MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY060

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016900	TCTG	2	8	15	22	0 %	50 %	25 %	25 %	377643907
2	NC_016900	CGT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643907
3	NC_016900	GCT	3	9	61	69	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643907
4	NC_016900	GACG	2	8	93	100	25 %	0 %	50 %	25 %	377643907
5	NC_016900	GGA	2	6	144	149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377643907
6	NC_016900	AGGA	2	8	232	239	50 %	0 %	50 %	0 %	377643907
7	NC_016900	CCGG	2	8	248	255	0 %	0 %	50 %	50 %	377643907
8	NC_016900	TGG	2	6	332	337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643907
9	NC_016900	GTG	2	6	349	354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643907
10	NC_016900	CCGG	2	8	377	384	0 %	0 %	50 %	50 %	377643907
11	NC_016900	CAC	2	6	420	425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377643907
12	NC_016900	G	6	6	515	520	0 %	0 %	100 %	0 %	377643907
13	NC_016900	GC	3	6	526	531	0 %	0 %	50 %	50 %	377643907
14	NC_016900	AGGG	2	8	600	607	25 %	0 %	75 %	0 %	377643907
15	NC_016900	GGC	2	6	660	665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643907
16	NC_016900	CGGT	2	8	815	822	0 %	25 %	50 %	25 %	377643907
17	NC_016900	GAGG	2	8	858	865	25 %	0 %	75 %	0 %	377643907
18	NC_016900	AGGA	2	8	877	884	50 %	0 %	50 %	0 %	377643907
19	NC_016900	CAG	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643907
20	NC_016900	GGC	2	6	927	932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643907
21	NC_016900	GCC	2	6	949	954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377643907
22	NC_016900	AGC	2	6	971	976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643907
23	NC_016900	TAT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377643908
24	NC_016900	ATC	3	9	1290	1298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643908
25	NC_016900	TGAA	2	8	1365	1372	50 %	25 %	25 %	0 %	377643908
26	NC_016900	CTGA	2	8	1391	1398	25 %	25 %	25 %	25 %	377643908
27	NC_016900	TCA	4	12	1417	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643908
28	NC_016900	CCA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377643908
29	NC_016900	A	6	6	1612	1617	100 %	0 %	0 %	0 %	377643908
30	NC_016900	A	8	8	1630	1637	100 %	0 %	0 %	0 %	377643908
31	NC_016900	GGC	2	6	1742	1747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643909
32	NC_016900	AGC	2	6	1764	1769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643909
33	NC_016900	TGG	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643909
34	NC_016900	TGCG	2	8	1886	1893	0 %	25 %	50 %	25 %	377643909
35	NC_016900	GGC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643909
36	NC_016900	CCA	2	6	2330	2335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377643910
37	NC_016900	GGA	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377643910
38	NC_016900	G	7	7	2356	2362	0 %	0 %	100 %	0 %	377643910
39	NC_016900	TAA	2	6	2424	2429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377643910
40	NC_016900	CGT	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643910
41	NC_016900	CGG	2	6	2480	2485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643910
42	NC_016900	T	6	6	2496	2501	0 %	100 %	0 %	0 %	377643910
43	NC_016900	ATG	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377643910
44	NC_016900	AGC	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643910
45	NC_016900	ATC	2	6	2647	2652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643910
46	NC_016900	GTA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377643910
47	NC_016900	CG	3	6	2750	2755	0 %	0 %	50 %	50 %	377643910
48	NC_016900	GT	3	6	2770	2775	0 %	50 %	50 %	0 %	377643910
49	NC_016900	TTC	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377643910
50	NC_016900	GCT	2	6	2844	2849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643910
51	NC_016900	GCC	2	6	2852	2857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377643910
52	NC_016900	TCC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377643910
53	NC_016900	GCT	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643910
54	NC_016900	TGG	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643910
55	NC_016900	TCA	2	6	3853	3858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643911
56	NC_016900	CAG	2	6	3908	3913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643911
57	NC_016900	C	6	6	3914	3919	0 %	0 %	0 %	100 %	377643911
58	NC_016900	TCTG	2	8	3964	3971	0 %	50 %	25 %	25 %	377643911
59	NC_016900	CTG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643911

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.