MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus thermoleovorans CCB_US3_UF5 chromosome

Total Repeats: 72716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016593	A	6	6	146	151	100 %	0 %	0 %	0 %	375006803
2	NC_016593	CAA	2	6	185	190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006803
3	NC_016593	ACT	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006803
4	NC_016593	GAA	2	6	310	315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006803
5	NC_016593	GAT	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006803
6	NC_016593	GAA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006803
7	NC_016593	GGC	2	6	553	558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006803
8	NC_016593	AC	3	6	574	579	50 %	0 %	0 %	50 %	375006803
9	NC_016593	TTA	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375006803
10	NC_016593	GAC	2	6	697	702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006803
11	NC_016593	CAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006803
12	NC_016593	GAT	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006803
13	NC_016593	AAG	2	6	779	784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006803
14	NC_016593	GAG	2	6	814	819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375006803
15	NC_016593	AGCA	2	8	820	827	50 %	0 %	25 %	25 %	375006803
16	NC_016593	CCG	2	6	850	855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006803
17	NC_016593	TCA	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006803
18	NC_016593	CGC	2	6	923	928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006803
19	NC_016593	TCC	2	6	953	958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006803
20	NC_016593	AAGGCG	2	12	964	975	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375006803
21	NC_016593	CGT	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006803
22	NC_016593	TCG	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006803
23	NC_016593	TCA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006803
24	NC_016593	GCA	2	6	1114	1119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006803
25	NC_016593	CAT	2	6	1134	1139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006803
26	NC_016593	GTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375006803
27	NC_016593	TC	3	6	1278	1283	0 %	50 %	0 %	50 %	375006803
28	NC_016593	A	6	6	1367	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	375006803
29	NC_016593	AAC	2	6	1449	1454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006803
30	NC_016593	TGA	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006804
31	NC_016593	ACG	2	6	1694	1699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006804
32	NC_016593	AAG	2	6	1803	1808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006804
33	NC_016593	GC	3	6	1856	1861	0 %	0 %	50 %	50 %	375006804
34	NC_016593	A	6	6	1880	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	375006804
35	NC_016593	CAA	2	6	1892	1897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006804
36	NC_016593	ATC	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006804
37	NC_016593	CGA	2	6	1981	1986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006804
38	NC_016593	GAA	3	9	2009	2017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006804
39	NC_016593	CGAC	2	8	2154	2161	25 %	0 %	25 %	50 %	375006804
40	NC_016593	CGT	2	6	2221	2226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006804
41	NC_016593	ACC	2	6	2277	2282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375006804
42	NC_016593	CTTCT	2	10	2333	2342	0 %	60 %	0 %	40 %	375006804
43	NC_016593	GCT	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006804
44	NC_016593	CTTG	2	8	2458	2465	0 %	50 %	25 %	25 %	375006804
45	NC_016593	GAAG	2	8	2471	2478	50 %	0 %	50 %	0 %	375006804
46	NC_016593	AAC	2	6	2480	2485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006804
47	NC_016593	ACG	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006804
48	NC_016593	GGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375006804
49	NC_016593	TTC	2	6	2527	2532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375006804
50	NC_016593	AGC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006804
51	NC_016593	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	375006804
52	NC_016593	CCT	2	6	2767	2772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006805
53	NC_016593	GCC	2	6	2806	2811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006805
54	NC_016593	GCT	2	6	2819	2824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006805
55	NC_016593	AAC	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006806
56	NC_016593	GA	3	6	3114	3119	50 %	0 %	50 %	0 %	375006806
57	NC_016593	TCG	3	9	3155	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006806
58	NC_016593	ATG	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006807
59	NC_016593	CGCAC	2	10	3340	3349	20 %	0 %	20 %	60 %	375006807
60	NC_016593	GAAG	2	8	3399	3406	50 %	0 %	50 %	0 %	375006807
61	NC_016593	A	7	7	3452	3458	100 %	0 %	0 %	0 %	375006807
62	NC_016593	A	7	7	3461	3467	100 %	0 %	0 %	0 %	375006807
63	NC_016593	CAG	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006807
64	NC_016593	GTC	2	6	3525	3530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006807
65	NC_016593	GCG	2	6	3578	3583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006807
66	NC_016593	TA	3	6	3624	3629	50 %	50 %	0 %	0 %	375006807
67	NC_016593	GCT	2	6	3653	3658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006807
68	NC_016593	CAA	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006807
69	NC_016593	ATG	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006807
70	NC_016593	GC	3	6	3693	3698	0 %	0 %	50 %	50 %	375006807
71	NC_016593	GAGCG	2	10	3699	3708	20 %	0 %	60 %	20 %	375006807
72	NC_016593	AGC	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006807
73	NC_016593	GGC	2	6	3752	3757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006807
74	NC_016593	GCG	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006807
75	NC_016593	GCT	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006807
76	NC_016593	GTCG	2	8	3869	3876	0 %	25 %	50 %	25 %	375006807
77	NC_016593	TAG	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006807
78	NC_016593	CGC	2	6	3932	3937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006807
79	NC_016593	AAC	2	6	3965	3970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006807
80	NC_016593	TGA	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006807
81	NC_016593	A	6	6	4016	4021	100 %	0 %	0 %	0 %	375006807
82	NC_016593	CAA	2	6	4047	4052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006807
83	NC_016593	GAT	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006807
84	NC_016593	TGA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006807
85	NC_016593	CCT	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006807
86	NC_016593	A	6	6	4194	4199	100 %	0 %	0 %	0 %	375006807
87	NC_016593	CAA	3	9	4216	4224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006807
88	NC_016593	AAG	2	6	4255	4260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006807
89	NC_016593	CTT	2	6	4300	4305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375006807
90	NC_016593	AAC	2	6	4364	4369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006808
91	NC_016593	TCG	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006808
92	NC_016593	ACA	2	6	4502	4507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006808
93	NC_016593	CGA	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006808
94	NC_016593	ACA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006808
95	NC_016593	CCG	2	6	4634	4639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006808
96	NC_016593	CGG	2	6	4704	4709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006808
97	NC_016593	GTC	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006808
98	NC_016593	GACCG	2	10	4849	4858	20 %	0 %	40 %	40 %	375006808
99	NC_016593	ACG	2	6	4861	4866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006808
100	NC_016593	GAC	2	6	4902	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006808
101	NC_016593	GACG	2	8	4983	4990	25 %	0 %	50 %	25 %	375006808
102	NC_016593	A	6	6	5007	5012	100 %	0 %	0 %	0 %	375006808
103	NC_016593	GGC	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006808
104	NC_016593	CGTC	2	8	5046	5053	0 %	25 %	25 %	50 %	375006808
105	NC_016593	TGC	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006808
106	NC_016593	ACG	2	6	5147	5152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006808
107	NC_016593	CAA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006808
108	NC_016593	GGC	2	6	5203	5208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006808
109	NC_016593	AGC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006808
110	NC_016593	CATC	2	8	5350	5357	25 %	25 %	0 %	50 %	375006808
111	NC_016593	AAACGA	2	12	5375	5386	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	375006808
112	NC_016593	GC	3	6	5404	5409	0 %	0 %	50 %	50 %	375006808
113	NC_016593	CGA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006808
114	NC_016593	TCG	2	6	5483	5488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006808
115	NC_016593	ATG	2	6	5497	5502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006808
116	NC_016593	GCG	2	6	5503	5508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006808
117	NC_016593	GGC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006808
118	NC_016593	A	6	6	5527	5532	100 %	0 %	0 %	0 %	375006808
119	NC_016593	GC	3	6	5533	5538	0 %	0 %	50 %	50 %	375006808
120	NC_016593	GTC	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006808
121	NC_016593	CGGC	2	8	5651	5658	0 %	0 %	50 %	50 %	375006808
122	NC_016593	GC	3	6	5737	5742	0 %	0 %	50 %	50 %	375006808
123	NC_016593	ATT	2	6	5779	5784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375006808
124	NC_016593	TCA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006808
125	NC_016593	CTT	2	6	5893	5898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375006808
126	NC_016593	T	7	7	5905	5911	0 %	100 %	0 %	0 %	375006808
127	NC_016593	ATTG	2	8	5928	5935	25 %	50 %	25 %	0 %	375006808
128	NC_016593	GCC	2	6	5961	5966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006808
129	NC_016593	CGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006808
130	NC_016593	ACG	2	6	6118	6123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006808
131	NC_016593	TGC	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006808
132	NC_016593	GCCGC	2	10	6219	6228	0 %	0 %	40 %	60 %	375006808
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134	NC_016593	AAC	2	6	6440	6445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006809
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263	NC_016593	CGG	2	6	18108	18113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006813
264	NC_016593	GCTT	2	8	18179	18186	0 %	50 %	25 %	25 %	375006813
265	NC_016593	GCC	2	6	18230	18235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006813
266	NC_016593	GCA	2	6	18284	18289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006813
267	NC_016593	AAG	2	6	18305	18310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006813
268	NC_016593	GC	3	6	18402	18407	0 %	0 %	50 %	50 %	375006813
269	NC_016593	A	6	6	18452	18457	100 %	0 %	0 %	0 %	375006813
270	NC_016593	AAG	2	6	18524	18529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006813
271	NC_016593	ACT	2	6	18536	18541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006813
272	NC_016593	GAG	3	9	18659	18667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375006814
273	NC_016593	AAAAC	2	10	18668	18677	80 %	0 %	0 %	20 %	375006814
274	NC_016593	GTT	2	6	18680	18685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375006814
275	NC_016593	GAA	2	6	18805	18810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006814
276	NC_016593	A	7	7	18820	18826	100 %	0 %	0 %	0 %	375006814
277	NC_016593	ATG	2	6	18864	18869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006814
278	NC_016593	CTT	2	6	18882	18887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375006814
279	NC_016593	ATC	2	6	19077	19082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006814
280	NC_016593	ATG	2	6	19110	19115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006814
281	NC_016593	GCGATG	2	12	19248	19259	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375006814
282	NC_016593	ATC	2	6	19282	19287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006814
283	NC_016593	GGAA	2	8	19331	19338	50 %	0 %	50 %	0 %	375006814
284	NC_016593	TGC	2	6	19375	19380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006814
285	NC_016593	CGAAA	2	10	19465	19474	60 %	0 %	20 %	20 %	375006814
286	NC_016593	ACA	2	6	19527	19532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006814
287	NC_016593	GC	3	6	19539	19544	0 %	0 %	50 %	50 %	375006814
288	NC_016593	GAAA	2	8	19658	19665	75 %	0 %	25 %	0 %	375006814
289	NC_016593	A	7	7	19758	19764	100 %	0 %	0 %	0 %	375006814
290	NC_016593	AAG	2	6	19771	19776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006814
291	NC_016593	A	6	6	19797	19802	100 %	0 %	0 %	0 %	375006814
292	NC_016593	AT	3	6	19817	19822	50 %	50 %	0 %	0 %	375006814
293	NC_016593	GAC	2	6	19842	19847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006814
294	NC_016593	CTT	2	6	19856	19861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375006814
295	NC_016593	A	7	7	19876	19882	100 %	0 %	0 %	0 %	375006814
296	NC_016593	GC	3	6	19946	19951	0 %	0 %	50 %	50 %	375006814
297	NC_016593	CGG	2	6	19955	19960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006814
298	NC_016593	TGTT	2	8	19963	19970	0 %	75 %	25 %	0 %	375006814
299	NC_016593	GGCT	2	8	20004	20011	0 %	25 %	50 %	25 %	375006814
300	NC_016593	GGC	2	6	20200	20205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006815
301	NC_016593	TCA	2	6	20207	20212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006815
302	NC_016593	CGT	2	6	20217	20222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006815
303	NC_016593	CGG	2	6	20291	20296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006815
304	NC_016593	CGC	2	6	20304	20309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006815
305	NC_016593	CG	3	6	20319	20324	0 %	0 %	50 %	50 %	375006815
306	NC_016593	CCGAC	2	10	20330	20339	20 %	0 %	20 %	60 %	375006815
307	NC_016593	GAA	2	6	20347	20352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006815
308	NC_016593	TGA	2	6	20354	20359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006815
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311	NC_016593	GCG	2	6	20548	20553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006815
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348	NC_016593	GAGC	2	8	22386	22393	25 %	0 %	50 %	25 %	375006817
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369	NC_016593	GAT	2	6	23310	23315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006818
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386	NC_016593	GC	3	6	24160	24165	0 %	0 %	50 %	50 %	375006819
387	NC_016593	TCG	2	6	24171	24176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006819
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389	NC_016593	GCG	2	6	24259	24264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006819
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391	NC_016593	CGCGC	2	10	24371	24380	0 %	0 %	40 %	60 %	375006819
392	NC_016593	TA	3	6	24428	24433	50 %	50 %	0 %	0 %	375006819
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433	NC_016593	GCC	3	9	26799	26807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006821
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455	NC_016593	A	6	6	27516	27521	100 %	0 %	0 %	0 %	375006822
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