MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gardnerella vaginalis ATCC 14019 chromosome

Total Repeats: 787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014644	GCTTG	2	10	497	506	0 %	40 %	40 %	20 %	311113889
2	NC_014644	GCCAA	2	10	7233	7242	40 %	0 %	20 %	40 %	311113896
3	NC_014644	ACAGC	2	10	10667	10676	40 %	0 %	20 %	40 %	311113899
4	NC_014644	TGATT	2	10	12087	12096	20 %	60 %	20 %	0 %	311113900
5	NC_014644	CAACA	2	10	14114	14123	60 %	0 %	0 %	40 %	311113900
6	NC_014644	CAGAC	2	10	14279	14288	40 %	0 %	20 %	40 %	311113900
7	NC_014644	CGGTA	2	10	14469	14478	20 %	20 %	40 %	20 %	311113900
8	NC_014644	AAGGA	2	10	18087	18096	60 %	0 %	40 %	0 %	311113904
9	NC_014644	ACACC	2	10	21139	21148	40 %	0 %	0 %	60 %	311113909
10	NC_014644	ACAAG	2	10	21543	21552	60 %	0 %	20 %	20 %	311113910
11	NC_014644	ACCAA	2	10	23578	23587	60 %	0 %	0 %	40 %	311113913
12	NC_014644	CGCTC	2	10	28802	28811	0 %	20 %	20 %	60 %	311113920
13	NC_014644	ACGTT	2	10	29643	29652	20 %	40 %	20 %	20 %	311113920
14	NC_014644	GCTAA	2	10	33006	33015	40 %	20 %	20 %	20 %	311113923
15	NC_014644	ACAGC	2	10	35735	35744	40 %	0 %	20 %	40 %	311113925
16	NC_014644	ATCGT	2	10	36774	36783	20 %	40 %	20 %	20 %	311113925
17	NC_014644	AAAAC	2	10	38620	38629	80 %	0 %	0 %	20 %	311113926
18	NC_014644	CCAAG	2	10	39017	39026	40 %	0 %	20 %	40 %	311113927
19	NC_014644	TTATT	2	10	41365	41374	20 %	80 %	0 %	0 %	311113929
20	NC_014644	TCTAA	2	10	43889	43898	40 %	40 %	0 %	20 %	311113932
21	NC_014644	AAGCA	2	10	44620	44629	60 %	0 %	20 %	20 %	311113932
22	NC_014644	AACAT	2	10	44891	44900	60 %	20 %	0 %	20 %	311113932
23	NC_014644	GCAAA	2	10	49467	49476	60 %	0 %	20 %	20 %	311113939
24	NC_014644	GCTGT	2	10	53734	53743	0 %	40 %	40 %	20 %	311113943
25	NC_014644	ACGCA	2	10	55813	55822	40 %	0 %	20 %	40 %	311113945
26	NC_014644	GCGAC	2	10	58589	58598	20 %	0 %	40 %	40 %	311113947
27	NC_014644	CTTCC	2	10	61063	61072	0 %	40 %	0 %	60 %	311113950
28	NC_014644	GCGAA	2	10	63030	63039	40 %	0 %	40 %	20 %	311113951
29	NC_014644	GCAAT	2	10	63462	63471	40 %	20 %	20 %	20 %	311113951
30	NC_014644	CCACT	2	10	63786	63795	20 %	20 %	0 %	60 %	311113952
31	NC_014644	CATGC	2	10	66001	66010	20 %	20 %	20 %	40 %	311113954
32	NC_014644	TGGTT	2	10	67498	67507	0 %	60 %	40 %	0 %	311113954
33	NC_014644	ACTTT	2	10	71763	71772	20 %	60 %	0 %	20 %	311113960
34	NC_014644	CAAGC	2	10	73777	73786	40 %	0 %	20 %	40 %	311113961
35	NC_014644	CGATG	2	10	75775	75784	20 %	20 %	40 %	20 %	311113963
36	NC_014644	CAAGC	2	10	76844	76853	40 %	0 %	20 %	40 %	311113965
37	NC_014644	TTTAT	2	10	80797	80806	20 %	80 %	0 %	0 %	311113967
38	NC_014644	AGTGC	2	10	81977	81986	20 %	20 %	40 %	20 %	311113968
39	NC_014644	AGCCC	2	10	82022	82031	20 %	0 %	20 %	60 %	311113968
40	NC_014644	ATAAA	2	10	86066	86075	80 %	20 %	0 %	0 %	311113971
41	NC_014644	CTTTT	2	10	88001	88010	0 %	80 %	0 %	20 %	311113972
42	NC_014644	CAACA	2	10	88999	89008	60 %	0 %	0 %	40 %	311113972
43	NC_014644	CGAAA	2	10	89178	89187	60 %	0 %	20 %	20 %	311113973
44	NC_014644	ATTCT	2	10	91789	91798	20 %	60 %	0 %	20 %	311113975
45	NC_014644	CAACA	2	10	94563	94572	60 %	0 %	0 %	40 %	311113979
46	NC_014644	AACAC	2	10	95140	95149	60 %	0 %	0 %	40 %	311113979
47	NC_014644	TATGC	2	10	97595	97604	20 %	40 %	20 %	20 %	311113981
48	NC_014644	AAGCC	2	10	99618	99627	40 %	0 %	20 %	40 %	311113982
49	NC_014644	CCAAA	2	10	99630	99639	60 %	0 %	0 %	40 %	311113982
50	NC_014644	TCCGT	2	10	108006	108015	0 %	40 %	20 %	40 %	311113988
51	NC_014644	TACAC	2	10	108142	108151	40 %	20 %	0 %	40 %	311113988
52	NC_014644	TTACA	2	10	108154	108163	40 %	40 %	0 %	20 %	311113988
53	NC_014644	TTCCA	2	10	110002	110011	20 %	40 %	0 %	40 %	311113988
54	NC_014644	TTGGA	2	10	110016	110025	20 %	40 %	40 %	0 %	311113988
55	NC_014644	GCATG	2	10	110224	110233	20 %	20 %	40 %	20 %	311113988
56	NC_014644	TTCCA	2	10	114245	114254	20 %	40 %	0 %	40 %	311113992
57	NC_014644	ATTTG	2	10	115947	115956	20 %	60 %	20 %	0 %	311113994
58	NC_014644	TTTTA	2	10	117564	117573	20 %	80 %	0 %	0 %	311113994
59	NC_014644	ATAAA	2	10	119039	119048	80 %	20 %	0 %	0 %	311113996
60	NC_014644	TTTTA	2	10	124901	124910	20 %	80 %	0 %	0 %	311114003
61	NC_014644	CAAAA	2	10	126681	126690	80 %	0 %	0 %	20 %	311114003
62	NC_014644	CGGCA	2	10	127281	127290	20 %	0 %	40 %	40 %	311114004
63	NC_014644	GCATG	2	10	129234	129243	20 %	20 %	40 %	20 %	311114005
64	NC_014644	CAAAT	2	10	131228	131237	60 %	20 %	0 %	20 %	311114005
65	NC_014644	TTTTC	2	10	133601	133610	0 %	80 %	0 %	20 %	311114007
66	NC_014644	ATTTT	2	10	135497	135506	20 %	80 %	0 %	0 %	311114009
67	NC_014644	TTCAA	2	10	136254	136263	40 %	40 %	0 %	20 %	311114010
68	NC_014644	TGCTG	2	10	137245	137254	0 %	40 %	40 %	20 %	311114011
69	NC_014644	TCTGC	2	10	139364	139373	0 %	40 %	20 %	40 %	311114014
70	NC_014644	GAAAA	2	10	143685	143694	80 %	0 %	20 %	0 %	311114017
71	NC_014644	GGTAA	2	10	148837	148846	40 %	20 %	40 %	0 %	311114019
72	NC_014644	TACTT	2	10	151869	151878	20 %	60 %	0 %	20 %	311114024
73	NC_014644	CGCAA	2	10	152751	152760	40 %	0 %	20 %	40 %	311114025
74	NC_014644	CTTCT	2	10	155793	155802	0 %	60 %	0 %	40 %	311114027
75	NC_014644	AACTT	2	10	160340	160349	40 %	40 %	0 %	20 %	311114031
76	NC_014644	CCCAA	2	10	161264	161273	40 %	0 %	0 %	60 %	311114032
77	NC_014644	ACTTG	2	10	162492	162501	20 %	40 %	20 %	20 %	311114034
78	NC_014644	TAGTG	2	10	163437	163446	20 %	40 %	40 %	0 %	311114035
79	NC_014644	GTTTT	2	10	163586	163595	0 %	80 %	20 %	0 %	311114035
80	NC_014644	CATAG	2	10	165937	165946	40 %	20 %	20 %	20 %	311114038
81	NC_014644	GTGGC	2	10	166603	166612	0 %	20 %	60 %	20 %	311114038
82	NC_014644	GCCTT	2	10	166913	166922	0 %	40 %	20 %	40 %	311114038
83	NC_014644	CAAAT	2	10	167020	167029	60 %	20 %	0 %	20 %	311114038
84	NC_014644	TCATG	2	10	167562	167571	20 %	40 %	20 %	20 %	311114038
85	NC_014644	GCAAA	2	10	169613	169622	60 %	0 %	20 %	20 %	311114041
86	NC_014644	AGCAC	2	10	172484	172493	40 %	0 %	20 %	40 %	311114043
87	NC_014644	TGGAT	2	10	173141	173150	20 %	40 %	40 %	0 %	311114043
88	NC_014644	TTGGC	2	10	176648	176657	0 %	40 %	40 %	20 %	311114045
89	NC_014644	TTTTG	2	10	177172	177181	0 %	80 %	20 %	0 %	311114046
90	NC_014644	GTGTT	2	10	181109	181118	0 %	60 %	40 %	0 %	311114049
91	NC_014644	GGATC	2	10	181642	181651	20 %	20 %	40 %	20 %	311114049
92	NC_014644	GAAAG	2	10	182598	182607	60 %	0 %	40 %	0 %	311114049
93	NC_014644	ATGAG	2	10	185253	185262	40 %	20 %	40 %	0 %	311114052
94	NC_014644	GGTTT	2	10	187320	187329	0 %	60 %	40 %	0 %	311114055
95	NC_014644	ATTCT	2	10	189293	189302	20 %	60 %	0 %	20 %	311114057
96	NC_014644	CGTTA	2	10	190012	190021	20 %	40 %	20 %	20 %	311114057
97	NC_014644	ATGCG	2	10	190500	190509	20 %	20 %	40 %	20 %	311114057
98	NC_014644	ATTGA	2	10	192691	192700	40 %	40 %	20 %	0 %	311114060
99	NC_014644	GCAAG	2	10	194587	194596	40 %	0 %	40 %	20 %	311114061
100	NC_014644	AAAGC	2	10	198485	198494	60 %	0 %	20 %	20 %	311114064
101	NC_014644	CTTTG	2	10	199907	199916	0 %	60 %	20 %	20 %	311114066
102	NC_014644	CAGGT	2	10	201307	201316	20 %	20 %	40 %	20 %	311114066
103	NC_014644	CGTAA	2	10	205938	205947	40 %	20 %	20 %	20 %	311114070
104	NC_014644	TTTAT	2	10	207314	207323	20 %	80 %	0 %	0 %	311114074
105	NC_014644	ATTCC	2	10	208034	208043	20 %	40 %	0 %	40 %	311114074
106	NC_014644	TCTGC	2	10	211348	211357	0 %	40 %	20 %	40 %	311114075
107	NC_014644	TGCAA	2	10	214574	214583	40 %	20 %	20 %	20 %	311114077
108	NC_014644	AAGCA	2	10	216381	216390	60 %	0 %	20 %	20 %	311114078
109	NC_014644	TGATT	2	10	219780	219789	20 %	60 %	20 %	0 %	311114081
110	NC_014644	AGGCA	2	10	220093	220102	40 %	0 %	40 %	20 %	311114081
111	NC_014644	TTTGC	2	10	222762	222771	0 %	60 %	20 %	20 %	311114083
112	NC_014644	CAAGG	2	10	225764	225773	40 %	0 %	40 %	20 %	311114086
113	NC_014644	CAATC	2	10	228677	228686	40 %	20 %	0 %	40 %	311114088
114	NC_014644	CGTAT	2	10	234111	234120	20 %	40 %	20 %	20 %	311114092
115	NC_014644	TACAG	2	10	243573	243582	40 %	20 %	20 %	20 %	311114095
116	NC_014644	ATGAT	2	10	247063	247072	40 %	40 %	20 %	0 %	311114099
117	NC_014644	AATTG	2	10	247874	247883	40 %	40 %	20 %	0 %	311114100
118	NC_014644	GTTTT	2	10	249675	249684	0 %	80 %	20 %	0 %	311114102
119	NC_014644	TAAAC	2	10	249823	249832	60 %	20 %	0 %	20 %	311114102
120	NC_014644	CAAAA	2	10	252910	252919	80 %	0 %	0 %	20 %	311114105
121	NC_014644	AAAAG	2	10	253086	253095	80 %	0 %	20 %	0 %	311114105
122	NC_014644	GGAGG	2	10	253707	253716	20 %	0 %	80 %	0 %	311114106
123	NC_014644	AGAAA	2	10	255476	255485	80 %	0 %	20 %	0 %	311114108
124	NC_014644	TTGCG	2	10	258197	258206	0 %	40 %	40 %	20 %	311114110
125	NC_014644	TTATG	2	10	263603	263612	20 %	60 %	20 %	0 %	311114113
126	NC_014644	CTCAG	2	10	267657	267666	20 %	20 %	20 %	40 %	311114118
127	NC_014644	AGTTT	2	10	269361	269370	20 %	60 %	20 %	0 %	311114119
128	NC_014644	GGAAT	2	10	271717	271726	40 %	20 %	40 %	0 %	311114122
129	NC_014644	TTTGC	2	10	275959	275968	0 %	60 %	20 %	20 %	311114124
130	NC_014644	TTTTG	2	10	276784	276793	0 %	80 %	20 %	0 %	311114124
131	NC_014644	CTCTT	2	10	277164	277173	0 %	60 %	0 %	40 %	311114124
132	NC_014644	TTTCT	2	10	277259	277268	0 %	80 %	0 %	20 %	311114124
133	NC_014644	AACAA	2	10	282048	282057	80 %	0 %	0 %	20 %	311114127
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137	NC_014644	AAAAG	2	10	289465	289474	80 %	0 %	20 %	0 %	311114132
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260	NC_014644	TGGAT	2	10	562359	562368	20 %	40 %	40 %	0 %	311114345
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