MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	GA	3	6	745	750	50 %	0 %	50 %	0 %	336233475
2	NC_015665	GC	3	6	2409	2414	0 %	0 %	50 %	50 %	336233476
3	NC_015665	GA	3	6	3606	3611	50 %	0 %	50 %	0 %	336233478
4	NC_015665	TC	3	6	4177	4182	0 %	50 %	0 %	50 %	336233478
5	NC_015665	TC	3	6	7147	7152	0 %	50 %	0 %	50 %	336233480
6	NC_015665	TG	3	6	8171	8176	0 %	50 %	50 %	0 %	336233480
7	NC_015665	CT	3	6	8227	8232	0 %	50 %	0 %	50 %	336233480
8	NC_015665	GT	3	6	9670	9675	0 %	50 %	50 %	0 %	336233481
9	NC_015665	AT	3	6	9692	9697	50 %	50 %	0 %	0 %	336233481
10	NC_015665	TA	3	6	10099	10104	50 %	50 %	0 %	0 %	336233481
11	NC_015665	GT	3	6	10132	10137	0 %	50 %	50 %	0 %	336233481
12	NC_015665	GA	3	6	10240	10245	50 %	0 %	50 %	0 %	336233481
13	NC_015665	TC	3	6	10460	10465	0 %	50 %	0 %	50 %	336233481
14	NC_015665	TA	3	6	10882	10887	50 %	50 %	0 %	0 %	336233481
15	NC_015665	CT	3	6	15891	15896	0 %	50 %	0 %	50 %	336233485
16	NC_015665	GA	3	6	20975	20980	50 %	0 %	50 %	0 %	336233488
17	NC_015665	GC	3	6	21075	21080	0 %	0 %	50 %	50 %	336233488
18	NC_015665	TG	3	6	21215	21220	0 %	50 %	50 %	0 %	336233488
19	NC_015665	GT	3	6	21875	21880	0 %	50 %	50 %	0 %	336233489
20	NC_015665	TC	3	6	22190	22195	0 %	50 %	0 %	50 %	336233489
21	NC_015665	AT	3	6	22736	22741	50 %	50 %	0 %	0 %	336233489
22	NC_015665	AC	3	6	24430	24435	50 %	0 %	0 %	50 %	336233491
23	NC_015665	AG	3	6	27042	27047	50 %	0 %	50 %	0 %	336233493
24	NC_015665	GA	3	6	27455	27460	50 %	0 %	50 %	0 %	336233493
25	NC_015665	AG	3	6	28765	28770	50 %	0 %	50 %	0 %	336233494
26	NC_015665	CT	3	6	29080	29085	0 %	50 %	0 %	50 %	336233494
27	NC_015665	TC	3	6	29427	29432	0 %	50 %	0 %	50 %	336233495
28	NC_015665	CG	3	6	33804	33809	0 %	0 %	50 %	50 %	336233496
29	NC_015665	TC	3	6	34799	34804	0 %	50 %	0 %	50 %	336233497
30	NC_015665	GC	3	6	34969	34974	0 %	0 %	50 %	50 %	336233497
31	NC_015665	GC	3	6	35101	35106	0 %	0 %	50 %	50 %	336233497
32	NC_015665	CG	3	6	35437	35442	0 %	0 %	50 %	50 %	336233499
33	NC_015665	GC	3	6	38482	38487	0 %	0 %	50 %	50 %	336233503
34	NC_015665	CT	3	6	38840	38845	0 %	50 %	0 %	50 %	336233503
35	NC_015665	AT	3	6	41066	41071	50 %	50 %	0 %	0 %	336233505
36	NC_015665	GC	3	6	41604	41609	0 %	0 %	50 %	50 %	336233505
37	NC_015665	CA	3	6	41917	41922	50 %	0 %	0 %	50 %	336233505
38	NC_015665	AT	3	6	42533	42538	50 %	50 %	0 %	0 %	336233506
39	NC_015665	AT	3	6	42640	42645	50 %	50 %	0 %	0 %	336233506
40	NC_015665	TC	3	6	42758	42763	0 %	50 %	0 %	50 %	336233506
41	NC_015665	CG	3	6	43311	43316	0 %	0 %	50 %	50 %	336233506
42	NC_015665	GA	3	6	43737	43742	50 %	0 %	50 %	0 %	336233507
43	NC_015665	AT	3	6	43866	43871	50 %	50 %	0 %	0 %	336233507
44	NC_015665	CT	3	6	44176	44181	0 %	50 %	0 %	50 %	336233507
45	NC_015665	AT	3	6	44751	44756	50 %	50 %	0 %	0 %	336233507
46	NC_015665	CT	3	6	44953	44958	0 %	50 %	0 %	50 %	336233507
47	NC_015665	TC	3	6	47558	47563	0 %	50 %	0 %	50 %	336233511
48	NC_015665	GC	3	6	51096	51101	0 %	0 %	50 %	50 %	336233514
49	NC_015665	CG	3	6	51510	51515	0 %	0 %	50 %	50 %	336233514
50	NC_015665	CG	3	6	51933	51938	0 %	0 %	50 %	50 %	336233514
51	NC_015665	GA	3	6	52916	52921	50 %	0 %	50 %	0 %	336233515
52	NC_015665	GC	3	6	52973	52978	0 %	0 %	50 %	50 %	336233515
53	NC_015665	TA	3	6	53881	53886	50 %	50 %	0 %	0 %	336233516
54	NC_015665	CG	3	6	54115	54120	0 %	0 %	50 %	50 %	336233516
55	NC_015665	CG	3	6	55131	55136	0 %	0 %	50 %	50 %	336233517
56	NC_015665	GC	3	6	58205	58210	0 %	0 %	50 %	50 %	336233520
57	NC_015665	AT	3	6	58673	58678	50 %	50 %	0 %	0 %	336233520
58	NC_015665	CG	3	6	58859	58864	0 %	0 %	50 %	50 %	336233520
59	NC_015665	GC	3	6	59518	59523	0 %	0 %	50 %	50 %	336233521
60	NC_015665	CG	3	6	60027	60032	0 %	0 %	50 %	50 %	336233521
61	NC_015665	GC	3	6	60735	60740	0 %	0 %	50 %	50 %	336233522
62	NC_015665	CG	3	6	60777	60782	0 %	0 %	50 %	50 %	336233522
63	NC_015665	AT	3	6	63420	63425	50 %	50 %	0 %	0 %	336233523
64	NC_015665	GA	3	6	65595	65600	50 %	0 %	50 %	0 %	336233526
65	NC_015665	GA	3	6	66061	66066	50 %	0 %	50 %	0 %	336233526
66	NC_015665	CA	3	6	66915	66920	50 %	0 %	0 %	50 %	336233527
67	NC_015665	AT	3	6	67210	67215	50 %	50 %	0 %	0 %	336233527
68	NC_015665	AT	3	6	67416	67421	50 %	50 %	0 %	0 %	336233527
69	NC_015665	AC	3	6	67636	67641	50 %	0 %	0 %	50 %	336233527
70	NC_015665	AT	3	6	68320	68325	50 %	50 %	0 %	0 %	336233528
71	NC_015665	CG	3	6	68355	68360	0 %	0 %	50 %	50 %	336233528
72	NC_015665	AT	3	6	68459	68464	50 %	50 %	0 %	0 %	336233528
73	NC_015665	TA	3	6	68533	68538	50 %	50 %	0 %	0 %	336233528
74	NC_015665	AC	3	6	68897	68902	50 %	0 %	0 %	50 %	336233529
75	NC_015665	AT	3	6	68937	68942	50 %	50 %	0 %	0 %	336233529
76	NC_015665	GA	3	6	69395	69400	50 %	0 %	50 %	0 %	336233529
77	NC_015665	AG	3	6	70492	70497	50 %	0 %	50 %	0 %	336233530
78	NC_015665	CT	3	6	71819	71824	0 %	50 %	0 %	50 %	336233531
79	NC_015665	AT	3	6	72003	72008	50 %	50 %	0 %	0 %	336233531
80	NC_015665	CG	3	6	77746	77751	0 %	0 %	50 %	50 %	336233533
81	NC_015665	CG	3	6	77926	77931	0 %	0 %	50 %	50 %	336233533
82	NC_015665	AC	3	6	79551	79556	50 %	0 %	0 %	50 %	336233534
83	NC_015665	CG	3	6	80482	80487	0 %	0 %	50 %	50 %	336233536
84	NC_015665	AT	3	6	80575	80580	50 %	50 %	0 %	0 %	336233536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.