MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 chromosome

Total Repeats: 50984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015460	TAA	2	6	53417	53422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288128
1002	NC_015460	ATT	2	6	53449	53454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288129
1003	NC_015460	ATCA	2	8	53469	53476	50 %	25 %	0 %	25 %	332288129
1004	NC_015460	AGC	2	6	53487	53492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288129
1005	NC_015460	TAG	2	6	53510	53515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288129
1006	NC_015460	AATGC	2	10	53519	53528	40 %	20 %	20 %	20 %	332288129
1007	NC_015460	ACCA	2	8	53548	53555	50 %	0 %	0 %	50 %	332288129
1008	NC_015460	T	6	6	53569	53574	0 %	100 %	0 %	0 %	332288129
1009	NC_015460	ATA	2	6	53599	53604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288129
1010	NC_015460	TGC	2	6	53646	53651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288129
1011	NC_015460	TCA	2	6	53803	53808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288129
1012	NC_015460	AAAAT	2	10	53811	53820	80 %	20 %	0 %	0 %	332288129
1013	NC_015460	TGC	2	6	53857	53862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288129
1014	NC_015460	TGT	2	6	53863	53868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288129
1015	NC_015460	AAC	2	6	53944	53949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288129
1016	NC_015460	AAC	2	6	54081	54086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288130
1017	NC_015460	ATT	2	6	54104	54109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288130
1018	NC_015460	GAA	2	6	54110	54115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288130
1019	NC_015460	T	6	6	54160	54165	0 %	100 %	0 %	0 %	332288130
1020	NC_015460	T	6	6	54201	54206	0 %	100 %	0 %	0 %	332288130
1021	NC_015460	CGG	2	6	54285	54290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288130
1022	NC_015460	ATCA	2	8	54297	54304	50 %	25 %	0 %	25 %	332288130
1023	NC_015460	ATT	2	6	54331	54336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288130
1024	NC_015460	TCAC	2	8	54384	54391	25 %	25 %	0 %	50 %	332288130
1025	NC_015460	TGA	2	6	54424	54429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288130
1026	NC_015460	ATT	2	6	54437	54442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288130
1027	NC_015460	AATT	2	8	54462	54469	50 %	50 %	0 %	0 %	332288130
1028	NC_015460	TATCGC	2	12	54541	54552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332288130
1029	NC_015460	AAT	2	6	54686	54691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288130
1030	NC_015460	GAA	2	6	54767	54772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288130
1031	NC_015460	ATG	2	6	54810	54815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288130
1032	NC_015460	ATT	2	6	54836	54841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288130
1033	NC_015460	GT	3	6	54873	54878	0 %	50 %	50 %	0 %	332288130
1034	NC_015460	ACCGT	2	10	54929	54938	20 %	20 %	20 %	40 %	332288130
1035	NC_015460	GGT	2	6	54962	54967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288130
1036	NC_015460	ACA	2	6	54991	54996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288130
1037	NC_015460	GAATA	2	10	55159	55168	60 %	20 %	20 %	0 %	332288131
1038	NC_015460	GAC	2	6	55183	55188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288131
1039	NC_015460	TTGAT	2	10	55314	55323	20 %	60 %	20 %	0 %	332288131
1040	NC_015460	CAT	2	6	55411	55416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288131
1041	NC_015460	CAA	2	6	55534	55539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288131
1042	NC_015460	AAT	2	6	55560	55565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288131
1043	NC_015460	GGT	2	6	55610	55615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288131
1044	NC_015460	AATGCC	2	12	55653	55664	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332288131
1045	NC_015460	TCA	3	9	55692	55700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288131
1046	NC_015460	ATCT	2	8	55718	55725	25 %	50 %	0 %	25 %	332288131
1047	NC_015460	CAA	2	6	55813	55818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288131
1048	NC_015460	GATAA	2	10	55867	55876	60 %	20 %	20 %	0 %	332288131
1049	NC_015460	CAA	2	6	55897	55902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288131
1050	NC_015460	CTT	2	6	55927	55932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288131
1051	NC_015460	CAT	2	6	56056	56061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288131
1052	NC_015460	CGG	2	6	56186	56191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288131
1053	NC_015460	T	7	7	56221	56227	0 %	100 %	0 %	0 %	332288131
1054	NC_015460	CAT	2	6	56245	56250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288131
1055	NC_015460	TTAA	2	8	56328	56335	50 %	50 %	0 %	0 %	332288131
1056	NC_015460	TTTC	2	8	56360	56367	0 %	75 %	0 %	25 %	332288132
1057	NC_015460	TAA	2	6	56369	56374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288132
1058	NC_015460	CAC	2	6	56401	56406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288132
1059	NC_015460	AAT	2	6	56426	56431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288132
1060	NC_015460	GCAA	2	8	56450	56457	50 %	0 %	25 %	25 %	332288132
1061	NC_015460	AAC	2	6	56474	56479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288132
1062	NC_015460	AAT	2	6	56545	56550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288132
1063	NC_015460	AAT	2	6	56555	56560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288132
1064	NC_015460	GGA	2	6	56574	56579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332288132
1065	NC_015460	AACC	2	8	56601	56608	50 %	0 %	0 %	50 %	332288132
1066	NC_015460	TA	3	6	56620	56625	50 %	50 %	0 %	0 %	332288132
1067	NC_015460	CTG	2	6	56679	56684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288132
1068	NC_015460	CAAGC	2	10	56753	56762	40 %	0 %	20 %	40 %	332288132
1069	NC_015460	TAA	3	9	56777	56785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288132
1070	NC_015460	GCA	2	6	56832	56837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288132
1071	NC_015460	GCA	2	6	56841	56846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288132
1072	NC_015460	ATC	2	6	56886	56891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288132
1073	NC_015460	AATG	2	8	56960	56967	50 %	25 %	25 %	0 %	332288132
1074	NC_015460	ACA	2	6	56973	56978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288132
1075	NC_015460	ACC	2	6	57077	57082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288132
1076	NC_015460	ACGGC	2	10	57097	57106	20 %	0 %	40 %	40 %	332288132
1077	NC_015460	CAAAAT	2	12	57176	57187	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332288132
1078	NC_015460	TTA	2	6	57210	57215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288132
1079	NC_015460	ACC	2	6	57250	57255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288132
1080	NC_015460	TG	3	6	57261	57266	0 %	50 %	50 %	0 %	332288132
1081	NC_015460	TAA	2	6	57272	57277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288132
1082	NC_015460	AGG	2	6	57370	57375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332288132
1083	NC_015460	A	7	7	57416	57422	100 %	0 %	0 %	0 %	332288132
1084	NC_015460	TCA	2	6	57423	57428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288132
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1086	NC_015460	TAT	2	6	57512	57517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288132
1087	NC_015460	TTC	2	6	57747	57752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288133
1088	NC_015460	A	6	6	57769	57774	100 %	0 %	0 %	0 %	332288133
1089	NC_015460	TGT	2	6	57801	57806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288133
1090	NC_015460	GCA	2	6	57925	57930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288133
1091	NC_015460	ATC	2	6	57942	57947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288133
1092	NC_015460	T	6	6	57962	57967	0 %	100 %	0 %	0 %	332288133
1093	NC_015460	CAC	2	6	58037	58042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288133
1094	NC_015460	GAT	2	6	58049	58054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288133
1095	NC_015460	CCA	2	6	58058	58063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288133
1096	NC_015460	CTG	2	6	58079	58084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288133
1097	NC_015460	TCC	2	6	58089	58094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332288133
1098	NC_015460	AAT	2	6	58115	58120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288133
1099	NC_015460	CCG	2	6	58175	58180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288133
1100	NC_015460	ATA	2	6	58203	58208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288133
1101	NC_015460	CCG	2	6	58228	58233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288133
1102	NC_015460	ATTATG	2	12	58242	58253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332288133
1103	NC_015460	TGC	2	6	58288	58293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288133
1104	NC_015460	A	6	6	58294	58299	100 %	0 %	0 %	0 %	332288133
1105	NC_015460	ACC	2	6	58306	58311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288133
1106	NC_015460	CAA	2	6	58328	58333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288133
1107	NC_015460	CTG	2	6	58354	58359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288133
1108	NC_015460	TAA	2	6	58401	58406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288133
1109	NC_015460	TGT	2	6	58445	58450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288134
1110	NC_015460	CCG	2	6	58587	58592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288134
1111	NC_015460	TCA	2	6	58644	58649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288134
1112	NC_015460	CAAAC	2	10	58713	58722	60 %	0 %	0 %	40 %	332288134
1113	NC_015460	TGT	2	6	58782	58787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288134
1114	NC_015460	AAT	2	6	58801	58806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288134
1115	NC_015460	GT	5	10	58831	58840	0 %	50 %	50 %	0 %	332288134
1116	NC_015460	AT	3	6	58850	58855	50 %	50 %	0 %	0 %	332288134
1117	NC_015460	ATT	2	6	58987	58992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288134
1118	NC_015460	AAT	2	6	59013	59018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288134
1119	NC_015460	CCA	2	6	59043	59048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288134
1120	NC_015460	TTGC	2	8	59057	59064	0 %	50 %	25 %	25 %	332288134
1121	NC_015460	GCA	2	6	59085	59090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288134
1122	NC_015460	TTC	2	6	59128	59133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288134
1123	NC_015460	GCT	2	6	59256	59261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288134
1124	NC_015460	A	6	6	59279	59284	100 %	0 %	0 %	0 %	332288134
1125	NC_015460	TTG	2	6	59290	59295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288134
1126	NC_015460	TCA	2	6	59456	59461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288134
1127	NC_015460	TGA	2	6	59495	59500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288134
1128	NC_015460	TGA	2	6	59569	59574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288134
1129	NC_015460	GCT	2	6	59636	59641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288134
1130	NC_015460	CGGT	2	8	59646	59653	0 %	25 %	50 %	25 %	332288134
1131	NC_015460	TTGC	2	8	59680	59687	0 %	50 %	25 %	25 %	332288134
1132	NC_015460	CAAGC	2	10	59707	59716	40 %	0 %	20 %	40 %	332288134
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1159	NC_015460	ATA	2	6	60636	60641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288135
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1242	NC_015460	CAAA	2	8	64928	64935	75 %	0 %	0 %	25 %	332288137
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