MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 plasmid pUMN179

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015461	AAC	2	6	68	73	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290581
2	NC_015461	TGA	2	6	330	335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290581
3	NC_015461	TTG	2	6	602	607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290581
4	NC_015461	TGA	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290581
5	NC_015461	TCT	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290582
6	NC_015461	AAG	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290582
7	NC_015461	ATG	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290582
8	NC_015461	TAA	2	6	1371	1376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290582
9	NC_015461	ATT	2	6	1381	1386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290582
10	NC_015461	TTA	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290582
11	NC_015461	TCA	2	6	1541	1546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290582
12	NC_015461	AGA	3	9	1551	1559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290582
13	NC_015461	GCT	2	6	2230	2235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290583
14	NC_015461	CCT	2	6	2242	2247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290583
15	NC_015461	GCT	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290583
16	NC_015461	CAT	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290583
17	NC_015461	AAG	2	6	2329	2334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290583
18	NC_015461	CCA	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290583
19	NC_015461	TCA	2	6	2525	2530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290583
20	NC_015461	GTT	3	9	2668	2676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290583
21	NC_015461	AAT	2	6	2736	2741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290583
22	NC_015461	ACT	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290583
23	NC_015461	GTA	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290583
24	NC_015461	CTT	2	6	3212	3217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290583
25	NC_015461	TAA	2	6	3236	3241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290583
26	NC_015461	TTA	2	6	3247	3252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290583
27	NC_015461	GCT	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290583
28	NC_015461	ACA	2	6	3328	3333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290583
29	NC_015461	CCA	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290583
30	NC_015461	TTG	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290583
31	NC_015461	TCA	2	6	3454	3459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290583
32	NC_015461	TGT	2	6	3467	3472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290583
33	NC_015461	AAC	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290583
34	NC_015461	AAT	2	6	3556	3561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290583
35	NC_015461	TTA	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290583
36	NC_015461	AAG	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290583
37	NC_015461	TTG	2	6	3679	3684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290583
38	NC_015461	TAA	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290584
39	NC_015461	TGT	2	6	3836	3841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290584
40	NC_015461	AAT	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290584
41	NC_015461	ATT	2	6	3931	3936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290584
42	NC_015461	TAA	2	6	3988	3993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290584
43	NC_015461	AAC	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290584
44	NC_015461	ATC	2	6	4326	4331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290585
45	NC_015461	TCT	2	6	4780	4785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290586
46	NC_015461	ACT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290586
47	NC_015461	CCG	2	6	4873	4878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332290586
48	NC_015461	GCT	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290586
49	NC_015461	AAT	2	6	5071	5076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290586
50	NC_015461	GAT	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290586
51	NC_015461	GTT	2	6	5092	5097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290586
52	NC_015461	GCC	2	6	5118	5123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332290586
53	NC_015461	CTT	2	6	5192	5197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290586
54	NC_015461	TTG	2	6	5217	5222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290586
55	NC_015461	TGC	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290586

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.