MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 chromosome

Total Repeats: 71961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015660	TGG	2	6	450	455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233547
2	NC_015660	GAAAA	2	10	497	506	80 %	0 %	20 %	0 %	336233547
3	NC_015660	CAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233547
4	NC_015660	GA	3	6	601	606	50 %	0 %	50 %	0 %	336233547
5	NC_015660	ATT	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233547
6	NC_015660	CCT	2	6	692	697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233547
7	NC_015660	AATC	2	8	698	705	50 %	25 %	0 %	25 %	336233547
8	NC_015660	GAT	2	6	710	715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233547
9	NC_015660	AGC	2	6	741	746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233547
10	NC_015660	TATT	2	8	897	904	25 %	75 %	0 %	0 %	336233547
11	NC_015660	CGG	2	6	907	912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233547
12	NC_015660	ATGC	2	8	938	945	25 %	25 %	25 %	25 %	336233547
13	NC_015660	TCCG	2	8	973	980	0 %	25 %	25 %	50 %	336233547
14	NC_015660	AGT	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233547
15	NC_015660	TATC	2	8	992	999	25 %	50 %	0 %	25 %	336233547
16	NC_015660	TTA	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233547
17	NC_015660	CAA	2	6	1063	1068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233547
18	NC_015660	CTA	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233547
19	NC_015660	TGA	2	6	1096	1101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233547
20	NC_015660	AAG	2	6	1134	1139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233547
21	NC_015660	CA	3	6	1148	1153	50 %	0 %	0 %	50 %	336233547
22	NC_015660	GAA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233547
23	NC_015660	CAAA	2	8	1177	1184	75 %	0 %	0 %	25 %	336233547
24	NC_015660	GCC	2	6	1204	1209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233547
25	NC_015660	CTC	2	6	1278	1283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233547
26	NC_015660	A	7	7	1315	1321	100 %	0 %	0 %	0 %	336233547
27	NC_015660	CGT	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233547
28	NC_015660	TCA	2	6	1433	1438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233547
29	NC_015660	ATT	2	6	1490	1495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233547
30	NC_015660	AAGAA	2	10	1586	1595	80 %	0 %	20 %	0 %	336233547
31	NC_015660	TCAT	2	8	1707	1714	25 %	50 %	0 %	25 %	336233547
32	NC_015660	A	6	6	1722	1727	100 %	0 %	0 %	0 %	336233547
33	NC_015660	ATCG	2	8	1998	2005	25 %	25 %	25 %	25 %	336233548
34	NC_015660	GCA	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233548
35	NC_015660	TGC	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233548
36	NC_015660	T	7	7	2226	2232	0 %	100 %	0 %	0 %	336233548
37	NC_015660	A	7	7	2243	2249	100 %	0 %	0 %	0 %	336233548
38	NC_015660	GAA	2	6	2346	2351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233548
39	NC_015660	CCGTTT	2	12	2440	2451	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336233548
40	NC_015660	ACAG	2	8	2520	2527	50 %	0 %	25 %	25 %	336233548
41	NC_015660	GTC	2	6	2586	2591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233548
42	NC_015660	TTA	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233548
43	NC_015660	AAAAC	2	10	2685	2694	80 %	0 %	0 %	20 %	336233548
44	NC_015660	TAT	2	6	2698	2703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233548
45	NC_015660	TCT	2	6	2704	2709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233548
46	NC_015660	GCTT	2	8	2713	2720	0 %	50 %	25 %	25 %	336233548
47	NC_015660	CTT	2	6	2818	2823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233548
48	NC_015660	GA	3	6	2831	2836	50 %	0 %	50 %	0 %	336233548
49	NC_015660	GAA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233548
50	NC_015660	TGT	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233548
51	NC_015660	ACG	2	6	2862	2867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233548
52	NC_015660	CAT	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233548
53	NC_015660	TCC	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233548
54	NC_015660	GGA	2	6	2924	2929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233548
55	NC_015660	TTTC	2	8	2968	2975	0 %	75 %	0 %	25 %	336233548
56	NC_015660	AT	3	6	2984	2989	50 %	50 %	0 %	0 %	336233548
57	NC_015660	ATGG	2	8	3222	3229	25 %	25 %	50 %	0 %	336233549
58	NC_015660	A	6	6	3232	3237	100 %	0 %	0 %	0 %	336233549
59	NC_015660	GCG	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233549
60	NC_015660	CAAA	2	8	3328	3335	75 %	0 %	0 %	25 %	336233549
61	NC_015660	CGC	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233549
62	NC_015660	A	6	6	3384	3389	100 %	0 %	0 %	0 %	336233549
63	NC_015660	AGTCGA	2	12	3399	3410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336233549
64	NC_015660	GTT	2	6	3458	3463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233550
65	NC_015660	A	6	6	3482	3487	100 %	0 %	0 %	0 %	336233550
66	NC_015660	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233550
67	NC_015660	GA	3	6	3547	3552	50 %	0 %	50 %	0 %	336233550
68	NC_015660	ATG	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233550
69	NC_015660	GAAG	2	8	3669	3676	50 %	0 %	50 %	0 %	336233550
70	NC_015660	CAA	3	9	3679	3687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233550
71	NC_015660	ATT	2	6	3714	3719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233550
72	NC_015660	A	6	6	3723	3728	100 %	0 %	0 %	0 %	336233550
73	NC_015660	A	6	6	3731	3736	100 %	0 %	0 %	0 %	336233550
74	NC_015660	AGC	3	9	3757	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233550
75	NC_015660	TA	3	6	3894	3899	50 %	50 %	0 %	0 %	336233550
76	NC_015660	GCA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233550
77	NC_015660	ATT	2	6	3943	3948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233550
78	NC_015660	TGC	2	6	3955	3960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233550
79	NC_015660	CG	3	6	3964	3969	0 %	0 %	50 %	50 %	336233550
80	NC_015660	AGC	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233550
81	NC_015660	TTTTGC	2	12	4054	4065	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336233550
82	NC_015660	AAT	2	6	4175	4180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233550
83	NC_015660	AG	3	6	4214	4219	50 %	0 %	50 %	0 %	336233550
84	NC_015660	ACA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233550
85	NC_015660	AAC	2	6	4325	4330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233550
86	NC_015660	AATT	2	8	4360	4367	50 %	50 %	0 %	0 %	336233550
87	NC_015660	T	6	6	4366	4371	0 %	100 %	0 %	0 %	336233550
88	NC_015660	TGA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233550
89	NC_015660	CAT	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233550
90	NC_015660	AGC	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233550
91	NC_015660	ATG	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233551
92	NC_015660	CAT	2	6	4745	4750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233551
93	NC_015660	TGA	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233551
94	NC_015660	GCA	2	6	4836	4841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233551
95	NC_015660	AGG	2	6	4936	4941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233551
96	NC_015660	TGGCGG	2	12	4948	4959	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	336233551
97	NC_015660	CGT	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233551
98	NC_015660	GAA	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233551
99	NC_015660	GCG	2	6	5076	5081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233551
100	NC_015660	T	6	6	5221	5226	0 %	100 %	0 %	0 %	336233551
101	NC_015660	A	6	6	5275	5280	100 %	0 %	0 %	0 %	336233551
102	NC_015660	GAG	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233551
103	NC_015660	ATT	2	6	5366	5371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
104	NC_015660	AGC	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233551
105	NC_015660	AAC	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233551
106	NC_015660	AC	3	6	5462	5467	50 %	0 %	0 %	50 %	336233551
107	NC_015660	ATT	2	6	5513	5518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
108	NC_015660	ACGC	2	8	5526	5533	25 %	0 %	25 %	50 %	336233551
109	NC_015660	ACA	2	6	5536	5541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233551
110	NC_015660	ACAA	2	8	5641	5648	75 %	0 %	0 %	25 %	336233551
111	NC_015660	ACGG	2	8	5674	5681	25 %	0 %	50 %	25 %	336233551
112	NC_015660	TTG	2	6	5751	5756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233551
113	NC_015660	GAT	2	6	5764	5769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233551
114	NC_015660	GGC	2	6	5770	5775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233551
115	NC_015660	GC	3	6	5780	5785	0 %	0 %	50 %	50 %	336233551
116	NC_015660	GGC	2	6	5788	5793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233551
117	NC_015660	A	6	6	5795	5800	100 %	0 %	0 %	0 %	336233551
118	NC_015660	GC	3	6	5826	5831	0 %	0 %	50 %	50 %	336233551
119	NC_015660	TCC	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233551
120	NC_015660	ATT	2	6	5987	5992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
121	NC_015660	CAA	2	6	6028	6033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233551
122	NC_015660	ATT	2	6	6047	6052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
123	NC_015660	GC	3	6	6098	6103	0 %	0 %	50 %	50 %	336233551
124	NC_015660	ATT	2	6	6116	6121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
125	NC_015660	ATT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233551
126	NC_015660	CTTT	2	8	6171	6178	0 %	75 %	0 %	25 %	336233551
127	NC_015660	CCG	2	6	6230	6235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233551
128	NC_015660	ACAA	2	8	6255	6262	75 %	0 %	0 %	25 %	336233551
129	NC_015660	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	336233551
130	NC_015660	CGA	2	6	6330	6335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233551
131	NC_015660	AAC	2	6	6385	6390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233551
132	NC_015660	GCT	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233551
133	NC_015660	AAG	2	6	6490	6495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233551
134	NC_015660	GAA	2	6	6506	6511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233551
135	NC_015660	CGC	2	6	6744	6749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233552
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153	NC_015660	TGCAA	2	10	7577	7586	40 %	20 %	20 %	20 %	336233552
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262	NC_015660	CGG	2	6	18538	18543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233555
263	NC_015660	AGA	2	6	18583	18588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233555
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266	NC_015660	A	6	6	18816	18821	100 %	0 %	0 %	0 %	336233556
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