MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY030

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016028	TGT	2	6	27	32	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347762034
2	NC_016028	CCT	2	6	42	47	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347762034
3	NC_016028	GCA	2	6	63	68	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762034
4	NC_016028	TCG	2	6	171	176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762034
5	NC_016028	CAG	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762034
6	NC_016028	CGA	2	6	444	449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762034
7	NC_016028	CGC	2	6	493	498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762034
8	NC_016028	ATG	2	6	575	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762034
9	NC_016028	ATT	2	6	599	604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347762034
10	NC_016028	ACG	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762034
11	NC_016028	ATT	2	6	732	737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347762034
12	NC_016028	GAT	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762034
13	NC_016028	ATC	2	6	770	775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762034
14	NC_016028	TCA	2	6	824	829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762034
15	NC_016028	CAG	2	6	857	862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762034
16	NC_016028	CAT	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762034
17	NC_016028	GAA	2	6	990	995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347762034
18	NC_016028	TCA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762034
19	NC_016028	GAC	2	6	1116	1121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762035
20	NC_016028	TCA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762035
21	NC_016028	CTG	2	6	1215	1220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762035
22	NC_016028	CAC	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347762035
23	NC_016028	ACC	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347762035
24	NC_016028	CAG	3	9	1461	1469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762036
25	NC_016028	ATG	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762036
26	NC_016028	ACA	2	6	1547	1552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347762036
27	NC_016028	GCC	2	6	1589	1594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762036
28	NC_016028	GAG	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347762036
29	NC_016028	CCG	2	6	1674	1679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762036
30	NC_016028	ATA	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347762036
31	NC_016028	TAT	2	6	1789	1794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347762036
32	NC_016028	CCA	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347762036
33	NC_016028	CGT	2	6	1990	1995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762036
34	NC_016028	CCA	2	6	2308	2313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347762037
35	NC_016028	GGC	3	9	2393	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762037
36	NC_016028	GGC	2	6	2727	2732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762038
37	NC_016028	GTG	2	6	2899	2904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347762038
38	NC_016028	ACC	2	6	3019	3024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347762038
39	NC_016028	ATC	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762038
40	NC_016028	ATC	2	6	3099	3104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762038
41	NC_016028	CGG	2	6	3128	3133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762038
42	NC_016028	CGT	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762038
43	NC_016028	GCT	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762039
44	NC_016028	CGT	2	6	3821	3826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762039
45	NC_016028	TGT	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347762039
46	NC_016028	GGC	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762039
47	NC_016028	GCG	2	6	4021	4026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762039
48	NC_016028	GTC	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762039
49	NC_016028	TGC	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762039
50	NC_016028	CAC	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347762039
51	NC_016028	CGG	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762039
52	NC_016028	GCA	2	6	4268	4273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762039
53	NC_016028	GAT	2	6	4281	4286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762039
54	NC_016028	CGC	4	12	4645	4656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762040
55	NC_016028	GCA	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762040
56	NC_016028	GCA	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762040
57	NC_016028	CAT	2	6	4843	4848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762040
58	NC_016028	GAT	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762041
59	NC_016028	GCA	2	6	5119	5124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762041
60	NC_016028	CGA	2	6	5132	5137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762041
61	NC_016028	CGT	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762041
62	NC_016028	GCG	2	6	5154	5159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762041
63	NC_016028	CGG	2	6	5181	5186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762041
64	NC_016028	AGC	2	6	5279	5284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762041
65	NC_016028	GGC	3	9	5325	5333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762041
66	NC_016028	GAT	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762041
67	NC_016028	TCA	3	9	5396	5404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762041
68	NC_016028	CGG	2	6	5433	5438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762041
69	NC_016028	TCA	2	6	5447	5452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762041
70	NC_016028	CGA	2	6	5523	5528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762041
71	NC_016028	GCA	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762042
72	NC_016028	GCG	2	6	5656	5661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762042
73	NC_016028	GTG	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347762042
74	NC_016028	TCG	2	6	5717	5722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762042
75	NC_016028	CGA	2	6	5780	5785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762042
76	NC_016028	CAG	2	6	5796	5801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762042
77	NC_016028	CGA	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762042
78	NC_016028	GTC	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762042
79	NC_016028	GCG	2	6	6031	6036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762042
80	NC_016028	GCC	2	6	6052	6057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762042
81	NC_016028	GTC	2	6	6129	6134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762042
82	NC_016028	CGG	2	6	6233	6238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762042
83	NC_016028	CTG	2	6	6246	6251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762042
84	NC_016028	GGT	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347762042
85	NC_016028	TCG	2	6	6340	6345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762042
86	NC_016028	GCA	2	6	6392	6397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762042
87	NC_016028	GCG	3	9	6399	6407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762042
88	NC_016028	TGA	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762042
89	NC_016028	GCC	3	9	6471	6479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762042
90	NC_016028	CCT	2	6	6545	6550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347762042
91	NC_016028	GAG	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347762042
92	NC_016028	GAT	3	9	6594	6602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762042
93	NC_016028	GCA	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762042
94	NC_016028	TTC	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762042
95	NC_016028	CGA	2	6	6752	6757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762042
96	NC_016028	ATC	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762042
97	NC_016028	GCC	2	6	6888	6893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762042
98	NC_016028	CGG	3	9	6935	6943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762042
99	NC_016028	GCC	2	6	6996	7001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762042
100	NC_016028	GGT	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347762042
101	NC_016028	GCA	2	6	7023	7028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762042
102	NC_016028	GCG	2	6	7086	7091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762043
103	NC_016028	AAG	2	6	7131	7136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347762043
104	NC_016028	GCA	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762043
105	NC_016028	TGC	2	6	7288	7293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762043
106	NC_016028	TGG	2	6	7331	7336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347762044
107	NC_016028	CGG	2	6	7340	7345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762044
108	NC_016028	GGC	2	6	7398	7403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762044
109	NC_016028	TCT	2	6	7505	7510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762044
110	NC_016028	CGG	2	6	7517	7522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762044
111	NC_016028	GCG	2	6	7543	7548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762044
112	NC_016028	TCG	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762044
113	NC_016028	CGG	2	6	7580	7585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762044
114	NC_016028	GCC	2	6	7594	7599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762044
115	NC_016028	GCG	2	6	7670	7675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762045
116	NC_016028	CCA	2	6	7677	7682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347762045
117	NC_016028	AGG	2	6	7699	7704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347762045
118	NC_016028	CGG	3	9	7844	7852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762045
119	NC_016028	CAA	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347762045
120	NC_016028	GCG	2	6	7928	7933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762045
121	NC_016028	GCA	2	6	7938	7943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762045
122	NC_016028	CGG	2	6	7996	8001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762045
123	NC_016028	GCT	2	6	8018	8023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762045
124	NC_016028	ATG	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762046
125	NC_016028	CGC	2	6	8248	8253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762046
126	NC_016028	CGA	2	6	8342	8347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762046
127	NC_016028	TCG	2	6	8368	8373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762046
128	NC_016028	GCG	2	6	8377	8382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762046
129	NC_016028	CCG	2	6	8485	8490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762046
130	NC_016028	ATC	2	6	8526	8531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762046
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133	NC_016028	GCA	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762047
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240	NC_016028	CAT	2	6	16708	16713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762053
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245	NC_016028	CTT	2	6	17204	17209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762053
246	NC_016028	CAG	2	6	17526	17531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762054
247	NC_016028	TTG	2	6	17626	17631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347762054
248	NC_016028	CTT	2	6	17774	17779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762054
249	NC_016028	ATA	2	6	17889	17894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347762055
250	NC_016028	GCT	2	6	18080	18085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762055
251	NC_016028	TGG	2	6	18089	18094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347762055
252	NC_016028	GCA	2	6	18158	18163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347762055
253	NC_016028	ATA	2	6	18219	18224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347762055
254	NC_016028	TGG	2	6	18367	18372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347762055
255	NC_016028	TGA	2	6	18386	18391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762055
256	NC_016028	TCA	2	6	18415	18420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762055
257	NC_016028	GCG	2	6	18473	18478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762055
258	NC_016028	TTC	2	6	18508	18513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762055
259	NC_016028	CTT	2	6	18552	18557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762055
260	NC_016028	GCT	2	6	18617	18622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762055
261	NC_016028	CCT	2	6	18659	18664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347762055
262	NC_016028	GCC	2	6	18667	18672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762055
263	NC_016028	GTG	2	6	18724	18729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347762055
264	NC_016028	GCC	2	6	18811	18816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762055
265	NC_016028	TTA	2	6	18841	18846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347762055
266	NC_016028	GGC	2	6	18895	18900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347762055
267	NC_016028	ATG	2	6	19070	19075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762056
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271	NC_016028	CCA	2	6	19351	19356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347762056
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274	NC_016028	TCT	2	6	19923	19928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762057
275	NC_016028	TCC	2	6	19967	19972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347762057
276	NC_016028	AGA	2	6	20026	20031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347762058
277	NC_016028	GCC	2	6	20044	20049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762058
278	NC_016028	GCT	2	6	20100	20105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762058
279	NC_016028	TTC	3	9	20139	20147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762058
280	NC_016028	CTT	2	6	20621	20626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762059
281	NC_016028	AAG	2	6	20722	20727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347762060
282	NC_016028	GCC	2	6	20822	20827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762060
283	NC_016028	CCG	2	6	20881	20886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762060
284	NC_016028	TTG	2	6	20891	20896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347762060
285	NC_016028	GAA	2	6	20922	20927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347762060
286	NC_016028	TCA	3	9	20934	20942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347762060
287	NC_016028	TTC	2	6	20962	20967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762060
288	NC_016028	GCT	2	6	21122	21127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347762061
289	NC_016028	CTT	2	6	21167	21172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762061
290	NC_016028	AAT	2	6	21225	21230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347762061
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293	NC_016028	CTT	2	6	21711	21716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347762062
294	NC_016028	CCG	2	6	21836	21841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347762062
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345	NC_016028	GTA	2	6	27671	27676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347762072

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.