MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 chromosome

Total Repeats: 45382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015660	TGG	2	6	450	455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233547
2	NC_015660	CAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233547
3	NC_015660	ATT	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233547
4	NC_015660	CCT	2	6	692	697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233547
5	NC_015660	GAT	2	6	710	715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233547
6	NC_015660	AGC	2	6	741	746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233547
7	NC_015660	CGG	2	6	907	912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233547
8	NC_015660	AGT	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233547
9	NC_015660	TTA	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233547
10	NC_015660	CAA	2	6	1063	1068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233547
11	NC_015660	CTA	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233547
12	NC_015660	TGA	2	6	1096	1101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233547
13	NC_015660	AAG	2	6	1134	1139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233547
14	NC_015660	GAA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233547
15	NC_015660	GCC	2	6	1204	1209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233547
16	NC_015660	CTC	2	6	1278	1283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233547
17	NC_015660	CGT	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233547
18	NC_015660	TCA	2	6	1433	1438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233547
19	NC_015660	ATT	2	6	1490	1495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233547
20	NC_015660	GCA	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233548
21	NC_015660	TGC	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233548
22	NC_015660	GAA	2	6	2346	2351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233548
23	NC_015660	GTC	2	6	2586	2591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233548
24	NC_015660	TTA	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233548
25	NC_015660	TAT	2	6	2698	2703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233548
26	NC_015660	TCT	2	6	2704	2709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233548
27	NC_015660	CTT	2	6	2818	2823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233548
28	NC_015660	GAA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233548
29	NC_015660	TGT	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233548
30	NC_015660	ACG	2	6	2862	2867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233548
31	NC_015660	CAT	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233548
32	NC_015660	TCC	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233548
33	NC_015660	GGA	2	6	2924	2929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233548
34	NC_015660	GCG	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233549
35	NC_015660	CGC	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233549
36	NC_015660	GTT	2	6	3458	3463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233550
37	NC_015660	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233550
38	NC_015660	ATG	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233550
39	NC_015660	CAA	3	9	3679	3687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233550
40	NC_015660	ATT	2	6	3714	3719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233550
41	NC_015660	AGC	3	9	3757	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233550
42	NC_015660	GCA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233550
43	NC_015660	ATT	2	6	3943	3948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233550
44	NC_015660	TGC	2	6	3955	3960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233550
45	NC_015660	AGC	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233550
46	NC_015660	AAT	2	6	4175	4180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233550
47	NC_015660	ACA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233550
48	NC_015660	AAC	2	6	4325	4330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233550
49	NC_015660	TGA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233550
50	NC_015660	CAT	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233550
51	NC_015660	AGC	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233550
52	NC_015660	ATG	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233551
53	NC_015660	CAT	2	6	4745	4750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233551
54	NC_015660	TGA	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233551
55	NC_015660	GCA	2	6	4836	4841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233551
56	NC_015660	AGG	2	6	4936	4941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233551
57	NC_015660	CGT	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233551
58	NC_015660	GAA	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233551
59	NC_015660	GCG	2	6	5076	5081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233551
60	NC_015660	GAG	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233551
61	NC_015660	ATT	2	6	5366	5371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
62	NC_015660	AGC	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233551
63	NC_015660	AAC	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233551
64	NC_015660	ATT	2	6	5513	5518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
65	NC_015660	ACA	2	6	5536	5541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233551
66	NC_015660	TTG	2	6	5751	5756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233551
67	NC_015660	GAT	2	6	5764	5769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233551
68	NC_015660	GGC	2	6	5770	5775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233551
69	NC_015660	GGC	2	6	5788	5793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233551
70	NC_015660	TCC	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233551
71	NC_015660	ATT	2	6	5987	5992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
72	NC_015660	CAA	2	6	6028	6033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233551
73	NC_015660	ATT	2	6	6047	6052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
74	NC_015660	ATT	2	6	6116	6121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
75	NC_015660	ATT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
76	NC_015660	CCG	2	6	6230	6235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233551
77	NC_015660	CGA	2	6	6330	6335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233551
78	NC_015660	AAC	2	6	6385	6390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233551
79	NC_015660	GCT	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233551
80	NC_015660	AAG	2	6	6490	6495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233551
81	NC_015660	GAA	2	6	6506	6511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233551
82	NC_015660	CGC	2	6	6744	6749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233552
83	NC_015660	TCG	2	6	6814	6819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233552
84	NC_015660	ACC	2	6	6838	6843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233552
85	NC_015660	CGG	2	6	6856	6861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233552
86	NC_015660	ACG	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233552
87	NC_015660	TTC	2	6	7118	7123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233552
88	NC_015660	CGA	2	6	7144	7149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233552
89	NC_015660	CCG	2	6	7155	7160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233552
90	NC_015660	AGC	3	9	7354	7362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233552
91	NC_015660	GAT	2	6	7376	7381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233552
92	NC_015660	CGA	2	6	7484	7489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233552
93	NC_015660	GCA	2	6	7658	7663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233552
94	NC_015660	CCG	3	9	7691	7699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233552
95	NC_015660	ATC	2	6	7768	7773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233552
96	NC_015660	GCA	2	6	7838	7843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233552
97	NC_015660	GAA	2	6	7986	7991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233552
98	NC_015660	ATT	2	6	8004	8009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233552
99	NC_015660	GGA	2	6	8073	8078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233552
100	NC_015660	GAA	2	6	8082	8087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233552
101	NC_015660	TGA	2	6	8429	8434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233552
102	NC_015660	AAC	2	6	8511	8516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233552
103	NC_015660	ATT	2	6	8589	8594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233552
104	NC_015660	GTT	2	6	8745	8750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233552
105	NC_015660	CGG	2	6	8807	8812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233552
106	NC_015660	TTG	2	6	8857	8862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233552
107	NC_015660	TTA	2	6	8899	8904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233552
108	NC_015660	AGA	2	6	9041	9046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233552
109	NC_015660	GAA	2	6	9066	9071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233552
110	NC_015660	GAT	2	6	9195	9200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233553
111	NC_015660	AAG	2	6	9224	9229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233553
112	NC_015660	TTA	2	6	9307	9312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233553
113	NC_015660	AAG	2	6	9338	9343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233553
114	NC_015660	ATT	3	9	9532	9540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233553
115	NC_015660	ATT	2	6	9642	9647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233553
116	NC_015660	TAC	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233553
117	NC_015660	GAA	2	6	9793	9798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233553
118	NC_015660	AAG	2	6	9854	9859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233553
119	NC_015660	CAT	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233553
120	NC_015660	TAG	2	6	9956	9961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233553
121	NC_015660	GTT	2	6	10264	10269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233553
122	NC_015660	TAT	2	6	16110	16115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233554
123	NC_015660	GCT	2	6	16138	16143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233554
124	NC_015660	CAG	2	6	16180	16185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233554
125	NC_015660	TAA	2	6	16238	16243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233554
126	NC_015660	CCA	2	6	16250	16255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233554
127	NC_015660	AAT	2	6	16300	16305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233554
128	NC_015660	GCA	2	6	16321	16326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233554
129	NC_015660	TAA	2	6	16491	16496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233554
130	NC_015660	ATG	2	6	16618	16623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233554
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132	NC_015660	GTT	2	6	16681	16686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233554
133	NC_015660	ATA	2	6	16952	16957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233554
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251	NC_015660	ATT	2	6	25922	25927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233562
252	NC_015660	TGG	2	6	25931	25936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233562
253	NC_015660	GGA	2	6	26094	26099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233562
254	NC_015660	GCT	2	6	26161	26166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233562
255	NC_015660	CAA	2	6	26236	26241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233562
256	NC_015660	CGA	2	6	26263	26268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233562
257	NC_015660	TTC	2	6	26309	26314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233562
258	NC_015660	TAT	2	6	26323	26328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233562
259	NC_015660	ACG	2	6	26367	26372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233562
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261	NC_015660	GGC	2	6	26564	26569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233563
262	NC_015660	AGG	2	6	26785	26790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233563
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374	NC_015660	GAA	3	9	41048	41056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233574
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