	6	40471	40476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720545
604	NC_016907	CG	3	6	40494	40499	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
605	NC_016907	CCG	2	6	40502	40507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720545
606	NC_016907	CGA	2	6	40569	40574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720545
607	NC_016907	CAG	2	6	40581	40586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720545
608	NC_016907	AGC	2	6	40595	40600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720545
609	NC_016907	CGC	2	6	40618	40623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720545
610	NC_016907	CG	3	6	40791	40796	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
611	NC_016907	TCGGCG	2	12	40813	40824	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378720545
612	NC_016907	TCG	2	6	40828	40833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720545
613	NC_016907	GGC	2	6	40842	40847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720545
614	NC_016907	TCA	2	6	40934	40939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720545
615	NC_016907	CGC	2	6	40941	40946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720545
616	NC_016907	GCCTCG	2	12	40957	40968	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378720545
617	NC_016907	GC	3	6	40999	41004	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
618	NC_016907	CG	3	6	41046	41051	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
619	NC_016907	GCG	2	6	41059	41064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720545
620	NC_016907	TCG	2	6	41074	41079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720545
621	NC_016907	TGC	2	6	41105	41110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720545
622	NC_016907	GGT	2	6	41112	41117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720545
623	NC_016907	GGA	2	6	41189	41194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720545
624	NC_016907	ATC	2	6	41305	41310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720546
625	NC_016907	CCG	2	6	41311	41316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720546
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