MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 136790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016906	GCG	3	9	168499	168507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715698
4002	NC_016906	GC	3	6	168509	168514	0 %	0 %	50 %	50 %	378715698
4003	NC_016906	GCG	2	6	168562	168567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715698
4004	NC_016906	AGC	2	6	168618	168623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715698
4005	NC_016906	CGA	2	6	168665	168670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715698
4006	NC_016906	CCA	3	9	168671	168679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715698
4007	NC_016906	CGC	3	9	168693	168701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715698
4008	NC_016906	ATG	2	6	168741	168746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715698
4009	NC_016906	CGT	2	6	168749	168754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715698
4010	NC_016906	GCC	2	6	168835	168840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715698
4011	NC_016906	CGA	2	6	168854	168859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715698
4012	NC_016906	GCC	2	6	168884	168889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715698
4013	NC_016906	CGT	2	6	168915	168920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715698
4014	NC_016906	CGG	2	6	168980	168985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715698
4015	NC_016906	CGT	2	6	168996	169001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715698
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4017	NC_016906	CGT	2	6	169173	169178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715699
4018	NC_016906	CTT	2	6	169198	169203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715699
4019	NC_016906	TGA	2	6	169239	169244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715699
4020	NC_016906	GCA	2	6	169332	169337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715699
4021	NC_016906	CCA	2	6	169344	169349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715699
4022	NC_016906	CGG	2	6	169389	169394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715699
4023	NC_016906	CGA	2	6	169441	169446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715699
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4025	NC_016906	TGA	2	6	169467	169472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715699
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4028	NC_016906	CGT	2	6	169548	169553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715699
4029	NC_016906	GTA	2	6	169579	169584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715699
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4031	NC_016906	CGT	2	6	169656	169661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715699
4032	NC_016906	CGA	2	6	169662	169667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715699
4033	NC_016906	GC	3	6	169669	169674	0 %	0 %	50 %	50 %	378715699
4034	NC_016906	GTAGCG	2	12	169705	169716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378715699
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4052	NC_016906	CGA	2	6	170418	170423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715699
4053	NC_016906	TGA	2	6	170424	170429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715699
4054	NC_016906	CGA	2	6	170451	170456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715699
4055	NC_016906	GCA	2	6	170496	170501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715699
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4058	NC_016906	GCG	3	9	170650	170658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715699
4059	NC_016906	TGA	2	6	170679	170684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715699
4060	NC_016906	CGG	2	6	170688	170693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715699
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4065	NC_016906	GACC	2	8	170986	170993	25 %	0 %	25 %	50 %	378715700
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4069	NC_016906	CGG	2	6	171131	171136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715700
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4110	NC_016906	CCAC	2	8	172633	172640	25 %	0 %	0 %	75 %	378715700
4111	NC_016906	TGC	2	6	172642	172647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715700
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4116	NC_016906	GC	3	6	172876	172881	0 %	0 %	50 %	50 %	378715700
4117	NC_016906	CCG	2	6	172897	172902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715700
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4120	NC_016906	ACG	2	6	173038	173043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715700
4121	NC_016906	GACG	2	8	173049	173056	25 %	0 %	50 %	25 %	378715700
4122	NC_016906	TGG	2	6	173062	173067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715700
4123	NC_016906	CACC	2	8	173071	173078	25 %	0 %	0 %	75 %	378715700
4124	NC_016906	GCC	2	6	173097	173102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715700
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4152	NC_016906	CGG	2	6	174160	174165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715700
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4228	NC_016906	CAT	2	6	177341	177346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715704
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4231	NC_016906	GCGA	2	8	177441	177448	25 %	0 %	50 %	25 %	378715704
4232	NC_016906	CAG	2	6	177548	177553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715704
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4236	NC_016906	CGCA	2	8	177670	177677	25 %	0 %	25 %	50 %	378715704
4237	NC_016906	TGT	2	6	177744	177749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715704
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4241	NC_016906	CGGCGC	3	18	177822	177839	0 %	0 %	50 %	50 %	378715705
4242	NC_016906	GCCG	2	8	177856	177863	0 %	0 %	50 %	50 %	378715705
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4479	NC_016906	TCC	2	6	189442	189447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715716
4480	NC_016906	ATG	2	6	189455	189460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715716
4481	NC_016906	GGC	2	6	189573	189578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715716
4482	NC_016906	CGA	2	6	189591	189596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715716
4483	NC_016906	TGG	2	6	189656	189661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715716
4484	NC_016906	GCG	2	6	189743	189748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715716
4485	NC_016906	GCAGCG	2	12	189796	189807	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378715716
4486	NC_016906	CG	3	6	189866	189871	0 %	0 %	50 %	50 %	378715716
4487	NC_016906	TGC	2	6	189878	189883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715716
4488	NC_016906	GTG	2	6	189993	189998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715716
4489	NC_016906	GCG	2	6	190022	190027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715716
4490	NC_016906	CCT	2	6	190035	190040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715716
4491	NC_016906	CTC	2	6	190057	190062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715716
4492	NC_016906	CGCGG	2	10	190111	190120	0 %	0 %	60 %	40 %	378715716
4493	NC_016906	ATGCC	2	10	190145	190154	20 %	20 %	20 %	40 %	378715716
4494	NC_016906	CCA	2	6	190169	190174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715716
4495	NC_016906	CGAT	2	8	190247	190254	25 %	25 %	25 %	25 %	378715716
4496	NC_016906	GATC	2	8	190341	190348	25 %	25 %	25 %	25 %	378715716
4497	NC_016906	TCG	2	6	190368	190373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715716
4498	NC_016906	GTG	2	6	190466	190471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715716
4499	NC_016906	GC	3	6	190489	190494	0 %	0 %	50 %	50 %	378715716
4500	NC_016906	CGCAC	2	10	190530	190539	20 %	0 %	20 %	60 %	378715716

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