MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 chromosome

Total Repeats: 71961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_015660	AAAC	2	8	183839	183846	75 %	0 %	0 %	25 %	336233710
3003	NC_015660	TCA	2	6	183913	183918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233711
3004	NC_015660	A	6	6	183927	183932	100 %	0 %	0 %	0 %	336233711
3005	NC_015660	ATT	2	6	183992	183997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233711
3006	NC_015660	TCG	2	6	184031	184036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233711
3007	NC_015660	A	6	6	184062	184067	100 %	0 %	0 %	0 %	336233711
3008	NC_015660	GAT	2	6	184174	184179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233711
3009	NC_015660	A	7	7	184261	184267	100 %	0 %	0 %	0 %	336233711
3010	NC_015660	ATT	2	6	184312	184317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233711
3011	NC_015660	TTA	2	6	184345	184350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233711
3012	NC_015660	T	6	6	184387	184392	0 %	100 %	0 %	0 %	336233711
3013	NC_015660	CAT	2	6	184426	184431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233711
3014	NC_015660	A	6	6	184504	184509	100 %	0 %	0 %	0 %	336233711
3015	NC_015660	ATG	2	6	184553	184558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233711
3016	NC_015660	ATG	2	6	184651	184656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233711
3017	NC_015660	TGG	2	6	184735	184740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233711
3018	NC_015660	TTG	2	6	184744	184749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233711
3019	NC_015660	TCT	2	6	184750	184755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233711
3020	NC_015660	GCCT	2	8	184831	184838	0 %	25 %	25 %	50 %	336233712
3021	NC_015660	AT	3	6	184913	184918	50 %	50 %	0 %	0 %	336233712
3022	NC_015660	CT	3	6	184945	184950	0 %	50 %	0 %	50 %	336233712
3023	NC_015660	A	6	6	184954	184959	100 %	0 %	0 %	0 %	336233712
3024	NC_015660	CTTTC	2	10	185054	185063	0 %	60 %	0 %	40 %	336233712
3025	NC_015660	AAG	3	9	185098	185106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
3026	NC_015660	TTTA	2	8	185177	185184	25 %	75 %	0 %	0 %	336233712
3027	NC_015660	ATC	2	6	185194	185199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233712
3028	NC_015660	TCA	2	6	185222	185227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233712
3029	NC_015660	TGG	2	6	185293	185298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233712
3030	NC_015660	TTCGC	2	10	185325	185334	0 %	40 %	20 %	40 %	336233712
3031	NC_015660	GAA	2	6	185349	185354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
3032	NC_015660	TGGA	2	8	185403	185410	25 %	25 %	50 %	0 %	336233712
3033	NC_015660	CGA	2	6	185609	185614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3034	NC_015660	GAT	2	6	185633	185638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233712
3035	NC_015660	CCGCT	2	10	185694	185703	0 %	20 %	20 %	60 %	336233712
3036	NC_015660	AAG	2	6	185764	185769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
3037	NC_015660	AGC	2	6	185797	185802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3038	NC_015660	GCT	2	6	185819	185824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3039	NC_015660	ATT	2	6	185840	185845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233712
3040	NC_015660	CGG	2	6	185891	185896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233712
3041	NC_015660	AC	3	6	185910	185915	50 %	0 %	0 %	50 %	336233712
3042	NC_015660	TGC	2	6	185921	185926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3043	NC_015660	CGA	2	6	185936	185941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3044	NC_015660	TCA	2	6	186032	186037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233712
3045	NC_015660	GAA	2	6	186078	186083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
3046	NC_015660	TCT	3	9	186107	186115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233712
3047	NC_015660	GAA	3	9	186117	186125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
3048	NC_015660	GAA	2	6	186174	186179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
3049	NC_015660	T	6	6	186182	186187	0 %	100 %	0 %	0 %	336233712
3050	NC_015660	AGCA	2	8	186277	186284	50 %	0 %	25 %	25 %	336233712
3051	NC_015660	GAA	2	6	186435	186440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
3052	NC_015660	ATC	2	6	186547	186552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233712
3053	NC_015660	CGC	2	6	186610	186615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233712
3054	NC_015660	TTA	2	6	186702	186707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233712
3055	NC_015660	TTCC	2	8	186795	186802	0 %	50 %	0 %	50 %	336233712
3056	NC_015660	TGG	2	6	186823	186828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233712
3057	NC_015660	GAA	2	6	186833	186838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
3058	NC_015660	CAT	2	6	186939	186944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233712
3059	NC_015660	ATTGC	2	10	186949	186958	20 %	40 %	20 %	20 %	336233712
3060	NC_015660	TGG	2	6	186973	186978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233712
3061	NC_015660	G	6	6	186977	186982	0 %	0 %	100 %	0 %	336233712
3062	NC_015660	CTTG	2	8	187023	187030	0 %	50 %	25 %	25 %	336233712
3063	NC_015660	AAC	2	6	187061	187066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233712
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3065	NC_015660	AGC	2	6	187162	187167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3066	NC_015660	GCC	2	6	187178	187183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233712
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3069	NC_015660	TA	3	6	187353	187358	50 %	50 %	0 %	0 %	336233712
3070	NC_015660	ATCAA	2	10	187372	187381	60 %	20 %	0 %	20 %	336233712
3071	NC_015660	GTG	2	6	187458	187463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233712
3072	NC_015660	GGTT	2	8	187492	187499	0 %	50 %	50 %	0 %	336233712
3073	NC_015660	AGCAA	2	10	187519	187528	60 %	0 %	20 %	20 %	336233712
3074	NC_015660	GA	3	6	187569	187574	50 %	0 %	50 %	0 %	336233712
3075	NC_015660	TCCG	2	8	187592	187599	0 %	25 %	25 %	50 %	336233712
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3080	NC_015660	GCC	2	6	187812	187817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233712
3081	NC_015660	GGA	2	6	187913	187918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233712
3082	NC_015660	GCC	2	6	187934	187939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233712
3083	NC_015660	ACC	2	6	188008	188013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233712
3084	NC_015660	CAA	2	6	188088	188093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233712
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3088	NC_015660	TGC	3	9	188332	188340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3089	NC_015660	CAT	2	6	188349	188354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233712
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3093	NC_015660	A	7	7	188550	188556	100 %	0 %	0 %	0 %	336233712
3094	NC_015660	AGA	2	6	188573	188578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
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3098	NC_015660	TGC	2	6	188716	188721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233712
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3102	NC_015660	TAG	2	6	188821	188826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233712
3103	NC_015660	CTT	2	6	188889	188894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233712
3104	NC_015660	TGG	2	6	188956	188961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233712
3105	NC_015660	ATT	2	6	188999	189004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233712
3106	NC_015660	GCG	2	6	189128	189133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233712
3107	NC_015660	TAC	2	6	189200	189205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233712
3108	NC_015660	GCT	2	6	189236	189241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3109	NC_015660	AGT	2	6	189248	189253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233712
3110	NC_015660	GAA	2	6	189354	189359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233712
3111	NC_015660	A	6	6	189391	189396	100 %	0 %	0 %	0 %	336233712
3112	NC_015660	AAAC	2	8	189452	189459	75 %	0 %	0 %	25 %	336233712
3113	NC_015660	AGT	2	6	189512	189517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233712
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3116	NC_015660	ATG	2	6	189633	189638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233712
3117	NC_015660	ATGT	2	8	189654	189661	25 %	50 %	25 %	0 %	336233712
3118	NC_015660	TTA	2	6	189718	189723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233712
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3120	NC_015660	GAT	2	6	189777	189782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233712
3121	NC_015660	ATC	2	6	189825	189830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233712
3122	NC_015660	TGA	2	6	189865	189870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233712
3123	NC_015660	GTC	2	6	189885	189890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3124	NC_015660	GAT	2	6	189933	189938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233712
3125	NC_015660	GTT	2	6	189947	189952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233712
3126	NC_015660	CAT	2	6	190032	190037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233712
3127	NC_015660	TTG	2	6	190072	190077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233712
3128	NC_015660	ACG	2	6	190287	190292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233712
3129	NC_015660	GTG	2	6	190339	190344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233712
3130	NC_015660	AAC	2	6	190377	190382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233713
3131	NC_015660	GA	3	6	190383	190388	50 %	0 %	50 %	0 %	336233713
3132	NC_015660	CGA	2	6	190493	190498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233713
3133	NC_015660	T	7	7	190530	190536	0 %	100 %	0 %	0 %	336233713
3134	NC_015660	CGTG	2	8	190843	190850	0 %	25 %	50 %	25 %	336233713
3135	NC_015660	CCA	2	6	190877	190882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233713
3136	NC_015660	TGT	2	6	190897	190902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233713
3137	NC_015660	CAACG	2	10	190942	190951	40 %	0 %	20 %	40 %	336233713
3138	NC_015660	GAT	2	6	191079	191084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233713
3139	NC_015660	CAA	2	6	191103	191108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233713
3140	NC_015660	CAC	2	6	191326	191331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233714
3141	NC_015660	CCG	2	6	191421	191426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233714
3142	NC_015660	GA	3	6	191437	191442	50 %	0 %	50 %	0 %	336233714
3143	NC_015660	GC	3	6	191466	191471	0 %	0 %	50 %	50 %	336233714
3144	NC_015660	AAG	2	6	191480	191485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233714
3145	NC_015660	TTG	2	6	191509	191514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233714
3146	NC_015660	AGATC	2	10	191604	191613	40 %	20 %	20 %	20 %	336233714
3147	NC_015660	TGT	2	6	191699	191704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233714
3148	NC_015660	TTG	2	6	191737	191742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233714
3149	NC_015660	GCT	2	6	191796	191801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233714
3150	NC_015660	TGA	2	6	191836	191841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233714
3151	NC_015660	CTGC	2	8	191889	191896	0 %	25 %	25 %	50 %	336233714
3152	NC_015660	GAT	2	6	191906	191911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233714
3153	NC_015660	AAG	2	6	191944	191949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233714
3154	NC_015660	TGA	2	6	192002	192007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233714
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3156	NC_015660	TGGAG	2	10	192077	192086	20 %	20 %	60 %	0 %	336233714
3157	NC_015660	AGC	2	6	192153	192158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233714
3158	NC_015660	TGC	2	6	192178	192183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233714
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3160	NC_015660	GC	3	6	192306	192311	0 %	0 %	50 %	50 %	336233714
3161	NC_015660	CCAG	2	8	192389	192396	25 %	0 %	25 %	50 %	336233714
3162	NC_015660	TTG	2	6	192411	192416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233714
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3174	NC_015660	ATT	2	6	192852	192857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233714
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3176	NC_015660	A	6	6	192946	192951	100 %	0 %	0 %	0 %	336233714
3177	NC_015660	ACCT	2	8	193019	193026	25 %	25 %	0 %	50 %	336233715
3178	NC_015660	ATG	2	6	193038	193043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233715
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3203	NC_015660	A	7	7	194914	194920	100 %	0 %	0 %	0 %	336233717
3204	NC_015660	A	7	7	195001	195007	100 %	0 %	0 %	0 %	336233717
3205	NC_015660	CTG	2	6	195048	195053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233717
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3219	NC_015660	TGC	2	6	195574	195579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233717
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3222	NC_015660	GGA	2	6	195736	195741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233717
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3225	NC_015660	AT	3	6	195875	195880	50 %	50 %	0 %	0 %	336233717
3226	NC_015660	AAAGT	2	10	195887	195896	60 %	20 %	20 %	0 %	336233717
3227	NC_015660	GA	3	6	195901	195906	50 %	0 %	50 %	0 %	336233717
3228	NC_015660	GCA	2	6	195987	195992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233717
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3230	NC_015660	CAG	2	6	196061	196066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233717
3231	NC_015660	CTT	2	6	196106	196111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233717
3232	NC_015660	AAG	2	6	196125	196130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233717
3233	NC_015660	T	6	6	196287	196292	0 %	100 %	0 %	0 %	336233717
3234	NC_015660	ATGA	2	8	196360	196367	50 %	25 %	25 %	0 %	336233718
3235	NC_015660	AAG	2	6	196384	196389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233718
3236	NC_015660	ATG	2	6	196412	196417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233718
3237	NC_015660	GCG	2	6	196476	196481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233719
3238	NC_015660	ATC	2	6	196489	196494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233719
3239	NC_015660	GGAA	2	8	196513	196520	50 %	0 %	50 %	0 %	336233719
3240	NC_015660	AGC	2	6	196529	196534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233719
3241	NC_015660	GCG	2	6	196535	196540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233719
3242	NC_015660	AAAG	2	8	196549	196556	75 %	0 %	25 %	0 %	336233719
3243	NC_015660	GGC	2	6	196691	196696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233719
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3486	NC_015660	GAT	2	6	211253	211258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233732
3487	NC_015660	TTA	2	6	211294	211299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233732
3488	NC_015660	TCA	2	6	211656	211661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233732
3489	NC_015660	TGG	2	6	211662	211667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233732
3490	NC_015660	GGT	2	6	211711	211716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233732
3491	NC_015660	TCG	2	6	211743	211748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233732
3492	NC_015660	ATCA	2	8	211775	211782	50 %	25 %	0 %	25 %	336233732
3493	NC_015660	CAA	2	6	211824	211829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233732
3494	NC_015660	TCGGT	2	10	211920	211929	0 %	40 %	40 %	20 %	336233732
3495	NC_015660	GGA	2	6	212032	212037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233732
3496	NC_015660	TAT	2	6	212060	212065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233732
3497	NC_015660	GAA	2	6	212159	212164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233732
3498	NC_015660	GTTT	2	8	212173	212180	0 %	75 %	25 %	0 %	336233732
3499	NC_015660	GCC	2	6	212194	212199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233732
3500	NC_015660	TACA	2	8	212238	212245	50 %	25 %	0 %	25 %	336233732

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