MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 chromosome

Total Repeats: 1263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015660	CCGTTT	2	12	2440	2451	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336233548
2	NC_015660	AGTCGA	2	12	3399	3410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336233549
3	NC_015660	TTTTGC	2	12	4054	4065	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336233550
4	NC_015660	TGGCGG	2	12	4948	4959	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	336233551
5	NC_015660	ATTTAT	2	12	8437	8448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233552
6	NC_015660	CGATGT	2	12	17314	17325	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336233555
7	NC_015660	AACTGG	2	12	19502	19513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336233556
8	NC_015660	GACAGG	2	12	22735	22746	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336233559
9	NC_015660	GAAAAA	2	12	26917	26928	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336233563
10	NC_015660	ACTTTT	2	12	42468	42479	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336233576
11	NC_015660	TCGAAA	2	12	44594	44605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336233578
12	NC_015660	TACACG	2	12	46702	46713	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336233580
13	NC_015660	AAACAA	2	12	47246	47257	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	336233581
14	NC_015660	TCGAAA	2	12	50239	50250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336233584
15	NC_015660	TAAAAA	2	12	56143	56154	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336233592
16	NC_015660	GACGCG	2	12	56197	56208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336233592
17	NC_015660	ATTGAA	2	12	56881	56892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336233593
18	NC_015660	ATTGAT	2	12	57116	57127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336233593
19	NC_015660	TATTCA	2	12	59971	59982	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336233596
20	NC_015660	ATTCGG	2	12	61771	61782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336233596
21	NC_015660	TAGCAG	2	12	64130	64141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336233598
22	NC_015660	AAAAGA	2	12	65567	65578	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336233599
23	NC_015660	TCGCAA	2	12	67501	67512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336233603
24	NC_015660	TAAACA	2	12	69491	69502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336233605
25	NC_015660	TGCGAT	2	12	70811	70822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336233605
26	NC_015660	TTAATA	2	12	71888	71899	50 %	50 %	0 %	0 %	336233606
27	NC_015660	CATTCC	2	12	72999	73010	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336233607
28	NC_015660	ATTATC	2	12	76232	76243	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336233610
29	NC_015660	CAATAC	2	12	77355	77366	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336233611
30	NC_015660	CGGTAA	2	12	85366	85377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336233621
31	NC_015660	CAAATT	2	12	86302	86313	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336233622
32	NC_015660	GTTTCA	2	12	107387	107398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336233629
33	NC_015660	AAGGAA	2	12	114354	114365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233636
34	NC_015660	ATGGAG	2	12	114888	114899	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	336233637
35	NC_015660	GGGGAT	2	12	115173	115184	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	336233638
36	NC_015660	CATTTA	2	12	117310	117321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336233642
37	NC_015660	TGACGA	2	12	119150	119161	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336233645
38	NC_015660	TTGGCT	2	12	121045	121056	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	336233647
39	NC_015660	GGAAGT	2	12	126886	126897	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	336233648
40	NC_015660	AAAATC	2	12	128288	128299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336233650
41	NC_015660	GACAAC	2	12	129379	129390	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	336233652
42	NC_015660	ACAAGA	2	12	129472	129483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336233652
43	NC_015660	AGCGTT	2	12	130237	130248	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336233652
44	NC_015660	AAACGC	2	12	130343	130354	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	336233652
45	NC_015660	TTCGAA	2	12	130871	130882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336233652
46	NC_015660	AAAAGG	2	12	133679	133690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233655
47	NC_015660	AAAAGC	2	12	133955	133966	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336233655
48	NC_015660	CAGCTA	2	12	134287	134298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336233656
49	NC_015660	ATTGAA	2	12	136630	136641	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336233661
50	NC_015660	GTCGGT	2	12	140330	140341	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336233670
51	NC_015660	AAAGGA	2	12	140534	140545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233670
52	NC_015660	GGCAAA	2	12	141814	141825	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336233674
53	NC_015660	TGCTTC	2	12	142825	142836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336233675
54	NC_015660	TGAAAT	2	12	144197	144208	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336233677
55	NC_015660	ATTGAA	2	12	146362	146373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336233682
56	NC_015660	AAAAAG	2	12	147089	147100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336233682
57	NC_015660	TTACCC	2	12	150787	150798	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336233687
58	NC_015660	ATTGTT	2	12	152803	152814	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336233691
59	NC_015660	AAAATT	2	12	168311	168322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233701
60	NC_015660	ACAAGA	2	12	168729	168740	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336233702
61	NC_015660	CATTAA	2	12	168990	169001	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336233702
62	NC_015660	TGTGAA	2	12	169482	169493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233702
63	NC_015660	GCGAAA	2	12	171426	171437	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336233703
64	NC_015660	TCAAGA	2	12	176179	176190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336233706
65	NC_015660	TTTGAT	2	12	178164	178175	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336233707
66	NC_015660	AAACAA	2	12	180985	180996	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	336233709
67	NC_015660	AACGCC	2	12	181937	181948	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336233709
68	NC_015660	TAAAAC	2	12	196794	196805	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336233719
69	NC_015660	AGCGAA	2	12	196996	197007	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336233719
70	NC_015660	TCGCGC	2	12	198049	198060	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336233720
71	NC_015660	CAAAAG	2	12	213727	213738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336233734
72	NC_015660	AAGTCG	2	12	216404	216415	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336233737
73	NC_015660	GAGGCA	2	12	216811	216822	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336233737
74	NC_015660	CGATTG	2	12	218017	218028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336233738
75	NC_015660	GAAAGA	2	12	224312	224323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233741
76	NC_015660	TTGGAG	2	12	225855	225866	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336233743
77	NC_015660	CCGGTC	2	12	228175	228186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336233744
78	NC_015660	TGAATT	2	12	230981	230992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336233746
79	NC_015660	GAAAAG	2	12	231612	231623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233748
80	NC_015660	CCAGCG	2	12	234213	234224	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336233749
81	NC_015660	GTGGAT	2	12	234306	234317	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336233749
82	NC_015660	CAGGAG	2	12	234427	234438	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336233749
83	NC_015660	ATATGC	2	12	236779	236790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336233752
84	NC_015660	GGAAGC	2	12	237422	237433	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336233752
85	NC_015660	GACCAA	2	12	237997	238008	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	336233753
86	NC_015660	AGTTTC	2	12	243620	243631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336233757
87	NC_015660	GCGGAA	2	12	244193	244204	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336233758
88	NC_015660	CATATT	2	12	244349	244360	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	336233758
89	NC_015660	CGTTAG	2	12	248246	248257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336233760
90	NC_015660	CAACAG	2	12	248301	248312	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	336233760
91	NC_015660	CGCTGG	2	12	248822	248833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336233760
92	NC_015660	TTATTT	2	12	249705	249716	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	336233761
93	NC_015660	TCACGA	2	12	251189	251200	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336233762
94	NC_015660	ATCTTT	2	12	257338	257349	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336233764
95	NC_015660	TCAGGC	2	12	261302	261313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336233768
96	NC_015660	CTTCGT	2	12	262203	262214	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336233768
97	NC_015660	GTCGCT	2	12	262313	262324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233768
98	NC_015660	CATCGG	2	12	270617	270628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336233776
99	NC_015660	ATTTTA	2	12	271110	271121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233776
100	NC_015660	TGTGAA	2	12	284036	284047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233793
101	NC_015660	GTTTTC	2	12	290188	290199	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336233798
102	NC_015660	GCAAAA	2	12	290591	290602	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336233798
103	NC_015660	TGTTTT	2	12	293202	293213	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	336233800
104	NC_015660	TGTTTT	2	12	293676	293687	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	336233800
105	NC_015660	ACATTA	2	12	306084	306095	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336233805
106	NC_015660	ATGATA	2	12	315310	315321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336233812
107	NC_015660	TGTTAT	2	12	315470	315481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	336233812
108	NC_015660	GTTCTT	2	12	320829	320840	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336233816
109	NC_015660	AAAGAT	2	12	328218	328229	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336233821
110	NC_015660	AAGTCA	2	12	329401	329412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336233823
111	NC_015660	CACTTC	2	12	339315	339326	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336233832
112	NC_015660	TTTGCG	2	12	342464	342475	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	336233834
113	NC_015660	AGATTT	2	12	342517	342528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336233834
114	NC_015660	GGAAAA	2	12	342872	342883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233834
115	NC_015660	CGAAGG	2	12	345257	345268	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336233835
116	NC_015660	GAAAGG	2	12	349636	349647	50 %	0 %	50 %	0 %	336233838
117	NC_015660	ATACCA	2	12	350362	350373	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	336233838
118	NC_015660	CATTTC	2	12	353387	353398	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336233839
119	NC_015660	TTAAAG	2	12	355414	355425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	336233842
120	NC_015660	GTCCGC	2	12	360057	360068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336233846
121	NC_015660	TGCCGA	2	12	360866	360877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336233847
122	NC_015660	CAGTTC	2	12	368008	368019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336233852
123	NC_015660	AAGAAC	2	12	368216	368227	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	336233852
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129	NC_015660	GTTGCG	2	12	381015	381026	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336233861
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228	NC_015660	TGGATA	2	12	759467	759478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336234244
229	NC_015660	AGGAAG	2	12	760259	760270	50 %	0 %	50 %	0 %	336234246
230	NC_015660	AATCCC	2	12	761705	761716	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	336234248
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344	NC_015660	GAGATT	2	12	1040929	1040940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336234522
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346	NC_015660	ACTTGT	2	12	1045849	1045860	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336234528
347	NC_015660	TTCTTT	2	12	1048539	1048550	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	336234530
348	NC_015660	GAAAAA	2	12	1050914	1050925	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	336234531
349	NC_015660	TTCGCG	2	12	1054731	1054742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336234534
350	NC_015660	CGGAAT	2	12	1058932	1058943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336234538
351	NC_015660	GACGAG	2	12	1059282	1059293	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336234538
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453	NC_015660	TGGCGA	2	12	1274268	1274279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336234784
454	NC_015660	TTCCGG	2	12	1277025	1277036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336234787
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457	NC_015660	GATGAA	2	12	1288967	1288978	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	336234801
458	NC_015660	ATTATG	2	12	1292985	1292996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336234807
459	NC_015660	CGATGG	2	12	1295203	1295214	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336234809
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