MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	TCAT	2	8	272	279	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
2	NC_015665	TTAT	2	8	309	316	25 %	75 %	0 %	0 %	336233475
3	NC_015665	ATCT	2	8	350	357	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
4	NC_015665	CATA	2	8	559	566	50 %	25 %	0 %	25 %	336233475
5	NC_015665	TGAT	2	8	623	630	25 %	50 %	25 %	0 %	336233475
6	NC_015665	TCAT	2	8	832	839	25 %	50 %	0 %	25 %	336233475
7	NC_015665	GCTG	2	8	2187	2194	0 %	25 %	50 %	25 %	336233476
8	NC_015665	AGAA	2	8	2303	2310	75 %	0 %	25 %	0 %	336233476
9	NC_015665	ATGG	2	8	3219	3226	25 %	25 %	50 %	0 %	336233477
10	NC_015665	TTGA	2	8	3868	3875	25 %	50 %	25 %	0 %	336233478
11	NC_015665	ATGG	2	8	4243	4250	25 %	25 %	50 %	0 %	336233478
12	NC_015665	TCGT	2	8	4917	4924	0 %	50 %	25 %	25 %	336233479
13	NC_015665	CATA	2	8	5309	5316	50 %	25 %	0 %	25 %	336233479
14	NC_015665	CTTC	2	8	5499	5506	0 %	50 %	0 %	50 %	336233479
15	NC_015665	AGCC	2	8	5630	5637	25 %	0 %	25 %	50 %	336233479
16	NC_015665	TAGG	2	8	5907	5914	25 %	25 %	50 %	0 %	336233479
17	NC_015665	TCAT	2	8	6541	6548	25 %	50 %	0 %	25 %	336233480
18	NC_015665	AGCA	2	8	6602	6609	50 %	0 %	25 %	25 %	336233480
19	NC_015665	TAAC	2	8	6997	7004	50 %	25 %	0 %	25 %	336233480
20	NC_015665	GCGG	2	8	7304	7311	0 %	0 %	75 %	25 %	336233480
21	NC_015665	GAAA	2	8	7376	7383	75 %	0 %	25 %	0 %	336233480
22	NC_015665	CGCC	2	8	7415	7422	0 %	0 %	25 %	75 %	336233480
23	NC_015665	TGGG	2	8	7749	7756	0 %	25 %	75 %	0 %	336233480
24	NC_015665	ATTT	2	8	7824	7831	25 %	75 %	0 %	0 %	336233480
25	NC_015665	GATT	2	8	8138	8145	25 %	50 %	25 %	0 %	336233480
26	NC_015665	TTGG	2	8	9635	9642	0 %	50 %	50 %	0 %	336233481
27	NC_015665	CGGC	2	8	9781	9788	0 %	0 %	50 %	50 %	336233481
28	NC_015665	TCAT	2	8	10369	10376	25 %	50 %	0 %	25 %	336233481
29	NC_015665	ACAA	2	8	10874	10881	75 %	0 %	0 %	25 %	336233481
30	NC_015665	ATTA	2	8	11402	11409	50 %	50 %	0 %	0 %	336233482
31	NC_015665	ATGG	2	8	13848	13855	25 %	25 %	50 %	0 %	336233484
32	NC_015665	AAAG	2	8	16331	16338	75 %	0 %	25 %	0 %	336233485
33	NC_015665	TGAT	2	8	17743	17750	25 %	50 %	25 %	0 %	336233486
34	NC_015665	ACCA	3	12	17980	17991	50 %	0 %	0 %	50 %	336233486
35	NC_015665	GGTT	2	8	18058	18065	0 %	50 %	50 %	0 %	336233486
36	NC_015665	AAAG	2	8	18206	18213	75 %	0 %	25 %	0 %	336233486
37	NC_015665	AAAG	2	8	18263	18270	75 %	0 %	25 %	0 %	336233486
38	NC_015665	AAAC	2	8	19746	19753	75 %	0 %	0 %	25 %	336233487
39	NC_015665	TTAA	2	8	19961	19968	50 %	50 %	0 %	0 %	336233488
40	NC_015665	TTGC	2	8	19988	19995	0 %	50 %	25 %	25 %	336233488
41	NC_015665	GTTG	2	8	20311	20318	0 %	50 %	50 %	0 %	336233488
42	NC_015665	CAAC	2	8	20722	20729	50 %	0 %	0 %	50 %	336233488
43	NC_015665	AAAT	2	8	20750	20757	75 %	25 %	0 %	0 %	336233488
44	NC_015665	GAAG	2	8	20830	20837	50 %	0 %	50 %	0 %	336233488
45	NC_015665	TCGG	2	8	20886	20893	0 %	25 %	50 %	25 %	336233488
46	NC_015665	AATC	2	8	21095	21102	50 %	25 %	0 %	25 %	336233488
47	NC_015665	CTTC	2	8	21125	21132	0 %	50 %	0 %	50 %	336233488
48	NC_015665	TGTT	2	8	21295	21302	0 %	75 %	25 %	0 %	336233488
49	NC_015665	GTTT	2	8	21455	21462	0 %	75 %	25 %	0 %	336233488
50	NC_015665	ATCA	2	8	22088	22095	50 %	25 %	0 %	25 %	336233489
51	NC_015665	TCTT	2	8	22338	22345	0 %	75 %	0 %	25 %	336233489
52	NC_015665	ATCA	2	8	22412	22419	50 %	25 %	0 %	25 %	336233489
53	NC_015665	CGGC	2	8	23294	23301	0 %	0 %	50 %	50 %	336233491
54	NC_015665	GGAA	2	8	23473	23480	50 %	0 %	50 %	0 %	336233491
55	NC_015665	TCCA	2	8	23691	23698	25 %	25 %	0 %	50 %	336233491
56	NC_015665	CGTA	2	8	24009	24016	25 %	25 %	25 %	25 %	336233491
57	NC_015665	TGGT	2	8	24396	24403	0 %	50 %	50 %	0 %	336233491
58	NC_015665	TTTG	2	8	24522	24529	0 %	75 %	25 %	0 %	336233491
59	NC_015665	GCAT	2	8	25600	25607	25 %	25 %	25 %	25 %	336233492
60	NC_015665	GCTT	2	8	25777	25784	0 %	50 %	25 %	25 %	336233492
61	NC_015665	ATTG	2	8	26202	26209	25 %	50 %	25 %	0 %	336233492
62	NC_015665	TATT	2	8	26263	26270	25 %	75 %	0 %	0 %	336233492
63	NC_015665	TAAT	2	8	26720	26727	50 %	50 %	0 %	0 %	336233492
64	NC_015665	ATGA	2	8	26781	26788	50 %	25 %	25 %	0 %	336233492
65	NC_015665	CCAT	2	8	27974	27981	25 %	25 %	0 %	50 %	336233494
66	NC_015665	TCCT	2	8	28350	28357	0 %	50 %	0 %	50 %	336233494
67	NC_015665	TAGA	2	8	28617	28624	50 %	25 %	25 %	0 %	336233494
68	NC_015665	ATCA	2	8	28824	28831	50 %	25 %	0 %	25 %	336233494
69	NC_015665	TTCA	2	8	28902	28909	25 %	50 %	0 %	25 %	336233494
70	NC_015665	ATCC	2	8	29197	29204	25 %	25 %	0 %	50 %	336233495
71	NC_015665	ACTC	2	8	29830	29837	25 %	25 %	0 %	50 %	336233495
72	NC_015665	CAAA	2	8	29851	29858	75 %	0 %	0 %	25 %	336233495
73	NC_015665	CTTG	2	8	33643	33650	0 %	50 %	25 %	25 %	336233496
74	NC_015665	GATC	2	8	35530	35537	25 %	25 %	25 %	25 %	336233499
75	NC_015665	CTTC	2	8	36507	36514	0 %	50 %	0 %	50 %	336233501
76	NC_015665	GGAC	2	8	37050	37057	25 %	0 %	50 %	25 %	336233502
77	NC_015665	ATCG	2	8	37151	37158	25 %	25 %	25 %	25 %	336233502
78	NC_015665	GAAT	2	8	37479	37486	50 %	25 %	25 %	0 %	336233502
79	NC_015665	TGTC	2	8	37498	37505	0 %	50 %	25 %	25 %	336233502
80	NC_015665	TGTT	2	8	37573	37580	0 %	75 %	25 %	0 %	336233502
81	NC_015665	GCTG	2	8	38020	38027	0 %	25 %	50 %	25 %	336233502
82	NC_015665	GGCG	2	8	38072	38079	0 %	0 %	75 %	25 %	336233502
83	NC_015665	GCAA	2	8	38588	38595	50 %	0 %	25 %	25 %	336233503
84	NC_015665	TAAA	2	8	39013	39020	75 %	25 %	0 %	0 %	336233503
85	NC_015665	GTTT	2	8	39470	39477	0 %	75 %	25 %	0 %	336233504
86	NC_015665	ATCC	2	8	39834	39841	25 %	25 %	0 %	50 %	336233504
87	NC_015665	AATC	2	8	39868	39875	50 %	25 %	0 %	25 %	336233504
88	NC_015665	AGCC	2	8	39957	39964	25 %	0 %	25 %	50 %	336233504
89	NC_015665	ACAA	2	8	40338	40345	75 %	0 %	0 %	25 %	336233504
90	NC_015665	ATCC	2	8	41044	41051	25 %	25 %	0 %	50 %	336233505
91	NC_015665	ACGC	2	8	41326	41333	25 %	0 %	25 %	50 %	336233505
92	NC_015665	AAAT	2	8	41549	41556	75 %	25 %	0 %	0 %	336233505
93	NC_015665	TTCT	2	8	42267	42274	0 %	75 %	0 %	25 %	336233506
94	NC_015665	AATA	2	8	42491	42498	75 %	25 %	0 %	0 %	336233506
95	NC_015665	CTTC	2	8	42545	42552	0 %	50 %	0 %	50 %	336233506
96	NC_015665	GCTT	2	8	42833	42840	0 %	50 %	25 %	25 %	336233506
97	NC_015665	GCTT	2	8	42910	42917	0 %	50 %	25 %	25 %	336233506
98	NC_015665	CGCC	2	8	42961	42968	0 %	0 %	25 %	75 %	336233506
99	NC_015665	GGTT	2	8	42996	43003	0 %	50 %	50 %	0 %	336233506
100	NC_015665	TTCC	2	8	43654	43661	0 %	50 %	0 %	50 %	336233507
101	NC_015665	TTTC	2	8	44022	44029	0 %	75 %	0 %	25 %	336233507
102	NC_015665	TCGA	2	8	44154	44161	25 %	25 %	25 %	25 %	336233507
103	NC_015665	CGAA	2	8	45372	45379	50 %	0 %	25 %	25 %	336233508
104	NC_015665	TGCC	2	8	45465	45472	0 %	25 %	25 %	50 %	336233508
105	NC_015665	GAGC	2	8	45634	45641	25 %	0 %	50 %	25 %	336233508
106	NC_015665	GCGA	2	8	45662	45669	25 %	0 %	50 %	25 %	336233508
107	NC_015665	CGAA	2	8	45858	45865	50 %	0 %	25 %	25 %	336233508
108	NC_015665	AAGA	2	8	46114	46121	75 %	0 %	25 %	0 %	336233509
109	NC_015665	GAAA	2	8	46140	46147	75 %	0 %	25 %	0 %	336233509
110	NC_015665	ATTT	2	8	46221	46228	25 %	75 %	0 %	0 %	336233509
111	NC_015665	TGAA	2	8	46258	46265	50 %	25 %	25 %	0 %	336233509
112	NC_015665	CGGG	2	8	46678	46685	0 %	0 %	75 %	25 %	336233510
113	NC_015665	AGAA	2	8	46868	46875	75 %	0 %	25 %	0 %	336233510
114	NC_015665	GAAA	2	8	47061	47068	75 %	0 %	25 %	0 %	336233510
115	NC_015665	AGGA	2	8	47138	47145	50 %	0 %	50 %	0 %	336233510
116	NC_015665	GACC	2	8	47307	47314	25 %	0 %	25 %	50 %	336233510
117	NC_015665	TTCT	2	8	47438	47445	0 %	75 %	0 %	25 %	336233511
118	NC_015665	TAAT	2	8	47501	47508	50 %	50 %	0 %	0 %	336233511
119	NC_015665	AATA	2	8	47657	47664	75 %	25 %	0 %	0 %	336233511
120	NC_015665	ATTT	2	8	47677	47684	25 %	75 %	0 %	0 %	336233511
121	NC_015665	ATGG	2	8	50165	50172	25 %	25 %	50 %	0 %	336233512
122	NC_015665	CAGC	2	8	50708	50715	25 %	0 %	25 %	50 %	336233513
123	NC_015665	GCCG	2	8	50792	50799	0 %	0 %	50 %	50 %	336233513
124	NC_015665	CGAA	2	8	50856	50863	50 %	0 %	25 %	25 %	336233513
125	NC_015665	TTTC	2	8	51709	51716	0 %	75 %	0 %	25 %	336233514
126	NC_015665	GTTT	2	8	52065	52072	0 %	75 %	25 %	0 %	336233514
127	NC_015665	CAGC	2	8	52087	52094	25 %	0 %	25 %	50 %	336233514
128	NC_015665	CGAA	2	8	52949	52956	50 %	0 %	25 %	25 %	336233515
129	NC_015665	TGCC	2	8	53162	53169	0 %	25 %	25 %	50 %	336233515
130	NC_015665	AAAC	2	8	53815	53822	75 %	0 %	0 %	25 %	336233516
131	NC_015665	CAAG	2	8	55422	55429	50 %	0 %	25 %	25 %	336233517
132	NC_015665	CTTG	2	8	55443	55450	0 %	50 %	25 %	25 %	336233517
133	NC_015665	CTTT	2	8	55570	55577	0 %	75 %	0 %	25 %	336233518
134	NC_015665	TCTG	2	8	55607	55614	0 %	50 %	25 %	25 %	336233518
135	NC_015665	CGGA	2	8	55652	55659	25 %	0 %	50 %	25 %	336233518
136	NC_015665	CGGC	2	8	55960	55967	0 %	0 %	50 %	50 %	336233518
137	NC_015665	TTTG	2	8	56706	56713	0 %	75 %	25 %	0 %	336233519
138	NC_015665	TTTC	2	8	57012	57019	0 %	75 %	0 %	25 %	336233519
139	NC_015665	GATG	2	8	58939	58946	25 %	25 %	50 %	0 %	336233520
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.