MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	TGA	2	6	322	327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233475
2	NC_015665	ATC	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233475
3	NC_015665	CTC	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233475
4	NC_015665	TTC	2	6	521	526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233475
5	NC_015665	TGA	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233475
6	NC_015665	ATG	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233475
7	NC_015665	TTA	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233475
8	NC_015665	TGT	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233476
9	NC_015665	CGG	2	6	2127	2132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233476
10	NC_015665	AAG	2	6	2258	2263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233476
11	NC_015665	GGC	2	6	2315	2320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233476
12	NC_015665	TAT	2	6	2449	2454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233476
13	NC_015665	ATA	2	6	2472	2477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233476
14	NC_015665	GTG	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233476
15	NC_015665	AAC	2	6	2526	2531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
16	NC_015665	CTT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233477
17	NC_015665	ACA	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
18	NC_015665	CAA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
19	NC_015665	TGA	3	9	3227	3235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233477
20	NC_015665	CAA	2	6	3252	3257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233477
21	NC_015665	GTA	2	6	3358	3363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233477
22	NC_015665	GAT	2	6	3646	3651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
23	NC_015665	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
24	NC_015665	ATT	2	6	3715	3720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233478
25	NC_015665	ATG	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
26	NC_015665	ATA	2	6	3792	3797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233478
27	NC_015665	TCA	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233478
28	NC_015665	GGC	2	6	3931	3936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233478
29	NC_015665	AGA	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233478
30	NC_015665	TAG	2	6	4159	4164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
31	NC_015665	TGC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233478
32	NC_015665	ATG	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233478
33	NC_015665	TTC	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
34	NC_015665	AGG	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233479
35	NC_015665	TCC	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233479
36	NC_015665	GAA	2	6	5295	5300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233479
37	NC_015665	TCC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233479
38	NC_015665	CTT	2	6	5364	5369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
39	NC_015665	CTT	2	6	5397	5402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
40	NC_015665	TTG	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233479
41	NC_015665	TGA	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233479
42	NC_015665	TCC	2	6	5624	5629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233479
43	NC_015665	TAG	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233479
44	NC_015665	TTC	2	6	5806	5811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
45	NC_015665	CTT	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233479
46	NC_015665	CAA	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233480
47	NC_015665	GCG	2	6	6207	6212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233480
48	NC_015665	CTT	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233480
49	NC_015665	TTG	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233480
50	NC_015665	AAG	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233480
51	NC_015665	ATT	2	6	6460	6465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233480
52	NC_015665	CGA	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
53	NC_015665	TGT	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233480
54	NC_015665	AAC	2	6	6697	6702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233480
55	NC_015665	TGA	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233480
56	NC_015665	CGC	2	6	6937	6942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233480
57	NC_015665	GCA	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
58	NC_015665	CAG	2	6	7032	7037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
59	NC_015665	TCT	2	6	7283	7288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233480
60	NC_015665	TGA	2	6	7339	7344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233480
61	NC_015665	CAC	2	6	7366	7371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233480
62	NC_015665	TTC	2	6	7468	7473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233480
63	NC_015665	GAA	2	6	7503	7508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233480
64	NC_015665	CAT	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233480
65	NC_015665	CTG	2	6	7761	7766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233480
66	NC_015665	CAG	2	6	7814	7819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
67	NC_015665	GCT	2	6	7838	7843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233480
68	NC_015665	GCA	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233480
69	NC_015665	CGG	2	6	8162	8167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233480
70	NC_015665	ATG	2	6	8208	8213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233480
71	NC_015665	ATT	2	6	9525	9530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233481
72	NC_015665	AAG	2	6	9643	9648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
73	NC_015665	CTT	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233481
74	NC_015665	GTC	2	6	9759	9764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233481
75	NC_015665	AAG	2	6	9835	9840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
76	NC_015665	GAA	2	6	9885	9890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
77	NC_015665	GAA	2	6	9912	9917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
78	NC_015665	AAG	2	6	9958	9963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
79	NC_015665	CAT	2	6	9971	9976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233481
80	NC_015665	GCG	2	6	10021	10026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233481
81	NC_015665	GGT	2	6	10148	10153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233481
82	NC_015665	TTG	2	6	10158	10163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233481
83	NC_015665	GCC	2	6	10173	10178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233481
84	NC_015665	ATC	3	9	10248	10256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233481
85	NC_015665	CAT	2	6	10331	10336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233481
86	NC_015665	CGA	2	6	10338	10343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233481
87	NC_015665	AGG	2	6	10379	10384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233481
88	NC_015665	GCT	2	6	10575	10580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233481
89	NC_015665	ATT	2	6	10601	10606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233481
90	NC_015665	TTA	2	6	10611	10616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233481
91	NC_015665	CTT	2	6	10630	10635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233481
92	NC_015665	ATC	2	6	10681	10686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233481
93	NC_015665	AAG	2	6	10697	10702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233481
94	NC_015665	CAG	2	6	10779	10784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233481
95	NC_015665	TGT	2	6	11135	11140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233482
96	NC_015665	TTG	2	6	11141	11146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233482
97	NC_015665	ATT	2	6	11187	11192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233482
98	NC_015665	AGA	2	6	11269	11274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233482
99	NC_015665	GCG	2	6	11338	11343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233482
100	NC_015665	GGC	2	6	11359	11364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233482
101	NC_015665	AGG	3	9	11373	11381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233482
102	NC_015665	GAG	2	6	11390	11395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233482
103	NC_015665	TTA	2	6	12895	12900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233483
104	NC_015665	TAT	2	6	12929	12934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233483
105	NC_015665	TTA	2	6	12936	12941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233483
106	NC_015665	AGG	2	6	12956	12961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233483
107	NC_015665	AAC	2	6	13155	13160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233484
108	NC_015665	CTT	2	6	13380	13385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233484
109	NC_015665	ACA	2	6	13492	13497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233484
110	NC_015665	CAA	2	6	13830	13835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233484
111	NC_015665	TGA	3	9	13856	13864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233484
112	NC_015665	CAA	2	6	13881	13886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233484
113	NC_015665	GTA	2	6	13987	13992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233484
114	NC_015665	GCT	2	6	15761	15766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233485
115	NC_015665	CTA	2	6	15863	15868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233485
116	NC_015665	ATG	2	6	15994	15999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233485
117	NC_015665	GAA	2	6	16054	16059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233485
118	NC_015665	GTG	2	6	16170	16175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233485
119	NC_015665	CAT	2	6	16232	16237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233485
120	NC_015665	GCC	3	9	16297	16305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233485
121	NC_015665	AAG	2	6	16377	16382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233485
122	NC_015665	AAG	2	6	16422	16427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233485
123	NC_015665	TTG	2	6	16429	16434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233485
124	NC_015665	CGT	2	6	16524	16529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233485
125	NC_015665	CTT	2	6	16537	16542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233485
126	NC_015665	GCG	2	6	16581	16586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233485
127	NC_015665	GGT	2	6	16601	16606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233485
128	NC_015665	TGT	2	6	16692	16697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233485
129	NC_015665	GCT	2	6	16755	16760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233485
130	NC_015665	TGA	2	6	17465	17470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233486
131	NC_015665	ATT	2	6	17649	17654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233486
132	NC_015665	TAC	2	6	17861	17866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233486
133	NC_015665	CTA	2	6	17884	17889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233486
134	NC_015665	GAA	2	6	18029	18034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233486
135	NC_015665	TGC	2	6	18040	18045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233486
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150	NC_015665	CGA	2	6	20075	20080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233488
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162	NC_015665	CAA	2	6	20531	20536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233488
163	NC_015665	CGA	2	6	20580	20585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233488
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249	NC_015665	TAA	2	6	26825	26830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233492
250	NC_015665	AGG	2	6	26856	26861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233492
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252	NC_015665	TCC	2	6	27273	27278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233493
253	NC_015665	ACA	2	6	27340	27345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233493
254	NC_015665	TTC	2	6	27357	27362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233493
255	NC_015665	GCT	2	6	27515	27520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233493
256	NC_015665	TTC	2	6	27549	27554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233493
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258	NC_015665	GCA	2	6	28087	28092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233494
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263	NC_015665	GGA	2	6	28410	28415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233494
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364	NC_015665	TGA	2	6	41637	41642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233505
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369	NC_015665	GCA	2	6	41913	41918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233505
370	NC_015665	GCG	2	6	41923	41928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233505
371	NC_015665	GTC	2	6	42041	42046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233505
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373	NC_015665	TTC	2	6	42100	42105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233505
374	NC_015665	GCA	2	6	42345	42350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233506
375	NC_015665	TTC	2	6	42400	42405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233506
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383	NC_015665	CGC	2	6	42796	42801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233506
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498	NC_015665	AGC	2	6	54607	54612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233517
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500	NC_015665	CGC	2	6	54694	54699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233517

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