MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 136790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016906	ACG	2	6	219544	219549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5003	NC_016906	GCC	2	6	219603	219608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715733
5004	NC_016906	GTCGAG	2	12	219612	219623	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378715733
5005	NC_016906	CCG	2	6	219703	219708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715733
5006	NC_016906	CGC	2	6	219725	219730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715733
5007	NC_016906	GC	3	6	219750	219755	0 %	0 %	50 %	50 %	378715733
5008	NC_016906	CAA	2	6	219759	219764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715733
5009	NC_016906	GGA	2	6	219773	219778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715733
5010	NC_016906	GCGA	2	8	219781	219788	25 %	0 %	50 %	25 %	378715733
5011	NC_016906	CGA	2	6	219854	219859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5012	NC_016906	TCG	2	6	219883	219888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5013	NC_016906	CA	3	6	219926	219931	50 %	0 %	0 %	50 %	378715733
5014	NC_016906	ACC	2	6	219981	219986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715733
5015	NC_016906	AGCG	2	8	220021	220028	25 %	0 %	50 %	25 %	378715733
5016	NC_016906	CT	3	6	220037	220042	0 %	50 %	0 %	50 %	378715733
5017	NC_016906	GGGAA	2	10	220107	220116	40 %	0 %	60 %	0 %	378715733
5018	NC_016906	CGCA	2	8	220148	220155	25 %	0 %	25 %	50 %	378715733
5019	NC_016906	CAA	2	6	220233	220238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715733
5020	NC_016906	CGT	2	6	220250	220255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5021	NC_016906	TCG	2	6	220258	220263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5022	NC_016906	ATCTCT	2	12	220291	220302	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378715733
5023	NC_016906	CGA	2	6	220334	220339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5024	NC_016906	GGA	2	6	220379	220384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715733
5025	NC_016906	ATC	2	6	220533	220538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715733
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5028	NC_016906	ACG	2	6	220735	220740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5029	NC_016906	GTC	2	6	220758	220763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5030	NC_016906	GAG	3	9	220821	220829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715733
5031	NC_016906	GAA	2	6	220833	220838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715733
5032	NC_016906	CGA	2	6	220839	220844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5033	NC_016906	TCG	2	6	220906	220911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715733
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5037	NC_016906	GATCC	2	10	221097	221106	20 %	20 %	20 %	40 %	378715733
5038	NC_016906	ACC	2	6	221221	221226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715733
5039	NC_016906	TCG	2	6	221239	221244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715733
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5041	NC_016906	CGA	2	6	221318	221323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5042	NC_016906	GCG	3	9	221574	221582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715733
5043	NC_016906	GACG	2	8	221633	221640	25 %	0 %	50 %	25 %	378715733
5044	NC_016906	GAC	2	6	221675	221680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715733
5045	NC_016906	GCT	2	6	221733	221738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715733
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5049	NC_016906	CA	3	6	221973	221978	50 %	0 %	0 %	50 %	378715733
5050	NC_016906	CGC	2	6	221980	221985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715733
5051	NC_016906	GGA	2	6	221999	222004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715733
5052	NC_016906	GGC	2	6	222006	222011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715733
5053	NC_016906	TCG	2	6	222029	222034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715733
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5055	NC_016906	CGA	2	6	222104	222109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715733
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5065	NC_016906	GGCGA	2	10	222456	222465	20 %	0 %	60 %	20 %	378715734
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5103	NC_016906	TGG	3	9	224260	224268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715734
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5105	NC_016906	GCG	2	6	224363	224368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715734
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5120	NC_016906	GCT	2	6	225322	225327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715736
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5239	NC_016906	GAG	2	6	231951	231956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715739
5240	NC_016906	GAT	2	6	231963	231968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715739
5241	NC_016906	CGC	2	6	231979	231984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715739
5242	NC_016906	CGGCCT	3	18	231986	232003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378715739
5243	NC_016906	ACC	2	6	232027	232032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715739
5244	NC_016906	TGT	2	6	232034	232039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715739
5245	NC_016906	GC	3	6	232110	232115	0 %	0 %	50 %	50 %	378715740
5246	NC_016906	GCA	2	6	232161	232166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715740
5247	NC_016906	CGA	2	6	232171	232176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715740
5248	NC_016906	CGA	2	6	232219	232224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715740
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5250	NC_016906	TCGTC	2	10	232297	232306	0 %	40 %	20 %	40 %	378715740
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5252	NC_016906	GATG	2	8	232343	232350	25 %	25 %	50 %	0 %	378715740
5253	NC_016906	AAC	2	6	232353	232358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715740
5254	NC_016906	ATCG	2	8	232477	232484	25 %	25 %	25 %	25 %	378715740
5255	NC_016906	CGG	2	6	232533	232538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715740
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5258	NC_016906	CG	3	6	233550	233555	0 %	0 %	50 %	50 %	378715741
5259	NC_016906	GTCG	2	8	233610	233617	0 %	25 %	50 %	25 %	378715741
5260	NC_016906	CCG	2	6	233645	233650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715741
5261	NC_016906	GGC	2	6	233753	233758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715741
5262	NC_016906	GCCG	2	8	233805	233812	0 %	0 %	50 %	50 %	378715741
5263	NC_016906	AAG	2	6	233937	233942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715741
5264	NC_016906	ACGCG	2	10	233970	233979	20 %	0 %	40 %	40 %	378715741
5265	NC_016906	TCGA	2	8	234030	234037	25 %	25 %	25 %	25 %	378715741
5266	NC_016906	CGAC	2	8	234055	234062	25 %	0 %	25 %	50 %	378715741
5267	NC_016906	TGG	2	6	234078	234083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715741
5268	NC_016906	ATC	2	6	234096	234101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715741
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5270	NC_016906	CGAG	2	8	234137	234144	25 %	0 %	50 %	25 %	378715741
5271	NC_016906	TGC	2	6	234305	234310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715741
5272	NC_016906	CAG	2	6	234419	234424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715741
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5274	NC_016906	CG	3	6	234960	234965	0 %	0 %	50 %	50 %	378715742
5275	NC_016906	GGT	2	6	234971	234976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715742
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5278	NC_016906	GCT	2	6	235015	235020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715742
5279	NC_016906	CGAAGG	2	12	235024	235035	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378715742
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5311	NC_016906	CGG	2	6	236317	236322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715743
5312	NC_016906	CGTCGA	2	12	236335	236346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378715743
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5314	NC_016906	CGG	2	6	236371	236376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715743
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5319	NC_016906	GC	3	6	236671	236676	0 %	0 %	50 %	50 %	378715744
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5323	NC_016906	GCG	2	6	236807	236812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715744
5324	NC_016906	TGA	2	6	236867	236872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715744
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5327	NC_016906	TCG	2	6	236941	236946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715744
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5329	NC_016906	GCA	2	6	236981	236986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715744
5330	NC_016906	ACGCTC	2	12	237251	237262	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378715745
5331	NC_016906	GCT	2	6	237290	237295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715745
5332	NC_016906	CGA	2	6	237310	237315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715745
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5334	NC_016906	GCGAC	2	10	237372	237381	20 %	0 %	40 %	40 %	378715745
5335	NC_016906	GC	4	8	237387	237394	0 %	0 %	50 %	50 %	378715745
5336	NC_016906	GCC	2	6	237437	237442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715745
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5338	NC_016906	CGA	2	6	237496	237501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715745
5339	NC_016906	CGCGC	2	10	237502	237511	0 %	0 %	40 %	60 %	378715745
5340	NC_016906	C	6	6	237523	237528	0 %	0 %	0 %	100 %	378715745
5341	NC_016906	GCC	2	6	237594	237599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715745
5342	NC_016906	GCAC	2	8	237607	237614	25 %	0 %	25 %	50 %	378715745
5343	NC_016906	GAA	2	6	237631	237636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715745
5344	NC_016906	GGT	2	6	237658	237663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715745
5345	NC_016906	GAC	2	6	237693	237698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715745
5346	NC_016906	TGGG	2	8	237770	237777	0 %	25 %	75 %	0 %	378715746
5347	NC_016906	CGG	2	6	237785	237790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715746
5348	NC_016906	CGT	2	6	237818	237823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715746
5349	NC_016906	GGCC	2	8	237831	237838	0 %	0 %	50 %	50 %	378715746
5350	NC_016906	CCACCC	2	12	237848	237859	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	378715746
5351	NC_016906	TCG	2	6	237938	237943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715746
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5353	NC_016906	CTG	2	6	238012	238017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715746
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5355	NC_016906	CGC	2	6	238068	238073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715746
5356	NC_016906	CG	3	6	238099	238104	0 %	0 %	50 %	50 %	378715746
5357	NC_016906	CGC	2	6	238149	238154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715746
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5359	NC_016906	GTCCG	2	10	238183	238192	0 %	20 %	40 %	40 %	378715746
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5481	NC_016906	CGT	2	6	241703	241708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715749
5482	NC_016906	CGC	2	6	241841	241846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715749
5483	NC_016906	TCG	2	6	241849	241854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715749
5484	NC_016906	GCC	2	6	241868	241873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715749
5485	NC_016906	CGC	2	6	241892	241897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715749
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